W tym miejscu opisujemy protokół konstruowania modelu serca od podstaw w oparciu o tomografię komputerową i prezentujemy go studentom medycyny przy użyciu druku trójwymiarowego (3D) i technologii rzeczywistości mieszanej do nauki anatomii.
Artykuł metodologiczny
W tym miejscu opisujemy protokół konstruowania modelu serca od podstaw w oparciu o tomografię komputerową i prezentujemy go studentom medycyny przy użyciu druku trójwymiarowego (3D) i technologii rzeczywistości mieszanej do nauki anatomii.
Technologia rzeczywistości mieszanej i druk trójwymiarowy (3D) stają się coraz bardziej powszechne w medycynie. W czasie pandemii COVID-19 i bezpośrednio po złagodzeniu obostrzeń wdrożono wiele innowacji w kształceniu przyszłych lekarzy. Pojawiło się również zainteresowanie technikami immersyjnymi i technologią druku 3D w nauczaniu anatomii. Nie są to jednak typowe implementacje. W 2023 roku wydruki 3D i hologramy w technologii mieszanej zostały przygotowane na potrzeby zajęć skoncentrowanych na budowie serca. Służyły one do nauczania studentów, którzy przy wsparciu inżynierów mogli poznać szczegółową budowę serca oraz zapoznać się z nowymi technologiami wspierającymi tradycyjny model uczenia się na ludzkich zwłokach. Studenci uważają tę możliwość za bardzo cenną. W artykule przedstawiono proces przygotowania materiałów do zajęć oraz możliwości dalszej realizacji. Autorzy widzą szansę na rozwój prezentowanych technologii w dydaktyce studentów na różnych poziomach kształcenia oraz uzasadnienie dla coraz powszechniejszego wdrażania.
Technologia druku trójwymiarowego (3D) i rzeczywistość mieszana to coraz powszechniej wykorzystywane zdobycze technologiczne w medycynie. Coraz więcej zastosowań znajduje się nie tylko w codziennej praktyce klinicznej wielu specjalistów z różnych dziedzin, ale także w nauczaniu rezydentów i przyszłych lekarzy, czyli studentów medycyny 1,2,3,4,5,6.
Do drukowania modeli anatomicznych często wykorzystywana jest technologia druku 3D, oferowana głównie przez podmioty komercyjne, jednak rosnące zainteresowanie studentów tego typu przygotowaniem do nauki jest impulsem do wprowadzania innowacji w wydziałach anatomiina uczelniach medycznych7. Preparaty mogą być tworzone w oparciu o dane z atlasów anatomicznych, rysunków i rycin, ale także w oparciu o badania obrazowe takie jak tomografia komputerowa czy rezonans magnetyczny 1,8,9. Możliwe jest drukowanie preparatów anatomicznych na drukarce 3D w różnych skalach, a także możliwe jest użycie kolorów, markerów i innych wariacji w celu zwiększenia dostępności materiału dydaktycznego10,11. Pomimo zwiększonej dostępności materiałów, studenci medycyny w Polsce nie mają szerokiego dostępu do tego typu preparatów, niezależnie od deklarowanej chęci wsparcia obecnego, klasycznego modelu nauczania opartego na preparatyce zwłok ludzkich z dodatkiem nowych technologii, które nie są jeszcze w pełni wdrażane.
Technologia mieszanej rzeczywistości to integracja świata wirtualnego ze światem rzeczywistym. Dzięki goglom, które umożliwiają wizualizację wcześniej przygotowanych hologramów, mogą one być "nakładane" na otaczające obiekty w świecie rzeczywistym12. Hologramy można manipulować w przestrzeni, np. powiększać, zmniejszać lub obracać, dzięki czemu oglądany obraz jest lepiej wizualizowany, dostępny i bardziej użyteczny. Rzeczywistość mieszana jest coraz częściej wykorzystywana przez operatorów w dyscyplinach chirurgicznych, np. kardiochirurgii 3,13, ortopedii 14,15,16,17, onkologii 18. Coraz częściej, zwłaszcza w okresie po pandemii COVID-19, dydaktykami z zakresu podstawowych nauk medycznych interesują się nowe technologie, w tym rzeczywistość mieszana, w celu wdrożenia ich do kształcenia przyszłych lekarzy 19,20,21. Również nauczyciele akademiccy prowadzący zajęcia z anatomii normalnej znajdują przestrzeń do wprowadzania rzeczywistości mieszanej w swojej dziedzinie 22,23,24,25,26. Tworzenie hologramów wymaga badania obrazowego, najczęściej tomografii komputerowej, która jest renderowana i przetwarzana przez inżynierów za pomocą dedykowanego oprogramowania do wersji holograficznej – możliwej do użycia z goglami.
