$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
W przypadku ujemnego barwienia wirusów otoczkowych należy rozpocząć od pożądanej zawiesiny wirusowej. Inkubuj wirusy za pomocą aldehydu glutarowego, chemicznego utrwalacza. Po penetracji aldehyd glutarowy sieciuje białka wirusowe i kwasy nukleinowe, inaktywując wirusy przy jednoczesnym zachowaniu morfologii, ułatwiając w ten sposób bezpieczne obchodzenie się z wirusem. Przenieś tę mieszaninę na płytkę wielodołkową.
Podłączyć transmisyjną mikroskopię elektronową, TEM, siatki zawierające kapsułkę do pipety za pomocą łącznika. Za pomocą pipety odessać mieszaninę utrwalającą wirusa do kapsułki. Przeprowadzić inkubację zespołu pipet, aby wirusy mogły adsorbować się na powierzchni siatki.
Usuń mieszaninę. Umyj kapsułkę, usuwając nieprzylegające wirusy i utrwalacze. Do kapsułki należy wprowadzić pipetą roztwór octanu uranylu, barwnika na bazie metali ciężkich. Inkubować, aby plama mogła zetknąć się z wirusami.
Jony uranylowe wiążą się ze specyficznymi glikoproteinami błonowymi i fosfolipidami na powierzchni wirusa. Jony mogą przenikać do wirusów i wiązać się z białkami nukleokapsydu otaczającymi genom. To wiązanie indukuje agregację i odkładanie jonów metali ciężkich wokół wirusa i określonych struktur wirusowych.
Oddzielić kapsułkę. Usuń nadmiar plamy z rusztów i wysusz na powietrzu.
Podczas obrazowania TEM wiązki elektronów o wysokiej energii przechodzą przez wirusa, powodując, że zabarwione elektronami obszary wirusa rozpraszają więcej elektronów. Jednak ogólna niska gęstość elektronowa wirusa pozwala elektronom na przemieszczanie się. System obrazowania przetwarza te różnie rozproszone elektrony, tworząc obraz o wysokim kontraście.
Ujemnie zabarwione wirusy wydają się jaśniejsze z ciemnym nukleokapsydem na ciemnej obwódce, co ułatwia wizualizację ultrastruktury.
Na początek wymieszaj zawiesinę wirusa z równą objętością 4% aldehydu glutarowego, aby uzyskać końcowe stężenie 2% aldehydu glutarowego. Za pomocą utrwalacza dezaktywuj wirusa na co najmniej 24 godziny. Odkaż rurkę i przenieś ją do zakładu BSL2-EM.
Następnie podłącz wychwytywacz z siatką do pipety. Zassać mieszaninę do kapsułki. Umieść pipetę na boku z kratkami ustawionymi poziomo na 10 minut.
Następnie podnieś pipetę i wyrzuć mieszaninę wirusów do pojemnika na odpady. Zassać 40 mikrolitrów wody dejonizowanej do kapsułki, a następnie wyrzucić wodę do pojemnika na odpady. Powtórz to pranie trzy razy.
Następnie zassaj 40 mikrolitrów 1% UA lub 1% PTA do kapsułki przez 30 sekund. Wyjąć kapsułkę z pipety. Używając bibuły filtracyjnej, wysusz kratki, a następnie pozwól im wyschnąć na powietrzu.