Identification of Rare Bacterial Pathogens by 16S rRNA Gene Sequencing and MALDI-TOF MS

Percy Schr&#246;ttner; Florian Gunzer; Jana Sch&#252;ppel; Wolfram W. Rudolph

doi:10.3791/53176

Identyfikacja rzadkich patogenów bakteryjnych za pomocą sekwencjonowania genu 16S rRNA i MALDI-TO...

JoVE Journal
Immunology and Infection

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Immunology and Infection

Identification of Rare Bacterial Pathogens by 16S rRNA Gene Sequencing and MALDI-TOF MS

Identyfikacja rzadkich patogenów bakteryjnych za pomocą sekwencjonowania genu 16S rRNA i MALDI-TOF MS

Full Text

20,803 Views

06:34 min

July 11, 2016

DOI: 10.3791/53176-v

Percy Schröttner¹, Florian Gunzer¹, Jana Schüppel², Wolfram W. Rudolph²

¹Institut für Medizinische Mikrobiologie und Hygiene, Medizinische Fakultät Carl Gustav Carus,TU Dresden, ²Institut für Virologie, Medizinische Fakultät Carl Gustav Carus,TU Dresden

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Laserowa desorpcja/jonizacja wspomagana matrycą spektrometria mas lotu (MALDI-TOF MS) oraz techniki molekularne (sekwencjonowanie genów 16S rRNA) pozwalają na identyfikację rzadkich patogenów bakteryjnych w rutynowej diagnostyce. Celem tego protokołu jest połączenie obu technik, co prowadzi do dokładniejszych i bardziej wiarygodnych danych.

Ogólnym celem tego protokołu spektrometrii mas MALDI-TOF jest poprawa typowania rzadkich patogenów poprzez szybką i opłacalną procedurę. Metoda ta może pomóc odpowiedzieć na kluczowe pytania z zakresu mikrobiologii diagnostycznej, pozwala na szybkie poznanie rzadkich patogenów bakteryjnych. Dzisiaj chcemy porozmawiać o odoratimimus i bakteriach z rodzaju Myroides.

Zademonstrowanie metody i opowiedzenie o interpretacji wyników. Ogólnie rzecz biorąc, osoby, które dopiero zaczynają korzystać z tej metody, mogą mieć trudności, ponieważ przenoszenie bakterii, nakładanie metryk i interpretacja wyników wymagają umiejętności technicznych i wiedzy mikrobiologicznej. Po raz pierwszy wpadliśmy na pomysł, aby użyć MALD-TOF MS do badań przesiewowych w kierunku rzadkich bakterii, gdy mieliśmy w naszym szpitalu pacjenta cierpiącego na cukrzycową infekcję pokarmową wywołaną przez Myroides odoratimus.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Explore More Videos

Słowa kluczowe: Sekwencjonowanie genu 16S RRNA MALDI-TOF MS rzadkie patogeny bakteryjne Myroides Odoratimimus ekstrakcja bakteryjnego DNA 16S RRNA PCR sekwencjonowanie Sangera analiza MS MALDI-TOF oprogramowanie MALDI Biotyper identyfikacja bakterii mikrobiologia diagnostyczna