Name: Obrazowanie dynamiki F-aktyny na żywych komórkach za pomocą fluorescencyjnej mikroskopii plamkowej (FSM) (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2009-08-05T19:00:00.000+00:00
Duration: 19 min 16 s
Description: Poznaj technikę fluorescencyjnej mikroskopii plamkowej do badania dynamiki białek cytoszkieletowych w żywych komórkach. Naucz się mikroinjekcji fluorescencyjnie znakowanego aktyny i montażu komory obrazującej.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Rozwój qFSM jest finansowany z grantu NIH U01 GM06230.

Sekcja 1: Pozyskiwanie aktyny znakowanej fluorescencyjnie do FSM
Wymagane materiały: oczyszczona aktyna, fluorofor (zalecane Alexa, X-rhodamina), bufor G, ultracentryfuga
<ol>
<li>Kluczowym elementem pozwalającym na uzyskanie wysokiej jakości filmów FSM jest prawidłowe znakowanie aktyny (lub innych białek cytoszkieletu) wybranym fluoroforem. Zalecamy stosowanie fluoroforów z serii Alexa (o długościach fali 488, 568) oraz pochodnych estru sukkynimidy X-rodaminy, które celują w odsłonięte reszty lizyny na powierzchni aktyny. </li>
<li>Przy wyborze fluoroforu i odpowiedniej długości fali należy upewnić się, że konfiguracja mikroskopu posiada odpowiednie filtry (wzbudzenia i emisji) oraz iluminatory (lampę łukową rtęciową i/lub lasery) dostosowane do użytego znacznika fluorescencyjnego. Zalecamy wybór długości fal z zakresu pomarańczowego do czerwonego (560-630 nm), aby zminimalizować efekty autofluorescencji i fotouszkodzeń oraz zapewnić kompatybilność z koniugatami GFP. </li>
<li>Czystą aktynę można wyizolować z tkanki mięśniowej szczura lub kurczaka, jednak wymaga to długotrwałej procedury ekstrakcji z acetonowego proszku mięśniowego. Acetonowy proszek mięśniowy można nabyć od firmy Invitrogen. Procedura znakowania nie jest omawiana w niniejszym protokole, ale można ją znaleźć tutaj[1] </li>
<li>Alternatywnie można zakupić znakowane białka aktyny od kilku dostawców, w tym Cytoskeleton Inc. oraz Invitrogen. Poprzez firmę Invitrogen dostępne są również usługi znakowania na zamówienie. Oczyszczoną, nieznakowaną aktynę (zarówno aktynę mięśniową, jak i niemięśniową) można nabyć w firmie Cytoskeleton Inc.</li>
<li>Niezależnie od tego, czy zdecydują się Państwo na zakup, czy na samodzielne przygotowanie znakowanej aktyny, należy upewnić się, że stosunek znakowania wynosi około 0,3 do 0,7 cząsteczek barwnika na monomer aktyny. Zbyt wysoki stosunek znakowania może wpłynąć na kinetykę wymiany (oraz wiązanie z białkami towarzyszącymi) filamentu aktynowego, natomiast zbyt niski stosunek znakowania doprowadzi do uzyskania słabo widocznych plamek (niski stosunek sygnału do szumu) i może spowodować problemy z mikroiniekcją (patrz poniżej). Jest to krytyczny czynnik dla uzyskania wysokiej jakości obrazów plamek.</li>
<li>Przed długotrwałym przechowywaniem roztwór znakowanej aktyny należy sklarować poprzez wirowanie przy 75 000 - 80 000×g przez 20 minut w temperaturze 4 °C. Znakowaną aktynę należy przechowywać w roztworze buforu G w temperaturze -80 °C. Wysoce zalecane jest przygotowanie aliquotów o objętości 2 µL, aby ograniczyć szkodliwe skutki wielokrotnego zamrażania i rozmrażania (prowadzące do powstawania nierozpuszczalnych agregatów). Należy unikać wystawiania roztworu znakowanej aktyny na bezpośrednie działanie światła (powoduje fotobleaching fluoroforów). Do długotrwałego przechowywania zalecamy stosowanie nieprzezroczystych probówek do mikrocentryfugi.</li>
</ol>
Sekcja 2: Przygotowanie komórek i mikroiniekcja znakowanej aktyny
Wymagane materiały: igły do mikroiniekcji, mikroszyca, mikroladery, podgrzane pożywki komórkowe, bufor do iniekcji, naczynie z lodem, mikroskop (pierścień fazowy, obiektyw fazowo-kontrastowy 40X), transjektor, wyciągacz igieł, mikromanipulator
<ol>
<li>Wiele typów komórek nadaje się do FSM, jednak uzyskanie wysokiej jakości obrazów spekli jest bezpośrednio zależne od powodzenia procedury mikroiniekcji. Przy wyborze komórek do FSM, komórki powinny być duże ( &gt; (50 µm średnicy), powinny rozpłaszczać się po wysianiu i naturalnie przylegać do podłoży (lub plastikowych naczyń do hodowli tkankowej). Pomocne jest również, jeśli cytozol komórki zajmuje obszar większy niż jej jądro. Wyżej wymienione kryteria zapewniają, że komórki nadają się do mikroiniekcji. Do odpowiednich linii komórkowych należą (między innymi) PtK1[2,3], komórki płuca salamandry[4] oraz neurony Aplysia[3]. </li>
<li>Komórki należy wysiać na kwadratowych szkiełkach nakrywkowych (22 x 22 mm; nr 1-1/2), które zostały poddane myciu kwasowemu. Na szkiełko nakrywkowe można nanieść standardową powłokę substratu, co nie wpłynie na proces mikroiniekcji.</li>
<li>Prawidłowy dobór igieł do mikroiniekcji zależy od wielkości otworu w ich wierzchołku. Typowo średnice otworów mogą wahać się od 0,5 $\mu$m do nawet 3 $\mu$m. Zaleca się jednak, aby w przypadku iniekcji aktyny optymalna wielkość otworu mieściła się w przedziale od 0,5 do 1 $\mu$m. Jeśli stale występują problemy z zapychaniem się igieł, zastosowanie większych otworów może umożliwić dostarczenie zarówno aktyny monomerycznej, jak i niepożądanych spolimeryzowanych filamentów aktynowych. Igły do mikroiniekcji można nabyć u kilku dostawców, w tym w firmie Eppendorf systems, która produkuje igły do mikroiniekcji femtotip. Alternatywnie, w przypadku dostępności komercyjnego wyciągacza igieł, szklane kapilary do mikroiniekcji można zakupić w firmie Sutter i wyciągnąć zgodnie z wymaganą specyfikacją. Początkującym zaleca się przygotowanie 10–20 wyciągniętych igieł przed rozpoczęciem procedury iniekcji.</li>
<li>Idealne „stężenie do iniekcji” (stężenie końcowe aktyny wprowadzanej do igły) wynosi od 0,5 do 1,0 μg/μl, przy założeniu 40% stosunku barwnika do monomeru aktyny. Niższy stosunek znakowania aktyny można zrekompensować poprzez iniekcję przy wyższych stężeniach (1–3 μg/μl). Zwiększy to jednak częstotliwość zatykania się igły. Można temu częściowo zapobiec, stosując igły o większych światłach. Stężenie zapasowe aktyny można rozcieńczyć, dodając lodowaty bufor do iniekcji. Do szybkich iniekcji do rozcieńczania można również użyć lodowatej wody ddH2O. Na tym etapie wszystkie roztwory robocze powinny być przechowywane w lodzie. </li>
<li>Nanieś od 0,5 do 1,0 µL roztworu aktyny, używając mikrosyringi (o wąskiej igle – Hamilton) lub alternatywnie końcówki do pipety typu microloader. </li>
<li>Ostrożnie dozuj roztwór aktyny, powoli uwalniając ciecz. Należy unikać powstawania pęcherzyków powietrza, jednak w razie ich pojawienia się można je łatwo usunąć, odsysając nadmiar cieczy otaczającej pęcherzyk. </li>
<li>Należy upewnić się, że roztwór aktyny spoczywa całkowicie na końcówce igły. Nadmiar roztworu w jakimkolwiek miejscu kapilary igły może zakłócić przepływ podczas wstrzykiwania. </li>
<li>Następnie ostrożnie przymocuj igłę do uchwytu iniektora, unikając kontaktu z jej czubkiem. Ustaw uchwyt tak, aby igła tworzyła kąt od 35 do 50 stopni z podstawą stolika mikroskopu. Preferowane są mniejsze kąty.</li>
<li>Obniż końcówkę igły tak, aby ledwo przebiła powierzchnię pożywki, w której znajdują się komórki. </li>
<li>Następnie ustaw końcówkę igły (bez jej obniżania) tak, aby znajdowała się bezpośrednio nad środkiem obiektywu. Jeśli końcówka igły jest wyrównana z obiektywem, przez okular powinna być widoczna jasna aureola. Jest to wierzchołek końcówki igły. Powolne przesuwanie igły na boki (za pomocą manipulatora) może pomóc w dokładniejszym zlokalizowaniu aureoli. </li>
<li>Dostosuj ostrość w osi Z mikroskopu, aż komórki będą wyraźnie widoczne. Następnie powoli opuszczaj końcówkę, aż halo będzie stopniowo się zwężać, by w końcu zbiec się w czubku igły – w tym czasie należy równocześnie kontrolować ostrość (pozycję Z). Dodatkowym elementem, na który należy zwrócić uwagę, jest trzon igły, który będzie rzucać liniowe cienie. Opuszczanie igły pozwoli stopniowo zdefiniować jej trzon. Po poprawnym wykonaniu tej czynności zarówno koniec igły, jak i komórki powinny być wyraźnie widoczne. W celu poprawy kontrastu może być wymagana niewielka regulacja pierścienia fazowego. </li>
<li>Podczas nawigacji należy upewnić się, że końcówka igły znajduje się wystarczająco wysoko nad komórkami, aby zapobiec jej złamaniu. </li>
<li>Podczas wyboru komórek do iniekcji należy zadbać o to, aby ich wolne krawędzie były skierowane w stronę końcówki igły. Zapewni to, że obszar o malejącej grubości komórki (od punktu najgrubszego, w którym znajduje się jądro, do najcieńszego punktu, jakim jest krawędź prowadząca) spotka się z końcówką igły, zamiast przebiegać równolegle do niej. </li>
<li>Ciśnienie igły powinno zostać ustawione w zakresie od 0,3 do 0,8 psi. Przyłożone stałe ciśnienie zapewni jednostajny przepływ roztworu aktyny. </li>
<li>Po wybraniu komórki do iniekcji, ustaw igłę tak, aby jej końcówka znajdowała się obok jądra (region perinuklearny, najgrubsza część komórki, w której jądro nie znajduje się bezpośrednio poniżej). </li>
<li>Powoli opuść i skoryguj położenie igły, aż jej czubek zacznie uciskać błonę, a następnie obniżaj ją stopniowo, dopóki czubek igły nie przebije błony. Jeśli igła całkowicie przebije błonę, komórka stanie się jaśniejsza; niezwłocznie po zauważeniu tej różnicy podnieś igłę, aby przestała dotykać komórki. Sam proces przebijania i wstrzykiwania potrwa od 0,5 do 2 sekund. </li>
