$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Weźmy oczyszczony mózg myszy z komórkami wyrażającymi białka fluorescencyjne i lipidy usunięte w celu uzyskania przezroczystości do obrazowania głębokich struktur w wysokiej rozdzielczości.
Siatka hydrożelowa zachowuje biomolekuły i utrzymuje sieci neuronowe.
Przenieś mózg do komory obrazowania zawierającej pierścień agarozowy dla wsparcia.
Zabezpiecz tkankę klejem i wypełnij komorę roztworem dopasowującym współczynnik załamania światła, aby zminimalizować rozpraszanie światła i stworzyć stabilne środowisko obrazowania.
Umieść komorę na stoliku mikroskopu konfokalnego i delikatnie opuść obiektyw do roztworu, aby ustanowić ciągłą kolumnę kontaktu.
Użyj epifluorescencji, aby zlokalizować obszary zainteresowania. Następnie dostosuj parametry lasera i obrazowania, aby zoptymalizować jakość obrazu.
Uchwyć serię stosów z, aby stworzyć trójwymiarową reprezentację tkanki.
Użyj odpowiedniego oprogramowania do analizy morfologii komórek, w tym altan dendrytycznych, ich kolców oraz rozmieszczenia i gęstości neuronów.
Aby zbudować dużą komorę do obrazowania tkanek dla tkanek o grubości większej niż 5 milimetrów, użyj 10-centymetrowego szklanego naczynia o wysokiej ściance. Umieść stożkową rurkę o pojemności 50 mililitrów pośrodku, upewniając się, że średnica rurki jest wystarczająco duża, aby pomieścić tubus używanej soczewki obiektywu. Zrób 3% agarozy w wodzie i wlej ją do przestrzeni między szklanym naczyniem a stożkową rurką.
Następnie pozwól mu ostygnąć przez godzinę. Utworzy to pierścień z litej agarozy. Bezpiecznie przyklej tkankę do dna komory za pomocą superglue i napełnij komorę roztworem dopasowującym współczynnik załamania światła, który może zacząć polimeryzować, chyba że zostanie zachowany z powietrza i przechowywany w temperaturze 4 stopni Celsjusza. Uzyskaj obraz za pomocą mikroskopu konfokalnego.
Włącz wszystkie odpowiednie urządzenia do przetwarzania obrazu. Umieść próbkę na stoliku. Ostrożnie podejdź do mediów zanurzeniowych z obiektywem i uformuj ciągłą kolumnę mediów. Korzystając z epifluorescencji, znajdź odpowiednie pole obrazowania. Zacznij od ustawienia rozdzielczości i szybkości skanowania.
W przypadku obrazowania za pomocą mikroskopu konfokalnego należy całkowicie zamknąć otwór otworkowy, aby uzyskać najmniejszy przekrój optyczny, a tym samym najlepszą rozdzielczość Z. Stopniowo zwiększaj moc lasera lub wzmocnienie czujnika, aż do uzyskania odpowiedniego obrazu o wysokim stosunku sygnału do szumu. Jeśli korzystasz ze standardowego obrazowania dwukolorowego EGFP lub tdTomato, ustaw ustawienia zbierania światła.
Ustaw parametry stosu Z na podstawie obserwowanych początków i punktów końcowych tkanki. Ustaw rozmiar kroku na podstawie żądanej rozdzielczości Z. Mniejsze rozmiary kroków zapewnią większą rozdzielczość Z, ale mogą prowadzić do wybielania próbki.
Jeśli ustawienia akwizycji obrazu są zadowalające, uzyskaj obraz. Upewnij się, że obraz ma wysoki stosunek sygnału do szumu i pokazuje wyraźne granice struktur.