Strategie inokulacji w celu infekowania korzeni roślin mikroorganizmami przenoszonymi przez glebę

Chociaż niezliczone ilości drobnoustrojów kolonizują korzenie roślin, interakcje te są trudne do analizy, ponieważ zachodzą pod ziemią. Aby to ułatwić, niniejszy zbiór protokołów zawiera przegląd strategii inokulacji korzeni roślin drobnoustrojami przenoszonymi przez glebę. Inokulacja korzeni jest podstawą do badania interakcji mikroorganizmów korzeniowych, a dzięki zastosowaniu poniższych technik interakcje można badać na poziomie molekularnym, cytologicznym lub histologicznym.

Wyjaśniamy trzy systemy inokulacji wykorzystujące verticillium jako mikrob atakujący korzenie oraz roślinę modelową, arabidopsis. Możliwe jest jednak przeniesienie metod na inne rośliny, takie jak pomidor lub rzepak, a także na inne drobnoustroje korzeniowe, na przykład pożyteczne serendipita. Przygotować inokulum verticillium z wyprzedzeniem, hodując grzybnię w PDB i indukując bulion z dekstrozy Czapek i zarodnikowania.