Postanowiliśmy stworzyć przydatne materiały dla studentów do nauki anatomii ludzkiego serca w ramach zajęć z anatomii na pierwszym roku studiów medycznych. W tym celu wykorzystano angio-tomografię komputerową serca, udostępnioną przez Klinikę Kardiologii po uprzedniej całkowitej anonimizacji danych. My, podzieleni na dwa zespoły, stworzyliśmy hologramy i wydruki 3D, które następnie zostały udostępnione uczniom w ramach lekcji pilotażowej. Studenci bardzo dobrze ocenili dostępność i dokładność materiałów, ale szczegółowe opracowanie na ten temat zostanie przedstawione w dalszej części – wyniki są obecnie oceniane.
Pokazujemy tutaj proces tworzenia modeli od tomografii komputerowej do prezentacji gotowych modeli wdrożonych w praktyce dydaktycznej.
Protokół jest zgodny z wytycznymi Komisji Etycznej ds. Badań Naukowych z Udziałem Ludzi Śląskiego Uniwersytetu Medycznego. Dane obrazowe pacjenta zostały wykorzystane po całkowitej anonimizacji.
1. 3D Printing - Segmentacja i rekonstrukcja modelu 3D serca
2. Rzeczywistość mieszana
UWAGA: Przetwarzaj pliki DICOM CT serca na holograficzną reprezentację za pomocą CarnaLife Holo (określanego jako oprogramowanie rzeczywistości mieszanej).
Protokół segmentacji i rekonstrukcji 3D przyniósł dwa podstawowe wyniki treningu anatomii: wydrukowany w 3D model serca i wizualizację 3D MR serca. Wyniki te, które wykorzystują dane CT specyficzne dla pacjenta, zapewniają uczniom uzupełniające narzędzia do angażowania się w praktyczne i wciągające doświadczenia edukacyjne.
Wydrukowany w 3D model serca pozwala uczniom na fizyczną interakcję z namacalną reprezentacją anatomii serca. Model ten prezentuje wyraźne cechy zewnętrzne, takie jak mięsień sercowy, a także struktury wewnętrzne, w tym komory i zawory. W udanych eksperymentach dokładność anatomiczna była wysoka, z dobrze zdefiniowanymi cechami i minimalnymi artefaktami po obróbce końcowej. Rysunek 9 przedstawia w pełni przetworzony model wydrukowany w 3D z wyraźnym rozróżnieniem między mięśniem sercowym a komorami wewnętrznymi. W przypadkach, gdy kontrast w obrazach TK był nieoptymalny, błędy segmentacji prowadziły do niedokładności w modelu, takich jak nieregularne rozmiary komór lub niekompletna struktura zastawek. Problemy te często można było skorygować za pomocą ręcznej interwencji, w tym dodatkowego wygładzania i usuwania artefaktów, jak pokazano na rysunku 10.
Z kolei wizualizacja 3D Mixed Reality oferuje dynamiczne i interaktywne doświadczenie, w którym uczniowie mogą odkrywać serce w przestrzeni wirtualnej. Środowisko MR zapewnia interakcję w czasie rzeczywistym, w tym obracanie, powiększanie i przekroje przez różne płaszczyzny anatomiczne, co pozwala na bardziej szczegółowe zrozumienie złożonych struktur, takich jak tętnice wieńcowe lub ściany przegrody. Udane wdrożenia wizualizacji MR pozwoliły na bardzo dokładne odwzorowanie zarówno anatomii zewnętrznej, jak i wewnętrznej. Jednak nieoptymalne wizualizacje (np. tam, gdzie segmentacja była wadliwa) prowadziły do zniekształconych widoków struktur wewnętrznych, wpływając na realizm modelu MR i skuteczność nauczania (ryc. 11). W przypadku struktur anatomicznych, które są złożone, podejście segmentacyjne może być niewystarczające. Dzięki możliwości renderowania wolumetrycznego możliwe jest uwidocznienie różnych gęstości (reprezentowanych przez jednostki Hounsfielda), które są ważne dla zrozumienia anatomii (ryc.12).
