Strona raportu genu spook (spo) w bazie FlyBase została przedstawiona jako przykład ilustrujący wybór odpowiedniego allela mutantowego. spo jest jednym z genów „Halloween” kodującym enzymy zaangażowane w biosyntezę hormonów steroidowych21,22 i wykazano, że promuje on fuzję mioblastów23. Sekcja „Alleles” na stronie raportu genu spo w FlyBase wymienia 12 alleli mutantowych spo opisanych w literaturze, z których cztery zostały zdeponowane w BDSC (Rysunek 2A) i są łatwo dostępne. Jeśli pożądany allel nie jest dostępny za pośrednictwem BDSC, można go poprosić bezpośrednio grupę badawczą, która pierwotnie opisała tę linię mutantową.
Spośród czterech dostępnych z BDSC alleli mutantów, spo1 posiada mutację missense (G481E), podczas gdy spoMI06810 zawiera insercję MiMIC w obrębie sekwencji kodującej, co skutkuje przesunięciem ramki odczytu przy aminokwasie Y341 (Rycyna 2B,C). Ponieważ białko Spo składa się z 543 aminokwasów, przewiduje się, że spoMI06810 (Y341fs) prowadzi do powstania skróconego białka, któremu brakuje około 40% całkowitej długości, co sprawia, że prawdopodobnie reprezentuje ono silny allel z utratą funkcji. W związku z tym do analizy fenotypowej fuzji mioblastów preferowany jest spoMI06810 zamiast spo1 .
Fuzja mioblastów rozpoczyna się w 12. stadium embrionalnym (7,3−9,3 h po zniesieniu jaj [AEL]) i jest w dużej mierze zakończona do końca stadium 15 (11,3−13,3 h AEL)24. Fenotypy fuzji są zatem zazwyczaj oceniane w późnym stadium 15 embrionów, kiedy uformowany został wzór mięśni somatycznych i większość procesów fuzji została zakończona.
Zarodki w stadium 15 można zidentyfikować na podstawie dwóch wyraźnych cech morfologicznych: zakończenia zamknięcia grzbietowego oraz nabycia charakterystycznej, w kształcie serca morfologii jelita środkowego (Rycina 3A–C)19. Zarodki w stadium 14 można odróżnić na podstawie trwającej inwolucji głowy (Rycina 3A), podczas gdy zarodki w stadium 15 wykazują charakterystyczne jelito środkowe w kształcie serca (Rycina 3B). Zarodki w stadium 16 można zidentyfikować po zwężeniu jelita środkowego i utworzeniu czterech komór (ślepe jelita żołądkowe; Rycina 3C)19. Dodatkowo ekspresja białka MHC jest niewykrywalna we wcześniejszych stadiach, w tym w stadium 14, ale staje się wyraźna w stadium 15 i w stadiach późniejszych (Rycina 3A–C).
W późnym stadium embryonalnym 15 mięśni ścian ciała są w pełni ukształtowane w embrionach typu dzikiego (w1118), a większość półsegmentów brzusznych wykazuje identyczny, stereotypowy wzorzec mięśniowy w widoku bocznym (Rysunek 3B). Ten stereotypowy wzorzec mięśniowy można zwizualizować, używając przeciwciał anty-MHC z królika lub szczura (Rysunek 3B,D). W przeciwieństwie do tego, mniej włókien mięśniowych jest widocznych, gdy embriony są obrazowane w orientacji grzbietowej lub brzusznej (Rysunek 3E,F). Zatem obrazowanie embrionów w orientacji bocznej umożliwia wizualizację całej muskulatury ścian ciała i ułatwia ocenę defektów fuzji mioblastów.
Aby zbadać defekty fuzji mioblastów, obrazuje się muskulaturę ściany ciała embrionów mutantów homozygotycznych w orientacji bocznej. Mutanty homozygotyczne identyfikuje się na podstawie braku fluorescencyjnego markera balancerowego, takiego jak GFP lub YFP. Na przykład embriony mutantów homozygotycznych spo pochodzące od rodziców spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP są negatywne pod kątem GFP, podczas gdy embriony rodzeństwa niosące balancer wykazują ekspresję GFP w mezodermie (Rysunek 4B,C). W porównaniu z embrionami typu dzikiego oraz GFP-dodatnimi embrionami rodzeństwa, embriony mutantów spo wykazują defekt fuzji mioblastów, który charakteryzuje się obecnością licznych niefuzowanych mioblastów zdolnych do fuzji (FCMs; Rysunek 4A–C).
