1 maja 2021
Przedstawione tutaj protokoły ilustrują trzy alternatywne sposoby oceny wydajności genetycznie modyfikowanych komarów przeznaczonych do kontroli wektorów w laboratoryjnych próbach z małymi klatkami. Każdy protokół jest dostosowany do konkretnej modyfikacji, jaką niesie ze sobą szczep komarów (napęd genowy lub nie-genowy) oraz rodzajów mierzonych parametrów.
Opisany tutaj protokół jest odpowiedni do oceny wydajności komarów transgenicznych i porównań z ich odpowiednikami typu dzikiego w małych laboratoryjnych badaniach klatkowych. Badania z małymi klatkami są ważne, aby dostarczyć wartości empirycznych, które pomogą w realizacji nowych technologii eliminacji malarii. Próby klatkowe mogą być dostosowane do innych projektów eksperymentalnych i są odpowiednie do oceny dynamiki zagrożenia pożądanym transgenem.
Po wprowadzeniu osobników transgenicznych. Rozpocznij początkową fazę eksperymentu od ustawienia trzech klatek o pojemności 0,216 metra sześciennego w trzech egzemplarzach. I dodanie 60 larw drugiego stadium dzikiego do każdej klatki przez trzy kolejne tygodnie.
Co tydzień podawaj dorosłym samicom w każdej klatce znieczulone myszy jako źródło posiłku z krwi. I pojemnik do składania jaj trzy dni po posiłku z krwi. Jaja wykluwają się z każdej klatki co tydzień.
Od czwartego do ósmego tygodnia wybierz losowo 60 larw L2 w drugim stadium rozwoju, aby powróciły do odpowiednich klatek. W dziewiątym tygodniu losowo przypisz jeden zestaw potrójnych klatek jako kontrolę i jeden zestaw dla każdego pożądanego współczynnika uwalniania. Co tydzień do klatek kontrolnych należy dodawać 60 poczwarek typu dzikiego z 30 samcami i 30 samicami.
Utrzymuj stosunek jeden do jednego w każdej odpowiedniej klatce, dodając co tydzień 30 transgenicznych poczwarek płci męskiej wraz z 60 poczwarkami typu dzikiego. Aby uzyskać stosunek jeden do 0,1, dodaj 300 transgenicznych poczwarek płci męskiej tygodniowo do każdej odpowiedniej klatki wraz z 60 poczwarkami typu dzikiego. Powtarzaj dodawanie poczwarek komarów do klatki, dostarczając mączkę z krwi i jaja wylęgowe co tydzień.
Wybierz losowo łącznie 300 larw z każdej klatki do przesiewania. Przebadaj larwy pod mikroskopem stereoskopowym z filtrami fluorescencyjnymi w celu wyrażenia dominującego markera fluorescencyjnego w stadiach larwalnych i poczwarkowych. Oceń płeć powstałych poczwarek.
W eksperymencie z napędem genowym zastosuj strategię bariery, trzymając komary w bezpiecznym insekcie i przestrzegając standardowych procedur operacyjnych z regularnym monitorowaniem. Przygotuj klatkę z dwoma zestawami potrójnych klatek o pojemności 0,216 metra sześciennego dla każdego pożądanego stosunku uwalniania samców typu transgenicznego do dzikiego. Aby osiągnąć stosunek uwalniania samców jeden do jednego, dodaj 120 transgenicznych samców, 120 samców i samic typu dzikiego w stadium poczwarki do każdej replikowanej klatki.
Zapewnij posiłek z krwi za pomocą znieczulonych myszy cztero- do siedmiodniowych samic w każdej klatce. Po wykluciu się z jaj w tacy na larwy wybierz losowo około 240 larw L1 w pierwszym stadium rozwojowym z każdej klatki i wyhoduj je do poczwarek przed powrotem do odpowiednich klatek. Wybierz i przebadaj larwy pod kątem markera oka i fenotypu płci, jak opisano wcześniej.
