Wszystkie procedury na zwierzętach zostały zatwierdzone przez Komitet ds. Opieki i Wykorzystania Zwierząt Instytucjonalnych (numer protokołu: IACUC-2024-FK-007) i przeprowadzone zgodnie z Oświadczeniem Association for Research in Vision and Ophthalmology dotyczącym wykorzystania zwierząt w badaniach okulistycznych i wzrokowych. Samce myszy C57BL/6, w wieku 8-10 tygodni i ważące 20-25 g, były trzymane w indywidualnie wentylowanych klatkach w kontrolowanych warunkach środowiskowych 22 ± 2 °C i wilgotności względnej 50%-60%, z cyklem światła i ciemności 12:12 godzin. Te konkretne zwierzęta wolne od patogenów zostały pozyskane w Charles River Laboratories (patrz Tabela materiałów). Wszystkie myszy przeszły tygodniowy okres aklimatyzacji, aby przystosować się do nowego środowiska przed eksperymentalnymi procedurami, z nieograniczonym dostępem do standardowego jedzenia dla gryzoni i wody.
UWAGA: Aspergillus fumigatus to patogen wymagający zabezpieczenia biologicznego poziomu 2. Wszystkie hodowle grzybów muszą być obsługiwane w certyfikowanej szafce bezpieczeństwa biologicznego, z użyciem odpowiedniego sprzętu ochronnego, w tym rękawiczek, fartuchów laboratoryjnych i ochrony oczu. Dimetylosiarczek (DMSO) jest łatwopalny i może przenikać przez skórę; Obchodzić się w dobrze wentylowanych pomieszczeniach i unikać bezpośredniego kontaktu. Ketamina i ksylazyna to substancje kontrolowane, wymagające bezpiecznego przechowywania i odpowiedniej dokumentacji zgodnie z przepisami instytucjonalnymi.
Przygotowanie eksperymentalne
Wszystkie wymagane odczynniki, leki i materiały zostały przygotowane zgodnie z eksperymentalnym procesem pracy (zobacz Tabelę materiałów oraz Ilustrację Uzupełniającą 1 dla schematu). Roztwory racemiczne (±)-α-lipoowe (LA) przygotowywano przy użyciu racemicznego kwasu α-liponowego (1,2-ditiolanu-3-pentanoinowego) rozpuszczonego w DMSO do stężenia 60 mM i przechowywanego w jednorazowych alikwotach w temperaturze -80 °C, aby zapobiec rozkładowi oksydacyjnemu. Inhibitor Nrf2 ML385 oraz inhibitor HO-1 SnPPIX zostały podobnie przygotowane i alicytatowane do jednorazowego użycia, aby uniknąć cykli zamrożenia i rozmrażania. Wszystkie podłoża i suplementy do hodowli komórkowej przygotowywano w warunkach sterylnych i przed użyciem podgrzewano do 37 °C.
Wszystkie materiały skażone kulturami grzybowymi, w tym płytki agarowe, rurki hodowlane i jednorazowe plastiki, były autoklajowane w temperaturze 121 °C przez 30 minut przed utylizacją w pojemnikach na odpady biohazardowe. Odpady chemiczne zawierające rozpuszczalniki organiczne były zbierane osobno i utylizowane zgodnie z instytucjonalnymi protokołami zdrowia i bezpieczeństwa środowiskowego. Tkanki i tusze zwierzęce były spalane za pośrednictwem zatwierdzonych usług odpadów biomedycznych.
Hodowla grzybów i przygotowanie do infekcji
Aspergillus fumigatus był hodowany na agarze dekstrozy Sabouraud w temperaturze 37 °C przez 5-7 dni, aż zaobserwowano dojrzałe konidium. Konidia były zbierane przez zalewanie dojrzałych hodowli bezpłodną solą fizjologiczną (PBS) zawierającą 0,05% Tween-80, a zawiesiny konidiów filtrowano przez sterylną gazę w celu usunięcia fragmentów strzępków. Stężenie konidiów zostało określone za pomocą hemocytometru i dostosowane do ustalonych stężeń na podstawie opublikowanych modeli grzybowego keratitis. Do eksperymentów in vitro wybrano 1 x 106 konidiów/mL (wielokrotność zakażenia 10:1) na podstawie wcześniejszych badań wykazujących, że to stężenie wywołuje silne reakcje zapalne w komórkach nabłonka rogówki, jednocześnie utrzymując odpowiednią żywotność komórek dla dalszych analiz16,17. Do badań in vivo wybrano 1 x 107 konidiów/mL, ponieważ szczepionka ta powoduje stałe, umiarkowanie nasilone zapalenie rogówki z powtarzalnymi wynikami choroby do 5. dnia po zakażeniu, zapewniając wystarczający zakres dynamiczny do oceny skuteczności terapeutycznej bez nadmiernej śmiertelności16,19.
