November 27th, 2019
Szczegółowo opisujemy, jak przeprowadzić metaanalizę badań neuroobrazowania opartych na wokselach za pomocą Mapowania d opartego na nasionach z permutacją obrazów obiektowych (SDM-PSI).
Mapowanie d oparte na nasionach to metoda umieszczania metaanalizujących badań neuroobrazowych, które mogą wydawać się sprzeczne. Na przykład wyniki badań nieprawidłowości istoty szarej w OCD. Wcześniejsze metody metaanalityczne zwykle oceniały, czy badania potwierdzają więcej statystycznych szczytów z jednego lub innego powodu, podczas gdy SDM-PSI ocenia, czy występuje efekt w określonym przyczynie.
Naukowcy wykorzystywali SDM głównie do badania neuronalnych substratów funkcji psychologicznych i zaburzeń neuropsychiatrycznych, które mogą obejmować badania fMRI, VBM, DTI, PET lub SBM. Dotychczasowe korzystanie z SDM-PSI jest dość proste. Jednak najważniejszymi krokami do przeprowadzenia prawidłowej metaanalizy jest zaprojektowanie dokładnego planu metaanalizy i staranne zebranie danych.
Aby przeprowadzić wyczerpujące wyszukiwanie, otwórz interesującą Cię bazę danych i wprowadź różne słowa kluczowe, które umożliwią wyszukanie dowolnego badania, które może spełniać kryteria włączenia. Następnie należy zapisać liczbę pobranych badań i liczbę badań wykluczonych z każdego powodu. Rozważ utworzenie diagramu przepływu PRISMA z tymi liczbami.
Po przeczytaniu interesujących Cię manuskryptów w celu znalezienia konkretnych danych do wyodrębnienia, przekształcenia wartości Z i P na wartości T, kliknij przycisk Konwertuj piki w oprogramowaniu SDM-PSI. Następnie użyj dodatnich wartości T dla szczytów wzrostu i ujemnych wartości T dla szczytów spadku, korzystając z tabeli, aby uzyskać wskazówki dotyczące sposobu decydowania o znaku wartości T. W dwóch badaniach próbnych stosuje się dodatnie wartości T, gdy sygnał MRI jest wyższy u pacjentów niż w grupie kontrolnej.
I używaj ujemnych wartości T, gdy sygnał MRI jest niższy u pacjentów niż u grupy kontrolnej. Aby wprowadzić dane do SDM-PSI, otwórz graficzny interfejs użytkownika SDM-PSI i zamknij okno powitalne Informacje. Kliknij przycisk Zmień metaanalizę, aby wybrać nowy pusty katalog dla metaanalizy.
Kliknij edytor tabel SDM, aby wprowadzić ogólne informacje z badań i otwórz edytor tekstu, aby utworzyć plik tekstowy dla każdego badania, aby wpisać współrzędne i wartości T pików. I nazwij plik, używany program i przestrzeń stereotaktyczną. W celu wstępnego przetwarzania danych kliknij przycisk przetwarzania wstępnego, wybierz modalność badań w polu listy oznaczonym Modalność i naciśnij OK. Następnie poczekaj kilka minut, aż program do permutacji obrazów tematu obliczy mapy dolnej i górnej granicy potencjalnych rozmiarów efektu.
Aby przeprowadzić analizę główną, kliknij przycisk Średnia i naciśnij przycisk OK. Po przeprowadzeniu przez SDM-PSI wielokrotnych podstawień i metaanalizy kliknij przycisk Próg, wybierz nieskorygowane wartości P głównej analizy i kliknij przycisk OK. SDM-PSI automatycznie otworzy zarówno MRIcron w celu wizualizacji wyników, jak i stronę internetową ze szczegółowym raportem wyników. Kliknij opcję Korekcja błędów według rodziny, aby wybrać analizę główną z listy, a następnie kliknij przycisk OK. Program SDM-PSI przeprowadzi test permutacji przez kilka godzin lub dni. Na końcu pozostałych kliknij Próg, wybierz poprawkę TFCE głównej analizy i kliknij przycisk OK. Program automatycznie otworzy zarówno MRIcron w celu wizualizacji wyników, jak i stronę internetową ze szczegółowym raportem z analizy.
W przypadku niejednorodności, stronniczości publikacji i oceny kliknij przycisk wyodrębnij, wybierz pik z głównej analizy i naciśnij przycisk OK. Program automatycznie otworzy stronę internetową ze statystykami tego P. Zapisz statystykę niejednorodności I-kwadrat. Następnie kliknij przycisk Test odchylenia, wybierz pik z głównej analizy i kliknij OK. Program automatycznie otworzy stronę internetową z wykresem lejkowym i wynikami testu na efekt małego badania i testu na nadmierną istotność. Następnie kliknij przycisk Ocenianie dowodów w górnym polu narzędziowym.
Wybierz analizę główną z listy i kliknij przycisk OK, aby wyświetlić wyniki. Jak zaobserwowano na tych reprezentatywnych mapach, pacjenci z OCD mają statystycznie istotnie mniejszą objętość istoty szarej w grzbietowej przedniej części zakrętu obręczy i przyśrodkowej korze czołowej. Gromada jest umiarkowanie mała i znajduje się głównie w obszarze Brodmanna 32, ze szczytem gromady na MNI 2, 32, 32 z wartością Z wynoszącą 4,97 i skorygowaną o współczynnik błędu wartość P wynoszącą 0,01.
W tej analizie danych statystyka niskiego I-kwadrat wskazuje na bardzo małą niejednorodność, a wykres lejkowy nie wykazuje asymetrii. Kluczowymi aspektami udanej metaanalizy jest stworzenie jasnych kryteriów włączenia i wykluczenia, staranne gromadzenie danych i nieograniczanie wyników do wartości P. SDM-PSI zawiera ogólny model liniowy, dla którego użytkownicy mogą przeprowadzać meta-regresje lub meta-kompresję grup badań i/lub porównywać go z analizą.
Wiele metaanaliz SDM wywarło znaczący wpływ na ich konkretne dziedziny. Na przykład kilka metaanaliz ujawniło interesujący wpływ stymulantów na nieprawidłowości mózgu obserwowane w ADHD.
Ten artykuł szczegółowo opisuje proces przeprowadzania metaanalizy badań neuroobrazowych opartych na wokselach przy użyciu Seed-based d Mapping with Permutation of Subject Images (SDM-PSI). Metoda ma na celu pogodzenie wyników z różnych badań, które mogą wydawać się sprzeczne, szczególnie jeśli chodzi o anomalie substancji szarej w warunkach takich jak OCD.
In neuropharmacology and CNS drug development, reconciling contradictory neuroimaging findings is critical for target validation and mechanistic de-risking. SDM-PSI advances beyond binary significance testing by quantifying effect strength and assessing bias, enabling more confident go/no-go decisions in early discovery. This supports portfolio triage by providing continuous evidence grading rather than binary outcomes.
SDM-PSI integrates into the discovery continuum from target validation through lead identification to preclinical work by providing quantitative, bias-aware neuroimaging evidence that supports hypothesis testing and mechanistic de-risking.