Techniki te oferują solidne, uzupełniające się narzędzia, które zwiększają doświadczenie uczenia się, dostarczając dokładnych i podatnych na manipulację modeli, chociaż ich sukces zależy od jakości segmentacji i rekonstrukcji na początkowych etapach protokołu. Ogólnie rzecz biorąc, wyniki te pokazują skuteczność protokołu w tworzeniu precyzyjnych modeli serca na podstawie specyficznych dla pacjenta danych z tomografii komputerowej. Wyniki te pokazują skuteczność protokołu w tworzeniu precyzyjnych modeli serca na podstawie danych z tomografii komputerowej specyficznych dla pacjenta.
Przeprowadzono wstępne badanie, aby ocenić postrzeganie przez uczniów technologii rzeczywistości mieszanej w edukacji anatomicznej, a w szczególności w poznawaniu struktury serca. W badaniu wzięło udział 106 studentów, którzy pod nadzorem inżynierów potrafili wykorzystać hologramy do celów edukacyjnych. Pod koniec sesji zapytano ich: "Czy technologia rzeczywistości mieszanej pomogła Ci lepiej zrozumieć temat – strukturę serca?" Wszyscy respondenci (100%) odpowiedzieli "tak". Wiedza studentów była oceniana bezpośrednio po sesji za pomocą krótkiego testu pisemnego, który wymagał od nich opisania trzech struktur anatomicznych związanych z morfologią serca. Średni wynik wyniósł 2,037 przy łącznym wyniku 3 (Tabela 1).

Rycina 1: Segmentacja serca w tomografii komputerowej. Widoki osiowe (u góry po lewej), czołowe (u dołu po lewej), strzałkowe (u dołu po prawej) i 3D (u góry po prawej) segmentacji CT w oprogramowaniu 3D Slicer. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Przetwarzanie końcowe. Widoki segmentacyjnych modeli 3D w oprogramowaniu do projektowania prototypów. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Po przetworzeniu końcowym. Widoki segmentacyjnych modeli 3D w oprogramowaniu do projektowania prototypów. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Widok oprogramowania Mixed Reality. Ekran startowy aplikacji. Przejrzysty i dostępny panel logowania. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 5: Wybieranie odpowiednich serii w oprogramowaniu rzeczywistości mieszanej. Wybór dostępnych obrazów tomografii komputerowej do wizualizacji holograficznej. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 6: Opcja nożyczek do wycinania części wizualizacji w oprogramowaniu rzeczywistości mieszanej. Narzędzie, które pozwala dostosować hologram do potrzeb użytkownika w czasie rzeczywistym. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 7: Dostosowywanie kolorów wizualizacji holograficznej w oprogramowaniu rzeczywistości mieszanej. Dodanie kolorów do wizualizacji zwiększa dostępność i przejrzystość hologramów. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 8: Wizualizacje w przestrzeni holograficznej utworzone za pomocą oprogramowania rzeczywistości mieszanej. Trójwymiarowy hologram z podświetlonymi kolorami i znacznikami tomografii komputerowej ułatwiającymi orientację w przestrzeni. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 9: Po przetworzeniu końcowym i podglądzie operacji logicznej "x-ray". Widok modeli 3D na oprogramowaniu do projektowania prototypów. W pełni przetworzony model wydrukowany w 3D z wyraźnym rozróżnieniem między mięśniem sercowym a komorami wewnętrznymi. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 10: Po wycięciu modelu w rzucie czterokomorowym, ostateczny podgląd części wydrukowanej w 3D. Widok modeli 3D na oprogramowaniu do projektowania prototypów. Dodatkowe wygładzanie i usuwanie artefaktów. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 11: Wizualizacja danych CT w oprogramowaniu rzeczywistości mieszanej. Renderowanie powierzchni jest wynikiem nadmiernej segmentacji. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 12: Przykładowa wizualizacja danych z tomografii komputerowej w oprogramowaniu rzeczywistości mieszanej. Renderowanie objętościowe, które wizualizuje różne gęstości. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
| Łączna liczba studentów (n) | 106 | ||
| Liczba uczniów, którzy używali hologramów do celów edukacyjnych (n) | 106 | ||
| Liczba uczniów odpowiadających "TAK" na pytanie: "Czy technologia rzeczywistości mieszanej pomogła Ci lepiej zrozumieć temat – strukturę serca?" | 106 | ||
| Liczba uczniów, którzy odpowiedzieli "NIE" na pytanie: "Czy technologia rzeczywistości mieszanej pomogła Ci lepiej zrozumieć temat – strukturę serca?" | 0 | ||
| Minimalny wynik | 0 | ||
| Maksymalny wynik | 3 | ||
| Średni wynik uczniów, którzy wzięli udział w krótkim teście pisemnym w celu opisania trzech struktur anatomicznych związanych z morfologią serca | 2.037 | ||
| Łączny wynik | 3 | ||
Tabela 1: Wstępne dane badania.
