30 stycznia 2019
Prezentujemy metodę wykrywania chemicznych modyfikacji białek atmosferycznych 3-nitrotyrozyny za pomocą krążków o średnicy 6 mm wyciętych z filtrów wstępnych próbnika powietrza za pomocą wysokowydajnego detektora chromatografii cieczowej i elektrochemicznego (HPLC-ECD).
Metoda ta może pomóc odpowiedzieć na kluczowe pytanie w badaniach środowiskowych dotyczące nitrapyryny i 3-nitrotyrozyny. Główną zaletą tej techniki jest to, że jest to unikalna i bardzo czuła metoda wykrywania 3-nitrotyrozyny na filtrach próbek powietrza. Aby zebrać całkowitą ilość zawieszonych cząstek lub cząstek stałych o wielkości mniejszej niż siedem mikronów, należy najpierw zważyć filtr kwarcowy z 3 mikronami i zabezpieczyć go na próbniku powietrza o dużej objętości. Przykryj filtr selektorem wielkości cząstek, aby zebrać PM7 lub pozostaw filtr odkryty, aby zebrać całkowite zawieszone cząstki. Próbnik powietrza powinien pracować z prędkością 1000 litrów na minutę nieprzerwanie przez siedem dni. Załaduj filtry wstępne do jednostki klasyfikacji wielkości i zainstaluj jednostkę klasyfikacji wielkości oraz filtr zapasowy na próbniku powietrza o małej objętości. Uruchom próbnik powietrza z prędkością 116 litrów na minutę nieprzerwanie przez siedem dni, aby zebrać PM2,5 na filtrze zapasowym. Po zakończeniu pobierania próbek należy zapisać całkowitą objętość przepływu. Zważ filtr i oblicz wagę zebranych cząstek. Zamknij filtr w plastikowej torbie i przechowuj go w temperaturze 30 stopni Celsjusza.Następnie przygotuj 500 mikrolitrów 6X niespecyficznego koktajlu proteazy i buforu octanowego i umieść go w membranie dalasis z odcięciem masy cząsteczkowej 5000 daltonów. Zanurzyć wypełnioną błonę w 1 l buforu octanowego i mieszać w temperaturze 4 stopni Celsjusza przez 24 do 36 godzin, wymieniając bufor co 12 godzin w celu usunięcia indogennej 3-nitrotyrozyny i azotynów. Następnie zmierzyć stężenie białka w dializowanym roztworze proteazy za pomocą testu białkowego kwasu bicinchoninowego. Następnie wyjmij filtr z zamrażarki i pozwól mu ogrzać się do temperatury pokojowej, nadal zamknięty w torbie. Następnie wybij do pięciu okręgów o szerokości 6 milimetrów z obszaru filtra pokrytego cząstkami stałymi i umieść je w mikroprobówce wirówkowej o pojemności 1,5 mililitra. Przygotować 300 mikrolitrów buforu octanowego zawierającego 50
Niniejszy artykuł przedstawia wysokoczułą metodę wykrywania modyfikacji 3-nitrotyrozyny w białkach atmosferycznych z wykorzystaniem filtrów wstępnych próbników powietrza. Technika ta wykorzystuje wysokosprawną chromatografię cieczową z detektorem elektrochemicznym (HPLC-ECD) do analizy pobranych próbek.
Niniejsza metoda umożliwia czułe wykrywanie 3-nitrotyrozyny, biomarkera oksydacyjnego uszkodzenia białek, w atmosferycznym materiale zawieszonym. Wspiera ona badania nad zdrowiem środowiskowym, łącząc jakość powietrza z molekularnymi biomarkerami stanu zapalnego i potencjału alergennego. Analiza ta dostarcza ilościowych danych przydatnych w mechanistycznej ocenie ryzyka w badaniach z zakresu toksykologii płuc i immunotoksykologii.
Metoda ta wpisuje się w procesy wczesnego etapu odkryć, w których ocenia się istotność mechanistyczną czynników wyzwalających ze środowiska w odniesieniu do szlaków oddechowych lub odpornościowych.