<li>Przy prawidłowym wykonaniu kształt komórki pozostanie niezmieniony, natomiast zbyt duża ilość wstrzykniętego materiału spowoduje szybkie wciągnięcie krawędzi komórki, a w niektórych przypadkach można zaobserwować wręcz eksplozję komórki. </li>
<li>Jeśli podczas mikroiniekcji nie obserwuje się zmian w komórce (brak rozjaśnienia), końcówka igły może być zatkana. Można to sprawdzić, naciskając przycisk „clean” (oczyszczanie), jeśli jest on dostępny w transjektorze. W przypadku drożności spowoduje to znaczny wzrost stałego przepływu pod ciśnieniem, co będzie widoczne przez okulary – pojawi się obraz falowania, a okoliczne zanieczyszczenia zostaną rozproszone. </li>
<li>Jeśli końcówka igły jest zapchana, można zdecydować o wstawieniu nowej igły do mikroiniekcji lub spróbować odłamać końcówkę igły, delikatnie opuszczając ją, aż zostanie dociśnięta do szkiełka nakrywkowego, co spowoduje odłamanie samego wierzchołka. Obszar odłamania nie powinien przekraczać 1/5th powierzchni ostrza igły (części igły, która zaczyna zbiegać się w punkt). </li>
<li>Kontynuuj wstrzykiwanie, poświęcając nie więcej niż 20–45 minut na każdą sesję mikrowstrzykiwania (czas ten zależy od typu komórek). Co do zasady zaleca się krótsze sesje, aby zminimalizować stres komórek.</li>
<li>Po zakończeniu mikroiniekcji należy wymienić pożywkę komórkową w naczyniu, dodając świeżą, uprzednio ogrzaną pożywkę. Następnie należy pozostawić komórki na 30 minut w inkubatorze w celu regeneracji przed przeprowadzeniem obrazowania. Pozwoli to również na wbudowanie aktyny w istniejącą sieć cytoszkieletu. </li>
</ol>
Sekcja 3: Montaż komory obrazowania
Wymagane materiały: szkiełko nakrywkowe, taśma dwustronna, patyczki higieniczne, pęseta, Valap, chusteczki Kimwipe, Oxyrase, medium obrazujące, żyletka, pipeta p200, czysty etanol
<ol>
<li>Zacznij od wstępnego ogrzania medium do obrazowania i rozmrożenia 15 µL alikwotu Oxyrase. Pamiętaj o ochronie światłoczułego preparatu oxyrase przed światłem. Dodatek oxyrase znacznie zredukuje efekty fotobielenia.</li>
<li>Wstępnie ogrzej valap, ustawiając niską temperaturę płyty grzewczej. Nie przegrzej i nie przypal valapu, ponieważ utraci on skuteczność jako uszczelniacz.</li>
<li>Przetrzyj szkiełko przedmiotowe za pomocą chusteczki kimwipe nasączonej czystym etanolem, aby oczyścić je i usunąć drobne zanieczyszczenia.</li>
<li>Ułóż dwa równe odcinki (o długości 2,5 cm) taśmy dwustronnej jeden na drugim, wykorzystując czystą, płaską powierzchnię jako podstawę. Wciśnij wszelkie uwięzione pęcherzyki powietrza, aby stworzyć całkowicie płaską powierzchnię.</li>
<li>Za pomocą żyletki przetnij dwa proste paski wzdłuż dłuższej osi, tak aby każdy pasek miał szerokość 0,5 cm.</li>
<li>Za pomocą pęsety przyłóż każdy pasek do dłuższego brzegu szkiełka przedmiotowego w taki sposób, aby dwa paski taśmy stworzyły szczelinę w centrum szkiełka. Delikatnie dociśnij taśmę, aby uzyskać szczelne połączenie ze szkłem. Paski taśmy będą pełnić funkcję dystansów między szkiełkiem przedmiotowym a nakrywką.</li>
<li>Upewnij się, że valap całkowicie się upłynnił przed rozpoczęciem następnego kroku.</li>
<li>Pobierz wstępnie ogrzane medium do obrazowania, dodając 15 µL oxyrase na każde 500 µL medium.</li>
<li>Złóż chusteczki kimwipe w trójkąty, aby uzyskać 3 ostre krawędzie. Posłużą one do stworzenia suchej powierzchni, do której przylepi się taśma.</li>
<li>Wyjmij komórki z inkubatora. Za pomocą pęsety chwyć róg nakrywki. Szybko połóż nakrywkę na chusteczce kimwipe (stroną z komórkami do góry, aby nie dotykały tkanki) i użyj złożonej chusteczki do przetarcia dwóch przeciwległych stron nakrywki, aby stworzyć powierzchnię półsuchą (na stronie, na której spoczywają komórki).</li>
<li>Za pomocą pęsety chwyć róg nakrywki i połóż ją na szkiełku przedmiotowym tak, aby suche powierzchnie były wyrównane z dwoma paskami taśmy. Zauważ, że masz teraz dwie strony zamknięte i dwie otwarte szczeliny. Powoli pipetuj 200 µL roztworu medium do obrazowania z oxyrase blisko jednego z otworów. Ważne jest, aby nie wprowadzić pęcherzyków powietrza. Roztwór powinien zostać wciągnięty do nowo zmontowanej komory przez siły kapilarne, całkowicie zanurzając komórki w roztworze.</li>
<li>Za pomocą patyczka higienicznego nanieś roztopiony valap na cztery narożniki nakrywki, aby szybko przymocować i ustabilizować nakrywkę. Zauważysz, że valap wysycha natychmiast (w ciągu kilku sekund w temperaturze pokojowej).</li>
<li>Zacznij teraz od stron otwartych (tych bez taśmy), nakładając cienki pasek valapu za pomocą patyczka higienicznego, naśladując ruch pędzla. Powtórz czynność dla stron zamkniętych. Powoli nakładaj kolejne warstwy valapu, wzmacniając uszczelnienie poprzez powtarzanie kroków powlekania. Valap powinien być ograniczony do krawędzi, pozostawiając środek nakrywki czystym.</li>
<li>Delikatnie oczyść środkową część nakrywki, używając patyczka higienicznego z ddH₂O w celu usunięcia pozostałości medium, uważając, aby nie zmiażdżyć komórek. Powtórz etap oczyszczania z użyciem czystego etanolu.</li>
<li>Otrzymasz teraz całkowicie zamkniętą komorę obrazującą, zoptymalizowaną do obrazowania plamek (speckle imaging). Całkowicie szczelna obudowa zapobiegnie szybkiemu fotobieleniu fluoroforów.</li>
</ol>
Sekcja 4: Obrazowanie komórek
Wymagane materiały: odwrócony mikroskop szerokopolowy, lampa rtęciowa, odpowiednie filtry, chłodzona kamera CCD z pikselami o rozmiarze 6,7 micron, plan-apochromatyczne obiektywy imersyjne z wysoką aperturą numeryczną (60X do 100X, faza lub DIC). Stół wibroizolacyjny. Oprogramowanie do obrazowania.
<ol>
<li>Podgrzej stołyk mikroskopu do 37 °C. Umieść przygotowaną komorę obrazową i odczekaj 10-15 minut, aż temperatura się ustabilizuje przed rozpoczęciem obrazowania. </li>
<li>Zacznij od ustawienia ostrości na komórkach w świetle przechodzącym, a następnie odszukaj komórki poddane mikroiniekcji, przełączając odpowiednie ustawienia fluorescencji. Staraj się minimalizować czas ekspozycji na fluorescencję, aby ograniczyć fotowyblakanie.</li>
<li>Szukaj zainiekowanych komórek, które mają zdrowe, zakrzywione krawędzie przednie. Komórki nadmiernie zainiekowane (komórki „rozsadzone”) będą charakteryzować się cofniętymi i poszarpanymi krawędziami przypominającymi liczne filopodia – unikaj obrazowania takich komórek. </li>
<li>Ustawienia akwizycji będą zależeć od typu komórek, jakości znakowanej aktyny oraz komponentów mikroskopu. Niemniej jednak czas ekspozycji nie powinien przekraczać 2 sekund, a odstęp czasu między klatkami powinien być ustawiony w przedziale od 5 do 10 sekund. Typowa długość serii czasowej (na jedną obrazowaną komórkę) może wynosić od 10 do 30 minut i jest ograniczona efektami fotowyblakania. Wzmocnienie (gain) w kamerze można zwiększyć, aby poprawić stosunek sygnału do szumu.</li>
<li>Idealna charakterystyka plamek (speckles) powinna polegać na tym, że każda plamka jest oddalona od sąsiedniej o około 2 średnice plamki. Zapewni to optymalne próbkowanie przestrzenne i czasowe struktury aktyny. W przypadku komórek nabłonkowych nakrapiana sieć aktynowa będzie wyglądać homogenicznie, z równomiernie rozłożonymi plamkami. Linie komórkowe z gęstymi włóknami stresowymi lub lamelipodiami będą rozróżnialne, ale będą miały wygląd kropkowany/nakrapiany. Ustawienia ekspozycji należy dostosować tak, aby uzyskać najlepsze obrazy nakrapiane. </li>
<li>Komórki nadmiernie poddane mikroiniekcji będą miały gęsto upakowane plamki, które nie będą wydawać się rozdzielne. Włókna stresowe i lamelipodia utracą swój kropkowany wygląd.</li>
<li>Komórki niedostatecznie poddane mikroiniekcji będą wydawać się bardzo ciemne w okularze, zawierając plamki, które są od siebie oddalone (&gt;10 plamek odstępu) i wydają się rozrzucone losowo. Włókna stresowe i lamelipodia w tych komórkach będą nierozróżnialne.</li>
<li>Kluczem do uzyskania „dobrych” filmów z plamkami jest utrzymanie ostrości. Jest to szczególnie istotne w przypadku analizy potranskrypcyjnej obejmującej pomiary przepływu i wymiany plamek. Zatem jakość analizy ilościowej będzie zależeć od zablokowania ostrości na czas trwania serii czasowej (time-lapse). Może to być szczególnie trudne, jeśli płaszczyzna obrazowania jest bardzo cienka. Inne czynniki będą zależeć od stabilności systemu mikroskopowego, w szczególności od obudowy stołyka i komory obrazowej. Można zastosować ustawianie ostrości w oparciu o kontrast, jeśli odstępy między obrazami są wystarczające, aby obsłużyć tę funkcję. Inne opcje obejmują zakup systemu ustawiania ostrości w bliskiej podczerwieni, który zapewnia niezawodne regulacje ostrości w czasie rzeczywistym. Takie rozwiązania oferują firmy Nikon, Olympus i ASI. </li>
</ol>
Sekcja 5: Analiza qFSM
Ta sekcja nie jest omawiana szczegółowo, ale informacje na temat oprogramowania analitycznego można znaleźć tutaj [5]. Prośby o pobranie oprogramowania można składać na naszej stronie internetowej (lccb.scripps.edu). Omówione zagadnienia:
<ul>
<li>Kalibracja szumów</li>
<li>Detekcja plamek (speckles)</li>
<li>Śledzenie z wykorzystaniem podejścia hybrydowego, łączącego śledzenie grubego ruchu obszarów plamek w oparciu o korelację obrazów oraz śledzenie pojedynczych cząstek w celu analizy szczegółowego ruchu poszczególnych plamek.</li>
<li>Obliczanie szybkości montażu i demontażu polimerów na podstawie fluktuacji intensywności podczas zdarzeń pojawiania się i znikania plamek.</li>
</ul>

