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1. Ensaio de Toxicidade Líquida de C. elegans com Aeromonas
NOTA: Para evitar contaminação, os passos devem ser realizados em um exaustor de fluxo laminar.
- No dia seguinte à semeadura dos vermes L1 na placa ENGM (meio de crescimento de nematoides enriquecidos) espalhe com E. coli OP50, colhe uma única colônia de cada uma das quatro cepas Aeromonas e E. coli OP50, e cultive com 5 mL de caldo de 5 mL cada a 37 °C por 16 horas.
NOTA: No protocolo, foram usadas as seguintes cepas bacterianas: E. coli OP50, a fonte alimentar normal de C. elegans. A. dhakensis AAK1, o primeiro isolado clínico patogênico totalmente sequenciado de A. dhakensis . A. hydrophila A2-066, A. veronii A2-007 e A. caviae A2-9307121 são isolados clínicos representativos do Hospital Nacional da Universidade Cheng Kung.
NOTA: Para preparar GNM enriquecido (ENGM), dissolva 3 g de NaCl, 5 g de peptona bacteriana, 1 g de extrato de levedura e 30 g de ágar em 1 L de água deionizada. Autoclave a 121 °C por 20 minutos. Espere até que esteja resfriado a 55 °C em banho-maria e adicione 1 mL de 1 M CaCl2, 1 mL de 1 M MgSO4, 1 mL de colesterol a 5% em etanol e 25 mL de tampão fosfatado. Gire para misturar bem. - Meça a absorção OD600 do caldo de bactérias.
- Centrifuge o caldo bacteriano a 3.500 x g por 15 minutos para remover o caldo LB. Resuspenda as bactérias e ajuste o caldo bacteriano para OD600 = 3,0 com meio S. Adicione 195 μL de caldo bacteriano em meio S a pelo menos 8 poços de uma placa de 96 poços.
NOTA: Composição do meio S: Para preparar o meio S, misture 40 mL de S basal, 0,4 mL de citrato de potássio de 1 M, 0,4 mL de solução de metais traço, 0,12 mL de 1 MCaCl 2, 0,12 mL de 1 M MgSO4, 40 μL de colesterol 5% em etanol e 1 mL de 8 mM FudR antes do uso. - Lave os worms L4 na placa ENGM com E. coli OP5 usando meio M9. Ajuste a solução de verme para uma concentração de 5 minhocas por μL e adicione 5 μL da solução de verme a cada poço da placa de 96 poços. Certifique-se de que haja aproximadamente 25 minhocas por poço.
- Incube a placa de 96 poços em um shaker a 200 rpm a 25 °C.
- Conte o número de vermes vivos e mortos após 24, 48 e 72 horas. Calcule as taxas de sobrevivência de cada poço com a seguinte fórmula: (Vermes vivos/Vermes totais) × 100%.
- Desenhe um gráfico de gráfico de dispersão com o cálculo diário dos dados.