Protokół opisuje infekcję in vivo i in vitro nicieniami sosnówki Pinus pinaster oraz ich analizę lotną za pomocą chromatografii gazowej (GC) i GC sprzężonej ze spektrometrią mas (GC-MS).
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Protokół opisuje infekcję in vivo i in vitro nicieniami sosnówki Pinus pinaster oraz ich analizę lotną za pomocą chromatografii gazowej (GC) i GC sprzężonej ze spektrometrią mas (GC-MS).
Nicień sosnowy (PWN) to fitopasożyt, który powoduje chorobę więdnięcia sosny (PWD) u gatunków iglastych. Ten pasożytniczy nicień roślinny w dużym stopniu przyczynił się do wylesiania sosny w krajach azjatyckich, np. w Japonii, Chinach i Korei. W ciągu ostatnich dwóch dekad w Europie bardzo ucierpiały Portugalia i Hiszpania. Badania nad mechanizmami zakażenia węgorkiem sosnowca i/lub progresją PWD u wrażliwych gatunków żywicieli opierają się na kontrolowanym zakażeniu siewek sosny w warunkach szklarniowych. Technika ta jest pracochłonna i angażuje znaczne zasoby ekonomiczne i ludzkie. Dodatkowo może być podatny na zmienność, która wynika z różnorodności genetycznej związanej z niektórymi gatunkami sosny, ale także z ingerencji czynników zewnętrznych. Alternatywnie, kohodowle in vitro sosny z węgorkiem sosnowca oferują korzystniejszy system do badania zmian biochemicznych, ponieważ a) pozwalają kontrolować pojedyncze zmienne środowiskowe lub odżywcze, b) zajmują mniej miejsca, c) wymagają mniej czasu na uzyskanie oraz d) są wolne od zanieczyszczeń lub zmienności genetycznej gospodarza. Poniższy protokół szczegółowo opisuje standardowe zakażenie in vivo węgorkiem sosnowca Pinus pinaster, sosny nadmorskiej, oraz ustanowienie nowych kokultur in vitro pędów sosny z węgorkiem sosnowcem jako ulepszonej metodologii badania wpływu fitopasożytów na substancje lotne sosny. Substancje lotne indukowane węgorkiem sosnowca są ekstrahowane z sosny zakażonych in vivo i in vitro za pomocą hydrodestylacji i destylacji-ekstrakcji, a wyemitowane substancje lotne są wychwytywane przez mikroekstrakcję do fazy stałej (SPME) przy użyciu technik włókien lub kolumn z upakowaniem.
Nicień sosnowy (PWN), Bursaphelenchus xylophilus (Steiner & Bührer 1934) Nickle 1970, to pasożytniczy nicień roślinny, który głównie pasożytuje na gatunkach Pinus. Ten fitopasożyt jest przenoszony przez owady z rodzaju Monochamus na drzewa wrażliwych gatunków sosny podczas żerowania owada. Węgorek sosnowiec zabija drzewo, atakując jego kanały żywiczne i zmniejszając przepływ żywicy oraz uszkadzając jego tkankę naczyniową, powodując przerwy w słupie wody. Brak wody w koronach drzew wywołuje pierwsze widoczne objawy choroby więdnięcia sosny (PWD), tj. igły sosny stają się chlorotyczne po ustaniu fotosyntezy i opadają z powodu wysuszenia. Sosna generalnie reaguje na stres biotyczny i abiotyczny poprzez produkcję żywicy i związków lotnych1. Dlatego zrozumienie mechanizmów obrony sosny jest ważne dla określenia konkretnych skutków ataków węgorka sosnowca i znalezienia alternatywnych metod zwalczania szkodników2.
Obecnie, eksperymentowanie w warunkach polowych zależy od dostępności zainfekowanych sosen, potwierdzenia infekcji PWN i zmiennych warunków środowiskowych. W warunkach szklarniowych parametry te można łatwiej kontrolować; Jednak różnorodność genetyczna gospodarza staje się silnym źródłem zmienności3. Na przykład w badaniu dotyczącym odpowiedzi na oporność Pinus pinaster produkcja terpenu limonenu i kwasów żywicznych była związana z zakażeniem PWN4. Jednak ze względu na małą liczbę próbek i zmienność warunków naturalnych, wykrywalne zmiany zarejestrowano tylko dla połowy próbek. W innym badaniu, w którym wykorzystano sadzonki sosny uprawianej w szklarni, mimo że warunki środowiskowe były łatwiejsze do kontrolowania, naturalna różnorodność genetyczna sosny wywołała dużą zmienność w ekstrahowanych substancjach lotnych5. Ponieważ na substancje lotne sosny wywołane chorobą może mieć duży wpływ zmienność środowiskowa i genetyczna, zastosowanie kultur pędów in vitro jest dobrą alternatywą dla badań nad chemiczną i biochemiczną reakcją tkanki sosny na zakażenie węgorkiem sosnowca5,6. Rozmnażając genotyp rośliny in vitro, można utrzymać jej skład genetyczny i klonować w nieskończoność, co prowadzi do powstania większej liczby genetycznie identycznych osobników na mniejszej przestrzeni i w krótszym czasie niż w warunkach in vivo. Kultury te są prostym systemem roboczym działającym w łatwych do manipulowania warunkach żywieniowych i środowiskowych, dzięki czemu oferują dodatkowe korzyści w porównaniu z konwencjonalnymi systemami w ocenie produkcji i emisji substancji lotnych7,8. Systemy te są szczególnie korzystne dla badań nad gatunkami drzewiastymi, które w większości przypadków wymagają znacznych zasobów, tj. drzewa docelowe są czasami zlokalizowane w trudno dostępnych miejscach, wymagają drogiego sprzętu, dedykowanej siły roboczej i dłuższych okresów analizy8. In vitro, komulacje sosny z węgorkiem sosnowca umożliwiają ocenę interakcji metabolicznych między nicieniami a rośliną na różnych etapach9. W przypadku analizy substancji lotnych jest to bardzo ważne, ponieważ techniki profilowania stały się bardzo dokładne, a niewielkie różnice w próbkowaniu mogą powodować znaczne zmiany w profilach lotnych. Chromatografia gazowa sprzężona ze spektrometrią mas (GC-MS) jest potężną techniką analizy substancji lotnych i umożliwia szybkie i sprawne profilowanie substancji lotnych10. Przedstawiony tutaj protokół opisuje techniki infekowania sadzonek sosny in vivo w warunkach szklarniowych oraz kultur pędów in vitro genetycznie identycznych sosen, zoptymalizowanych pod kątem ekstrakcji i profilowania indukowanych substancji lotnych.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Uprawa nicieni sosnowych in vitro
UWAGA: Nicienie sosnowe są hodowane poprzez żywienie się grzybnią niezarodnikującego szczepu Botrytis cinerea (de Bary) Whetzel11.