<ol><li>Waterman-Storer, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescent+speckle+microscopy+%28FSM%29+of+microtubules+and+actin+in+living+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Fluorescent speckle microscopy (FSM) of microtubules and actin in living cells.</a> Curr Protoc Cell Biol. Chapter 4, Unit 4.10-Unit 4.10 (2002).</li>
<li>Ponti, A., Machacek, M., Gupton, S. L., Waterman-Storer, C. M., Danuser, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two+distinct+actin+networks+drive+the+protrusion+of+migrating+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Two distinct actin networks drive the protrusion of migrating cells.</a> Science. 305, 1782-1786 (2004).</li>
<li>Zhang, X. F., Schaefer, A. W., Burnette, D. T., Schoonderwoert, V. T., Forscher, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rho-dependent+contractile+responses+in+the+neuronal+growth+cone+are+independent+of+classical+peripheral+retrograde+actin+flow%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Rho-dependent contractile responses in the neuronal growth cone are independent of classical peripheral retrograde actin flow.</a> Neuron. 40, 931-944 (2003).</li>
<li>Salmon, W. C., Adams, M. C., Waterman-Storer, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dual-wavelength+fluorescent+speckle+microscopy+reveals+coupling+of+microtubule+and+actin+movements+in+migrating+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Dual-wavelength fluorescent speckle microscopy reveals coupling of microtubule and actin movements in migrating cells.</a> J Cell Biol. 158, 31-37 (2002).</li>
<li>Danuser, G., Waterman-Storer, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+fluorescent+speckle+microscopy+of+cytoskeleton+dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Biophys+Biomol+Struct%22%5BJournal%5D)">Quantitative fluorescent speckle microscopy of cytoskeleton dynamics.</a> Annu Rev Biophys Biomol Struct. 35, 361-387 (2006).</li>
</ol>

