Pierwsza kluczowa wskazówka do izolowania dużej liczby włókien mięśniowych z mięśnia płaskiego łydki (SOL) to zachowanie integralności strukturalnej mięśnia podczas dysekcji. Jeśli epimyzjum SOL zostanie rozerwane lub jeśli mięsień zostanie siłkowato wyciągnięty, szczególnie wzdłuż jego osi podłużnej, podczas dysekcji, wydajność izolacji zostanie poważnie naruszona. Błędy tej dysekcji są zwykle łatwe do zidentyfikowania później. Rzeczywiście, po trawieniu kolagenazą, mięsień staje się jednolicie skurczona i tworzy białą, zwartą masę. W takich warunkach, tylko bardzo niewielka liczba żywotnych włókien może zostać rozdzielonych.
Drugim decydującym czynnikiem dla pomyślnej izolacji płaskiego łydki jest wydajność trawienia kolagenazą typu I. Kiedy kolagenaza działa optymalnie, podczas pierwszych 10 sesji płukania można uzyskać około 100–200 włókien płaskiego łydki. W przeciwieństwie do tego, gdy trawienie jest nieoptymalne, nawet po pierwszych 20 płukaniach, może zostać uwolnionych mniej niż 50 włókien. Aby uzyskać wyższą wydajność włókien, wymagane jest bardziej energiczne płukanie i dodatkowe cykle płukania. Jednakże, ponieważ włókna SOL są wyjątkowo kruche, często prowadzi to do kurczenia się włókien podczas płukania.
Do ustanowienia czystej kultury pierwotnych mioblastów pochodzących z SOL, ponownie trawienie kolagenazą odgrywa kluczową rolę. Gdy trawienie jest wydajne, mniejsza liczba włókien pozostaje przyczepionych do pozostałego tkanki i przeniesienie włókien do środowiska kulturowego powoduje minimalne skażenie fibroblastami. W przeciwieństwie do tego, gdy SOL jest słabo strawiony, dysocjatowane włókna pozostaną przyczepione do pozostałej tkanki, zanieczyszczając kulturę mioblastów fibroblastami. Badacze powinni szukać typowych znaków skażenia fibroblastami w zasiewianych próbkach komórek; obejmują one znacznie większy rozmiar komórek i rozległe wypustki cytoszkieletu, w porównaniu z znacznie mniejszymi, wrzecionowatymi komórkami satelitarnymi w przyczepionych naczyniach pokrytych Matrigel. Jeśli wystąpi skażenie, badacze mogą poddać komórki krokom pre-plating, jak opisano gdzie indziej45. Krótko mówiąc, SC są kultywowane przez 3 dni po izolacji, a następnie trypsynowane i krótko pre-plating na pokrytych kolagenem naczyniach. Podczas 15–30 min inkubacji, fibroblasty przywierają, podczas gdy SC pozostają w zawieszeniu i są przenoszone do świeżych naczyń pokrytych Matrigel.
Jak wspomniano powyżej i zgodnie z naszym doświadczeniem, włókna SOL są dłuższe i bardziej kruche niż włókna z mięśnia przedłużacza długiego palców (EDL) i mięśnia zginacza krótkiego palców (FDB). To sprawia, że przenoszenie włókien za pomocą pipet Pasteur jest wyzwaniem. Istotne jest aspirowanie włókien wzdłuż ich osi podłużnej, a nie ciągnięcie ich od środka; w przeciwnym razie włókna składają się i kurczą pod wpływem stresu. Oprócz decydujących czynników, które bezpośrednio decydują o sukcesie izolacji włókien, kilka dodatkowych kroków technicznych jest istotne dla poprawy wydajności włókien płaskiego łydki. Jednym z nich jest pokrycie wszystkich pipet Pasteur, naczyń i probówek kolekcjonerskich 5% BSA. Zapobiega to przywieraniu świeżo dysocjowanych włókien mięśniowych do powierzchni, zapobiegając tym samym zginaniu włókien i późniejszemu kurczeniu się. Zaleca się przygotowanie nowych, wysterylizowanych w cieple, pokrytych BSA pipet Pasteur za każdym razem, gdy wyizolowane są próbki mięśniowe. Alternatywnie, badacze mogliby przygotować zestaw pipet Pasteur do długotrwałego użytku. Jeśli tak, każdorazowo wysterylizować w cieple i świeżo pokryć BSA przed użyciem.
Konwencjonalny protokół izolacji pojedynczych włókien mięśniowych był pierwotnie zoptymalizowany dla mięśni glikolitycznych, takich jak FDB i EDL37. Jednakże, mięśnie utleniające, takie jak SOL, są strukturalnie odmienne. Analizy transkryptomowe wykazały, że ekspresja genów związanych z zewnątrzkomórkową matrycą (ECM) różni się między SOL a EDL46, w tym geny takie jak dystrofina, białko łączące cytoszkielet mięśnia szkieletowego44. W konsekwencji, standardowa wartość trawienia mięśnia EDL z 0,2% (2 mg/mL) kolagenazą przez 60–90 min nie jest optymalna dla mięśni SOL, co prowadzi do zwartych pakietów włókien lub skurconych włókien po trawieniu. W niniejszym badaniu zoptymalizowano kilka kluczowych kroków, aby dostosować protokół dla utleniających mięśni SOL. Poprzez dostosowanie stężenia kolagenazy typu I do 0,5% (5 mg/mL), wydłużenie okresu inkubacji do 130 min i minimalizowanie stresu mechanicznego podczas płukania, można spójnie uzyskać 300–500 nienaruszonych włókien z jednego myszy. W porównaniu z EDL, liczba włókien i wydajność próbek SOL pozostaje mniejsza (EDL może dać > 500 włókien); niemniej jednak, liczba włóki