Leczenie zwierząt i infekcje rogówki
Pod znieczuleniem ogólnym (podanie ketaminy 100 mg/kg i ksylazyny 10 mg/kg) keratitis grzybicze wywoływano przez wykonanie trzech liniowych rys o średnicy 1 mm na środkowej rogówce za pomocą sterylnej igły 25G, po czym nastąpiło miejscowe zastosowanie 5 μL zawiesiny konidialnej A. fumigatus . Myszy zostały losowo przydzielone do grup leczenia (n=8 na grupę): kontrolne (niezakażone), kontrolne zakażone, zakażone + LA leczone (60 μmol/L miejscowo 4 razy dziennie) oraz zakażone + LA + leczenie SnPPIX (LA plus 5 mg/kg SnPPIX dootrzewkowo dziennie). Ocena kliniczna i pobranie tkanek przeprowadzono 5. dnia po zakażeniu.
Środki ostrożności dotyczące obchodzenia się ze zwierzętami: Wszystkie procedury z unieczulonymi zwierzętami powinny być wykonywane w warunkach aseptycznych. Monitorowanie zwierząt w trakcie znieczulenia w celu uzyskania depresji oddechowej. Utylizacja skażonej pościeli, odpadów chirurgicznych i zakażonych tkanek poprzez autoklawowanie, a następnie spalenie zgodnie z procedurami zarządzania odpadami biologicznymi z zagrożeniem biologicznym.
Hodowla komórek i leczenie
Ludzkie komórki nabłonkowe rogówki (HCEC) zostały pobrane z ATCC i utrzymywane w medium DMEM/F-12, uzupełnionym o 10% surowicę płodową bydła, 1% penicylin-streptomycynę oraz 1% L-glutaminę w stężeniach równomokrotnych w 37 °C w nawilżonej atmosferze 5% CO₂. Komórki były subhodowane co 3-4 dni po osiągnięciu 80%-90% zbiegu i wykorzystywane między przejściami 3-8, aby zapewnić spójność. W przypadku eksperymentalnych zabiegów komórki zasiano w odpowiednich płytkach w rozmiarach 5 x 10⁴ komórek na dołek i pozostawiano do przylegania przez 24 godziny przed zabiegiem. We wszystkich eksperymentach mechanistycznych in vitro komórki najpierw były wystawione na działanie konidiów Aspergillus fumigatus w wielokrotności zakażeń (MOI) 10:1 przez 4 godziny, aby ustalić infekcję, a następnie dodano LA (60 μM), ML385 (5 μM) lub SnPPIX (1 μM) samodzielnie lub w połączeniu przez dodatkowe 24 godziny przed pobraniem próbki. Taki sekwencyjny projekt pozwala ocenić terapeutyczne działanie LA na ustalone problemy grzybiczne, a nie na leczenie profilaktyczne.
Ocena żywotności komórek (analiza CCK-8)
Żywotność komórek oceniano za pomocą zestawu Cell Counting Kit-8 (CCK-8). Komórki zostały zasiane w płytkach 96-dołkowych o pojemności 5 x 10 po4 komórki na dołek i inkubowano przez 24 godziny przed zabiegiem. Po ekspozycji na lek do każdego dołku dodawano 10 μL roztworu CCK-8, a płytki inkubowano przez 2 godziny w temperaturze 37 °C. Absorpcję zmierzono na poziomie 450 nm za pomocą wielomodowego czytnika mikropłyt. Każdy warunek eksperymentalny wykonywano w oktuplikacie, a eksperymenty powtarzano trzy razy niezależnie. Stężenie kontroli pojazdu (DMSO) utrzymywano poniżej 0,1%, aby uniknąć efektów cytotoksycznych.
Ekstrakcja RNA i ilościowe PCR w czasie rzeczywistym
Całkowite RNA zostało wyizolowane z komórek hodowli i tkanek rogówki za pomocą zestawu RNeasy Mini Kit zgodnie z protokołem producenta. Próbki tkanek były homogenizowane w buforze RLT przy użyciu homogenizatora tkanek przez 2 minuty przy częstotliwości 50 Hz. Jakość i stężenie RNA oceniano za pomocą spektrofotometru, a do analizy końcowej użyto próbek o stosunku 260/280 1,8-2,0. Synteza cDNA pierwszej nici została przeprowadzona za pomocą zestawu do transkrypcji odwróconej cDNA o wysokiej pojemności z łączną ilością 1 μg RNA na reakcję. Ilościowe PCR przeprowadzono przy użyciu SYBR Green-based qPCR master mix na systemie PCR w czasie rzeczywistym, z początkową denaturacją w 95 °C przez 2 minuty, a następnie 40 cyklami 95 °C przez 15 sekund i 60 °C przez 1 minutę. Przeprowadzono analizę krzywej topnienia w celu weryfikacji specyficzności amplikonu. Wszystkie sprężarki zostały zweryfikowane pod kątem efektywności (90%-110%) oraz swoistości przed użyciem. Relatywna ekspresja mRNA została obliczona metodą 2(-ΔΔCT) z genem referencyjnym GAPDH .