Współczesna anatomia opiera się przede wszystkim na klasycznych, sprawdzonych metodach znanych od setek lat. Zwłoki ludzkie są podstawą kształcenia przyszłych lekarzy, a anatomowie podkreślają ich rolę nie tylko w zrozumieniu budowy ludzkiego ciała, ale także w kształtowaniu postaw etycznych28,29. Rozwój technologii jest ekspansywny nie tylko w codziennych procedurach klinicznych, ale także w dydaktyce, stąd próba wdrożenia druku 3D 7,30,31,32 oraz rzeczywistości mieszanej w nauczaniu anatomii 33,34,35,36. Obecnie praca lekarzy w dużej mierze opiera się na nowoczesnych rozwiązaniach, sprzęcie i szeroko pojętej cyfryzacji, a coraz większy udział automatyzacji, robotyzacji i wdrażania innowacyjnych rozwiązań będzie postępował, biorąc pod uwagę trwający od lat trend.
Uzupełnienie klasycznych form kształcenia o druk 3D, zajęcia z wykorzystaniem mieszanej rzeczywistości, czy ultrasonografii może mieć bardzo pozytywny wpływ na przygotowanie przyszłych lekarzy do zawodu, nie tylko ze względu na możliwość zdobycia większej ilości wiedzy i porównania wizualizacji w różnego rodzaju technikach obrazowania, ale również ze względu na kontakt z nowymi technologiami, zaznajomienie się z ich zastosowaniem, a także danie impulsu do myślenia o nowych zastosowaniach, zwłaszcza w obszarze zainteresowań37.
Przygotowanie modeli w technologii druku 3D, a także hologramów w technologii mixed reality, wymaga większego niż standardowe zaangażowania, zaplanowania ich powstania, a także uzyskania swobody w prowadzeniu zajęć z ich wykorzystaniem. Należy dodać, że są to drogie rozwiązania, zwłaszcza rzeczywistość mieszana, która wymaga urządzeń mogących wyświetlać hologramy (gogle), zaplecza inżynierskiego – w tym aplikacji i jej działania. Druk 3D, ze względu na większą popularność i niższe koszty38, jest łatwiejszy do wdrożenia, ale wymaga zaplanowania zakupu drukarki i filamentu, jeśli dział anatomii chciałby tworzyć od podstaw własne modele oraz oprogramowanie do tworzenia obrazów gotowych do druku z badań obrazowych DICOM.
CarnaLife Holo umożliwia użytkownikom przesyłanie zarówno danych z tomografii komputerowej, jak i wyników segmentacji, zapewniając unikalne podejście rzadko stosowane w dziedzinie MR. Obecne najnowocześniejsze techniki zazwyczaj wizualizują modele 3D przy użyciu renderingu powierzchni na podstawie plików STL lub OBJ39,40. W związku z tym użytkownicy mają dostęp tylko do wyników segmentacji, z ograniczoną możliwością bezpośredniego przeglądania oryginalnych danych. Może to stanowić wyzwanie podczas analizy małych struktur lub patologii, takich jak zwapnienia, gdzie precyzja segmentacji ma kluczowe znaczenie.
Dzięki wizualizacji danych surowych (renderowanie objętościowe) użytkownicy mogą oceniać konstrukcje nie tylko na podstawie geometrii, ale także analizując rozkład jednostek Hounsfielda (gęstości) w konstrukcji. Automatyczna segmentacja serca, powszechna technika, która ułatwia żmudne zadanie ręcznej segmentacji, ma swoje ograniczenia41. Jest ograniczony liczbą struktur, które może segmentować, zwłaszcza w obecności patologii, i wymaga wysokowydajnego sprzętu do wydajnego przetwarzania.
Aby sprostać tym wyzwaniom, zaproponowano połączenie dwóch metod wizualizacji - renderowania objętościowego i renderowania powierzchniowego. To hybrydowe podejście pozwala na jednoczesną wizualizację struktur segmentowych i rozkładu wartości w analizowanych danych, oferując użytkownikom bardziej kompleksowe narzędzie do interpretacji danych.
