Technika spektroskopii w podczerwieni z transformacją Fouriera do badania samoorganizacji peptydów

Spektroskopia w podczerwieni z transformacją Fouriera — FTIR — pomaga badać samoorganizację peptydów w struktury supramolekularne utrzymywane razem przez oddziaływania niekowalencyjne.

Zacznij od pobrania niezłożonej próbki białka - zawiesiny peptydów amyloidowych ze zdolnością do tworzenia bogatej w arkusze beta struktury supramolekularnej. Umieścić próbkę w przyrządzie FTIR wyposażonym w kryształ ATR.

Skieruj wiązkę podczerwieni pod krytycznym kątem na kryształ; wiązka przechodzi przez niego i uderza w granicę między kryształem a próbką. Kryształy o wyższym współczynniku załamania światła niż próbka powodują wewnętrzne odbicie wiązki.

Niewielka część wiązki rozciąga się w głąb próbki jako fala ulotna — fala stojąca w punktach odbicia. Oddziaływanie tej fali z próbką powoduje absorpcję energii fali, co prowadzi do tłumienia wiązki odbitej zarejestrowanej przez detektor.

W zależności od struktury peptydu, próbka absorbuje się w określonych obszarach widma podczerwonego. Widmo absorpcyjne — uzyskane w wyniku transformacji Fouriera sygnału — wykazuje szeroki pik przy określonej liczbie falowej, charakterystyczny dla niezłożonej próbki białka.

Inkubować próbkę, umożliwiając samoorgani