-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

PL

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

pl_PL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Ekstrakcja deoksyrybonukleinowym w całym genomie z gatunków Mycobacterium za pomocą<...
Ekstrakcja deoksyrybonukleinowym w całym genomie z gatunków Mycobacterium za pomocą
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Whole-Genome Deoxyribonucleic Acid Extraction from Mycobacterium Species via the Cetyltrimethylammonium Bromide Technique

Ekstrakcja deoksyrybonukleinowym w całym genomie z gatunków Mycobacterium za pomocą techniki bromku cetylotrymetylamoniowego

Full Text
930 Views
06:46 min
December 12, 2025

DOI: 10.3791/68409-v

Shatha Omar1, Brendon Mann1

1DST/NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, South African Medical Research Council (SAMRC), Centre for Tuberculosis Research, Division of Molecular Biology and Human Genetics, Faculty of Medicine and Health Sciences,Stellenbosch University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study addresses the challenges of extracting high-quality DNA from mycobacteria, particularly due to their robust cell walls composed of mycolic acids. The main outcome is the CTAB method, which effectively produces DNA suitable for various molecular studies.

Key Study Components

Research Area

  • Genetic characterization of mycobacteria
  • Mycobacterial diseases and interactions in co-infections
  • Pathogenic speciation and drug resistance

Background

  • Mycobacteria have structurally complex and tough cell walls, complicating DNA extraction.
  • Focus on nontuberculosis mycobacteria and their relationship with tuberculosis.
  • Challenges faced in extracting DNA due to lipid-rich cell walls.

Methods Used

  • CTAB method for DNA extraction
  • Mycobacterial species as the biological system
  • Enzymatic digestion and organic extraction techniques

Main Results

  • Yield of DNA ranged from 190 to 600 nanograms per microliter with high purity ratios.
  • Visualization of intact high molecular weight DNA through gel electrophoresis.
  • Some species yielded lower DNA amounts indicating variations in extraction efficiency.

Conclusions

  • The study establishes a reliable method for extracting high-quality DNA from mycobacteria.
  • This methodology enhances the potential for further research into mycobacterial genetics and diseases.

Frequently Asked Questions

What are mycobacteria?
Mycobacteria are a group of bacteria, some of which are pathogenic and responsible for diseases such as tuberculosis.
Why is DNA extraction from mycobacteria challenging?
Their thick, lipid-rich cell walls make it difficult to effectively lyse the cells and release genomic DNA.
What is the CTAB method?
The CTAB method is a protocol for extracting DNA that involves enzymatic digestion and organic extraction techniques.
How does the quality of extracted DNA ensure reliability in research?
High-quality DNA is essential for accurate sequencing and molecular studies, ensuring reliable results in research.
What are the purity ratios achieved in this study?
The 260/280 absorbance ratio ranged between 1.9 and 2.0, and the 260/230 ratio ranged from 1.8 to 2.2, indicating high DNA purity.
What is the significance of this research?
This research contributes to improved methodologies for studying mycobacterial genetics and their associated diseases, enhancing our understanding and potential treatment pathways.

Protokół ten opisuje metodę CTAB polegającą na wydobyciu wysokiej jakości DNA z mykobakterii, pokonując wyzwania związane z ich twardymi, bogatymi w kwas grzybniczy ściany komórkowe. Proces obejmuje trawienie enzymatyczne, lizę komórek za pomocą CTAB oraz oczyszczanie DNA poprzez ekstrakcję organiczną i wytrącanie etanolem. Ta metoda wytwarza DNA odpowiednie do badań molekularnych i jest wiarygodna w badaniach mykobakterialnych.

Nasze badania koncentrują się na genetycznej charakteryzacji gatunków grzybików oraz na złożonej naturze chorób grzybniczy u ludzi. Szczególny nacisk kładziemy na mykobakterie niegruźlicy i ich interakcje z makrofagami podczas współinfekcji z innymi gatunkami, zwłaszcza z mikrobakteriami gruźlicowymi. Dodatkowo koncentrujemy się na specjacji patogennych mykobakterii, identyfikacji genów związanych z wirulencją oraz polimorfizmie pojedynczego nukleotydu powiązanego z opornością na leki.