Autorzy nie zgłaszają żadnych konfliktów interesów.

Kilka kluczowych czynników ma decydujące znaczenie dla pomyślnego uzyskania obrazów plamek (speckles), jednak wysokiej jakości plamki zależą przede wszystkim od jakości fluorescencyjnie znakowanej aktyny. Wysoki stosunek barwnika do monomeru aktyny, ustalony na poziomie około 0,4 do 0,7, zapewni, że plamki będą jasne i wyraźne, natomiast samo znakowane białko powinno być rozpuszczalne i wolne od agregatów. Równie ważna jest procedura mikroiniekcji. Aby zapewnić prawidłową homeostazę (i przeżycie) komórek, należy wstrzyki...

<table><tbody><tr><td colspan="4">&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Bufor do wstrzykiwania (IB)&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;W niniejszym protokole opisujemy zastosowanie fluorescencyjnej mikroskopii plamistej (FSM) do obrazowania dynamiki aktyny w komórkach PtK1 z wysoką rozdzielczością. Unikalną zaletą FSM jest możliwość rejestracji ruchu oraz kinetyki obrotu (montażu/demontażu) sieci F-aktyny w żywych komórkach. Technika ta jest szczególnie użyteczna przy pozyskiwaniu ilościowych pomiarów dynamiki F-aktyny w połączeniu z oprogramowaniem do analizy obrazu (qFSM). Opisujemy proces wyboru, mikroiniekcji oraz wizualizacji fluorescencyjnych sond aktynowych w żywych komórkach. Co istotne, analogiczne procedury można zastosować do wizualizacji innych kompleksów makromolekularnych. Zastosowanie FSM wykazano w przypadku mikrotubul, włókien pośrednich oraz kompleksów adhezyjnych.&gt; 50 mM glutaminian potasu&lt;br/&gt; 0,5 M MgCl2 (&lt;em&gt;DODATEK 2A&lt;/em&gt;)&lt;br/&gt; Przechowywać do 2 lat w temperaturze &amp;#8722;20&amp;#x00B0; C&lt;strong&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Bufor G&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br/&gt; 2 mM Tris&amp;#8901;Cl, pH 8,0 (&lt;em&gt;DODATEK 2A&lt;/em&gt;)&lt;br/&gt; 0,2 mM CaCl2 (&lt;em&gt;DODATEK 2A&lt;/em&gt;)&lt;br/&gt; Dodać bezpośrednio przed użyciem:&lt;br/&gt; 0,2 mM ATP (patrz przepis dla 100 mM)&lt;W niniejszym protokole opisujemy zastosowanie mikroskopii plamek fluorescencyjnych (FSM) do obrazowania dynamiki aktyny w komórkach PtK1 z wysoką rozdzielczością. Wyjątkową zaletą FSM jest możliwość rejestracji ruchu oraz kinetyki wymiany (montażu/demontażu) sieci aktyny filamentowej (F-aktyny) w żywych komórkach. Technika ta jest szczególnie użyteczna przy wyznaczaniu ilościowych pomiarów dynamiki F-aktyny w połączeniu z oprogramowaniem do analizy obrazu (qFSM). Opisujemy proces wyboru, mikroiniekcji oraz wizualizacji fluorescencyjnych sond aktynowych w żywych komórkach. Co istotne, podobne procedury można zastosować do wizualizacji innych kompleksów makromolekularnych. Skuteczność metody FSM wykazano w przypadku mikrotubul, filamentów pośrednich oraz kompleksów adhezyjnych.&gt; 0,5 mM 2-merkaptoetanolu&amp;#8211;etanol&lt;/p&gt;Przechowywać do 1 doby w temperaturze 4°C&amp;#x00B0; C</td></tr></tbody></table>

