To badania obejmowały tylko udokumentowane komórki komercyjne i nie obejmowały udziału ludzi, próbek klinicznych ani eksperymentów na zwierzętach. Dlatego nie była wymagana zgoda instytucjonalnego komitetu etycznego ani zgoda na udział. Wszystkie eksperymenty przeprowadzono zgodnie z instytucjonalnymi wytycznymi dotyczącymi bezpieczeństwa laboratorium. Niebezpieczne odczynniki były obsługiwane w wyznaczonych kapturach wentylacyjnych, stosując odpowiednie środki ochrony osobistej (PPE). Odpady chemiczne i biologiczne były niszczone zgodnie z instytucjonalnymi regulacjami. Substancje chemiczne, zestawy i odczynniki użyte w protokołach są wymienione w Tabeli Materiałów.
1. Hodowla komórek
Komórki makrofagów muryny RAW264.7, ludzkie komórki raka szyjki macicy HeLa i ludzkie komórki nerki zarodkowej HEK293T zostały zakupione od Banku Komórek Chińskiej Akademii Nauk (Szanghaj, Chiny). Wszystkie komórki były utrzymywane w pożywce Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) zawierającej 10% fetalnego surowicy bydlęcej (FBS) i 1% penicyliny-streptomycyny. Środowisko hodowlane było ustawione na 37 °C z 5% CO₂ i nasyconą wilgotnością.
2. Ocena żywotności komórek
Żywotność komórek została oszacowana za pomocą zestawu Cell Counting Kit-8 (CCK-8). Komórki RAW264.7 (2,5 × 104 komórek/dołkiem) zostały zasadowe na 96-dołkowych płytkach i hodowane przez noc w 37 °C. Następnie komórki były traktowane różnymi stężeniami XTT przez 24 h z lub bez LPS (0,5 µg/mL). Stężenie LPS i czas trwania leczenia zostały zoptymalizowane w wstępnych eksperymentach, aby wywołać umiarkowaną reakcję zapalną bez wywoływania istotnej cytotoksyczności. Następnie do każdego dołka dodano 10 µL odczynnika CCK-8, a płytka była utrzymywana w 37 °C przez 2 h. Absorbancję mierzono przy 540 nm za pomocą czytnika płytek.
3. Oznaczanie stężeń NO i PGE₂ w pożywce hodowlowej
Komórki RAW264.7 zostały zasadowe na 24-dołkowych płytkach z gęstością 2,5 × 105 komórek/dołkiem i hodowane przez noc w 37 °C. Komórki były wstępnie traktowane XTT przez 2 h przed stymulacją LPS lub TNF-α (15 ng/mL) przez kolejne 24 h. 2-godzinny okres wstępnego traktowania został wybrany, aby umożliwić odpowiednią interakcję XTT z celami komórkowymi przed wyzwaniem zapalnym. Stężenia tlenku azotu (NO) i prostaglandyny E₂ (PGE₂) w pożywce hodowlowej zostały określone zgodnie z protokołami producenta.
4. Ilościowa czasoprzestrzenna reakcja łańcuchowa polimerazy (qRT-PCR)
Komórki RAW264.7 (2 × 106 komórek) zostały zasadowe na 6-dołkowych płytkach przez noc i wstępnie traktowane różnymi dawkami XTT przez 2 h przed wyzwaniem LPS (0,5 µg/mL) przez 24 h. Łączna ilość RNA została wyizolowana za pomocą odczynnika TRIzol zgodnie z instrukcjami producenta. Stężenie RNA i czystość zostały oceniane za pomocą spektrofotometru, a próbki z współczynnikami A260/A280 >1,8 zostały wykorzystane do dalszych analiz.
Łączna ilość RNA (2 µg) została odwrotnie transkrybowana na cDNA w końcowej objętości reakcji 20 µL za pomocą zestawu do syntezy cDNA. Ilościowa czasoprzestrzenna PCR została przeprowadzona z zastosowaniem chemii SYBR Green na systemie wykrywania PCR czasoprzestrzennej. Sekwencje primerów przedstawiały się następująco:
iNOS do przodu: 5′-GGA TCT TCC CAG GCA ACC A-3′
iNOS wspak: 5′-AAT CCA CAA CTC GCT CCA AGA TT-3′
COX2 do przodu: 5′-CAA CAC CTG AGC GGT TAC-3′
COX2 wspak: 5′-GTT CCA GGA GGA TGG AGT-3′
IL-1β do przodu: 5′-GCC TTG GGC CTC AAA GGA AAG AAT C-3′
IL-1β wspak: 5′-GGA AGA CAC AGA TTC CAT GGT GAA G-3′
IL-6 do przodu: 5′-TGG AGT CAC AGA AGG AGT GGC TAA G-3′
IL-6 wspak: 5′-TCT GAC CAC AGT GAG GAA TGT CCA C-3′
TNF-α do przodu: 5′-CAC CAC GCT CTT CTG TCT-3′
TNF-α wspak: 5′-GGC TAC AGG CTT GTC ACT C-3′