Ten protokół zapewnia usprawniony przepływ pracy do generowania i testowania ludzkich limfocytów regulatorowych receptora antygenu chimerycznego (Treg CAR).
Artykuł metodologiczny
Ten protokół zapewnia usprawniony przepływ pracy do generowania i testowania ludzkich limfocytów regulatorowych receptora antygenu chimerycznego (Treg CAR).
Terapia limfocytami T z chimerycznym receptorem antygenowym (CAR) zmieniła oblicze leczenia raka, prowadząc do rekordowych wskaźników remisji w wcześniej nieuleczalnych nowotworach hematologicznych. Sukcesy te wzbudziły zainteresowanie adaptacją platformy CAR do niewielkiego, ale kluczowego podzbioru limfocytów T CD4 + odpowiedzialnych głównie za regulację i hamowanie odpowiedzi immunologicznej, limfocytów T regulatorowych (Treg). Zdolność do przekierowania aktywności immunosupresyjnej limfocytów Treg na dowolny cel zewnątrzkomórkowy ma ogromne implikacje dla tworzenia terapii komórkowych w chorobach autoimmunologicznych, odrzucaniu przeszczepów narządów i chorobie przeszczep przeciwko gospodarzowi. Tutaj szczegółowo opisujemy metodologie izolacji limfocytów Treg w dobrej wierze z ludzkiej krwi obwodowej, modyfikacji genetycznej ludzkich limfocytów Treg z wykorzystaniem lentiwirusa lub wspomaganego przez CRISPR / Cas9 knock-in przy użyciu dostarczania szablonu homologicznej naprawy ukierunkowanej (HDR) za pośrednictwem wirusa związanego z adenowirusem oraz ekspansji ex vivo stabilnych ludzkich Treg CAR. Na koniec opisujemy ocenę stabilności fenotypowej ludzkiego CAR Treg i funkcji supresyjnej in vitro, co zapewnia wgląd w to, jak ludzkie Treg CAR będą się zachowywać w zastosowaniach przedklinicznych i klinicznych.
Terapie limfocytami T z chimerycznym receptorem antygenu antygenowego (CAR) zrewolucjonizowały leczenie nowotworów hematologicznych, osiągając niezwykle wysokie wskaźniki remisji w wcześniej nieuleczalnych nowotworach1,2. Zachęcające wczesne wyniki z wykorzystaniem limfocytów CAR T w leczeniu glejaka3,4,5 podkreślają wszechstronność technologii CAR i jej przyszły potencjał w zakresie zwalczania szerokiego zakresu nowotworów złośliwych. W miarę jak naukowcy badają dalsze zastosowania CAR, limfocyty T regulatorowe (Treg) okazały się obiecującym typem komórek. Tregi odgrywają kluczową rolę w utrzymaniu homeostazy immunologicznej i regulacji odpowiedzi immunologicznej poprzez kilka mechanizmów, w tym sekwestrację IL-2, wydzielanie cytokin immunosupresyjnych i modulowanie komórek prezentujących antygen6,7.
Dzięki technologii CAR, Tregi mogą być wykorzystywane do leczenia odrzucenia przeszczepu narządu, chorób autoimmunologicznych i zaburzeń zapalnych, takich jak alergie i astma6,8,9. Przeciwciała Treg CAR mogą prowadzić do znacznej poprawy wyników leczenia i jakości życia pacjentów poprzez ograniczenie stosowania leków immunosupresyjnych, które hamują działanie układu odpornościowego jako całości i wiążą się ze szkodliwymi skutkami ubocznymi10,11. Modele przedkliniczne wykazały obiecujące wyniki w translacji technologii CAR na limfocyty Treg, z udanymi zastosowaniami w chorobach takich jak cukrzyca typu 1, stwardnienie rozsiane, choroba przeszczep przeciwko gospodarzowi i nieswoiste zapalenie jelit9,12,13,14,15. W klinice prowadzone są obecnie badania nad limfocytami Treg CAR w celu zapobiegania odrzuceniu przeszczepu narządów litych16.