Zmontuj konfigurację klatek składającą się z potrójnych klatek o pojemności 0,005 metra sześciennego z równą liczbą samców i samic dla każdego określonego współczynnika uwalniania transgeników do samców typu dzikiego. Używając aparatu do sztucznego karmienia, podawaj posiłki z krwi cztero- lub siedmiodniowym samicom w każdej klatce przez dwa kolejne dni. Trzy dni po drugim posiłku z krwi dodać pojemnik do składania jaj i wyjąć pojemniki po trzech dniach.
Po nacięciu wszystkich martwych i żywych dorosłych pozostających w klatce według płci, przechowuj je w temperaturze minus 80 stopni Celsjusza do analizy molekularnej. Wykluwaj się z jaj i uruchamiaj, wybierz 200 larw L1 i odłóż larwy na bok, aby zaludnić nowe klatki dla następnego pokolenia. Następnie losowo wybierz kolejne 500 larw z każdej klatki przeznaczonej do przesiewania.
Wyhoduj wybrane 200 larw do poczwarki i 500 larw do stadium L4. Przywróć poczwarkę z 200 tac, aby zaludnić nową klatkę. Przesiewaj losowo wybrane larwy pod kątem markera oka i fenotypu płci Jak poprzednio.
W analizie reprezentatywnej przedstawiono oczekiwaną dynamikę fenotypu najlepiej działających kontrprób dla różnych protokołów prób wymiany populacji. Wyniki wykazały liniowy wzrost odsetka larw z fenotypem markera DsRed w ciągu siedmiu pokoleń. Uwolnienie jeden do jednego bez napędu osiągnęło niewiele ponad 80% wprowadzenia transgenu w ciągu siedmiu pokoleń.
Protokoły napędu genowego osiągnęły to w ciągu trzech do czterech pokoleń. W ten sposób potwierdzamy, że pojedyncze uwolnienie systemu napędu genowego może być bardziej efektywne w przypadku wprowadzenia transgenu. Pod koniec obserwacji rozprzestrzenianie się transgenu osiągnęło prawie całkowite wprowadzenie do genowych systemów napędowych.
Ważne parametry, takie jak współczynnik uwalniania, struktura wiekowa populacji, wielkość klatki i inne, będą się różnić w zależności od celu eksperymentu i konkretnych celów. Można przeprowadzić eksperymenty w celu oceny parametrów sprawności, takich jak płodność i płodność. Dalsze, bardziej empiryczne dane z prób klatkowych mogą być wykorzystane do parametryzacji matematycznych modeli dynamiki populacji.
Niniejszy artykuł przedstawia protokoły oceny genetycznie zmodyfikowanych komarów w badaniach w małych klatkach, mających na celu kontrolę wektorów. Metody te są dostosowane do różnych modyfikacji genetycznych i pozwalają na ocenę wielu parametrów wydajności.
Ocena wydajności transgenicznych komarów w badaniach w małych klatkach laboratoryjnych dostarcza danych empirycznych, które są niezbędne do ograniczania ryzyka związanego z technologiami napędu genowego przed ich wdrożeniem w terenie. Protokoły te umożliwiają systematyczne porównanie dynamiki rozprzestrzeniania się transgenów pomiędzy populacjami typu dzikiego a populacjami zmodyfikowanymi, co wspiera modelowanie predykcyjne strategii zwalczania wektorów malarii. Podejście to pomaga w priorytetyzacji konstruktów napędu genowego o wyższej wydajności wprowadzania do dalszych testów przedklinicznych i terenowych.
Metoda ta wpisuje się w kontinuum od odkrycia do badań przedklinicznych, generując wczesne dane dotyczące skuteczności narzędzi genetycznej kontroli wektorów, co dostarcza informacji niezbędnych na etapach identyfikacji wiodących kandydatów oraz walidacji przedklinicznej.