23 marca 2022
Ten protokół opisuje łatwą w użyciu metodę badania utleniania substratu poprzez śledzenie produkcji 14CO2 in vitro.
Stosowanie różnych substratów energetycznych jest zarówno specyficzne dla typu komórki, jak i wskazuje na chorobę. Pomiar zużycia określonych substratów może rzucić światło zarówno na normalną biologię, jak i patologię. Technika nie wymaga specjalistycznego sprzętu i jest łatwa do skalowania.
Jest również łatwiejszy w użyciu niż poprzednio opublikowane metody. Zrozumienie zmian w szybkości utleniania substratów pozwoli na opracowanie interwencji dietetycznych i farmakologicznych w przypadku zaburzeń metabolicznych. Chociaż wykazano to w przypadku tkanki kostnej, technikę tę można łatwo dostosować do badania elastyczności metabolicznej we wszystkich typach komórek, zapewniając zrozumienie zarówno przyczyn, jak i konsekwencji zmian metabolicznych.
Po złożeniu w ofierze szczeniąt w ciągu trzech do pięciu dni po urodzeniu, przenieś je do lodowatego roztworu podwójnego antybiotyku D PBS zawierającego penicylinę streptomycynę. Odsłoń kalwarię, usuwając skórę i tkankę miękką. Zbierz środkowy obszar, przecinając otaczające tkanki od tyłu do przodu w D PBS.
Delikatnie podrap wewnętrzną i zewnętrzną powierzchnię kalwarii za pomocą pęsety, aby pomóc uwolnić komórki po późniejszym trawieniu. Przygotować 2 i 4 miligramy na mililitr roztworów kolagenazy typu dwa w D PBS i przefiltrować każdy roztwór świeżym filtrem 0,22 mikrometra. Najpierw przetrawić oczyszczoną kalwarię dwoma miligramami na mililitr roztworu kolagenazy przez 15 minut, a następnie wyrzucić roztwór do wytrawiania.
Następnie trawić czyste próbki w czterech miligramach na mililitr roztworu kolagenazy trzy razy przez 15 minut za każdym razem. Następnie wyciągnij roztwór wytrawiający i zachowaj go. Przefiltrować roztwór wytrawiający przez sitka komórkowe o średnicy 70 mikrometrów i odwirować filtrat o temperaturze 300 RCF przez pięć minut.
Ponownie zawiesić osad komórkowy w kompletnym pożywce MEM alfa zawierającej 10% FBS i podwójnego roztworu antybiotyku streptomycyny penicyliny. Policz i zasiej komórki na 10-centymetrowej płytce. Hoduj komórki w inkubatorze o temperaturze 37 stopni Celsjusza z 5% dwutlenkiem węgla przez trzy dni.
Następnie dysocjuj komórki w temperaturze 37 stopni Celsjusza za pomocą 0,25 trypsyny EDTA. Po strawieniu policz i wysiew komórki na 24-dołkowej płytce do hodowli komórkowej z kompletną pożywką MEM alfa zawierającą 10% FBS i podwójny roztwór antybiotyku streptomycyny penicyliny. Wysiewać co najmniej cztery studzienki na typ komórki na substrat i co najmniej trzy dodatkowe studzienki dla każdego typu komórek w celu zliczenia przed testem.
Hoduj komórki w temperaturze 37 stopni Celsjusza przez noc. Po usunięciu mięśni i tkanki łącznej od ośmiotygodniowych myszy i zebraniu kości udowych i piszczelowych, odetnij i odrzuć oba końce kości ostrymi nożyczkami. Wypłucz szpik kostny z jednej kości udowej i jednej kości piszczelowej do świeżej 10-centymetrowej szalki Petriego za pomocą strzykawki wyposażonej w igłę o rozmiarze 23 zawierającą 15 mililitrów kompletnej pożywki MEM alfa z 10% penicyliną FBS, podwójnym roztworem antybiotyku streptomycyny i 10% pożywką kondycjonowaną CGM 14 12.
Hoduj komórki na szalce Petriego w inkubatorze o temperaturze 37 stopni Celsjusza z 5% dwutlenkiem węgla. Po trzech dniach wyrzucić pożywkę hodowlaną i przepłukać komórki D PBS. Oddziel przyłączone komórki w temperaturze 37 stopni Celsjusza za pomocą 0,25% trypsyny EDTA przez pięć minut.
Po odwirowaniu ponownie zawiesić osad komórkowy w pożywce BMM. Policz i zasiej komórki na 24-dołkowej płytce do hodowli komórkowej zgodnie z procedurą opisaną wcześniej. Hodowla w temperaturze 37 stopni Celsjusza przez noc w pożywce BMM przed rozpoczęciem testów.
Umyj komórki w dodatkowych studzienkach dwukrotnie za pomocą D PBS. Oddziel komórki za pomocą 0,25% trypsyny EDTA. Ponownie zawiesić 20 mikrolitrów strawionych komórek w D PBS.
