9 stycznia 2017
Opisano zastosowanie cząsteczek polideoxynukleotydu (44-merowego aptameru) do wykrywania niechelatowanego jonu gadolinu(III) w roztworze wodnym. Obecność jonu jest wykrywana poprzez wzrost emisji fluorescencji czujnika.
Ogólnym celem tego testu opartego na fluorescencji jest wykrycie obecności toksycznego nieschelatowanego jonu gadolinu w roztworach wodnych zawierających środki kontrastowe do obrazowania metodą rezonansu magnetycznego. Metoda ta może ułatwić stosowanie środków kontrastowych MRI na bazie gadolinu, zapewniając środki zapewniające wysoką parzystość syntetyzowanych środków. Główną zaletą tej techniki jest to, że jest ona w stanie wykryć submikromolowe stężenie niechelatowanego toksycznego gadolinu ze stosunkowo wysoką selektywnością w stosunku do innych kationów metali biologicznych.
Aby rozpocząć tę procedurę, należy przygotować bufor testowy zgodnie z opisem w protokole tekstowym. Używając wodorotlenku sodu i kwasu solnego, dostosuj pH do 7,4. Następnie przefiltruj bufor przez sterylny jednorazowy filtr butelkowy z membraną PES o grubości 0,2 mikrona.
Następnie przenieś 497 mikrolitrów buforu testowego do świeżej mikroprobówki wirówkowej. Dodać jeden mikrolitr przygotowanego roztworu podstawowego aptameru gadolinu i dwa mikrolitry przygotowanego roztworu podstawowego QS. Przenieś 50 mikrolitrów tego roztworu czujnika 2X gadolinu do każdej z dziewięciu probówek PCR.
Następnie umieść rurki w termocyklerze. Ustaw termocykler tak, aby podgrzewał próbki do 95 stopni Celsjusza przez pięć minut, a następnie powoli schładzaj roztwory do 25 stopni Celsjusza przez 15 minut. Ważne jest, aby pamiętać, aby podgrzać roztwory czujnika gadolinu 2X do 95 stopni, a następnie powoli schłodzić do temperatury pokojowej przed dodaniem roztworu jonów gadolinu.
Na początek rozpuść stały trichlorek gadolinu w buforze do oznaczania, aby utworzyć roztwór podstawowy trzech gadolinów o pożądanym stężeniu. Stosując rozcieńczenie szeregowe, przygotuj sześć 100 mikrolitrów trzech roztworów gadolinu, jak opisano w protokole tekstowym. Następnie rozpuścić badany środek kontrastowy w buforze do oznaczania.
Użyj seryjnego rozcieńczenia, aby przygotować trzy różne stężenia. Następnie wyjmij probówki PCR zawierające 2X roztwór czujnika gadolinu z termocyklera. Przenieś 50 mikrolitrów każdego roztworu gadolinu do oddzielnych probówek do PCR.
Odpipetuj każdy roztwór w górę i w dół kilka razy, aby wymieszać. Następnie przenieś 50 mikrolitrów każdego roztworu środka kontrastowego oddzielnie do pozostałych probówek PCR. Wymieszać, pipetując kilka razy w górę i w dół.
Inkubować wszystkie dziewięć roztworów przez pięć minut w temperaturze pokojowej. Następnie przenieś 45 mikrolitrów każdego roztworu na płytkę 384-dołkową w dwóch egzemplarzach. Następnie zapisz i przeanalizuj dane fluorescencji zgodnie z opisem w protokole tekstowym.
W tym badaniu niechelatowany trójwartościowy jon gadolinu jest wykrywany w roztworze wodnym przy użyciu metody opartej na fluorescencji. Czujnik fluorescencyjny jest opracowywany przez dołączenie fluoroforu do aptameru. Czujnik jest następnie hybrydyzowany z pasmem hartującym, które jest oznaczone ciemną cząsteczką wygaszającą.
Dodanie gadolinu trzeciego powoduje wyparcie nici gasnącej z aptameru, powodując wzrost emisji fluorescencji. Krzywe kalibracyjne uzyskuje się przy użyciu 100 nanomolowego aptameru gadolinu i 200 nanomolowego QS i wykreśla się albo surową fluorescencję, albo zmianę fałdowania fluorescencji. Obie krzywe pokazują zakres liniowy dla stężeń gadolinu o trzech stężeniach poniżej jednego mikromola i nasycenia sygnału przy stężeniach powyżej trzech mikromolowych.
Dwie różne partie kwasu gadoterowego są następnie analizowane pod kątem stężeń w zakresie od zera milimolowego do 20 milimolowych. Podczas gdy emisja fluorescencji próbki o wysokiej czystości nie wzrasta zauważalnie w tym zakresie, obserwuje się znaczącą zmianę w próbce zawierającej nieschelatowany gadolin trzy przy stężeniach tak niskich, jak pięć milimolów. Podczas wykonywania tej procedury ważne jest, aby upewnić się, że w dołkach mikropłytki nie ma pęcherzyków powietrza, ponieważ zmieni to odczyt fluorescencji.
Stosując tę procedurę, być może uda nam się wykryć nawet niewielkie ilości obliczonych jonów gadolinu w roztworach zawierających środki kontrastowe. Będzie to dobra metoda określania czystości środków. Praca z chemikaliami może być niebezpieczna, a podczas wykonywania tej procedury ważne jest podjęcie środków ostrożności, takich jak noszenie środków ochrony osobistej.
Wyświetl pełny transkrypt i uzyskaj dostęp do tysięcy filmów naukowych
Niniejsze badanie przedstawia analizę opartą na fluorescencji do wykrywania toksycznych, niechelatowanych jonów gadolinu(III) w roztworach wodnych. Metoda ta wykorzystuje cząsteczki polideoksynukleotydów (aptamer 44-mer), które wykazują zwiększoną emisję fluorescencji w obecności jonów gadolinu.
Wykrywanie niechelatowanych jonów gadolinu(III) jest kluczowe dla zapewnienia bezpieczeństwa i jakości środków kontrastowych do MRI opartych na gadolinie, stosowanych w diagnostyce klinicznej. Ten fluorescencyjny sensor oparty na aptamerach umożliwia submikromolarną detekcję toksycznego Gd³⁺ w buforze wodnym, co wspiera wczesny etap opracowywania testów do badania czystości środków kontrastowych. Metoda ta zapewnia selektywny i powtarzalny odczyt, który ułatwia ograniczanie ryzyka mechanistycznego podczas identyfikacji wiodących związków oraz przesiewowej oceny formulacji przedklinicznych.
Metoda ta wpisuje się w kontinuum procesu badawczego – od wczesnego przesiewu środków kontrastowych po przedkliniczną ocenę bezpieczeństwa, w której wykrywanie pozostałości jonów metali dostarcza informacji niezbędnych do optymalizacji formulacji oraz podejmowania decyzji o kontynuacji lub przerwaniu badań.