1. Ensaio de Aderência/Internalização
NOTA: Certifique-se de preparar todos os reagentes antes de iniciar o ensaio. Para os três grupos-controle apresentados na seção de resultados (células mock-infectadas, células pré-tratadas com neuraminidase e células tratadas com azida de sódio), são necessárias pequenas alterações no protocolo.
- Prepare 16 tubos de fundo cônico, cada um contendo 200.000 células A549. Além do conjunto experimental composto por 4 tubos, existem 3 condições de controle, cada uma exigindo 4 tubos: células mock-infectadas, células pré-tratadas com neuraminidase (NA) e células tratadas com azida de sódio. Cada grupo é composto por 4 tubos rotulados como ‘0 min’, ‘0 min + streptavidina (STV)’, ‘30 min’, ‘30 min + STV’.
- Centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 200 µl de solução salina tamponada com fosfato (PBS).
- Centrifugue os tubos a 4 °C a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 200 µl de meio de Eagle modificado por Dulbecco (DMEM) contendo 0,3% de albumina sérica bovina (BSA), 20 mM de 4-(2-hidroxietil)-1-piperazinaetanosulfônico (HEPES) e 1% de penicilina-estreptomicina (meio de incubação). Incube por 30 min a 37 °C.
NOTA: Para o controle com neuraminidase: Utilize neuraminidase bacteriana (por exemplo, sialidase de Vibrio cholera) na concentração de 200 mU/ml diluída no meio de incubação para ressuspender as células. - Centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 200 µl de PBS. Repita este passo mais uma vez e, em seguida, resfrie os tubos no gelo por 10 min.
- Centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 100 µl de vírus biotinilado (utilize a concentração de vírus determinada na seção 2 diluída em PBS de infecção). Incube por 1 h no gelo.
- Centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 200 µl de PBS. Repita este passo mais uma vez.
NOTA: Para o controle mock-infectado: Utilize PBS de infecção sem vírus. Para o controle com azida de sódio: Utilize vírus diluído em PBS de infecção suplementado com 0,1 % de azida de sódio. - Processamento das amostras após a infecção no gelo:
- Para as amostras de ‘0 min’, siga o passo 2,5 e armazene as amostras a 4 °C até que as demais amostras sejam fixadas.
- Para as amostras de ‘0 min + STV’, centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda os pellets em 50 µl de STV (utilize a concentração determinada na seção 3) diluída em PBS contendo 2% de BSA e 0,1% de azida de sódio (para prevenir internalização durante o manuseio da amostra). Incube por 30 min no gelo.
- Centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 200 µl de PBS. Repita este passo mais uma vez.
- Para fixação, centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 100 µl de paraformaldeído a 3,7% (PFA). Incube por 10 min à temperatura ambiente (RT). Em seguida, repita o passo de lavagem descrito no 1.6) e armazene as amostras a 4 °C.
- Para as amostras de ’30 min’, centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 200 µl de PBS contendo 2% de BSA. Incube por 30 min a 37 °C. Siga os passos 1.7.3-1.7.4 e armazene as amostras a 4 °C.
NOTA: Para o controle com azida de sódio: Utilize PBS suplementado com 2 % de BSA e 0,1 % de azida de sódio para a incubação de 30 min a 37 °C. - Para as amostras de ’30 min + STV’, centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 200 µl de PBS contendo 2% de BSA. Incube por 30 min a 37 °C. Em seguida, centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda os pellets em 50 µl de STV (utilize a concentração determinada na seção 3) diluída em PBS contendo 2% de BSA e 0,1% de azida de sódio (para prevenir internalização durante o manuseio da amostra). Incube por 30 min no gelo. Siga os passos 1.7.3-1.7.4 e armazene as amostras a 4 °C.
NOTA: Para o controle com azida de sódio: Utilize PBS suplementado com 2 % de BSA e 0,1 % de azida de sódio para a incubação de 30 min a 37 °C.
- Para permeabilização, centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 100 µl de PBS contendo 0,5% de Triton X-100. Incube por 6 min à temperatura ambiente. Em seguida, repita o passo de lavagem descrito no 1.6).
- Centrifugue os tubos a 4 °C por 3 min a 450 x g. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em 50 µl de 2% de BSA diluída em PBS contendo STV-Cy3. (Observe que a concentração apropriada de STV-Cy3 deve ser determinada antes de iniciar o experimento. Comece com uma concentração de 1:200 e teste diluições em duas vezes até 1:2.400. Em nossos experimentos, uma diluição de 1:1.000 mostrou-se ideal.)
- Incube por 1 h no escuro à temperatura ambiente. Em seguida, repita o passo de lavagem descrito no 1.6, mas ressuspenda o pellet em 200 µl de 2% de BSA diluída em PBS.
- Analise as amostras por citometria de fluxo. Determine a porcentagem de células positivas para Cy3 em cada amostra.