Za pomocą 20 mikrolitrów roztworu barwnika pomarańczy akrydynowej i jodku propidyny określ liczbę żywych komórek za pomocą automatycznego licznika komórek i zapisz liczbę. Umyć komórki w studzienkach testowych dwukrotnie za pomocą D PBS. Dodaj 500 mikrolitrów gorącej pożywki do każdego dołka testowego w kapturze do hodowli tkankowych wyznaczonym przez RAM.
Po uszczelnieniu płytki parafilmem inkubować komórki w inkubatorze wyznaczonym do pamięci RAM w temperaturze 37 stopni Celsjusza przez 4 godziny. Podczas inkubacji pokrój bibułę filtracyjną na okrągłe kawałki, nieco większe niż obszar wewnątrz nasadki 1,5-mililitrowej mikrorurki wirówkowej i włóż papier ciasno do nasadki. Dodać 200 mikrolitrów jednego 1 molowego kwasu nadchlorowego do każdej probówki i 20 mikrolitrów wodorotlenku sodu do bibuły filtracyjnej umieszczonej wewnątrz nakrętki.
Po inkubacji komórek przenieś 400 mikrolitrów pożywki hodowlanej z każdej studzienki do przygotowanych probówek i natychmiast zamknij nakrętki. Pozostaw probówki w stojaku na probówki w temperaturze pokojowej na jedną godzinę. Parallelae podczas inkubacji ustaw fiolkę scyntylacyjną dla każdej probówki i napełnij ją czterema mililitrami płynu scyntylacyjnego.
Przenieś każdy kawałek bibuły filtracyjnej do fiolki scyntylacyjnej i inkubuj w temperaturze pokojowej przez 30 minut. Wykonaj testy wycierania okapu do hodowli tkankowej, łaźni wodnej, lodówki, inkubatora, zlewu, ziemi i dowolnego innego obszaru roboczego pod kątem potencjalnego zanieczyszczenia pamięci RAM. Chusteczki papierowe należy włożyć do fiolek scyntylacyjnych zawierających płyn scyntylacyjny.
Zmierz aktywność radiacyjną węgla 14 w fiolkach scyntylacyjnych za pomocą licznika scyntylacyjnego i zapisz wyniki odczytu. W razie potrzeby należy odkazić środowisko pracy zgodnie z wytycznymi dotyczącymi bezpieczeństwa radiologicznego. Rysunek porównuje utlenianie substratu przez pierwotne preosteoblasty kalwarii z BMM.
Po przejściu przez noc komórek pierwotnych i hodowli w kompletnej pożywce MEM alfa, zwykle osiągają one 80 do 90% konfluencji i wykazują charakterystyczną morfologię. Preosteoblasty kalwaryczne są znacznie większe niż BMM. Wyniki utleniania substratu wykazały, że szybkość utleniania każdego substratu jest znacznie wyższa w preosteoblastach kalwaryjnych niż w BMM, co prawdopodobnie wskazuje na wyższą produkcję energii przez fosforylację oksydacyjną w preosteoblastach.
Włożony trzeci papier powinien być nieco większy niż 1.7 mililitrowa nasadka górnej rurki ebin. Metoda ta może być stosowana w połączeniu ze zużyciem tlenu oraz do określenia ogólnego tempa fosforylacji oksydacyjnej i produkcji laktatywnej w komórkach. Protokół ten może być wykorzystany do określenia wykorzystania substratu podczas różnych etapów różnicowania lub ustawień chorobowych.
Dzięki tej wiedzy możemy opracować interwencje w przypadku zaburzeń metabolicznych.
Wyświetl pełny transkrypt i uzyskaj dostęp do tysięcy filmów naukowych
Niniejsze badanie przedstawia metodę pomiaru utleniania substratu poprzez śledzenie produkcji 14CO2 in vitro. Podejście to zostało zaprojektowane tak, aby było przyjazne dla użytkownika i możliwe do zastosowania w różnych typach komórek, co ułatwia badania nad zaburzeniami metabolicznymi.
Bezpośrednie ilościowe oznaczanie utleniania substratów energetycznych in vitro umożliwia mechanistyczną weryfikację hipotez dotyczących szlaków metabolicznych we wczesnych etapach odkrywania leków. Ten skalowalny test wychwytywania 14CO2 dostarcza praktycznych informacji na temat utylizacji substratów specyficznych dla danego typu komórek, zwiększając pewność predykcyjną w walidacji celów metabolicznych i modelowaniu chorób. Zdolność tej metody do adaptacji w różnych typach komórek sprawia, że jest ona narzędziem wielokrotnego użytku w badaniach metabolicznych w ramach całego portfolio projektów.
Ten test wychwytywania 14CO2 integruje proces od wczesnego etapu odkrywania do przedklinicznych badań metabolicznych, umożliwiając testowanie hipotez i wyjaśnianie szlaków w wielu punktach zwrotnych.