Niniejsze badanie przedstawia wydajną i nienachirurgiczną metodę ortotopowej implantacji kseroprzeniesień raka piersi pochodzących od pacjentów u myszy. Tkankę guza piersi rozdzielono z wykorzystaniem enzymów specyficznych dla ludzi oraz agitacji mechanicznej, resuspensowano w stosunku 1:1 v/v Matrigel: RPMI 1640, a następnie wstrzyknięto ortotopowo do pachwinowych poduszek tłuszczowych gruczołów piersiowych myszy NSG (Rycina 1 i Rysunek 2). Aby zapewnić wierność modeli PDX, zgodność pierwotnej próbki guza pacjenta z guzami pasażowanymi została zweryfikowana przy użyciu uznanych technik histopatologicznych i genomicznych. Ekspresję receptorów określono za pomocą barwienia immunohistochemicznego (IHC) w kierunku standardowych receptorów raka piersi, w tym receptora estrogenowego (ER), receptora progesteronowego (PR) oraz ludzkiego receptora nadwrażliwości naskórkowej czynnika wzrostu 2 (HER2) (Rycina 3). Morfologię komórkową oceniono przy użyciu hematoksyliny i eozyny (H&E) barwienie przekrojów plastrów guza oraz interpretacja zabarwionych preparatów przez doświadczonego patomorfologa. Zachowanie krajobrazu genetycznego oraz obecność ludzkich komórek potwierdzono za pomocą sekwencjonowania całego RNA (bulk RNA-sequencing) oraz analizy krótkich tandemowych powtórzeń (STR) (Rysunek 4 i Tabela 1Dodatkowo badania w kierunku patogenów nie wykazały kontaminacji próbek pobranych od pacjenta ani próbek guza z pasażowania, co stanowi kluczowy etap weryfikacji ze względu na zastosowanie myszy z niedoborem odporności.

Rysunek 1: Przegląd protokołu. Przedstawienie schematu dysocjacji i wstrzykiwania guza. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.
Myszy NSG przygotowano do iniekcji, stosując krem depilacyjny nanoszony naprzemiennymi ruchami zgodnie i przeciwnie do ruchu wskazówek zegara, aby dokładnie usunąć sierść z obszaru pachwinowej poduszki tłuszczowej gruczołu mlekowego (Rysunek 2A). Nadmiar kremu depilacyjnego usunięto z odsłoniętej skóry brzucha za pomocą sterylnej gazy, a następnie obszar ten zdezynfekowano wacikiem nasączonym alkoholem (Rysunek 2B). Sterylną igłę z zawiesiną dysocjowanych komórek nowotworowych ustawiono pod kątem około 45 stopni, 0,5-1 mm ku strony ogonowej względem pachwinowej poduszki tłuszczowej czwartego sutka (Rysunek 2C). Komórki nowotworowe wstrzyknięto w sposób kontrolowany do pachwinowych poduszek tłuszczowych czwartego sutka (Rysunek 2D). Wzrost guza wykrywano początkowo za pomocą palpacji cyfrowej poduszek tłuszczowych. Następnie postęp wzrostu objętości guza monitorowano ilościowo przy użyciu obrazowania rezonansem magnetycznym (MRI) (Rysunek 2E). Zarówno masę ciała (Rysunek 2F), jak i objętość guzów (Rysunek 2G) mierzono co tydzień w celu monitorowania wahań wagi oraz postępu wzrostu objętości guzów. Guzy poddawano ocenie wizualnej w celu monitorowania ewentualnych ran, takich jak owrzodzenia, które mogłyby wymagać przedwczesnego przerwania badania. Pomyślne obustronne przeszczepienie PDX do pachwinowych poduszek tłuszczowych gruczołów mlekowych przedstawiono na Rysunku 2H, a poduszki tłuszczowe po wycięciu guzów pokazano na Rysunku 2I.