Ten artykuł przedstawia szczegółową metodologię generowania ludzkich limfocytów T regulatorowych receptora antygenu chimerycznego (Treg CAR). Protokół ten polega na izolowaniu limfocytów Treg z ludzkiej krwi obwodowej i genetycznej modyfikacji ich przy użyciu technik takich jak transdukcja lentiwirusowa i precyzyjne wbijanie genów przy użyciu edycji genów CRISPR/Cas9 i wektorów wirusa związanego z adenowirusem (AAV). Opisujemy również ocenę stabilności fenotypowej i funkcji supresyjnej tych zmodyfikowanych limfocytów Treg, które są kluczowymi krokami w celu walidacji ich potencjału terapeutycznego17,18,19. Takie podejście usprawnia projektowanie i wczesne testowanie terapii CAR Treg, które mają potencjał do rozszerzenia transformacyjnego wpływu terapii limfocytami T CAR na regulację układu odpornościowego. Dzieląc się naszą metodologią, mamy nadzieję zainspirować do dalszych badań i innowacji w rozwijającej się przestrzeni terapii CAR Treg9,20.
1. Izolacja ludzkich komórek Treg
2. Aktywacja limfocytów T
3. Transdukcja lentiwirusowa ludzkich komórek Treg
4. CRISPR/Cas9-pośredni knock-in genu w ludzkich komórkach Treg
5. Aktywacja ludzkich CAR Treg
6. Stabilność ludzkich CAR Treg
7. Supresja ludzkich CAR Treg

Opisany tutaj protokół zapewnia usprawnioną i zestandaryzowaną procedurę oceny nowych konstruktów chimerycznych receptorów antygenowych (CAR) w ludzkich limfocytach T regulatorowych (Tregs), w celu stworzenia żywych terapii chorób autoimmunologicznych, choroby przeszczep przeciw gospodarzowi, odrzucania przeszczepów narządowych oraz alergii. Rysunek 1 przedstawia sposób uzyskiwania wysokiej czystości ludzkich Tregs z krwi obwodowej za pomocą FACS (Rysunek 1A), co oceniono na podstawie wysokich poziomów czynników transkrypcyjnych linii Treg, FOXP3 i HELIOS, po ekspansji ex vivo (Rysunek 1B).
Przedstawiamy dwie metody modyfikacji genetycznej ludzkich komórek Tregs: transdukcję lentiwirusową (Rysunek 2) oraz knock-in genu za pomocą CRISPR/Cas9 (Rysunek 3), obie charakteryzujące się wysoką wydajnością. Korzystamy z usług zewnętrznych w celu syntezy konstruktów szkieletowych lentiwirusa oraz produkcji i miareczkowania lentiwirusa, który następnie jest transportowany do naszego laboratorium i przechowywany w temperaturze -80 °C do czasu użycia. Możliwe jest jednak również generowanie lentiwirusa we własnym zakresie poprzez transfekcję komórek HEK293T plazmidami CAR i plazmidami pakującymi, a następnie miareczkowanie w komórkach Jurkat z wykorzystaniem cytometrii przepływowej, zgodnie z opisem w innej publikacji17. W przypadku knock-in genu celujemy w locus stałego regionu receptora limfocytów T alfa (TRAC) przy użyciu Cas9 i pojedynczego przewodzącego RNA (sgRNA), co według naszych oraz innych badań skutkuje wysoką wydajnością edycji13,23, a następnie wprowadzamy transgen CAR, dostarczany w formie nieintegrującego się wirusa towarzyszącego adenowirusom (AAV) z ramionami homologii specyficznymi dla locus TRAC. Wykazano, że strategia ta prowadzi do bardziej jednolitej i spójnej ekspresji CAR u różnych dawców krwi w konwencjonalnych limfocytach T23, unikając jednocześnie potencjalnego ryzyka onkogennego związanego z losową integracją genomową przy użyciu lentiwirusa. Wykorzystany tutaj AAV został wyprodukowany i wymiareczkowany przez zewnętrznego dostawcę i dostarczony do naszego laboratorium, gdzie był przechowywany w -80 °C do momentu użycia. Niemniej jednak możliwe jest wytwarzanie AAV we własnym zakresie przy użyciu komórek HEK293T transfekowanych konstruktem AAV i plazmidami pakującymi AAV jako komórek producentów oraz dostępnych komercyjnie zestawów do oczyszczania i miareczkowania AAV, zgodnie z opisem w innych pracach13,24.
