Inwazja komórek nowotworowych pozostaje ważnym, ale niedostatecznie zbadanym tematem w kontekście współinwazji komórek odpornościowych, takich jak makrofagi. Zbiorowa i indywidualna inwazja komórek nowotworowych jest krytycznym procesem podczas przerzutów i wykazano, że obniża wskaźnik przeżycia pacjentów z rakiem ze względu na mnogość inwazji różnych narządów 8,9. Badania in vivo są złożone i ograniczają się do laboratoriów z dostępem do pomieszczeń dla zwierząt. Co więcej, trudno jest również kontrolować warunki in vivo lub specyficznie manipulować poszczególnymi aspektami. W związku z tym potrzeba bardziej dostępnego systemu pozostaje niezbędna, aby odpowiedzieć na podstawowe pytania w pierwszej linii badań.
Dzięki przedstawionej tutaj metodzie opracowaliśmy sposób, w jaki i) komórka odpornościowa i ii) zachowanie komórek nowotworowych, iii) wzrost i rozwój stałej sferoidy oraz iv) wpływ komórek w otaczającym mikrośrodowisku guza (TME) na komponenty ECM może być dalej analizowany. Można go wykorzystać do porównania wpływu zmodyfikowanych (np. zubożonych na określone regulatory przez leczenie siRNA) makrofagów na inwazyjność pojedynczych komórek nowotworowych z litej sferoidy. To, czy fizyczna rearanżacja TME, czy wydzielane czynniki stanowi główną przyczynę obserwowanego zachowania komórek nowotworowych, jest obecnie niejasne i wymaga bardziej szczegółowej analizy.
Ponadto również same komórki nowotworowe mogą być manipulowane, na przykład poprzez leczenie siRNA lub nokautowanie określonych regulatorów. Co więcej, analizę można ulepszyć, porównując liczbę zliczonych jąder w obrębie zidentyfikowanego profilu komórkowego, aby umożliwić bardziej precyzyjne określenie atakujących komórek nowotworowych.
Wykorzystaliśmy ten test do określenia wpływu makrofagów w TME na inwazję komórek nowotworowych. Należy jednak również zauważyć, że komórki nowotworowe mogą wpływać na aktywność makrofagów, prawdopodobnie poprzez czynniki wydzielane w pożywce. W związku z tym warto byłoby również podjąć próbę zidentyfikowania zmian w makrofagach, takich jak zmieniony stan polaryzacji (M1 vs. M2) przez barwienie immunofluorescencyjne przy użyciu odpowiednich przeciwciał. W przeszłości porównanie między komórkami rosnącymi w monowarstwach a komórkami hodowanymi w środowisku 3D wykazało znaczące różnice w ich profilach ekspresji10.
Ponadto pouczające może być sortowanie komórek aktywowane fluorescencją (FACS) subpopulacji makrofagów i ich integracja z procedurą eksperymentalną. Wreszcie, co nie mniej ważne, bardziej szczegółowe obrazowanie obszarów kontaktu, w których makrofagi oddziałują z komórkami nowotworowymi lub sferoidalną powierzchnią guza, może doprowadzić do identyfikacji dalszych mechanizmów związanych z inwazją i interakcją 3D.
Warto zauważyć, że nie można go w pełni kontrolować, jest precyzyjne umieszczenie sferoidy w środku studni po dodaniu mieszanki kolagenu. Ilość kolagenu pod sferoidą jest szczególnie trudna do regulacji. W tym przypadku ustalono inne metody, które pozwalają na precyzyjne pozycjonowanie sferoidy, np. na wierzchu form agarozowych o większej liczbie próbek11. Ponieważ jednak uwalnianie cytokin jest powszechnym mechanizmem, wszystkie sferoidy w tym teście wielosferoidalnym są narażone na wydzielane czynniki, a liczba komórek odpornościowych działających na pojedynczą sferoidę jest trudna do kontrolowania.
Jednym z podstawowych ograniczeń tego protokołu jest zdolność linii komórek rakowych do tworzenia jednolitych sferoid, a zatem ma zastosowanie tylko do podzbioru linii komórkowych. Na przykład komórki czerniaka MeWo tworzą nierówne, arkuszowe struktury 3D, ale bez jednolitych sferoid.
Należy również zauważyć, że test jest wysoce elastyczny, ponieważ wiele jego cech można modyfikować, takich jak materiał ECM, liczba komórek lub poprzez dodanie określonych czynników, takich jak cytokiny do supernatantu. W związku z tym powinien on być wysoce odpowiedni do wstępnych badań in vitro interakcji między komórką nowotworową a komórką odpornościową i może być dostosowany do konkretnego pytania badawczego, które jest obecnie przedmiotem konsultacji.