obrazowanie żywych komórek w celu analizy dynamiki f-aktyny za pomocą fluorescencyjnej mikroskopii plamistej (fsm)

Live Cell Imaging of F-actin Dynamics via Fluorescent Speckle Microscopy (FSM)

W niniejszym protokole opisujemy zastosowanie fluorescencyjnej mikroskopii plamistej (FSM) do rejestracji wysokorozdzielczych obrazów dynamiki aktyny w komórkach PtK1. Wyjątkową zaletą FSM jest możliwość obrazowania ruchu oraz kinetyki wymiany (montażu/demontażu) sieci F-aktyny w żywych komórkach. Technika ta jest szczególnie użyteczna przy wyznaczaniu pomiarów ilościowych dynamiki F-aktyny w połączeniu z oprogramowaniem do analizy obrazu (qFSM). Opisujemy proces wyboru, mikroiniekcji oraz wizualizacji fluorescencyjnych sond aktyny w żywych komórkach. Co istotne, podobne procedury można zastosować do wizualizacji innych kompleksów makromolekularnych. FSM została wykazana w badaniach mikrotubul, włókien pośrednich oraz kompleksów adhezyjnych.

Wybór, mikroiniekcja i obrazowanie znakowanej fluorescencyjnie F-aktyny za pomocą fluorescencyjnej mikroskopii plamkowej (FSM).

Obrazowanie żywych komórek w celu analizy dynamiki F-aktyny za pomocą fluorescencyjnej mikroskopii plamistej (FSM)

W niniejszym protokole opisujemy zastosowanie fluorescencyjnej mikroskopii plamistej (FSM) do rejestrowania obrazów dynamiki aktyny o wysokiej rozdzielczości w komórkach PtK1. Unikalny ...