Warto zauważyć, że w głębszych przekrojach optycznych (Z3 i Z4) obserwuje się więcej niezlepionych FCM niż w przekroju powierzchniowym (Z1) zarodków mutantów spo (Rycina 4B). Rozkład ten odzwierciedla organizację przestrzenną komórek założycielskich i FCM podczas embrionalnej fuzji mioblastów. Komórki założycielskie i rosnące prątki mięśniowe znajdują się głównie w powierzchniowej warstwie mezodermy, podczas gdy FCM zalegają w głębszych warstwach przed migracją w stronę rosnących prątków mięśniowych i ich fuzją25. W konsekwencji niezlączone mioblasty są liczniejsze w głębszych przekrojach konfokalnych, szczególnie u zarodków z częściowymi wadami fuzji. Pozyskiwanie stosów Z (z-stacks) obejmujących całą głębokość muskulatury ściany ciała jest zatem niezbędne, aby uniknąć niedoszacowania nasilenia fenotypu fuzji.
Choć wizualizacja ogólnej muskulatury ściany ciała w orientacji bocznej umożliwia ocenę fenotypową defektów fuzji mioblastów, analiza ilościowa może zostać przeprowadzona poprzez wizualizację mięśnia DA1 w orientacji grzbietowej. W embrionach typu dzikiego mięsień DA1 jest w pełni uformowany i zawiera 13,03 ± 0,60 jąder wykazujących ekspresję Eve (Rysunek 5A,C). W embrionach mutantów spo liczba jąder Eve-dodatnich w mięśniu DA1 jest zredukowana do 8,16 ± 0,54 (Rysunek 5B,C), co wskazuje na defekt fuzji, w którym mniejsza liczba FCM łączy się z komórką założycielską DA1. Aby uzyskać spójne i powtarzalne wyniki ilościowe, zliczane i uśredlane na jeden embrion są jądra Eve-dodatnie w mięśniach DA1 tych samych hemisegmentów brzusznych (A2−A5), a średnia z każdego embrionu jest traktowana jako pojedynczy punkt danych do analizy statystycznej (Rysunek 5C).

Rycina 1: Schemat analizy genetycznej, fenotypowej i ilościowej fuzji mioblastów w embrionach Drosophila. Schemat obejmuje wybór odpowiednich linii mutantów, pobieranie i fiksację embrionów, immunobarwienie całych preparatów i ich montowanie, a także określanie stadium rozwoju embrionów i obrazowanie. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 2: Wybór alleli mutantów przy użyciu FlyBase. (A) Zrzut ekranu strony raportu genu spo w bazie FlyBase. Allele mutantów są wymienione w sekcji „Alleles”. Kolumna Stocks (obramowana) wskazuje liczbę dostępnych linii, natomiast kolumna Refs (obramowana) wskazuje liczbę powiązanych referencji. (B,C) Uszkodzenia molekularne dwóch reprezentatywnych alleli mutantów spo, spo1 (B) oraz spoMI06810 (C). Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Układ mięśniowy embrionów Drosophila. (A–C) Obrazy w kontraście fazowym, obrazy konfokalne z projekcją Z po barwieniu na MHC oraz obrazy nałożone embrionów typu dzikiego (WT) w stadiach 14, 15 i 16. Inwolucja głowy jest widoczna (groty strzałek) w embrionie w stadium 14 (A). Charakterystyczne sercowate jelito środkowe (linia przerywana) jest obserwowane w embrionie w stadium 15 (B), natomiast jelito środkowe jest podzielone na cztery wyraźne komory (linie przerywane) w embrionie w stadium 16 (C). Ekspresja białka MHC jest niewykrywalna w stadium 14 (A), ale staje się intensywna w stadiach 15 (B) i 16 (C). Embriony przedstawiono w widoku bocznym, z przodem po lewej stronie, tyłem po prawej, stroną grzbietową u góry i brzuszną u dołu. Oznaczono hemisegmenty torakalne (T1–T3) i abdominalne (A1–A8). (D) Obraz konfokalny widoku bocznego układu mięśniowego w embrionie WT w stadium 15, wizualizowany przy użyciu przeciwciała szczurzego anty-MHC. Do obrazów w pozostałych panelach użyto przeciwciała króliczego anty-MHC. (E,F) Obrazy konfokalne z projekcją Z widoku