Comparative Lesions Analysis Through a Targeted Sequencing Approach

Caterina Vicentini; Andrea Mafficini; Michele Simbolo; Matteo Fassan; Pietro Delfino; Rita  Teresa Lawlor; Borislav Rusev; Aldo Scarpa; Vincenzo Corbo

doi:10.3791/59844

Analiza porównawcza zmian chorobowych za pomocą ukierunkowanego podejścia sekwencjonowania

JoVE Journal
Behavior

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Behavior

Comparative Lesions Analysis Through a Targeted Sequencing Approach

Analiza porównawcza zmian chorobowych za pomocą ukierunkowanego podejścia sekwencjonowania

Full Text

7,284 Views

08:16 min

November 5, 2019

DOI: 10.3791/59844-v

Caterina Vicentini¹, Andrea Mafficini¹, Michele Simbolo², Matteo Fassan³, Pietro Delfino², Rita Teresa Lawlor¹, Borislav Rusev¹, Aldo Scarpa^1,2, Vincenzo Corbo^1,2

¹ARC-Net Research Centre,University and Hospital Trust of Verona, ²Department of Diagnostics and Public Health, Section of Pathology,University and Hospital Trust of Verona, ³Department of Medicine (DIMED), Surgical Pathology and Cytopathology Unit,University of Padua

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

W artykule opisano metodę identyfikacji zmian klonalnych i subklonalnych wśród różnych próbek od danego pacjenta. Chociaż opisane tutaj eksperymenty koncentrują się na określonym typie nowotworu, podejście to ma szerokie zastosowanie do innych guzów litych.

Nasz protokół pozwala na uchwycenie genetycznego pokrewieństwa między zmianami pierwotnymi a przerzutowymi poprzez identyfikację zmian molekularnych zaangażowanych w postęp choroby. Nasza metoda daje możliwość zbadania pokrewieństwa genetycznego w próbce klinicznej z wysoką czułością i swoistością. Wynika to z integracji analizy molekularnej i histopatologicznej.

Ocena niejednorodności wewnątrznowotworowej w dziedzinie badań nad rakiem ma ogromne znaczenie w projektowaniu skutecznych strategii przeciwnowotworowych, a nasza metoda ma szerokie zastosowanie w wielu typach guzów litych. Po przygotowaniu i ilościowym określeniu interesujących bibliotek, rozcieńczyć każdą bibliotekę do stężenia 100 pikomolarów w wodzie wolnej od nukleaz i połączyć 10 mikrolitrów każdej rozcieńczonej biblioteki na pojedynczy przebieg w jednej probówce. Następnie wymieszaj biblioteki w puli przez pipetowanie.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Explore More Videos

W tym miesiącu w JoVE wydanie 153 Pokrewieństwo genetyczne Zmiany pierwotne Zmiany przerzutowe Zmiany molekularne Niejednorodność wewnątrzguza Strategie przeciwnowotworowe Przygotowanie biblioteki Sekwencjonowanie przebiegu Jonowy układ protonowy Ion Gene Studio S5 Analiza genetyczna Amplifikacja klonalna Sekwencjonowanie nowej generacji