Ekstrakcja białek i analiza Western blot
Do całkowitej ekstrakcji białka komórki i tkanki były lizowane w buforze RIPA wzbogaconym koktajlami inhibitorów proteazy i fosfatazy. Frakcje białek jądrowych i cytoplazmatycznych przygotowywano przy użyciu jądrowych i cytoplazmatycznych odczynników ekstrakcyjnych NE-PER zgodnie z protokołem producenta. Stężenia białek zostały określone za pomocą testu Bradforda. Równe ilości białka (30-50 μg) zostały rozdzielone przez SDS-PAGE i przeniesione do membran PVDF. Po zablokowaniu 5% mleka beztłuszczowego w soli fizjologicznej z buforem Tris zawierającym 0,1% Tween-20 przez 1 godzinę, błony były inkubowane z pierwotnymi przeciwciałami przez noc w temperaturze 4 °C, a następnie przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej stosowano odpowiednie przeciwciała wtórne sprzężone z HRP. Pasma białkowe były wizualizowane za pomocą zwiększonego odczynnika chemiluminescencyjnego o czasie ekspozycji 30-180 s, w zależności od natężenia sygnału. Pasma były ilościowo określane za pomocą oprogramowania ImageJ, gdzie β-aktyna służyła jako kontrola obciążenia dla białek całkowitych, a lamina B1 dla białek jądrowych.
Ocena kliniczna i analiza histologiczna
Nasilenie choroby rogówki oceniano za pomocą standaryzowanego systemu oceny klinicznej opartego na ustalonych protokołach dla grzybiczego keratitisu myszy22. System oceniający ocenia trzy parametry w skali 0-4: przezroczystość rogówki (0 = przezroczysta, 4 = całkowicie nieprzezroczysta), nieregularność powierzchni (0 = gładka, 4 = ciężka wrzodza z perforacją) oraz odpowiedź zapalna (0 = brak nacieku, 4 = gęsta infiltracja z hipopyoną), co daje łączną liczbę punktów od 0 do 12. Wszystkie oceny kliniczne przeprowadzali dwaj niezależni obserwatorzy, którzy byli przydzieleni do grup leczenia, przy czym zgoda między obserwatorami przekraczała 90%. Zdjęcia rogówki zostały wykonane za pomocą biomikroskopu z lampą szczelinową wyposażonego w aparat cyfrowy. Do analizy histologicznej oczy były enukleowane, utrwalane w 4% paradehydu, osadzane w pararafinie i przecinane z grubością 5 μm. Przekroje były barwione hematoksyliną i eozyną w celu ogólnej oceny morfologii.
Test immunosorbentny związany z enzymami (ELISA)
Wydzielane poziomy IL-1β i TNF-α w supernatantach hodowli komórkowych oraz homogenatach tkanek rogówki były ilościowo określane za pomocą komercyjnych zestawów ELISA zgodnie z instrukcjami producenta. Supernatanty hodowli komórkowych pobrano po 24 godzinach leczenia, natomiast tkanki rogówki zostały ujednolicone w PBS zawierającym inhibitory proteazy. Próbki były wirowane w 12 000 x g przez 10 minut w temperaturze 4 °C, a do analizy ELISA użyto supernatantów. Wszystkie próbki zostały przeanalizowane w duplikacie, a stężenia cytokin obliczono na podstawie standardowych krzywych.
Analiza statystyczna
Wszystkie eksperymenty przeprowadzono z odpowiednimi biologicznymi replikacjami (n ≥6 dla badań in vitro , n =8 dla badań na zwierzętach) i powtórzono co najmniej 3 razy niezależnie. Dane przedstawiane są jako średnia ± błąd standardowy średniej (SEM). Analiza danych została przeprowadzona przy użyciu GraphPad Prism w wersji 9.0. Konkretnie wykorzystaliśmy funkcję testu normalności (Shapiro-Wilk) do oceny rozkładu danych, jednokierunkowy test ANOVA z testem wielokrotnych porównań Tukeya dla eksperymentów z więcej niż dwiema grupami oraz niesparowany test Studenta do porównań dwóch grup. Wykresy były generowane jako zgrupowane wykresy słupkowe z poszczególnymi punktami danych nakładanymi jako wykresy rozrzutowe, przy czym słupki błędu reprezentowały standardowy błąd średniej.