2. Sterylizacja mieszanych nicieni sosnowych w stadium życia
3. Zakażenie in vivo siewek Pinus pinaster
UWAGA: Próby inokulacji przeprowadzane są na ≥ 2-letnich siewkach P. pinaster. Drzewa można nabyć od certyfikowanych sprzedawców komercyjnych, ale można je również uprawiać w szklarni z certyfikowanych nasion.
4. Zakładanie i infekowanie kultur pędów sosny in vitro
5. Izolacja związków lotnych
UWAGA: Izolację substancji lotnych można przeprowadzić za pomocą kilku technik. W tym przypadku ekstrakcja lotna odbywa się przez hydrodestylację, przy użyciu aparatu Clevengera20, destylację-ekstrakcję, przy użyciu aparatu Likensa-Nickersona21, oraz wychwytywanie substancji lotnych w przestrzeni nad powierzchnią poprzez mikroekstrakcję do fazy stałej (SPME) przy użyciu powlekanych włókien lub wypełnionych rurek (porowaty sorbent polimerowy)22.
6. Analiza profili lotnych
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
PWN szybko rozmnażają się w optymalnych warunkach, a czas generacji może wynosić zaledwie 4 dni, przy czym każda samica składa w ciągu swojego życia około 80 jaj28. Stosując opisaną powyżej metodologię, można uzyskać duże ilości PWN, w zależności od wzrostu grzyba. W ciągu 8-dniowego okresu wzrostu liczebność populacji PWN może wzrosnąć 100-krotnie (Rysunek 1). Aby zwiększyć powtarzalność ilości otrzymywanych PWN, należy używać sterylizowanych PWN, ponieważ zanieczysz...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Przedstawiony tutaj protokół przedstawia ulepszoną metodologię analizy lotnych związków w sosnie nadmorskiej zakażonej węgorkiem sosnowcem, w których zmienność środowiskowa i genetyczna jest zmniejszona i nie ma wpływu na wyniki. Wykorzystując czyste linie genotypów sosny morskiej in vitro , wyekstrahowane i wyemitowane substancje lotne mogą być analizowane jako odpowiedź gospodarza na jedno z najbardziej szkodliwych zagrożeń biotycznych dla lasów sosnowych.
Utrzymanie kultur referenc...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Nie mamy nic do ujawnienia.
To badanie zostało częściowo sfinansowane przez UE w ramach projektu PurPest na podstawie umowy o udzielenie dotacji 101060634, oraz przez Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT), poprzez projekty NemACT, DOI 10.54499/2022.00359.CEECIND/CP1737/CT0002; NemaWAARS, DOI 10.54499/PTDC/ASP-PLA/1108/2021; CESAM UIDP/50017/2020+UIDB/50017/2020+ LA/P/0094/2020; CE3C, DOI 10.54499/UIDB/00329/2020; GREEN-IT, DOI 10.54499/UIDB/04551/2020 oraz 10.54499/UIDP/04551/2020.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Sito testowe o oczkach 38 | Retsch | 60.131.000038 | |
| 6-Benzyloaminopuryna (6-BAP) | Duchefa Biochemie | B0904 | |
| Aktywowane węglem drzewnym | Duchefa Biochemie | C1302 | |
| Aparat Clevengera | WINZER Laborglastechnik | 25-000-02 | |
| Roztwór nadtlenku | wodoru Sigma-Aldrich | H1009-500ML | |
| Kwas indolo-3-masłowy (IBA) | Duchefa Biochemie | I0902 | |
| Aparat Likensa-Nickersona | VitriLab LDA. | c/IN29/32 | |
| Pojemniki okrągłe Microbox | Sac O2 | O118/80+OD118 | |
| n-Pentane | Sigma-Aldrich | 1.00882 | |
| Folia uszczelniająca PARAFILM M | MARKA | HS234526B-1EA | |
| Fitoagar | Duchefa Biochemie | P1003 | |
| Agar ziemniaczany dekstroza | BD DIFCO | 213400 | |
| Ostrze skalpela nr 24 | Romed Holland | BLADE24 | |
| Schenk & Hildebrandt Sól bazalna medium | Duchefa Biochemie | S0225 | |
| Schenk & Mieszanka witamin Hildebrandt | Duchefa Biochemie | S0411 | |
| Zespół włókien SPME Polidimetylosiloksan (PDMS) | Supelco | 57300-U | |
| Uchwyt na włókna SPME | Supelco | 57330-U | |
| Sacharoza | Duchefa Biochemie | S0809 | |
| Tenax TA- rurki ze stali nierdzewnej kondycjonowane + zaślepione | Markes International | C1-AAXX-5003 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.