Fluorescencyjna mikroskopia plamkowa (fluorescent speckle microscopy) jest wykorzystywana do badania dynamiki różnych białek cytoszkieletu w żywych komórkach. Przy prawidłowym zastosowaniu możliwe jest przeprowadzenie ilościowych pomiarów prędkości oraz kinetyki wymiany białek cytoszkieletu. Procedurę tę rozpoczynamy od mikroiniekcji niewielkiej objętości znakowanej fluorescencyjnie aktyny do żywych komórek.Następnie montujemy komorę obrazowania, aby zminimalizować efekty fotobleachingu. Najpierw dwa kawałki dwustronnej taśmy przyklejamy po obu stronach preparatu szkiełka w miejscu, w którym będzie spoczywać nakrywka z komórkami. Następnie do komory pipetujemy medium do obrazowania, dozując je w pobliżu jednej z otwartych szczelin.Na koniec wszystkie cztery boki zostają uszczelnione za pomocą Parafilmu. Dzień dobry, nazywam się James Lim i reprezentuję laboratorium Galena Deucera w Departamencie Biologii Komórki w Scripps Research Institute. Dzisiaj zaprezentujemy Państwu procedurę mikroskopii plamek fluorescencyjnych.Niniejszą procedurę wykorzystujemy do badania dynamiki aktyny w migrujących komórkach nabłonkowych. Przejdźmy zatem do realizacji. Kluczowym elementem pozwalającym na uzyskanie wysokiej jakości filmów w mikroskopii plamkowej (fluorescent speckle microscopy) jest prawidłowe znakowanie aktyny wybranym fluorophorem; zalecamy stosowanie fluorophoreów z serii Alexa oraz rodamyny, pochodnych estrów NHS, które wiążą się z odsłoniętymi resztami lizyny na powierzchni aktyny.Ważne jest, aby stopień znakowania był wysoki, w zakresie od 0,3 do 0,7 barwnika na monomer aktyny, aby zapewnić, że plamki będą jasne i wyraźne przed długoterminowym przechowywaniem. Roztwór znakowanej aktyny należy sklarować, wirując go przy 75 000 do 80 000 ×g przez 20 minut w temperaturze 4°C. Znakowaną aktynę należy przechowywać w roztworze buforu G w temperaturze -80°C.Przygotowano alikwoty o objętości 2 µL, aby uniknąć wielokrotnego zamrażania i rozmrażania, co może prowadzić do powstania nierozpuszczalnych agregatów. Aby zapobiec fotoblaknięciu fluoroforów, nie należy wystawiać znakowanego roztworu aktyny na bezpośrednie działanie światła przez dłuższy czas oraz należy używać nieprzezroczystych probówek do mikrocentryfugi do długoterminowego przechowywania. Komórki do mikroiniekcji umieszczono na kwadratowych szkiełkach podstawkowych przemytych kwasem.Standardową powłokę podłoża można nanieść na szkiełko podstawowe, co nie wpłynie na proces mikroiniekcji. Przechowuj komórki w temperaturze 37 °C podczas przygotowywania aktyny, aby wybrać komórki podatne na mikroiniekcję. W przypadku FSM należy wziąć pod uwagę następujące kryteria.Komórki powinny być duże, o średnicy przekraczającej 50 µm, spłaszczać się po wysianiu i naturalnie przylegać do podłoży. Korzystne jest również, jeśli cytoplazma komórki zajmuje powierzchnię większą niż jej jądro. Odpowiednie linie komórkowe obejmują m.in. PTK, komórki płuc traszki oraz neurony AIA.W niniejszej demonstracji przeprowadzimy iniekcję PTK do komórek nabłonkowych. Prawidłowy dobór igieł do mikroiniekcji zależy od rozmiaru otworu końcówki. Typowo wielkość otworu może wynosić od 0.5 micrometers do nawet trzech micrometers.Zalecamy optymalną wielkość otworu od 0,5 do 1 µm. Do iniekcji można zakupić gotowe igły do mikroiniekcji lub wykonać je samodzielnie. Jeśli dostępny jest komercyjny wyciągacz igieł, osobom początkującym zalecamy przygotowanie od 10 do 20 wyciągniętych igieł przed rozpoczęciem procedury iniekcji.Kolejnym krokiem jest rozcieńczenie znakowanego actonu lodowatym buforem do iniekcji. Wszystkie roztwory robocze należy przechowywać w lodzie. Optymalne stężenie iniekcyjne, czyli końcowe stężenie actonu załadowanego do igły, wynosi od 0.5 do 1 µg/µL.Przyjmując 40% stosunek znakowania D do ilości monomeru aktyny, nanieś od 0,5 do 1 µL rozcieńczonego roztworu aktyny. Używając igły mikros注射rówki, ostrożnie dozuj roztwór aktyny. Staraj się unikać pęcherzyków powietrza.W przypadku pojawienia się pęcherzyków powietrza można je łatwo usunąć, pobierając nadmiar cieczy otaczającej pęcherzyk. Należy upewnić się, że roztwór Acton spoczywa całkowicie na końcówce igły. Wzdłuż kapilary igły nie powinno znajdować się żadne nadmiarowe rozwiązanie, ponieważ może ono zaburzyć przepływ podczas iniekcji.Załadowana igła jest teraz gotowa do zamocowania w uchwycie wtryskowym do mikroiniekcji. Wyjmij komórki z inkubatora i umieść szkiełko podstawkowe na stoliku mikroskopu. Aby rozpocząć procedurę mikroiniekcji, przenieś załadowaną igłę do mikroskopu.Ostrożnie przymocuj igłę do uchwytu injektora, unikając kontaktu z jej końcówką. Ustaw uchwyt tak, aby igła tworzyła kąt od 35 do 50 stopni względem podstawy stolika mikroskopu. Obniż końcówkę igły, aż ledwo przebije powierzchnię medium kąpielowego.Komórki pozycjonują teraz końcówkę igły tak, aby znajdowała się ona bezpośrednio nad centrum obiektywu. Jeśli końcówka igły jest wyrównana z obiektywem, przez okular powinna być widoczna jasna aureola. Jest to krawędź końcówki igły.Powolne przesuwanie igły z boku na bok może pomóc w dokładniejszym zlokalizowaniu halo. Podczas nawigacji należy upewnić się, że końcówka igły znajduje się znacznie powyżej komórek. Aby zapobiec złamaniu końcówki igły, należy regulować pokrętło Z.Focus mikroskopu, aż komórki staną się wyraźnie widoczne.Następnie powoli opuszczaj końcówkę igły, kontrolując ostrość, aż halo stopniowo się zwęzi i ostatecznie zbiegnie się w końcówce igły. Można również szukać trzonu igły, który będzie rzucał liniowe cienie. Opuszczanie igły pozwoli stopniowo zdefiniować trzon igły.Może być konieczna niewielka regulacja pierścienia fazowego w celu poprawy kontrastu, tak aby zarówno koniec igły, jak i komórki były teraz wyraźnie widoczne. Podczas wyboru komórek do iniekcji, komórki z wolnymi krawędziami powinny być skierowane w stronę końcówki igły. Zapewni to, że opadający stok komórki – od najgrubszego punktu, w którym znajduje się jądro, do najcieńszego punktu krawędzi prowadzącej – spotka się z końcówką igły, zamiast przebiegać równolegle do niej.Ustaw ciśnienie igły w zakresie od 0.3 do 0.8 PSI. Stałe przyłożone ciśnienie zapewni jednostajny przepływ roztworu acton. Po wybraniu komórki do iniekcji, powoli ustaw igłę tak, aby jej końcówka znajdowała się obok jądra komórkowego, a następnie obniż ją i skoryguj pozycję igły, aż do momentu wciśnięcia końcówki.Stopniowo obniżaj igłę, aż jej końcówka przebije błonę. Jeśli igła całkowicie przebije błonę, komórka stanie się jaśniejsza. Gdy tylko zauważysz tę zmianę, podnieś igłę, aż przestanie ona dotykać komórki.Sam proces przebijania i wstrzykiwania trwa od 0,5 do dwóch sekund. Przy prawidłowym wykonaniu kształt komórki pozostanie niezmieniony. Aby zminimalizować stres komórek, każda sesja mikroiniekcji nie powinna trwać dłużej niż od 20 do 45 minut.Czasami podczas wstrzykiwania może nie być widocznych zmian w komórce, a komórka nie zwiększy swojej jasności. Świadczy to o tym, że końcówka igły może być zapchana. Można to sprawdzić, naciskając przycisk czyszczenia, jeśli jest on dostępny w Twoim mikroinjektorze.Jeśli końcówka igły jest otwarta, spowoduje to znaczne zwiększenie stałego przepływu pod ciśnieniem, co objawia się w postaci zmarszczek oraz rozproszenia znajdujących się w pobliżu zanieczyszczeń. Jeśli końcówka igły jest zamknięta, można wprowadzić nową igłę do mikroiniekcji lub spróbować