Schemat tego protokołu izolacji i hodowli FAP mięśni szkieletowych i serca przedstawiono w Rysunku 1. W przypadku pobierania tkanek zmiana koloru wątroby z ciemnoczerwonej na bladożółtą zazwyczaj świadczy o prawidłowym przebiegu perfuzji. Przy określonym przedziale wiekowym myszy kolczastej masa serca wynosi zazwyczaj około 200 mg, natomiast masa mięśnia czworogłowego wynosi około 350 mg.
Podczas każdej wymiany buforu trawiennego w krokach 3.5-3.7 bufor w probówkach do trawienia staje się mętny w miarę uwalniania komórek z tkanki. Po zakończeniu procesu roztwór powinien mieć postać względnie homogenicznej zawiesiny z pozostałymi fragmentami tkanki. Należy przerwać trawienie, zanim wszystkie tkanki zostaną całkowicie rozłożone, aby uniknąć nadmiernego trawienia, co negatywnie wpłynęłoby na żywotność komórek i wyniki hodowli.
Przewidywane wykresy przepływu dla FACS przedstawiono na Rysunku 2. Oczekuje się, że FAPs będą stanowiły około 2% żywych komórek LIN-. Odsetek zdarzeń PI+ jest wskaźnikiem jakości przygotowania próbki i powinien być mniejszy niż 10%. W badaniu tym zazwyczaj uzyskuje się 150k FAPs na serce (tylko komory) oraz 100k FAPs z dwóch mięśni czworogłowych uda.
Po przeniesieniu na płytkę komórki zazwyczaj przytwierdzają się w ciągu 72 h, osiągają 80% konfluencji w ciągu 5 dni i wykazują typową morfologię fibroblastów z wypustkami (Rysunek 5).

Rysunek 1: Schematyczny przebieg protokołu i przybliżony czas wymagany dla każdego etapu. Pobieranie tkanek: 10 min na mysz. Trawienie tkanek: 1,5-2 h. Barwienie komórek: 45 min-75 min. Sortowanie komórek metodą fluorescencyjnej aktywacji (FACS): 2 h. Ekspansja progenitorów fibro-adypogennych (FAP): 4 dni. Różnicowanie FAP: 48 h dla różnicowania fibrogennego, 6 dni dla różnicowania adypogennego w przypadku FAP z mięśni szkieletowych oraz 14 dni dla FAP z serca. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Reprezentatywne wykresy FACS dla izolacji FAP z mięśni szkieletowych (góra) i serca (dół). Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Różnicowanie FAP mięśni szkieletowych myszy kolczatej. (A) Kontrola różnicowania fibrogennego. (B) Różnicowanie fibrogenne. (C) Kontrola różnicowania adipogennego. (D) Różnicowanie adipogenne. Perilipina (zielony), SMA (magenta), DAPI (niebieski), pasek skali = 100 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rycina 4: Różnicowanie FAP serca myszy kolczastej. (A) Kontrola różnicowania fibrogennego. (B) Różnicowanie fibrogenne. (C) Kontrola różnicowania adipogennego. (D) Różnicowanie adipogenne. Perilipina (zielony), SMA (magenta), DAPI (niebieski), pasek skali = 100 µm. Proszę kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 5: Obrazy w polu jasnym FAP mięśni szkieletowych (A) i serca (B) myszy kolczastej po 5 dniach hodowli, przed różnicowaniem. Pasek skali = 360 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
| Kontrole | CD31 SC | PDGFRα SC | CD31 FMO | PDGFRα FMO | Próbka |
| Przeciwciało CD31 | + | - | - | + | + |
| Przeciwciało PDGFRα | - | + | + | - | + |
Tabela 1: Schematyczny przewodnik po przygotowaniu koktajli przeciwciał do barwienia dla kontroli i próbek. SC = kontrola jednobarwna, FMO = kontrola fluorescence minus one, + = z odpowiednim przeciwciałem, - = bez odpowiedniego przeciwciała.