27 lipca 2022
Obecny protokół przedstawia metodę, która wykorzystuje żółć lucyfera w modelu enteroidalnym wierzchołkowym do określenia przepuszczalności jelit. Metodę tę można zastosować do określenia przepuszczalności parakomórkowej w enteroidach, które modelują choroby zapalne jelit, takie jak martwicze zapalenie jelit.
Zastosowanie Lucifer Yellow do pożywki enteroidów wierzchołkowych zapewnia prostą metodę analizy ilościowej i jakościowej wszystkich trzech głównych parakomórkowych szlaków przepuszczalności jelit w modelu 3D. Jest to stosunkowo prosta technika, która pozwala nam ocenić przepuszczalność za pomocą modelu enteroidalnego. Pracujemy z tą techniką w naszych badaniach nad martwiczym zapaleniem jelit.
Jednak ta technika może być przydatna w badaniu każdej choroby jelit u ludzi, wykorzystując model enteroidalny. Dzisiejsze procedury zademonstrują nasi doktoranci, dr Tyler Leiva i dr Alena Golubkova, a także Camille Schlegel, asystent kierownika badań z naszego laboratorium. Aby rozpocząć, hoduj Androidy osadzone w BMM przez siedem do 10 dni za pomocą 50% pożywki kondycjonowanej LWRN dla generacji enteroidów wierzchołkowych lub AO.
Usuń pożywkę z okolic kopuł BMM i dodaj 500 mikrolitrów roztworu do odzyskiwania komórek lub CRS do jednej studzienki. Zeskrob kopułę, odpipetuj ją kilka razy w górę i w dół, aby homogenizować CRS z enteroidami osadzonymi w kopułach BMM i dodaj ten roztwór do następnego dołka. Ponownie zeskrob kopułę i odpipetuj ją kilka razy w górę iw dół przed przeniesieniem roztworu do probówki mikrowirówkowej.
Dodaj 500 mikrolitrów CRS do drugiego dołka, pipetuj w górę iw dół, aby dobrze wymieszać i przenieś do pierwszego dołka. Z pierwszego dołka połącz roztwór enteroidu BMM CRS w tej samej 1,5 mililitrowej probówce mikrowirówkowej i powtórz to łączenie dla pozostałych studzienek, aż zawartość wszystkich studzienek znajdzie się w CRS. Umieścić probówki do mikrowirówek zawierające zbiorczy roztwór CRS na rotatorze na jedną godzinę w temperaturze czterech stopni Celsjusza.
Następnie odwirować probówkę mikrowirówkową o sile 200 X g przez trzy minuty w temperaturze czterech stopni Celsjusza przed usunięciem supernatantu i ponownym zawieszeniem osadu enteroidalnego w jednym mililitrze 50% pożywki kondycjonowanej LWRN. Delikatnie przenieś 500 mikrolitrów ponownie zawieszonego roztworu enteroidu lub pożywki do każdej studzienki 24-dołkowej płytki do hodowli tkankowej o bardzo niskim mocowaniu. Inkubuj płytkę w temperaturze 37 stopni Celsjusza z 5% CO2 przez trzy dni przed eksperymentem.
Upewnij się, że enteroidy AO są zawieszone na co najmniej 72 godziny przed użyciem. Delikatnie przenieść wszystkie enteroidy zawieszone w pożywce z każdej studzienki do probówki mikrowirówkowej. Wirować przy 300 X g przez trzy minuty w temperaturze pokojowej i usunąć supernatant.
Dodaj 10 mikrolitrów po pięć miligramów na mililitr lipopolisacharydu lub LPS do 500 mikrolitrów 50% pożywki kondycjonowanej LWRN na studzienkę, aby przygotować mieszankę główną, i ponownie zawiesić osad enteroidowy AO z grupy poddawanej działaniu substancji do 500 mikrolitrów pożywki kondycjonowanej LPS plus 50% LWRN. Pipetuj w górę i w dół, aby dokładnie wymieszać. Porcję 500 mikrolitrów zawiesiny do każdej studzienki 24-dołkowej płytki o bardzo niskim mocowaniu.
Podobnie ponownie zawiesić enteroidy AO z nieleczonej grupy kontrolnej w 500 mikrolitrach 50% pożywki kondycjonowanej LWRN na studzienkę i podwielokrotnie 500 mikrolitrów tej zawiesiny do każdej studzienki oddzielnej 24-dołkowej płytki o bardzo niskim mocowaniu. Wywołaj niedotlenienie w enteroidach AO traktowanych LPS za pomocą modułowej komory inkubatora z 1% tlenem, 5% dwutlenkiem węgla i 94% azotem i inkubuj enteroidy z hipoksją i LPS przez 24 godziny. Umieść kultury niepoddane działaniu substancji i LPS plus hipoksja w inkubatorze z 5% dwutlenkiem węgla na 24 godziny.
