Badanie współpracy mikrobiologicznej poprzez obrazową analizę spektrometrii mas kolonii bakteryjnych hodowanych na agarze i w tkance podczas infekcji

Nasz protokół umożliwia wizualizację przestrzennego metabolizmu interakcji mikrobiologicznych, które zachodzą podczas infekcji. Opracowaliśmy ten przepływ pracy spektrometrii mas do obrazowania dla kokultur bakteryjnych hodowanych na modelach agarowych i tkankowych. Analiza nietradycyjnych substratów, takich jak kultury bakterii hodowane na agarze wiąże się z wieloma wyzwaniami.

Korzystając z naszego protokołu, próbki bakterii mogą być odpowiednio wysuszone, aby ułatwić zastosowanie matrycy MALDI w późniejszej analizie spektrometrii mas obrazowania. Metoda ta ma szerokie zastosowanie do różnych metabolitów, patogenów lub chorób mikrobiologicznych oraz typów próbek, w przypadku których pożądany jest przestrzenny pomiar biochemii komórkowej lub tkankowej, szczególnie podczas badania typów próbek, które wymagają odwodnienia przed analizą. Po przygotowaniu makrokolonii kultur bakteryjnych należy usunąć z materiału opakowaniowego kolonie bakteryjne agarozy zamontowane na szkiełkach mikroskopowych pokrytych ITO.