odłamać końcówkę igły, delikatnie ją opuszczając, aż naprze się ona o szklane szkiełko podstawowe. Spowoduje to odłamanie samego końca końcówki.Powierzchnia przełomu nie powinna przekraczać jednej piątej powierzchni czubka igły, czyli tej części igły, która zaczyna zwężać się ku końcowi po zakończeniu mikroiniekcji. Wymień pożywkę komórkową w naczyniu na świeżą, uprzednio ogrzaną pożywkę, aby usunąć wszelkie pozostałości fluorescencyjne. Po wymianie pożywki pozostaw komórki na 30 minut w inkubatorze o temperaturze 37 °C w celu regeneracji przed wykonaniem obrazowania.Pozwoli to również na wbudowanie aktyny w istniejącą sieć cytoszkieletu podczas regeneracji komórek w inkubatorze; w tym czasie należy rozpocząć montaż komory obrazowania. Najpierw podgrzać pożywkę do obrazowania w kąpieli wodnej o temperaturze 37 °C. Następnie rozmrozić w temperaturze pokojowej aliquot 15 µL oxa erase.Dodanie RA do pożywki w późniejszym etapie znacznie ograniczy efekty fotowybielania. Owinięcie gumy do uszczelniania (oxa erase) folią aluminiową zapewni ochronę związku światłoczułego przed światłem. Podgrzej uszczelniacz VAP na płycie grzejnej ustawionej na niską temperaturę; nie przegrzej i nie przypal uszczelniacza VAP, ponieważ straci on swoją skuteczność jako materiał uszczelniający.Przetrzyj szkiełko mikroskopowe chusteczką Kim nasączoną czystym etanolem, aby je oczyścić i usunąć drobne zanieczyszczenia. Ułóż dwa równe odcinki obustronnej taśmy klejącej o długości 2,5 cm jeden na drugim, korzystając z czystej, płaskiej powierzchni, takiej jak inne szkiełko mikroskopowe. Dociskając taśmy, usuń wszelkie uwięzione pęcherzyki powietrza, aby stworzyć całkowicie płaską powierzchnię.Następnie za pomocą żyletki wytnij dwa proste paski wzdłuż długiej osi taśmy, tak aby każdy pasek miał 0,5 centymetra szerokości. Używając pęsety, umieść każdy pasek wzdłuż długich krawędzi szkiełka przedmiotowego w taki sposób, aby dwa paski taśmy tworzyły przerwę w centrum szkiełka. Delikatnie dociśnij taśmę, aby zapewnić szczelne przyleganie do szkła.Te paski taśmy będą pełnić funkcję dystansów między szkiełkiem przedmiotowym a szkiełkiem nakrywką. Sprawdź zawór, aby upewnić się, że substancja całkowicie się upłynniła. Przed rozpoczęciem następnego kroku pobierz podgrzane wcześniej medium obrazujące.Do każdych 500 µL pożywki dodać 15 µL oxy rays. Złożyć chusteczkę do wycierania chem wipe w trójkąt, aby utworzyć trzy sztywne krawędzie. Posłuży ona później do przecierania szkiełka nakrywnego.Wyjmij komórki z inkubatora za pomocą pęsety. Szybko podnieś róg szkiełka nakrywki. Połóż szkiełko nakrywki na chusteczce Kimwipe stroną z komórkami do góry, tak aby nie dotykała ona tkanki, a następnie użyj złożonej chusteczki Kimwipe do wytarcia dwóch przeciwległych boków szkiełka, aby uzyskać powierzchnię półsuchą.Następnie chwyć pęsetą róg szkiełka nakrywki i umieść je na szkiełku przedmiotowym w taki sposób, aby suche powierzchnie były wyrównane z dwoma paskami taśmy. Zauważ, że powstały dwie zamknięte krawędzie i dwie otwarte szczeliny. Powoli pipetuj 200 µL roztworu RA medium obrazującego w pobliżu jednego z otworów.Ważne jest, aby nie wprowadzić żadnych pęcherzyków powietrza. Roztwór powinien zostać zassany do nowo złożonej komory siłami kapilarnymi, co zapewni pełne zanurzenie komórek w roztworze. Za pomocą patyczka higienicznego nanieś roztopiony vap na cztery narożniki szkiełka nakrywkowego, aby szybko przymocować i ustabilizować szkiełko.Zauważą Państwo, że VAP wysycha w ciągu kilku sekund w temperaturze pokojowej. Następnie, zaczynając od zamkniętych boków, należy nałożyć cienki pasek VAP za pomocą patyczka watowego, wykonując ruch przypominający malowanie pędzlem. Powtórzyć tę czynność dla boków otwartych.Powoli nakładaj warstwę VAP, wzmacniając uszczelnienie poprzez powtórzenie etapów powlekania. VAP należy ograniczyć do krawędzi, pozostawiając środek szkiełka nakrywki wolnym. Po uszczelnieniu krawędzi szkiełka nakrywki, delikatnie oczyść jego środkową część za pomocą patyczka kosmetycznego zwilżonego wodą DD H2O, aby usunąć wszelkie pozostałości pożywki.Należy uważać, aby nie zmiażdżyć komórek. Powtórz ten etap czyszczenia, używając czystego etanolu. Otrzymano w ten sposób w pełni zamkniętą komorę obrazującą, zoptymalizowaną do obrazowania fluorescencyjnych plamek.Zastosowanie całkowicie szczelnej obudowy zapobiegnie szybkiemu fotobieleniu próbek roślinnych. Komórki w całkowicie zamkniętej komorze są teraz gotowe do obrazowania. Używamy odwróconego mikroskopu szerokopolowego z lampą rtęciową, iluminatorem epi, odpowiednimi filtrami i obiektywem plan z imersją olejową.Obrazy z obiektywów apochromatycznych są rejestrowane za pomocą chłodzonej kamery CCD z pikselami o rozmiarze 6,7 mikrona oraz oprogramowania do akwizycji obrazu. Należy wstępnie podgrzać stołu mikroskopu do 37°C. Umieść komorę obrazującą i odczekaj od 10 do 15 minut, aż temperatura się ustabilizuje przed przystąpieniem do obrazowania.Po ustabilizowaniu temperatury ustaw ostrość obrazu komórek w polu jasnym, a następnie odszukaj komórki po injekcji, przełączając odpowiednie ustawienia fluorescencyjne. Staraj się zminimalizować czas ekspozycji na światło fluorescencyjne, aby ograniczyć fotobleaching. Szukaj zainfekowanych komórek, które posiadają zdrowe, zakrzywione krawędzie prowadzące.Komórki z nadmierną ilością wstrzykniętego materiału będą charakteryzować się wciągniętymi i poszarpanymi krawędziami przypominającymi liczne filopodia. Nie należy obrazować takich komórek. Ustawienia akwizycji będą zależały od typu komórek, jakości znakowanej aktyny oraz komponentów mikroskopu.Należy jednak pamiętać, aby czas naświetlania nie przekraczał dwóch sekund, a odstęp czasowy między klatkami ustawić w przedziale od 5 do 10 sekund. Można zwiększyć wzmocnienie (gain) w kamerze w celu poprawy stosunku sygnału do szumu. Idealna charakterystyka plamek powinna zapewniać odstęp między każdą plamką a sąsiednią wynoszący około dwóch średnic plamki.W przypadku komórek nabłonkowych sieć aktyny w formie plamek będzie wyglądać homogenicznie, z równomiernie rozmieszczonymi plamkami. Należy dostosować ustawienia ekspozycji, aby uzyskać optymalne obrazy plamek.Kluczem do uzyskania wysokiej jakości filmów z plamkami (speckle movies) jest utrzymanie ostrości. Jest to szczególnie istotne w przypadku analizy następczej obejmującej pomiary przepływu i wymiany plamek. Zatem jakość analizy ilościowej będzie zależeć od zablokowania ostrości na cały czas trwania serii zdjęć (time lapse).W tekście szczegółowo opisano różne strategie utrzymywania ostrości; w tym pokazie zostanie wykorzystany system Nikon Perfect Focus. Poniżej przedstawiono różne przykłady komórek poddanych mikroiniekcji. Panel lewy przedstawia komórkę po mikroinjekcji z obrazem plamkowym o niskim stężeniu.Środkowy panel przedstawia obraz plamkowy komórki z zastosowaniem zbyt wysokiego stężenia podczas mikroiniekcji, a prawy panel pokazuje komórkę po optymalnej iniekcji. W przypadku FSM wymagany jest obraz plamkowy wysokiej jakości. Przedstawiliśmy sposób mikroiniekcji znakowanej fluorescencyjnie aktyny do komórek nabłonkowych na potrzeby fluorescencyjnej mikroskopii plamkowej.Podczas wykonywania tej procedury niezwykle ważne jest pamiętanie, że jakość oznakowanej aktyny, jak i technika mikroiniekcji, będą decydować o ogólnej jakości obrazów speckle. To wszystko i powodzenia w eksperymentach.