Ze względu na grubą ścianę komórkową, lipidowe i hydrofobowe ściany komórkowe ekstrakcji DNA mykobakterii są wyzwaniem i wymagają specjalistycznych technik lizy, aby je rozłożyć i efektywnie uwalnić genomowe DNA. W naszym protokole zajmujemy się ekstrakcją DNA z gatunków mykobakterii za pomocą metody CTAB jako solidnej i skutecznej metody produkcji wysokiej jakości DNA odpowiedniej do wszystkich technik sekwencjonowania genomu oraz innych technik molekularnych. Na początek ciepło zabija cieczą pochłanianą w probówce 15-mililitrowej w temperaturze 80 stopni Celsjusza przez godzinę.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Biologia numer 226

Related Videos

Ekstrakcja genomowego DNA o wysokiej masie cząsteczkowej z gleb i osadów

11:24

Ekstrakcja genomowego DNA o wysokiej masie cząsteczkowej z gleb i osadów

Related Videos

26.5K Views

Ekstrakcja DNA o wysokiej masie cząsteczkowej z mat mikrobiologicznych

09:30

Ekstrakcja DNA o wysokiej masie cząsteczkowej z mat mikrobiologicznych

Related Videos

20.1K Views

Przygotowanie próbek ekstraktów z Mycobacterium tuberculosis do badań metabolomicznych magnetycznego rezonansu jądrowego

07:56

Przygotowanie próbek ekstraktów z Mycobacterium tuberculosis do badań metabolomicznych magnetycznego rezonansu jądrowego

Related Videos

15.9K Views

Separacja wariantów kwasu mykolowego oparta na chromatografii cienkowarstwowej: metoda rozdzielania lipidów ściany komórkowej prątków na podstawie polarności

03:26

Separacja wariantów kwasu mykolowego oparta na chromatografii cienkowarstwowej: metoda rozdzielania lipidów ściany komórkowej prątków na podstawie polarności

Related Videos

1.7K Views

Identyfikacja markerów wirulencji Mycobacterium abscessus do replikacji wewnątrzkomórkowej w fagocytach

08:34

Identyfikacja markerów wirulencji Mycobacterium abscessus do replikacji wewnątrzkomórkowej w fagocytach

Related Videos

9.1K Views

Modelowanie gruźlicy u dorosłych ryb pręgowanych zakażonych Mycobacterium marinum

07:00

Modelowanie gruźlicy u dorosłych ryb pręgowanych zakażonych Mycobacterium marinum

Related Videos

11.3K Views

Analiza składu lipidowego prątków metodą chromatografii cienkowarstwowej

07:42

Analiza składu lipidowego prątków metodą chromatografii cienkowarstwowej

Related Videos

9.3K Views

Izolacja, rozmnażanie i identyfikacja gatunków bakterii o właściwościach metabolizowania węglowodorów z siedlisk wodnych

10:03

Izolacja, rozmnażanie i identyfikacja gatunków bakterii o właściwościach metabolizowania węglowodorów z siedlisk wodnych

Related Videos

5.4K Views

Ekstrakcja DNA prątków za pomocą bicia kulek w niestandardowym buforze, a następnie przepływu pracy NGS

09:18

Ekstrakcja DNA prątków za pomocą bicia kulek w niestandardowym buforze, a następnie przepływu pracy NGS

Related Videos

977 Views

Ekstrakcja DNA oparta na matrycy do ukierunkowanego sekwencjonowania nowej generacji na odkażonych próbkach plwociny

06:07

Ekstrakcja DNA oparta na matrycy do ukierunkowanego sekwencjonowania nowej generacji na odkażonych próbkach plwociny

Related Videos

1.3K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code