Dwukierunkowa metodologia PCR w miejscu integracji retrowirusowej i przepływ pracy analizy danych ilościowych

10.3K wyświetleń

Cytowano 5 razy

12:53 min.

14 czerwca 2017

10.3791/55812-v

14 czerwca 2017

10.3K wyświetleń

Gajendra W. Suryawanshi^*¹^,² , Song Xu^*³ , Yiming Xie¹ , Tom Chou³ , Namshin Kim⁴ , Irvin S. Y. Chen¹^,⁵ , Sanggu Kim⁶

¹UCLA AIDS Institute, University of California at Los Angeles (UCLA), ²Department of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics, University of California at Los Angeles (UCLA), ³Departments of Biomathematics and Mathematics, University of California at Los Angeles (UCLA), ⁴Personalized Genomic Medicine Research Center, Division of Strategic Research Groups, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, ⁵Department of Medicine, University of California at Los Angeles (UCLA), ⁶Department of Veterinary Biosciences, College of Veterinary Medicine, The Ohio State University (OSU)

^* These authors contributed equally

Ten manuskrypt opisuje procedurę eksperymentalną i analizę oprogramowania dla dwukierunkowego testu miejsca integracji, który może jednocześnie analizować DNA połączenia wektor-gospodarz w górę i w dół. Dwukierunkowe produkty PCR mogą być używane na dowolnej platformie sekwencjonowania niższego szczebla. Uzyskane dane są przydatne do wysokoprzepustowego, ilościowego porównania zintegrowanych celów DNA.