Cały proces generowania komórek Af-CAR NK-92, obejmujący transfekcję, rekonwalescencję, wzbogacanie oraz ekspansję, trwa około 14 dni. Po transfekcji komórki są hodowane i pasażowane co drugi dzień. Żywotność komórek może spaść podczas pierwszego pasażowania w drugim dniu po transfekcji. Zazwyczaj komórki regenerują się 4 dni po transfekcji i zaczynają proliferować, przy czasie podwojenia wynoszącym 48 h.
Po regeneracji mierzy się wydajność transfekcji, która powinna osiągnąć poziom 10-20% (reprezentatywne wyniki przedstawiono na Rysunku 3). Wzbogacenie populacji komórek EGFR-dodatnich za pomocą MACS zwiększa odsetek komórek Af-CAR NK-92 do ponad 95% (reprezentatywne wyniki przedstawiono na Rysunku 4).
Do analiz funkcjonalnych wykorzystano hodowle zawierające ponad 95% komórek Af-CAR. Przeprowadzono kokulturę komórek z rurkami kiełkowymi A. fumigatus przez 6 h i zmierzono wydzielanie IFN-ɣ jako marker aktywacji. Jak pokazano na Rysunku 5, komórki Af-CAR wykazały znaczną sekrecję cytokin (średnia = 340,6 ± 86,5 pg/mL) w porównaniu do komórek Mock NK-92 (średnia = 75,6 ± 19,5 pg/mL), co wskazuje na istotnie wyższą aktywację komórek Af-CAR (wartość p = 0,03).

Rysunek 1: Kiełki rurkowe Aspergillus fumigatus. Obraz mikroskopowy A. fumigatus po 16 h inkubacji. Zaobserwowano kiełki rurkowe/małe strzępki, rozmieszczone homogenicznie wokół dołka. Pasek skali = 400 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Ko-kultura rurek kiełkowych Aspergillus fumigatus z komórkami NK-92. Obraz mikroskopowy ko-kultury. Komórki NK-92 tworzą skupiska i pozostają w kontakcie z rurkami kiełkowymi A. fumigatus. Pasek skali = 400 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Efektywność transfekcji oceniana poprzez barwienie markera transfekcyjnego EGFR. W 5. dniu po elektroporacji komórki NK-92 barwiono 7-AAD oraz przeciwciałem anty-EGFR. Wyniki przedstawiono dla jednego reprezentatywnego eksperymentu dla (A) komórek Mock oraz (B) komórek Af-CAR NK-92. Lewa kolumna przedstawia wykresy kropkowe wielkości komórek względem ziarnistości komórek; bramka została ustawiona na komórki NK-92. Martwe komórki wykluczono za pomocą znakowania 7-AAD (druga kolumna). Procent żyjących komórek EGFR+ pokazano w trzeciej kolumnie. Skróty: EGFR = receptor naskórkowego czynnika wzrostu; 7-AAD = 7-aminoaktynomycyna D; CAR = chimeryczny receptor antygenowy. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 4: Wyniki barwienia powierzchni komórek po wzbogaceniu populacji komórek NK-92 wykazujących ekspresję transgenu. Po lewej stronie przedstawiono komórki Mock. Po prawej stronie przedstawiono komórki Af-CAR-NK. Czerwone histogramy reprezentują komórki niebarwione. Niebieskie histogramy reprezentują odpowiadające im komórki barwione. Bramka została ustawiona na komórki EGFR+; liczby wskazują procent komórek pozytywnych. Skróty: EGFR = receptor epidermalnego czynnika wzrostu; CAR = chimeryczny receptor antygenowy. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 5: Wydzielanie cytokin przez komórki NK aktywowane przez rurki kiełkowe Aspergillus fumigatus. Diagramy przedstawiają wyniki wydzielania IFN-ɣ przez komórki Af-CAR i Mock w koanalizie z grzybem, zmierzone za pomocą testu ELISA po 6 h koanalizy. Przedstawione dane to średnia ± SD z trzech niezależnie przeprowadzonych eksperymentów (n = 3). Wartość P obliczona testem t Welcha przy użyciu oprogramowania GraphPad Prism 10, * p < 0,05. Skróty: NK = natural killer (komórki NK); IFN-ɣ = interferon gamma; CAR = chimeric antigen receptor (chimeryczny receptor antygenowy); ELISA = enzyme-linked immunosorbent assay (test immunosorpcyjny z enzymem). Aby wyświetlić większą wersję tego rysunku, kliknij tutaj.
| Nazwa | Firma | Stężenie roztworu zapasu | Bibliografia |
| Transpozaza | SB100X Mini Circle | PlasmidFactory | 1 µg/µL | 19 |
| Transpozon | plazmid Af-CAR | Wytworzone wewnątrz jednostki | 1 µg/µL | 6 |
Tabela 1: DNA wykorzystane w tym protokole.
Rycina dodatkowa S1: Mapa plazmidu transpozonu Af-CAR: Schemat wektora plazmidowego i konstrukcji transpozonu CAR. Skróty: EF1 = promotor czynnika elongacyjnego-1 alfa; ORI = bakteryjna sekwencja początku replikacji; LIR = lewa powtórka odwrócona; RIR: prawa powtórka odwrócona; Cyto = cytoplazmatyczny; Tm = transbłonowy. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.