$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Procedura
Powlekanie szkiełek fibronektyną
Przed montażem urządzenia mikroprzepływowego, wysterylizuj szkiełka za pomocą fibronektyny. Pokryj szkiełka biokapturem, aby zachować sterylność. Dopasuj sterylną przekładkę PDMS wzdłuż krawędzi szkiełka i zaznacz stronę skierowaną do góry trwałym markerem. Odpipetować 1 ml roztworu fibronektyny (Sigma) o stężeniu 5 μg/ml wewnątrz przekładki PDMS na całej powierzchni szkiełka podstawowego. Pozostaw szkiełka w spokoju na godzinę, a następnie całkowicie wysusz za pomocą pistoletu N2. Preparaty można przechowywać w temperaturze 4oC do późniejszych eksperymentów.
Montaż urządzenia
Cały protokół montażu urządzenia odbywa się w kapturze biologicznym w sterylnych warunkach, przy użyciu następujących procedur:
- Wyczyść silikonowy master z wzorowanymi na nim mikrokanalikami, przecierając go 70% etanolem i susząc pistoletemN2. Umieść sterylną przekładkę PDMS o wysokości 1 mm za pomocą kleszczy wokół elementów reliefowych mistrza.
- Przygotować żel agarozowy stosowany w urządzeniu, ważąc 0,3 g proszku agarozowego (Fisher Scientific) i 10 ml pożywki niezależnej od CO2 (Invitrogen) w zlewce o pojemności 50 ml. Wymieszaj mieszaninę szpatułką i podgrzewaj w kuchence mikrofalowej przez 20 sekund na WYSOKIM POZIOMIE. Jeśli obecne są nierozpuszczone granulki, podgrzej mieszaninę przez kolejne 10 sekund i zamieszaj gorącą mieszaninę, aby pozbyć się ostatnich pozostałych granulek. Powtórz proces z czasem nagrzewania 8 sekund, a następnie 5 sekund.
- Szybko wylej roztwór agarozy na wzorzec silikonowy otoczony przekładką PDMS i natychmiast przykryj mieszaninę agarozy sterylnym szkiełkiem podstawowym. Wywieraj stały, delikatny nacisk na szkiełko przez około 2 minuty, aby upewnić się, że agaroza zżeluje się na tę samą stałą wysokość 1 mm, co przekładka PDMS.
- Po żelach agarozowych odklej wzorzysty żel agarozowy za pomocą przekładki PDMS z wzorca silikonowego i przenieś do szkiełka pokrytego fibronektyną tak, aby mikrokanaliki w żelu agarozowym były skierowane do szkiełka. Użyj końcówki strzykawki o rozmiarze 16, aby wybić otwory w obszarach zbiornika mikrokanałów dla dostępu wlotowego i wylotowego. Dodaj 500 μl pożywki niezależnej od CO2 do wzorzystego żelu agarozowego na szkiełku, aby zapobiec wysuszeniu mikrokanałów.
- Umyj akrylowy kolektor zastosowany w urządzeniu 70% etanolem i spłucz wodą DI. Wyrównaj otwory w kolektorze z otworami wybitymi w żelu agarozowym z mikrokanalikami. Następnie wyrównaj kolektor z żelem, przekładką PDMS, a szkiełko fibronektynowe z metalową ramką urządzenia. Umieść w urządzeniu i dokręć do oporu za pomocą śrubokręta. Ma to na celu zapewnienie, że urządzenie nie jest zbyt mocno dokręcone do tego stopnia, że odkształcają się mikrokanaliki w agarozie. Dokręć w kolejności zgodnej z ruchem wskazówek zegara, aby upewnić się, że żel wewnątrz urządzenia się nie przesuwa. Przetestuj urządzenie pod kątem wycieków i zatorów w mikrokanalikach za pomocą strzykawki o pojemności 1 ml. Strzykawka jest wyposażona w rurkę Tygon z końcówką pipety z żelem na końcu rurki do wstrzykiwania mediów niezależnych od CO2 do mikrokanałów. Mikrokanał uważa się za pomyślnie utworzony, gdy zaobserwuje się, że media wychodzą z wylotu mikrokanału tylko wtedy, gdy media są wstrzykiwane do odpowiedniego wlotu. Teraz urządzenie jest gotowe do użycia.
Przygotowanie i zasiewanie komórek w urządzeniu
Gdy komórki osiągną 70% zbieżności (gęstość komórek około 100 000 komórek/ml), są przygotowane do wprowadzenia do urządzenia.
Poddaj komórki dwóm myciom DPBS (Invitrogen). Dodaj 200 μl trypsyny-EDTA (Invitrogen), aby odłączyć komórki. Przenieść komórki do probówki wirówkowej o pojemności 15 ml zawierającej 5 ml pożywki M2 zawierającej surowicę w celu dezaktywacji trypsyny. Odwirowywano pożywkę wzrostową z komórkami z prędkością 1000 obr./min przez 5 minut. Odessać z supernatantu i ponownie zawiesić osad komórek 5 ml DPBS. Ponownie odwirować komórki DPBS w tych samych warunkach. Ponownie odessać supernatant i ponownie zawiesić osad komórki w 500 μl pożywki niezależnej od CO2.
Umieść powstałą zawiesinę komórek w centralnym mikrokanale urządzenia za pomocą przepływu napędzanego grawitacją. Dodaj wlot i wylot środkowego mikrokanału odpowiednio 60 μl zawiesiny komórek i 20 μl pożywki niezależnej od CO2. Obserwuj środkowy mikrokanał pod mikroskopią jasnego pola, aby znaleźć adhezję komórek. Komórki zwykle przylegają po 10 minutach. Po tym, jak komórki przylegają do dna kanału o odpowiedniej gęstości, wypipetuj pozostałą zawiesinę komórek na wlocie i pożywkę na wylocie. Umieść 60 μl mediów niezależnych od CO2 zarówno na wlocie, jak i wylocie kanału środkowego. Umieść osłony PDMS nad środkowym wlotem i wylotem, aby zminimalizować parowanie mediów z kanału środkowego.
Obrazowanie komórek w urządzeniu
Przed montażem urządzenia, przeciągnij sterylną rurkę perystaltyczną przez stację pogodową mikroskopu (Olympus X81) i połącz z pompą perystaltyczną (Watson-Marlow 205U/CA). Przepłukać PBS przez rurkę z szybkością 4 obr./min. Po zmontowaniu urządzenia należy przygotować roztwory naskórkowego czynnika wzrostu (EGF) (Sigma) w pożywkach niezależnych od CO2 w probówkach wirówkowych o pojemności 15 ml. Wiruj roztwory EGF przez 5 sekund i połącz z rurką. Podłącz rurki oznaczone odpowiednimi stężeniami EGF do urządzenia. Potrzeba około godziny, aby EGF dyfundował przez grzbiet kanału i tworzył stały gradient chemiczny.
Oprogramowanie do obrazowania, Slidebook, służy do wykonywania zestawu zdjęć co 10 minut przez około 5 godzin w eksperymentalnym przebiegu. Zautomatyzowany stolik x-y jest zaprogramowany w taki sposób, że w danym punkcie czasowym obrazowane są dwa podobszary (każdy o powierzchni 400 μm x 400 μm) tego samego kanału środkowego i łącznie trzy kanały centralne. Ogniwa w różnych kanałach środkowych (zwykle 3 w jednym przebiegu) mają różne stężenia EGF, jak oznaczono na rurce.
Materiały i sprzęt
Linie komórkowe: Komórki C17.2 to NSC pochodzące z zewnętrznej warstwy rozrodczej móżdżku myszy po urodzeniu 6, 7. Korzystając z tej linii komórkowej, opracowaliśmy dwie inne linie mysich komórek macierzystych przy użyciu metody transfekcji retrowirusów. Te dwie stabilnie transfekowane linie komórkowe to (1) wtEGFR - który wykazuje nadmierną ekspresję ludzkiego dzikiego typu EGFR i (2) ΔEGFR - który jest konstytutywnie aktywnym mutantem EGFR. Aby ułatwić wykrycie, retrowirusy przenoszą szkielet z genem będącym przedmiotem zainteresowania, a następnie wewnętrznym miejscem wiązania rybosomalnego (IRES) i białkiem zielonej fluorescencji (GFP).
Hodowla komórkowa: Mysie C17.2 NSC i ich warianty były hodowane na 6-dołkowej płytce w pożywce M2 (DMEM (Invitrogen) z 10% płodowej surowicy bydlęcej (FBS) (Invitrogen), 5% surowicy końskiej (HS) (Invitrogen) i 1% penicyliny/streptomycyny (Invitrogen).) Komórki utrzymywano w temperaturze 37oC w 80% powietrzu i 5% CO2 .
Urządzenie mikroprzepływowe: Plastikowy kolektor, przekładka PDMS i nierdzewna ramka do przytrzymywania urządzenia na miejscu.
Obrazowanie
Używany jest odwrócony mikroskop fluorescencyjny (Olympus IX-81) w połączeniu ze wzmocnioną kamerą CCD (Orca, Hamamatsu). Urządzenie mikroprzepływowe jest zamontowane na zautomatyzowanym stoliku x-y-z, a stopień jest zamknięty w komorze środowiskowej, która utrzymuje temperaturę 37oC. Zwykle na tym samym chipie znajdują się 3-4 urządzenia, które zostaną sfilmowane w tym samym punkcie czasowym za pomocą zautomatyzowanego stolika x-y-z.
Utrzymanie przepływu
Pompa perystaltyczna z 8 równoległymi liniami (Watson-Marlow 205U/CA) auto służy do utrzymywania przepływów we wszystkich kanałach zlewu i źródła.

Rys. 1 Ruchliwość trzech szczepów NSC (rodzicielskiego, wtEGFR i DEGFR) w różnych stężeniach EGF Wszystkie trajektorie pochodzą ze śledzenia filmu trwającego 5 godzin (z wyjątkiem wtEGF 100ng/ml, 4 godziny), a początek wszystkich ścieżek został przesunięty na (0,0) w celach porównawczych.

Rys. 2 Korelacja poziomu ekspresji EGFR i ruchliwości (a) dwa obrazy NSC wtEGF na powierzchni kanału mikroprzepływowego o 100ng/ml EGF. Lewy obraz jest obrazem fluorescencyjnym, a prawy jest przesyłanym obrazem w jasnym polu. Pasek skali wynosi 100 μm, a szerokość kanału wynosi 400 μm. Komórki są rozdzielane na dwie populacje na podstawie jasności wyrażonego GFP. Komórki w niebieskich kółkach są ciemniejsze, a zatem mają mniejszy poziom ekspresji EGFR; a komórki w czerwonych kółkach są jaśniejsze, a zatem mają wyższy poziom ekspresji EGFR. (b) Trajektorie komórek o niskim i wysokim poziomie ekspresji EGFR. Te trajektorie pochodzą z czterogodzinnego filmu.