Aby zmierzyć przepuszczalność parakomórkową za pomocą Lucifer Yellow lub LY, delikatnie przenieś zawiesinę enteroidu lub pożywki z każdej studzienki do probówki mikrowirówkowej. Ciepłe roztwory soli fizjologicznej buforowanej fosforanami Dulbecco lub DPBS i kondycjonowane w 50% LWRN w łaźni wodnej o temperaturze 37 stopni Celsjusza. Odwirować zawiesinę o stężeniu 300 X g przez trzy minuty w temperaturze pokojowej.
Usunąć pożywkę i przemyć osad enteroidalny 500 mikrolitrami ciepłego DPBS przed odwirowaniem przy 300 X g przez trzy minuty. Usunąć supernatant za pomocą mikropipety i powtórzyć etap płukania DPBS jeszcze raz. Po umyciu DPBS dodaj 450 mikrolitrów ciepłej pożywki kondycjonowanej 50% LWRN i dodaj zawiesinę do płytki 24-dołkowej.
Następnie dodaj 50 mikrolitrów po 2,5 miligrama na mililitr LY do każdej studzienki. Delikatnie zakręć płytką, aby wymieszać, i umieść ją w inkubatorze z 5% dwutlenkiem węgla na dwie godziny. Delikatnie odpipetować zawiesinę enteroidalną z każdej studzienki do probówki mikrowirówkowej.
Odwirować go i usunąć supernatant, pozostawiając osad enteroidalny. Umyj granulat za pomocą 500 mikrolitrów ciepłego DPBS i odwiruj go. Usunąć supernatant, pozostawiając osad.
Powtórzyć trzy płukania DPBS przed ponownym zawiesieniem osadu z 1000 mikrolitrów zimnego DPBS i oddzielić enteroidy przez energiczne mieszanie za pomocą pipety. Dla krzywej wzorcowej Lucyfera Żółtego należy przygotować wzorce rozcieńczone w DPBS zgodnie z opisem w tekście. Odpipetować 150 mikrolitrów każdej próbki na studzienkę w trzech kroplach na 96-dołkowej płytce.
Zmierz fluorescencję przy piku wzbudzenia 428 nanometrach i piku emisji 536 nanometrów na czytniku płytek fluorescencyjnych. Obliczyć stężenia za pomocą oprogramowania statystycznego i krzywej czteroparametrowej interpolującej krzywą wzorcową. Barwienie immunofluorescencyjne enteroidów zawieszonych w 50% pożywce LWRN przez 72 godziny wykazało Zo-1 na zewnętrznej powierzchni wierzchołkowej enteroidu, podczas gdy beta katenina jest widoczna na powierzchni podstawno-bocznej.
Wskazało to na oczekiwane odwrócenie polaryzacji enteroidów, potwierdzając konformację AO enteroidów. Enteroidy podstawno-boczne lub BO leczone LPS i niedotlenieniem wykazały znacznie zwiększoną przepuszczalność, co wykazano w teście Lucifer Yellow lub LY przez zwiększony wychwyt barwnika LY do światła enteroidu, w porównaniu z nieleczonymi kontrolami. Test Lucyfer Yellow wykazał również zwiększony wychwyt LY w świetle leczonych enteroidów AO w porównaniu z nieleczonymi kontrolami.
Potwierdziło to zwiększoną przepuszczalność enteroidów AO leczonych LPS i niedotlenieniem w porównaniu z nieleczonymi kontrolami. Ważne jest, aby dokładnie umyć granulki enteroidów, aby upewnić się, że cały pozaświetlny LY został usunięty. Pozwala to na dokładne ilościowe określenie pozostałego LY w obrębie światła przy obliczaniu przepuszczalności.
W celu analizy jakościowej enteroidy można uwidocznić za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej w celu wychwytu LY do światła. Po inkubacji LY i kolejnych etapach płukania przed dysocjacją od odczytu mikropłytki.
Wyświetl pełny transkrypt i uzyskaj dostęp do tysięcy filmów naukowych
Niniejszy protokół opisuje metodę wykorzystującą lucifer yellow w modelu enteroidów z orientacją wierzchołkową na zewnątrz (apical-out) do oceny przepuszczalności jelit. Jest ona szczególnie istotna w badaniach nad zapalnymi chorobami jelit, takimi jak martwicze zapalenie jelit.
Ilościowa ocena przepuszczalności jelitowej z użyciem lucifer yellow w modelach enteroidów typu apical-out umożliwia rzetelną analizę funkcji bariery nabłonkowej w ludzkich systemach istotnych dla przebiegu chorób. Podejście to zwiększa pewność predykcyjną w początkowej fazie walidacji celów terapeutycznych oraz w ograniczaniu ryzyka mechanistycznego w ramach portfeli projektów poszukiwania leków na schorzenia przewodu pokarmowego. Zdolność tego modelu do odzwierciedlenia wszystkich głównych szlaków parakomórkowych poprawia ciągłość translacyjną od etapu odkryć do badań przedklinicznych.
Niniejszy test przepuszczalności oparty na lucifer yellow sytuuje się w kontinuum od odkryć do badań przedklinicznych, łącząc wczesne studia mechanistyczne z badaniami translacyjnymi w modelach chorób przewodu pokarmowego.