Aby zaprezentować nasz protokół testowania wielu CAR w ludzkich komórkach Treg, wykorzystaliśmy uznaną konstrukcję CD19 CAR i stworzyliśmy warianty o różnych architekturach sygnałowych, zawierające łańcuch CD3delta lub CD3epsilon zamiast typowego łańcucha CD3zeta25, lub posiadające mutacje w znanych motywach sygnałowych CD2826. Rycina 4 przedstawia stopień aktywacji, mierzony ekspresją powierzchniową CD71 (receptora transferyny), różnych komórek CD19 CAR Treg po wspólnej inkubacji z napromieniowanymi komórkami K562 wykazującymi ekspresję CD19. Komórki K562 są powszechnie wybierane jako komórki docelowe w testach aktywacji limfocytów T ze względu na łatwość hodowli i transdukcji lentiwirusowej oraz brak HLA, CD80 i CD86, co zapobiega wystąpieniu tła wynikającego z aktywacji endogennego TCR lub receptorów kostymulujących przez niemodyfikowane komórki21,27.
Alternatywnie można zastosować kulki magnetyczne sprzężone z białkiem docelowym CAR w celu aktywacji CAR Treg28. Brak sygnału kostymulującego przekazywanego przez CAR, wynikający albo z całkowitego braku domeny CD28 (konstrukt Zeta), albo z dezaktywacji wszystkich trzech znanych motywów sygnałowych CD28 (konstrukt CD28(xxx)zeta), prowadził do niższej ekspresji CD71 niż w przypadku CD28zeta CD19 CAR (Rycina 4). Bardzo ważnym parametrem dla skuteczności i bezpieczeństwa terapii CAR Treg jest stabilność Treg, ponieważ komórki Treg mogą utracić funkcję supresyjną i przekształcić się w prozapalne limfocyty T podczas przedłużonej hodowli ex vivo lub ekspozycji na środowiska zapalne in vivo29,30. Zastosowanie naszego protokołu pozwala utrzymać pozytywną ekspresję FOXP3 oraz HELIOS – złotego standardu tożsamości Treg – w ludzkich CAR Treg po izolacji, modyfikacji genetycznej, ekspansji poliklonalnej i aktywacji za pomocą CAR (Rycina 5). Warto zaznaczyć, że do analizy próbek poddanych wewnątrzkomórkowemu barwieniu przeciwciałami użyliśmy spektralnego cytometru przepływowego w celu uzyskania większej intensywności sygnału i rozdzielczości. Na koniec w Rycynie 6 przedstawiamy test immunologiczny służący do oceny funkcji ludzkich CAR Treg. Konwencjonalne limfocyty T są znakowane barwnikiem fluorescencyjnym w celu śledzenia ich proliferacji za pomocą cytometrii przepływowej, a następnie są aktywowane. Te aktywowane limfocyty T odpowiadające (Tresp) są następnie współinkubowane z aktywowanymi CAR Treg w różnych stosunkach Treg:Tresp. Im większa liczba CAR Treg, tym mniejsza proliferacja komórek Tresp, co stanowi bezpośredni miernik funkcji supresyjnej CAR Treg. Co ciekawe, wymiana łańcucha CD3 lub zmutowanie domeny CD28 w CAR miało jedynie niewielki wpływ na zapośredniczoną przez CAR Treg supresję proliferacji limfocytów T in vitro (Rycina 6), co jest zgodne z wynikami raportowanymi przez inne grupy31,32.

