$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Badanie chorób ośrodkowego układu nerwowego (OUN) jest notorycznie trudne ze względu na złożone, wielokomórkowe sygnalizowanie międzykomórkowe pośredniczone przez płyn śródmiąższowy (ISF)1,2,3,4. Ta złożoność jest szczególnie widoczna w guzach mózgu, takich jak glejak (GBM), gdzie sygnały międzykomórkowe są przekazywane zarówno między komórkami nowotworowymi, jak i stromalnymi 5,6,7,8,9. W wielu przypadkach nienaturalna wymiana różnorodnych biocząsteczek, w tym metabolitów i białkowych przekaźników, przyczynia się do ukształtowania pierwotnej etiologii patologii OUN. To wyzwanie badawcze jest szczególnie spotęgowane, zwłaszcza w GBM, przez fakt, że skład molekularny ISF jest czasowo dynamiczny i ewoluuje w trakcie postępu choroby oraz w odpowiedzi na leczenie interwencyjne10,11.
Tradycyjne przedkliniczne metody badań GBM obejmują badania in vitro oraz modele zwierzęce z pojedynczym punktem końcowym. Charakter tych podejść ogranicza ich szerszą użyteczność kliniczną ze względu na niezdolność do uchwycenia zarówno cech mikrośrodowiska guza, jak i podłużnych zmian czasowych. Postępy wprowadzone na początku lat 80. przezwyciężyły te ograniczenia kontekstowe dzięki rozwojowi mikrodializy intracerebralnej (cMD)12,13,14,15. Od momentu powstania 45 lat temu, cMD ugruntował swoją pozycję jako standardowa metoda podłużnego pobierania próbek płynu śródmiąższowego (ISF)w żywym mózgu. Osiąga się to poprzez swobodną dyfuzję i konwekcję wysokostężeniowych substancji rozpuszczonych ISF przez błonę półprzepuszczalną do stale płynącego, niskostężeniowego perfuzjatu, zazwyczaj sztucznego płynu mózgowo-rdzeniowego (aCSF)17. Te półprzepuszczalne membrany składają się z różnych biokompatybilnych polimerów o typowych granicach wielkości porów o masie molekularnej w zakresie od 20 kDa do 3 MDa18. Ten minimalnie inwazyjny zabieg umożliwia podłużne zbieranie in situ różnorodnych analitów, od małych cząsteczek, takich jak metabolity czy neuroprzekaźniki, po duże białka, takie jak przeciwciała. Jednak porowatość strukturalna membran cMD w połączeniu z adsorpcyjnym charakterem polimerów składowych może znacząco wpływać na względny odzysk analitów o określonych cechach biochemicznych lub wymiarowych, takich jak lipidy lub przeciwciała, odpowiednio19,20.
Postępy w celu przezwyciężenia tego ograniczenia błon cMD rozpoczęły się na początku lat 2010. wraz z opracowaniem mózgowej mikroperfuzji otwartego przepływu (cOFM)21. Działając na podobnych ogólnych zasadach co cMD, cOFM usuwa ograniczenia biochemiczne narzucone przez błony półprzepuszczalne, zamieniając je na sonda z siatką plastikową o niskiej adsorpcji o otworach makroskopowych o rozmiarze około 100 μm20. Wiele raportów wykazało poprawę użyteczności cOFM nad cMD dzięki zbieraniu wykrywalnych składników ISF, w tym hormonów peptydowych, nanociał/przeciwciał, małych lipofilowych terapii oraz liposomów PEGylowanych 19,22,23,24,25 . Wcześniejsze raporty analizujące fizjologiczną reakcję tkanek na implantację sondy prowadzącej cOFM pokazują, że integralność bariery krew-mózg zostaje przywrócona do 15 dni po implantacji, a blizny glejowe nie powstają do 30 dni po implantacji,26 dni. Dzięki zastąpieniu błon mikrodializujących otworami makroskopowymi, badacze wykazali również innowacyjną zdolność sond prowadzących cOFM do ułatwiania wstrzyknięcia ksenprzeszczepionych komórek glejaka do mózgów szczurów niedoborowych odporności, tak aby aurazowe wszczepienie i wzrost guza zachodziły bezpośrednio w okolicach obszaru pobierania próbekcOFM 27.
Rozważania dotyczące stosowania cOFM w badaniach patologii OUN muszą nadal uwzględniać jego ograniczenia metodologiczne. Ze względu na uzależnienie od pasywnej dyfuzji i konwekcji analitów ISF w płynący perfuzat, ograniczenia te dotyczą stężenia analitu i objętości próbki18. Próbkowane składniki ISF zostaną rozcieńczone w zebranym perfuzacie cOFM w porównaniu do poziomów endogennych, co skłoniło wiele badań do porównania względnych proporcji analitów między warunkami eksperymentalnymi28. Typowe przepływy wahają się od 0,1 μL/min do 1,0 μL/min, co odpowiada zaledwie 6 μL/h do 60 μL/h. Uwzględniając czas przejścia w martwej przestrzeni rur, należy również uwzględnić całkowity czas próbki. Jest to szczególnie ważne podczas pobierania cOFM u zwierząt znieczulonych, gdzie kwestie dobrostanu zwierząt muszą być starannie uwzględniane. Bardziej szczegółowy opis tych i innych kwestii jest dostępny w wcześniejszym raporcie metodycznym zespołu rozwojowego cOFM29.
W tym manuskrypcie przedstawiamy zaktualizowany protokół stosowania podłużnego pobierania próbek cOFM w badaniach chorób neurologicznych, ze szczególnym uwzględnieniem GBM. Protokół obejmuje etapy wszczepienia kaniuli przewodniczej cOFM, wstrzyknięcia komórek nowotworowych oraz wszczepienia za pomocą przewodnika cOFM, a także dwie konfiguracje pobierania próbek cOFM u zwierząt obudzonych, swobodnie poruszających się. Przedstawiamy reprezentatywne dane pokazujące efekty leczenia na metabolomiczne i proteomiczne składniki ISF mierzone przez cOFM, wpływ konfiguracji próbkowania na stężenia analitów oraz skuteczność implantacji komórek nowotworowych prowadzonej przez cOFM.