Techniki obrazowania stają się coraz ważniejsze w badaniach nad funkcjami mózgu. Wśród nich mikroskopia laserowa dwufotonowa stała się niezwykle użyteczną metodą, ponieważ umożliwia badanie żywego, nienaruszonego mózgu. Przy odpowiednim przygotowaniu technika ta pozwala na chroniczną obserwację tego samego obszaru kory, od kilku minut do wielu miesięcy. W tym filmie przedstawiamy metodę przygotowania do chronicznego obrazowania mózgu in vivo z wykorzystaniem mikroskopii dwufotonowej. Technika ta została zapoczątkowana przez dr. Karela Svobodę, obecnie badacza w Howard Hughes Medical Institute w Janelia Farm. Preparaty, takie jak ten pokazany tutaj, mogą być wykorzystywane do obrazowania struktury neocortex (np. dynamiki dendrytów i aksonów), rejestracji aktywności neuronalnej przy użyciu barwników wrażliwych na wapń, obrazowania dynamiki przepływu krwi w korze mózgowej lub do badań z zakresu wewnątrzpochodnego obrazowania optycznego. Głębokie obrazowanie neocortex jest możliwe dzięki optymalnemu przeprowadzeniu operacji okna czaszkowego. Praca w możliwie najbardziej sterylnych warunkach w celu uniknięcia infekcji, wraz z zachowaniem szczególnej ostrożności, aby nie uszkodzić opony twardej podczas operacji, pozwoli na uzyskanie trwałych i skutecznych okien czaszkowych przykrytych szkłem.