Rycina 1: Izolacja ludzkich limfocytów T regulatorowych. (A) Strategia bramkowania podczas sortowania komórek wspomaganego fluorescencją (FACS) w celu izolacji limfocytów T regulatorowych i konwencjonalnych limfocytów T z limfocytów T CD4+ wzbogaconych magnetycznie z mononuklearnych komórek krwi obwodowej. Wykres przedstawia ekspresję CD25 i CD127, gdzie Tregs zidentyfikowano jako komórki CD25highCD127-, a Tconv jako komórki CD25lowCD127+. (B) Barwienie wewnątrzkomórkowe izolowanych populacji komórek analizowane metodą cytometrii przepływowej w celu potwierdzenia tożsamości komórkowej na podstawie ekspresji FOXP3 i HELIOS. Tregs zazwyczaj wykazują wysoką ekspresję FOXP3 i HELIOS, które są czynnikami transkrypcyjnymi linii Treg. Komórki Tconv wykazują minimalną ekspresję obu markerów, co potwierdza ich fenotyp konwencjonalnych limfocytów T. (C) Strategia bramkowania w celu oceny stabilności Treg po transdukcji CAR. Skróty: Treg = limfocyt T regulatorowy; Tconv = konwencjonalny limfocyt T; FSC-A = pole powierzchni szczytu rozproszenia przedniego; SSC-A = pole powierzchni szczytu rozproszenia bocznego; CAR = chimeryczny receptor antygenowy; GFP = zielone białko fluorescencyjne. Aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny, kliknij tutaj.

Rycina 2: Generowanie CAR Tregs za pomocą transdukcji lentiwirusowej. Wykres kropkowy z cytometrii przepływowej przedstawiający ekspresję powierzchniową CAR (Myc-tag) oraz ekspresję genu reporterowego GFP w komórkach Treg po transdukcji lentiwirusem Myc-tag-CD19CAR-2A-GFP (A) przed i (B) po sortowaniu komórek wspomaganym fluorescencją. Skróty: Treg = regulatorowa limfocyt T; CAR = chimeryczny receptor antygenowy; GFP = zielone białko fluorescencyjne. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 3: Generowanie CAR Tregów za pomocą knock-in zapośredniczonego przez CRISPR/Cas9. (A) Wykres kropkowy cytometrii przepływowej Tregów poddanych elektroporacji kompleksem RNP CRISPR/Cas9 celującym w locus TRAC, wraz z AAV zawierającym gen Myc-tag-CD19CAR-2A-EGFRt jako matrycę do naprawy kierowanej homologią. Ekspresję CAR, wskazaną przez ekspresję genu reporterowego EGFRt, analizowano w połączeniu z utratą ekspresji CD3 w celu pomiaru knock-in CAR w locus TRAC. (B) Kontrolny wykres kropkowy cytometrii przepływowej Tregów poddanych elektroporacji mock bez kompleksu CRISPR-RNP i AAV, wykazujący brak reportera EGFRt i obecność CD3. (C) Strategia bramkowania w celu oceny wydajności knock-in w Tregach. Skróty: Treg = limfocyt T regulatorowy; FSC-A = obszar piku rozproszenia przedniego; SSC-A = obszar piku rozproszenia bocznego; CAR = chimeryczny receptor antygenowy; RNP = rybonukleoproteina; AAV = wirus adeno-zależny; EGFRt = skrócony receptory czynnika wzrostu naskórka. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 4: Aktywacja CAR Treg z różnymi konstruktami CAR. (A) Histogramy cytometrii przepływowej reprezentujące ekspresję powierzchniową CD71, marker aktywacji limfocytów T, na CAR Tregach 48 h po aktywacji komórkami docelowymi — naświetlonymi komórkami K562 wykazującymi ekspresję CD19. Każdy kolor reprezentuje Tregi transdukowane innym konstruktem CD19 CAR zawierającym różne domeny sygnalizacyjne łańcucha CD3 — CD28zeta, CD28delta, CD28epsilon — lub zmutowane kostymulacyjne domeny CD28 — CD28(x23)zeta, CD28(1x3)zeta, CD28(12x)zeta, CD28(xxx)zeta — gdzie „x” oznacza miejsce mutacji tyrozyny na fenyloalaninę w obrębie trzech motywów sygnalizacyjnych CD28 (1. motyw wiązania PI3K, 2. motyw wiązania ITK, 3. motyw wiązania LCK). UT służą jako kontrola negatywna. (B) Średnia intensywność fluorescencji CD71 w aktywowanych CAR Tregach. Wartości reprezentują powtórzenia techniczne reprezentatywnych eksperymentów. Słupki reprezentują średnią ± SD, a istotność statystyczną obliczono za pomocą jednoczynnikowej analizy ANOVA z testem Tukey HSD. *, p < 0.05, ***, p < 0.001, w porównaniu z CAR Treg CD19 CD28zeta. (C) Schemat konstruktów CAR zawierających różne mutacje w kostymulacyjnej domenie sygnalizacyjnej CD28. (D) Schemat konstruktów CAR zawierających różne domeny sygnalizacyjne łańcucha CD3. Skróty: Treg = regulacyjny limfocyt T; CAR = chimeryczny receptor antygenowy; UT = nietransdukowany; MFI = średnia intensywność fluorescencji. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 5: Stabilność tożsamości CAR Treg po aktywacji CAR. Wykresy kropkowe z cytometrii przepływowej obrazujące wewnątrzkomórkową ekspresję FOXP3 i HELIOS, kluczowych markerów tożsamości Treg, w komórkach Treg 9 dni po aktywacji (A) za pomocą CAR CD19 z zastosowaniem celu, napromianianych komórek K562 wykazujących ekspresję CD19, lub (B) za pomocą TCR i CD28 z użyciem kulek anti-CD3/28. (C) Komórki Tconv aktywowane kulkami CD3/28 zostały uwzględnione jako negatywna kontrola barwienia dla FOXP3 i HELIOS. Skróty: Treg = regulatorna komórka T; Tconv = konwencjonalna komórka T; CAR = chimeryczny receptor antygenowy. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 6: Funkcja immunosupresyjna CAR Treg z różnymi konstruktami CAR. (A) Reprezentatywny histogram cytometrii przepływowej proliferacji znakowanych CTV komórek CD4+ Tresp współhodowanych z aktywowanymi CAR Treg CD19 CD28zeta w różnych stosunkach Treg do Tresp (1:1, 1:2, 1:4 i 1:8). (B) Procentowa supresja proliferacji komórek CD4+ Tresp przez Tregs wyposażone w CAR CD19 z mutantami domeny CD28 lub alternatywnymi domenami sygnalizacyjnymi CD3. (C) Reprezentatywny histogram cytometrii przepływowej proliferacji znakowanych CTV komórek CD4+ Tresp współhodowanych z aktywowanymi CAR Treg CD19 CD28zeta w różnych stosunkach Treg do Tresp. (D) Procentowa supresja proliferacji komórek CD8+ Tresp przez Tregs wyposażone w CAR CD19 z mutantami domeny CD28 lub alternatywnymi domenami sygnalizacyjnymi CD3. Wartości reprezentują powtórzenia techniczne reprezentatywnych eksperymentów. Słupki reprezentują średnią ± SD, a istotność statystyczną obliczono za pomocą jednoczynnikowej analizy ANOVA z testem Tukey HSD *, p < 0.05, **, p < 0.01, ***, p < 0.001, ****, p < 0.0001, w porównaniu z CAR Treg CD19 CD28zeta. (E) Strategia bramkowania w celu oceny supresji komórek Tresp przez CAR Treg. Skróty: Treg = limfocyt T regulatorowy; CAR = chimeryczny receptor antygenowy; CTV = Cell Trace Violet; Tresp = odpowiadające limfocyty T.Aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku, kliknij tutaj.
Protokół ten zapewnia usprawnioną i kompleksową metodologię generowania i oceny ludzkich limfocytów T regulatorowych receptora antygenu chimerycznego (CAR Treg). Sukces technologii CAR w leczeniu nowotworów hematologicznych zainspirował jej zastosowanie w immunosupresyjnym podzbiorze limfocytów T, Treg. W przeciwieństwie do konwencjonalnych limfocytów T, limfocyty Treg hamują odpowiedź immunologiczną, oferując potencjalne metody leczenia stanów wynikających z niepożądanej odporności, takich jak choroba autoimmunologiczna, odrzucenie przeszczepu narządu, choroba przeszczep przeciwko gospodarzowi i alergie9. Wykorzystanie CAR Treg umożliwia terapię specyficzną dla antygenu, posiadając potencjał uniknięcia skutków ubocznych związanych z lekami immunosupresyjnymi o szerokim spektrum działania11. W tym miejscu opisujemy protokoły in vitro w celu walidacji stabilności i funkcji linii Treg podczas inżynierii z CAR. Chociaż nie zostało to omówione w tym artykule, myszy z niedoborem odporności NSG dają możliwość przetestowania funkcji ludzkiego CAR Treg in vivo w modelach choroby przeszczep przeciwko gospodarzowi i przeszczepu narządów13,14, co jest ważnym krokiem przed translacją na ludzi.
Krytyczny krok w tym protokole polega na wyizolowaniu i oczyszczeniu limfocytów Treg z ludzkiej krwi obwodowej, przy użyciu sekwencyjnej separacji magnetycznej i sortowania komórek aktywowanych fluorescencją (FACS) w celu uzyskania wysokiej czystości limfocytów Treg CD4 + CD25o wysokiej zawartościCD127. Jakość izolacji limfocytów Treg ma kluczowe znaczenie, ponieważ bezpośrednio wpływa na skuteczność terapeutyczną limfocytów Treg CAR. Należy bezwzględnie unikać zanieczyszczenia konwencjonalnymi limfocytami T (Tconv), ponieważ mogą one namnażać się szybciej niż limfocyty Treg, zwłaszcza przy wysokich stężeniach IL-2 (1000 IU / ml). Inne opublikowane metodologie obejmują dodanie rapamycyny do protokołu ekspansji Treg w celu selektywnego ograniczenia ekspansji Tconv przy minimalnym wpływie na ekspansję Treg33. Magnetyczna negatywna selekcja limfocytów T CD4 + jest stosowana w celu skrócenia czasu trwania FACS, co jest mniej łagodne dla komórek niż izolacja magnetyczna nietkniętych komórek. Co więcej, selekcja negatywna zachowuje epitop CD4 do barwienia przeciwciał. Etapy te są kluczowe ze względu na niską częstotliwość Treg we krwi obwodowej (1% PBMC, 3-8% limfocytów T CD4+ ).
Opisano tutaj dwie metody modyfikacji genetycznej ludzkich limfocytów Treg: transdukcję lentiwirusową i knock-in za pośrednictwem genu CRISPR/Cas9. Transdukcja lentiwirusowa zapewnia skuteczne dostarczanie genów, a lentiwirus jest łatwiejszy do wytworzenia. Wiąże się to jednak z losową integracją genomową i zmienną liczbą kopii genów na komórkę. W przeciwieństwie do tego, CRISPR/Cas9 i HDR pozwalają na edycję genomu w precyzyjnej lokalizacji (w naszym przypadku locus TRAC) oraz, jeśli celuje w region genomowy TCR, pojedynczą kopię genu na komórkę (tylko jeden allel TCR może być celowany na komórkę T ze względu na wykluczenie alleli TCR34). Jednak elektroporacja, stosowana do dostarczania CRISPR/Cas9 RNP, jest bardziej destrukcyjna dla komórek niż dodanie lentiwirusa do pożywki i wirowanie, wymagając więcej limfocytów Treg na początku (4 × 106 Treg do elektroporacji za pomocą końcówki do elektroporacji 100 μl w porównaniu z zaledwie 2,5 × 105 Treg do transdukcji lentiwirusowej w 24-dołku) i skutkuje niższą ekspansją CAR Treg (zwykle 20-70 razy między dniem transdukcji lentiwirusa i dzień oceny funkcjonalnej).
Przedstawiono tutaj trzy testy porównawcze do oceny inżynierii ludzkiego CAR Treg: aktywacja, stabilność i tłumienie. Oceniamy aktywację CAR Treg w obecności komórek docelowych wykazujących ekspresję antygenu CAR, mierząc regulację w górę CD71, receptora transferyny. Chociaż CD69 i CD25 są również markerami aktywacji, CD71 został wybrany ze względu na jego stabilną ekspresję po aktywacji przez różne dni w porównaniu z przejściową ekspresją CD6935. CD25 ma niski zakres dynamiki w limfocytach Treg ze względu na wysoki podstawowy poziom tej cząsteczki. Badanie stabilności ma kluczowe znaczenie, ponieważ limfocyty Treg mogą przekształcić się w fenotyp efektorowy pod wpływem przedłużonej ekspansji ex vivo, wielu rund aktywacji lub pewnych stanów zapalnych, które mogą przeciwdziałać pożądanym efektom immunosupresyjnym29,30. Protokół ten ocenia stabilność fenotypową CAR Treg 9 dni po aktywacji za pośrednictwem CAR, ponieważ jest to typowy czas trwania cyklu aktywacji ludzkich limfocytów T. Jednak ważne może być przyjrzenie się dalszym punktom czasowym, ponieważ w przypadku niektórych dawców limfocyty Treg nie są w pełni wypoczęte i kontynuują ekspansję do 12 dni po stymulacji. Ponadto ważna może być ocena wpływu wielokrotnych cykli aktywacji na stabilność CAR Treg. Wykorzystujemy jednoczesną ekspresję FOXP3 i HELIOS jako cechę charakterystyczną stabilności Treg. Włączenie HELIOS jest kluczowe, ponieważ u ludzi komórki Tconv zwiększają poziom FOXP3 po aktywacji36.
Test supresji ocenia funkcję immunosupresyjną limfocytów CAR Treg, mierząc podział limfocytów T CD4 + i CD8 + poprzez śledzenie fluorescencji CellTrace Violet (CTV). Czułość tego testu i zależność od dawcy wymagają starannej konfiguracji i rozwiązywania problemów. Parametry, które można ustalić przed zastosowaniem limfocytów Treg CAR, których liczba może być czynnikiem ograniczającym, obejmują określenie, jak szybko znakowane limfocyty T namnażają się dla określonego dawcy oraz optymalny stosunek kulek anty-CD3 / CD28 do limfocytów T dla danego dawcy i partii kulek 17,28,37.
Wyzwaniem w inżynierii ludzkich TROG CAR jest zmienność między dawcami w obfitości Treg, skuteczności manipulacji genetycznej, ekspansji i funkcji immunosupresyjnej. Zmienność tę można przypisać specyficznym dla dawcy różnicom genetycznym i środowiskowym oraz zwiększonej wrażliwości limfocytów Treg podczas pracy in vitro w porównaniu z komórkami Tconv, co może wpływać na odtwarzalność i skalowalność procesu wytwarzania i testowania ludzkich limfocytów CAR Treg. Szczegółowo opisując ten protokół i jego niuanse tutaj, staramy się umożliwić innym badaczom powtórzenie i rozwinięcie naszych ustaleń, posuwając naprzód dziedzinę terapii CAR Treg. Przyszłe badania powinny koncentrować się na opracowywaniu CAR dla nowych celów, dostosowywaniu sygnalizacji CAR do specyficznych potrzeb limfocytów Treg, badaniu niewirusowych systemów dostarczania, pogłębianiu naszej wiedzy na temat mechanizmów supresji CAR Treg oraz rozszerzaniu zastosowania tej technologii na różne choroby o podłożu immunologicznym.
LMRF jest wynalazcą i otrzymał tantiemy z patentów na zmodyfikowane komórki odpornościowe oraz konsultuje się z Guidepoint Global i McKesson. Pozostali autorzy deklarują brak sprzecznych interesów.
LMRF jest finansowany przez Human Islet Research Network (HIRN) Emerging Leader in Type 1 Diabetes grant U24DK104162-07, American Cancer Society (ACS) Institutional Research Grant IRG-19-137-20, South Carolina Clinical and Translational Research (SCTR) Pilot Project Discovery Grant 1TL1TR001451-01, Diabetes Research Connection (DRC) Grant IPF 22-1224 oraz Swim Across America Grant 23-1579. RWC jest wspierany przez grant szkoleniowy w zakresie nauk komórkowych, biochemicznych i molekularnych T32GM132055 oraz stypendium Hollings Cancer Center Lowvelo Graduate Fellowship. Badanie to było częściowo wspierane przez Flow Cytometry and Cell Sorting Shared Resource, Hollings Cancer Center, Medical University of South Carolina (P30 CA138313). Specjalne podziękowania dla dr Qizhi Tang z Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Francisco (UCSF) za uprzejme podarowanie zmutowanych plazmidów CAR.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Wirus związany z adenowirusem ( AAV) | Charles River Laboratories | ||
| CAR z ekspresją docelową komórek K562 | , np. CD19-K562 | ||
| promiennik | |||
| Anty-ludzki CD8 PerCP (klon SK1) | Biolegend | 344708 | |
| Anti-human CD4 PE / Cy7 (klon SK3) | Biolegend | 344612 | |
| DynaMag-15 | ThermoFisher | 12301D | |
| Ghost BV510 barwnik żywotności | Komórki TONBO | 13-0870-T100 | |
| K562 | Kolekcja kultur typu amerykańskiego | CCL-243 | |
| 0,5 M EDTA, pH 8,0 | Gibco | ||
| 1 M HEPES | Gibco | 15630080 | |
| roztwór chlorku amonu | STEMCELL Technologies | 7850 | |
| Anty-ludzki CD127 PE (klon hIL-7R-M21) | BD Biosciences | 557938 | |
| Anty-ludzki CD25 APC (klon BC96) | Biolegend | 302610 | |
| Anty-ludzki CD4 FITC (klon SK3) | Biolegend | ||
| Anty-ludzki CD71 PE (klon SK1) | Biolegend | 334106 | |
| Anty-ludzki CD8 PerCP (klon SK1) | Biolegend | ||
| Anty-ludzki CTLA-4 PerCP-e710 | ThermoFisher | 46-1529-42 | |
| Anty-ludzki EGFR APC (klon AY13) | Biolegend | 352905 | |
| Anty-ludzki FOXP3 eFluor 450 | ThermoFisher | 48-4776-42 | |
| Anty-ludzki HELIOS PE | Biolegend | 137216 | |
| Ca2+ oraz Mg2+ wolne Dulbecco" s Sól fizjologiczna buforowana fosforanami (DPBS) | Gibco | 14190144 | |
| Licznik komórek (automatyczny licznik komórek TC20) | komórek Bio-Rad | ||
| Bio-Rad | 1450016 | ||
| CellTrace Zestaw do proliferacji komórek fioletowych | ThermoFisher | C34571 | |
| Probówki DNA LoBind | Eppendorf | 22431021 | |
| Magnes Easy 50 EasySep | STEMCELL Technologies | 18002 | |
| Zestaw do wzbogacania ludzkich limfocytów T EasySep CD4+ | STEMCELL Technologies | 19052 | |
| Zestaw do wzbogacania limfocytów T EasySep Human CD8+ | STEMCELL Technologies | 19053 | |
| Magnes EasySep | STEMCELL Technologies | 18000 | |
| eBioscience Zestaw do barwienia czynnikiem transkrypcyjnym Foxp3 | ThermoFisher | 00-5523-00 | |
| Falcon Probówki z polistyrenu okrągłodennego z zatrzaskiem z sitkiem do komórek, 5 ml | Fisher Scientific | 08-771-23 | 40μ m |
| Płodowa surowica bydlęca (FBS) | Gibco | 26140079 | |
| Cytometr przepływowy | Beckman Coulter | CytoFLEX LX U3-V5-B3-Y5-R3-I2 | |
| Aktywowany fluorescencją sortownik komórek | BD Biosciences | FACS Sortownik komórek Aria III | |
| GlutaMAX | Gibco | 35050061 | |
| Ludzka ekspansja i aktywacja komórek T CD3/28 Dynabeads | Gibco | 11131D | |
| System transfekcji Invitrogen Neon | ThermoFisher | 10431915 | |
| System transfekcji Invitrogen Neon 100 μ L Zestaw | ThermoFisher | 10114334 | |
| Lentivirus | VectorBuilder | ||
| MEM Roztwór aminokwasów endogennych | Przeciwciało Gibco | 11140050 | |
| Myc Tag A647 (klon 9B11) | Technologie sygnalizacji komórkowej | 2233S | |
| Opti-MEM I Zredukowana pożywka w surowicy | ThermoFisher | 31985062 | |
| roztwór penicyny-streptomycyny | Gibco | 15140122 | |
| Rekombinowana ludzka interleukina-2 (rhIL-2) | Peprotech | 200-02 | |
| RPMI 1640 podłoże, bez glutaminy | Gibco | 11875093 | |
| Pirogronian sodu | Gibco | 11360070 | |
| Cytometr spektralny przepływowy | Cytek | Northern | |
| Lights TRAC gRNA | Synthego | Sequence (CAGGGTTCTGGATATCTGT) | |
| TrueCut Cas9 Protein v2 | ThermoFisher | A36496 | |
| Roztwór błękitu trypanowego | Sigma | T8154-100ML | |
| 1/10 Leukopak | STEMCELL Technologies | 200-0092 | 1-2 miliardy PBMC |