Rysunek 2: Przygotowanie myszy, wstrzyknięcie PDX i monitorowanie progresji guza. (A) Podskórne poduszki tłuszczowe gruczołów mlekowych zostały dokładnie wydepilowane. (B) Prezentacja miejsca wstrzyknięcia z wyraźną widocznością docelowych obszarów iniekcji. (C) Pozycja strzykawki na poduszce tłuszczowej, zazwyczaj 0,5-1 mm guzowo względem poduszki tłuszczowej, w zależności od długości igły. Biała strzałka wskazuje docelowy obszar wprowadzenia igły. (D) Przedstawienie wstrzyknięcia dysocjowanych komórek do lewej czwartej pachwinowej poduszki tłuszczowej gruczołu mlekowego. Podczas wstrzykiwania igłę należy trzymać pod kątem około 45 stopni, jak pokazano na rysunku. (E) Reprezentatywny obraz MRI obustronnie wszczepionych guzów w miejscu iniekcji. Guzy zaznaczono na zielono. (F) Reprezentatywna progresja masy ciała w gramach po wstrzyknięciu komórek nowotworowych (n = 5). Ciemnoniebieska linia przedstawia prostą regresję liniową, która jest istotnie różna od zera (p < 0,0001); masa ciała myszy rosła średnio o 22 mg.day-1. Ciemnoniebieskie cieniowanie to 95% przedział ufności, jasnoniebieskie cieniowanie to 95% przedział prognozy, a pomarańczowe linie to podłużne pomiary masy ciała. (G) Reprezentatywna progresja indywidualnych objętości guzów w mm3 po wstrzyknięciu komórek nowotworowych (n = 10). Ciemnoniebieska linia przedstawia regresję wykładniczą; czas podwojenia objętości guza wynosił 19,08 dnia. Ciemnoniebieskie cieniowanie to 95% przedział ufności, jasnoniebieskie cieniowanie to 95% przedział prognozy, a pomarańczowe linie to podłużne pomiary objętości guzów. (H) Pomyślne obustronne wszczepienie komórek PDX do pachwinowych poduszek tłuszczowych gruczołów mlekowych. Zauważalna jest unaczynienie doprowadzające krew do każdego guza. Białe strzałki wskazują guzy. (I) Obszar pachwinowej poduszki tłuszczowej gruczołu mlekowego po wycięciu guzów. (H,I) Jednostki na linijce są podane w cm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
Reprezentatywny model PDX (PEN_056) pochodził od 31-letniej kobiety rasy kaukaskiej z inwazyjnym rakiem piersi w stadium 3A. Guz pierwotny, pobrany z prawej piersi, miał status receptorów ER i PR ujemny oraz HER2 dodatni (ER-PR-HER2+). Barwienie IHC dla receptorów ER, PR i HER2 wykazało zgodność między guzem pacjentki a guzem PDX (Rysunek 3). Niemniej jednak, model PDX wykazuje silniejszą ekspresję HER2, co może wynikać z selektywnego wzrostu komórek HER2+. Ocena patomorfologiczna skrawków barwionych H&E potwierdziła słabo zróżnicowany rak z podobną morfologią i cytologią w próbkach pacjentki oraz PDX (Rysunek 3).

Rysunek 3: Barwienie H&E oraz IHC receptorów. (Lewa kolumna) Barwienie IHC receptorów ER, PR i HER2 oraz barwienie H&E w guzie pacjenta. Barwienia ER i PR nie wykazują wyraźnego obrazu dodatniego, zgodnie z oczekiwaniami. Barwienia HER2 wykazują dodatni wynik dla HER2 (kolor brązowy). (Prawa kolumna) Barwienie IHC receptorów ER, PR i HER2 oraz barwienie H&E w pasażowanej próbce PDX. Barwienie receptorów ściśle przypomina obraz widoczny w próbce pacjenta, choć HER2 wykazuje silniejszą ekspresję po pasażowaniu. Pasek skali: 50 µm; powiększenie: 20x. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
Genotypowanie krótkich powtórzeń tandemowych (STR) potwierdziło >80% podobieństwa w 13 loci autosomalnych zdefiniowanych przez wytyczne konsensusu American Type Cell Culture Collection (ATCC) ASN-0002-2022 oraz w 3 dodatkowych loci (Tabela 1). Sekwencjonowanie całego RNA (RNA-seq) próbki guza pacjenta i modelu PDX potwierdziło równoważne poziomy dopasowania do najnowszej referencyjnej genomu ludzkiego (T2T CHM13v2.0), przy czym odpowiednio 82,3% i 79,1% odczytów zostało dopasowanych. Ponadto guz pacjenta i PDX wykazały silną dodatnią korelację z wartością r Pearsona wynoszącą 0,9559 (Rysunek 4A). Analiza wzbogacenia zestawów genów (GSEA) w porównaniu PDX z guzami pacjenta wykazała, że 10 najważniejszych istotnie wzbogaconych szlaków z biologicznych procesów ontologii genów to przede wszystkim zestawy genów immunologicznych, co sugeruje, że większość wariancji transkrypcyjnej między PDX a guzami pacjenta wynika z braku komórek odpornościowych w próbce PDX (Rysunek 4B).
| D5S818 | D13S317 | D7S820 | VWA | TH01 | AM | TPOX | CSF1PO | D3S1358 | D21S11 | D18S51 | Penta_E | Penta_D | D8S1179 | FGA |
| Guz pacjenta | 12
13 | 8
8 | 8
9 | 17
17 | 9
9.3 | X
X | 8
10 | | 15
16 | 29
31.2 | 16
19 | 12
13 | 14
14 | 10
14 | 21
25 |
| Guz PDX | 13
14 | 8
8 | 8
9 | 17
17 | 9
9.3 | X
X | 10
10 | | 15
15 | 29
29 | 16
19 | 12
13 | 14
14 | 10
14 | 21
25 |
Tabela 1: Uwierzytelnianie za pomocą krótkich tandemowych powtórzeń (STR).

Rycina 4: Korelacja sekwencjonowania RNA i wzbogacenie zestawów genów. (A) Wykres rozrzutu wizualizujący log2 znormalizowaną liczbę odczytów na milion (CPM) dla wszystkich genów z guza pacjenta (oś x) i PDX (oś y). Stwierdzono silną dodatnią korelację, z wartością r Pearsona wynoszącą 0,9559. (B) Wykresy grzbietowe (ridge plots) dla 10 najbardziej wzbogaconych zestawów genów procesów biologicznych ontologii genów przy porównaniu PDX vs. guza pacjenta. Krzywe przedstawiają rozkład wyniku wzbogacenia dla każdego zestawu genów; kolor reprezentuje wartość q FDR dla każdego zestawu genów. Aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny, kliknij tutaj.