W przypadku anatomii serca stworzenie modelu 3D jest skomplikowane, ponieważ standardowe narzędzia automatyczne w programie są niewystarczające do wyodrębnienia tkanki serca z pełnego obrazu ze względu na niejednorodność wielkości, kształtu, położenia struktur anatomicznych, obecność artefaktów oraz rozmyte granice (niski kontrast) między sąsiednimi tkankami. Dlatego oprócz segmentacji progowej powinna być wykonywana segmentacja nadzorowana przez lekarza w mechanizmie "slice by slice". Kolejnym etapem jest adaptacja modelu do druku 3D, co obejmuje dalsze usuwanie zniekształceń wynikających z szumów podczas akwizycji obrazu. Po wydrukowaniu modele są delikatnie rozpuszczane w acetonie, aby uzyskać gładszą powierzchnię. Korzystanie przez studentów z gotowych modeli jest proste – analogicznie do oglądania i omawiania preparatów zwłok ludzkich. W przypadku rzeczywistości mieszanej za każdym razem wymagane jest szkolenie z obsługi technologii – prawidłowego mocowania gogli do głowy, a także sterowania głosem i gestami. Ze względu na ograniczoną ilość dostępnego sprzętu nie jest możliwe jednoczesne uczestnictwo większej liczby uczniów. W celu zwiększenia dostępności zobrazowanego materiału wykorzystano markery konkretnych struktur anatomicznych, które ułatwiają szybsze omówienie preparatów – hologramy.
Opanowanie procesu segmentacji i rekonstrukcji 3D w 3D Slicer może być wyzwaniem dla początkujących, ponieważ wiąże się z nauką wielu funkcji i przepływów pracy. Rozwijanie biegłości zazwyczaj wymaga znacznej praktyki i doświadczenia. Z naszych obserwacji wynika, że osiągnięcie zaufania do oprogramowania wymagało około 20-30 godzin dedykowanej pracy, która obejmowała segmentację co najmniej 5-7 różnych modeli serca. 3D Slicer to platforma typu open source, która korzysta z solidnej społeczności internetowej. Oferuje obszerne zasoby do rozwiązywania problemów, fora rozwiązywania problemów oraz bogactwo samouczków i przypadków użycia. Zasoby te ułatwiają proces uczenia się, zapewniając dostępne wskazówki. Ponadto wykorzystanie narzędzi, takich jak duże modele językowe (LLM), w tym ChatGPT lub Gemini, może jeszcze bardziej zwiększyć zrozumienie oprogramowania i jego funkcji. W fazie nauki bardzo korzystny okazuje się dostęp do mentora lub superwizora z doświadczeniem w obrazowaniu medycznym i anatomii. Natychmiastowa informacja zwrotna na temat strategii segmentacji i dokładności przyspiesza rozwój umiejętności i zapewnia utrzymanie precyzji anatomicznej. Początkujący powinni liczyć się z tym, że początkowe próby mogą być czasochłonne i podatne na błędy. Jednak konsekwentna praktyka sprawia, że procesy segmentacji i udoskonalania są znacznie bardziej intuicyjne i wydajne. Ważne jest, aby podejść do tej krzywej uczenia się z cierpliwością, ponieważ stałe zaangażowanie w narzędzie znacznie poprawia szybkość i dokładność.
Krytycznymi etapami przedstawionego protokołu była właściwa segmentacja i ekstrakcja tkanki serca z badania obrazowego w celu stworzenia trójwymiarowego modelu, który jest przydatny w druku 3D i technologiach rzeczywistości mieszanej.
Lekcja anatomii serca z wykorzystaniem druku 3D i technologii mieszanej rzeczywistości została bardzo dobrze przyjęta przez uczniów, a zdecydowana większość uznała wsparcie technologiczne za przydatne – pozwalające na lepsze zrozumienie omawianego tematu. Zdaniem autorów nowe technologie powinny wspierać istniejące, klasyczne rozwiązania dydaktyczne i być coraz szerzej stosowane.
Maciej Stanuch, Marcel Pikuła, Oskar Trybus i Andrzej Skalski są pracownikami MedApp S.A. MedApp S.A. jest firmą produkującą rozwiązanie CarnaLifeHolo.
Badanie zostało zrealizowane w ramach współpracy niekomercyjnej.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Fragmentator 3D | Społeczność slicera | https://www.slicer.org | Wersja 5.6.0 |
| CarnaLifeHolo | MedApp S.A. | https://carnalifeholo.com | Oprogramowanie do wizualizacji 3D |
| Mieszalnik siatkowy | Autodesk Inc. | https://www.research.autodesk.com/projects/meshmixer/ | oprogramowanie do projektowania prototypów |
| Ender 3 | Creality | https://www.creality.com/products/ender-3-3d-printer | Drukarka 3D |
| Cura | UltiMaker | https://ultimaker.com/software/ultimaker-cura/ | Oprogramowanie do druku 3D |
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie