$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Aby wykryć interakcje antygen-przeciwciało za pomocą fotometrii masowej, najpierw inkubuj pożądane stężenie oczyszczonych antygenów i przeciwciał przez wymagany okres czasu, ułatwiając wiązanie antygen-przeciwciało. Opierając się na stechiometrii wiązania antygenu, regiony paratopowe tych przeciwciał mogą mieć różną liczbę przyłączonych antygenów.
Przepłynąć roztwór zawierający wolne przeciwciała wraz z kompleksami antygen-przeciwciało przez wstępnie zmontowaną komorę przepływową. Przymocuj komorę do stolika mikroskopu fotometru masowego. Następnie skieruj wiązkę lasera przez komorę przepływową, aby uzyskać optymalne obrazowanie.
W zależności od liczby antygenów przyłączonych do każdego przeciwciała zmienia się masa cząsteczkowa kompleksów. Te zmiany masy powodują, że kompleksy rozpraszają światło w różny sposób.
Kompleksy o większych masach cząsteczkowych, w których dwa antygeny są związane z obydwoma paratopami jednego przeciwciała, rozpraszają więcej światła w porównaniu z pojedynczymi kompleksami zawierającymi antygen. Ponadto wolne przeciwciała wykazują najmniejsze rozproszenie światła.
Detektor zbiera rozproszone światło i mierzy jego częstotliwość oraz intensywność. Fotometr rejestruje fluktuacje rozproszonego światła jako wzór interferencyjny, reprezentując go jako plamy.
Słabe punkty odpowiadają wolnym przeciwciałom. Natomiast bardzo ciemne plamy reprezentują kompleksy z dwoma antygenami, a mniej ciemna plama zawiera jeden związany antygen.
Obecność ciemnych plam jest zgodna z interakcjami antygen-przeciwciało.
Aby ocenić powinowactwo przeciwciało-antygen za pomocą fotometrii masowej, nałóż kroplę olejku immersyjnego mikroskopu na obiektyw instrumentu i umieść komorę przepływową na stoliku mikroskopu. Dodaj 10 mikrolitrów przefiltrowanego PBS do jednego końca kanału komory przepływowej. Bufor wejdzie do kanału przez działanie kapilarne.
Na karcie Focus Control w oprogramowaniu do zbierania danych użyj przycisków ruchu zgrubnego stage w górę i w dół, aby dokonać początkowych regulacji, a następnie kliknij przycisk Ostrość, aby view odczyt sygnału ostrości. Użyj precyzyjnych przycisków regulacji w górę i w dół, aby zmaksymalizować wartość ostrości, a następnie kliknij Ustaw ostrość i Zablokuj ostrość, aby aktywować funkcję śledzenia ostrości. Obraz czystego slajdu powinien mieć wartość "sygnału" równą lub mniejszą niż 0,05%.
Załaduj 20 mikrolitrów pierwszej próbki przeciwciała-antygenu, jak pokazano, osuszając płyn z drugiego końca małym kawałkiem bibuły. Natychmiast po załadowaniu kliknij przycisk Nagraj, aby uzyskać odpowiednią liczbę klatek odpowiadającą 100 sekundom danych. Na koniec okresu zbierania danych wprowadź nazwę pliku dla danych i kliknij przycisk OK, a następnie Próbka, aby zapisać plik.
Aby przeanalizować dane fotometrii masowej, otwórz interesujący Cię plik i kliknij przycisk Analizuj. Kliknij przycisk Załaduj, aby załadować funkcję kalibracji, a następnie kliknij przycisk Plik i zapisz wyniki jako, aby zapisać analizowane dane.
Aby uzyskać względne stężenia każdego gatunku w próbce, otwórz plik "eventsFitted.csv", skopiuj dane z kolumny M do odpowiedniego oprogramowania do tworzenia wykresów i analizy, a następnie użyj funkcji Wykres/Statystyka/Histogram, aby wykreślić rozkład masy cząsteczkowej. Kliknij dwukrotnie histogram, aby otworzyć okno Właściwości działki, wyłącz automatyczne kategoryzowanie i wybierz rozmiar pojemnika 2,5 kilodaltonów.
Aby utworzyć dane wyśrodkowań pojemników i inwentaryzacji, kliknij przycisk Zastosuj i przenieś. Aby dopasować histogram do funkcji Gaussa, wybierz kolumny Centra pojemników i Liczności, a następnie kliknij funkcje menu Analiza/Piki i Dopasowanie linii bazowej/wielu pików. Kliknij dwukrotnie, aby wskazać przybliżone pozycje pików na wykresie rozkładu, a następnie kliknij przycisk Otwórz NLFit.
Zaznacz pola wyboru Stałe dla centrów "xc" i ustaw ich wartości na oczekiwane masy cząsteczkowe wolnego przeciwciała oraz pojedynczych i podwójnych kompleksów antygen-przeciwciało. Zaznacz opcję Udostępnij dla parametrów szerokości i kliknij Dopasuj.
Dopasowane wartości wysokości pików składowych Gaussa reprezentują względne stężenie każdego gatunku w próbce. Następnie użyj równania, aby obliczyć ułamek stężenia każdego gatunku na podstawie wartości wysokości piku.