grzbietowego (E) i brzusznego (F) układu mięśniowego w embrionach WT w stadium 15. W orientacjach grzbietowej i brzusznej widocznych jest mniej włókien mięśniowych niż w orientacji bocznej. Pasek skali = 50 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rycina 4: Porównanie układu mięśniowego embrionów typu dzikiego i mutantów spo. (A) Reprezentatywne obrazy z serii z-stack wykonane za pomocą mikroskopu konfokalnego, przedstawiające mięśnie ściany ciała w widoku bocznym późnego embrionu WT w stadium 15. Fuzja mioblastów jest zakończona i nie obserwuje się niefuzowanych mioblastów. MHC pokazano w kolorze zielonym. (B) Reprezentatywne obrazy z serii z-stack wykonane za pomocą mikroskopu konfokalnego, przedstawiające mięśnie ściany ciała w widoku bocznym embrionu mutanty spo negatywnego pod kątem GFP, pochodzącego od rodziców spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP. Brak fluorescencji GFP (czerwony) wskazuje, że embrion jest homozygotą dla spoMI06810. Groty strzałek wskazują reprezentatywne niefuzowane mioblasty. Więcej niefuzowanych mioblastów obserwuje się w głębszych przekrojach optycznych (Z3 i Z4) niż w pobliżu powierzchni embrionu (Z1). MHC pokazano w kolorze zielonym. (C) Obrazy konfokalne w widoku bocznym dodatniego pod kątem GFP embrionu rodzeństwa, pochodzącego od tych samych rodziców spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP. Mezodermalna ekspresja GFP (czerwony) sterowana przez transgen twi>UAS-GFP na balancerze TM3 pozwala odróżnić dodatnie pod kątem GFP embriony rodzeństwa od negatywnych pod kątem GFP homozygotycznych embrionów mutanty spo. MHC pokazano w kolorze zielonym. Pasek skali = 20 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 5Reprezentatywne obrazy z serii z-stack wykonane za pomocą mikroskopu konfokalnego oraz analiza ilościowa mięśni DA1. (A,B) obrazy z serii z-stack wykonane za pomocą mikroskopii konfokalnej, przedstawiające widok grzbietowy zarodków WT w późnej fazie 15 (A) i spo mutant (B) zarodki znakowane przeciwciałem anty-MHC (zielony) i przeciwciałem anty-Eve (czerwony). Konfokalne serie obrazów (z-stacks) pozyskano przez całą głębokość mięśnia DA1 wykazującego ekspresję Eve, aby uchwycić wszystkie jądra w obrębie tego mięśnia. Jądra Eve-dodatnie widoczne są jako obszary niezabarwione w obrębie sygnału MHC. Reprezentatywny mięsień DA1 zaznaczono linią przerywaną, a jądra Eve-dodatnie w obrębie mięśnia DA1 ponumerowano. (C) Ilościowe oznaczenie jąder Eve-dodatnich w mięśniach DA1 u osobników WT i spo zarodki mutanty. Dla każdego genotypu ilościowo oceniono osiem zarodków. Każdy punkt danych reprezentuje średnią liczbę jąder w mięśniach DA1 hemisegmentów A2–A5 jednego zarodka. Dane przedstawiono jako średnią ± SD (czerwone słupki). Istotność statystyczną określono za pomocą dwustronnego testu t Studenta Proszę o podanie tekstu źródłowego do tłumaczenia.-test; p < 0,0001. Pasek skali = 20 µm. Proszę kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.
| numer katalogowy BDSC | Genotyp | Cel |
| 6873 | N1/FM7c, twi>UAS-GFP | Ekspresja GFP w mezodermie umożliwia identyfikację embrionów homozygotycznych mutantów niewykazujących ekspresji GFP. |
| 6662 | wgGla-1/CyO, twi>UAS-GFP |
| 6663 | drMio/TM3, twi>UAS-GFP |
| 23229 | baza4/FM7c, Dfd-YFP | Ekspresja YFP specyficzna dla głowy umożliwia identyfikację embrionów mutantów homozygotycznych, które nie wykazują ekspresji YFP. |
| 23230 | SNASco/ CyO, Dfd-YFP |
| 23232 | dr1/TM6B, Dfd-YFP |
Tabela 1: Linie Drosophila niosące gen markera fluorescencyjnego na chromosomach balancerowych.