live-cell-imaging-f-actin-dynamics-via-fluorescent-speckle-microscopy

Research

JoVE Journal

Biology

Biologia

Obrazowanie żywych komórek dynamiki F-aktyny za pomocą fluorescencyjnej mikroskopii plamek (FSM)

Celem niniejszej pracy jest przeszkolenie czytelnika w obsłudze zintegrowanego mikroskopu sił atomowych i obrazowania optycznego do stymulacji mechanicznej żywych komórek w hodowli. Przedstawiono szczegółowy protokół krok po kroku. Zaprezentowano reprezentatywny zestaw danych obrazujący odpowiedź żywych komórek na stymulację mechaniczną.

Badanie odpowiedzi żywych komórek na stymulację mechaniczną za pomocą zintegrowanej mikroskopii optycznej i sił atomowych

Obrazowanie mikroskopowe żywych komórek śródbłonka wykazujących ekspresję GFP-actin pozwala na charakterystykę dynamicznych zmian w strukturach cytoszkieletu. W przeciwieństwie do technik wykorzystujących utrwalone preparaty, metoda ta umożliwia szczegółową ocenę zmian czasowych w cytoszkielecie aktynowym w tych samych komórkach przed, w trakcie i po różnych bodźcach fizycznych, farmakologicznych lub zapalnych.

Badanie cytoszkieletu aktynowego w żywych komórkach śródbłonka wykazujących ekspresję GFP-aktyny

Czasoprzestrzenne informacje o dynamicznych białkach wewnątrz żywych komórek są kluczowe dla zrozumienia biologii. Rodzaj mikroskopii superrozdzielczej, zwany szybką mikroskopią oświetlenia strukturalnego 3D (f3D-SIM), ujawnia unikalne informacje na temat cytokinetycznego pierścienia Z u bakterii: zarówno jego wygląd podobny do koralików, jak i szybką dynamikę FtsZ w pierścieniu.

Obrazowanie cytokinetycznego pierścienia Z w superrozdzielczości u żywych bakterii przy użyciu szybkiej mikroskopii oświetlenia strukturalnego 3D (f3D-SIM)

Przestrzenny rozkład i czasowa dynamika białek błony komórkowej i lipidów to gorący temat w biologii. W tym przypadku problem ten został rozwiązany za pomocą czasoprzestrzennej analizy fluktuacji obrazu, która zapewnia koncepcyjnie te same fizyczne wielkości śledzenia pojedynczych cząstek, ale wykorzystuje małe znaczniki molekularne i standardowe konfiguracje mikroskopowe.

Od szybkiego obrazowania fluorescencyjnego do prawa dyfuzji molekularnej na żywych błonach komórkowych w komercyjnym mikroskopie

Aby zbadać prędkości przepływu i kierunkowość aktyny nitkowatej w synapsie immunologicznej limfocytów T, obrazowanie super-rozdzielcze żywych komórek jest połączone z całkowitą fluorescencją wewnętrznego odbicia i określone ilościowo za pomocą czasoprzestrzennej spektroskopii korelacji obrazu.

Korowy przepływ aktyny w limfocytach T określony ilościowo za pomocą czasoprzestrzennej spektroskopii korelacji obrazów danych z mikroskopii oświetlenia strukturalnego

Przedstawiamy protokół zastosowania interferometrycznej mikroskopii lokalizacji fotoaktywowanej (iPALM), 3-wymiarowej metody mikroskopii lokalizacji pojedynczych cząsteczek w super rozdzielczości, do obrazowania cytoszkieletu aktynowego w przylegających komórkach ssaków. Takie podejście umożliwia opartą na świetle wizualizację cech strukturalnych w nanoskali, które w przeciwnym razie pozostałyby nierozwiązane przez konwencjonalną mikroskopię optyczną z ograniczoną dyfrakcją.

Trójwymiarowa mikroskopia superrozdzielcza włókien F-aktyny za pomocą interferometrycznej mikroskopii lokalizacji aktywowanej światłem (iPALM)

Ten protokół opisuje nową metodę pozwalającą na ilościową wizualizację złożonego tworzenia białek SNARE, opartą na transferze energii rezonansu Förstera i mikroskopii obrazowania życia fluorescencji.

Wizualizacja wewnątrzkomórkowego transportu SNARE za pomocą mikroskopii obrazowania czasu życia fluorescencji

Opisujemy, jak techniki mikro- i fotomanipulacji, takie jak FRAP i fotoaktywacja, umożliwiają określenie parametrów ruchliwości i czasoprzestrzennej dynamiki białek w migrujących komórkach. Odczyty eksperymentalne obejmują dynamikę subkomórkową i obrót regulatorów ruchliwości lub leżącego u podstaw cytoszkieletu aktynowego.

Techniki mikromanipulacji pozwalające na analizę dynamiki morfogenetycznej i obrotu regulatorów cytoszkieletu

Aby się rozwijać, stożki wzrostu muszą wywierać siłę napędową na środowisko zewnętrzne. Wytwarzanie sił uciągu zależy od dynamiki aktyny i sprzężenia sprzęgła. W niniejszej pracy opisano metody analizy dynamiki aktyny, sprzęgu sprzęgła i sił trakcyjnych dla wyprzedzenia stożka wzrostu.

Analizy dynamiki aktyny, sprzęgła sprzęgła i siły uciągu dla wyprzedzenia stożka wzrostu

Prezentujemy protokoły prostych testów mikroprzepływowych filamentów aktynowych, w połączeniu z mikroskopią fluorescencyjną, które pozwalają na dokładne monitorowanie poszczególnych filamentów aktynowych w czasie rzeczywistym, podczas sekwencyjnego wystawiania ich na działanie różnych roztworów białkowych.

Wykorzystanie mikrofluidyki i mikroskopii fluorescencyjnej do badania dynamiki składania pojedynczych filamentów i wiązek aktyny

Tutaj prezentujemy metody przygotowania quasi-dwuwymiarowych (2D) splątanych, usieciowanych i ciekłokrystalicznych zespołów aktynowych z oczyszczonych białek.

Dostrajanie trybów kurczliwości i deformacji aktywnych zespołów na bazie aktyny in vitro: od dwuwymiarowych sieci aktywnych do kropli ciekłokrystalicznych

Poznaj technikę fluorescencyjnej mikroskopii plamkowej do badania dynamiki białek cytoszkieletowych w żywych komórkach. Naucz się mikroinjekcji fluorescencyjnie znakowanego aktyny i montażu komory obrazującej.

Obrazowanie żywych komórek w celu analizy dynamiki F-aktyny za pomocą fluorescencyjnej mikroskopii plamistej (FSM)

Przeglądaj więcej filmów