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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Métodos de imagem de bioluminescência de infecções bacterianas em animais vivos são descritos. Patógenos são modificados para expressar luciferase permitindo que imagens de corpo inteiro óptico de infecções em animais vivos. Modelos animais podem ser infectados com patógenos luciferase expressar eo curso resultante de doença visualizadas em tempo real pela imagem de bioluminescência.
Imagem é uma técnica valiosa que pode ser usado para monitorar processos biológicos. Em particular, a presença de células cancerosas, células-tronco, tipos específicos de célula imunológica, patógenos virais, parasitas e bactérias podem ser acompanhadas em tempo real dentro de animais vivos 1-2. Aplicação de imagem de bioluminescência para o estudo de patógenos tem vantagens em relação às estratégias convencionais para análise de infecções em modelos animais 3-4. Infecções podem ser visualizados dentro de animais individuais ao longo do tempo, sem a necessidade de eutanásia para determinar a localização ea quantidade do patógeno. Imageamento óptico permite o exame abrangente de todos os tecidos e órgãos, ao invés de amostragem de locais previamente conhecido por ser infectados. Além disso, a precisão da inoculação em tecidos específicos pode ser diretamente determinada antes do transporte de animais para a frente que foram inoculados sem sucesso durante todo o experimento. Variabilidade entre os animais podem ser controlados pela falta de imagens permite que cada animal a ser seguido individualmente. Imagem tem o potencial para reduzir significativamente o número de animais necessários por causa da capacidade de obter dados de numerosos pontos de tempo sem a necessidade de tecidos de amostra para determinar carga de patógenos 3-4.
Este protocolo descreve métodos para visualizar infecções em animais vivos usando imagens de bioluminescência de linhagens recombinantes de bactérias expressando luciferase. O besouro clique (CBRLuc) e luciferases firefly (FFluc) utilizam como substrato luciferina 5-6. A luz produzida por ambos os CBRluc FFluc e tem um comprimento de onda de 500 nm larga a 700 nm, tornando estes luciferases repórteres excelente para a imagem óptica em modelos animais de vida 7-9. Isso ocorre principalmente porque comprimentos de onda da luz é superior a 600 nm são necessárias para evitar a absorção pela hemoglobina e, assim, viajar através de tecidos de mamíferos, de forma eficiente. Luciferase é geneticamente introduzido na bactéria para produzir sinal de luz 10. Os ratos são pulmonar inoculada com bactérias bioluminescentes intratraqueal para permitir o monitoramento de infecções em tempo real. Após a injeção luciferina, as imagens são adquiridas usando o Sistema de Imagem IVIS. Durante a gravação, os ratos são anestesiados com isoflurano usando uma XGI-8 Gas Sistema Anethesia. As imagens podem ser analisados para localizar e quantificar a fonte do sinal, que representa o local da infecção bacteriana (s) e número, respectivamente. Depois de imagem, a determinação de UFC é realizada em tecido homogeneizado para confirmar a presença de bactérias. Várias doses de bactérias são usadas para correlacionar número de bactérias com luminescência. Imagem pode ser aplicada ao estudo da patogenia e avaliação da eficácia dos compostos antibacterianos e vacinas.
1. Infecção pulmonar por entubação endotraqueal
2. Anestesiados animais e preparação para o Imaging Bioluminescência
Os ratos são anestesiados com isoflurano usando a XGI-8 Gas Sistema Aneshesia.
3. Imagem bioluminescência
4. Ex vivo de Imagem e Análise de CFU para a quantificação de bactérias nos Pulmões
5. Análise de imagem Luminescência
6. Resultados representativos:
As imagens bioluminescência de camundongos infectados com bactérias bioluminescentes, juntamente com um controle do mouse não infectados são mostrados na Figura 1. O pulmonares camundongos infectados com bactérias bioluminescentes produzir sinal significativo dos pulmões (Figura 1). Intensidade da luminescência é quantificado como fluxo total dentro de um ROI (região de interesse) (Figura 2). Os dados quantitativos para a intensidade da luz é normalizado para as unidades formadoras de colônia (UFC) de bactérias obtidas de pulmões para confirmar que o sinal é produzido a partir de bactérias bioluminescentes e pode ser comparado ao controle negativo. A localização ea intensidade do sinal pode ser posteriormente analisado por DLIT reconstrução 3D da fonte de luminescência com base na tomografia da superfície do mouse 11. Essas análises permitem a quantificação e localização do sinal bioluminescente produzido. Os resultados da reconstrução 3D de uma fonte luminescente em camundongos infectados demonstra que a luz é produzida a partir de pulmões do mouse (Figura 3). As imagens ex vivo dos pulmões do rato resultando confirmar que a luminescência é emitido a partir dos pulmões, ao invés de algum outro tecido ou órgão estreitamente justapostas (Figura 2C).

Figura 1. Imagens da luminescência pulmonar camundongos infectados com bactérias bioluminescentes marcados com CBRluc. Rato controle não infectado é do lado esquerdo e dois camundongos infectados estão na direita. Camundongos foram infectados com bactérias expressando CBRluc (n = 2) por via intratraqueal. 10 minutos após a injeção de luciferina, imagens de luminescência foram adquiridas por 10 minutos a 4 posições: dorsal, lateral, ventral esquerdo e lado direito.

Figura 2. A intensidade da luz quantitativa de camundongos infectados com bactérias expressando CBRluc. (A, B) imagens Luminescência de ROI análise e quantificação do fluxo total de luz de ROI em posições dorsal e ventral, respectivamente. Camundongos não infectados estão na esquerda e dois camundongos infectados estão na direita. Luminescência imagens foram adquiridas a partir de pulmões of camundongos não infectados e infectados com CBRlux (n = 2). A intensidade da luz em torno dos pulmões foi quantificada por análise de ROI. C) imagens ex vivo de pulmões de não infectados (em cima) e infectadas (em baixo dois conjuntos de pulmões) camundongos. Luciferina foi injetado 5 miniuts antes da eutanásia e as imagens foram então adquiridos. Os valores quantificados são normalizados para CFU.

Figura 3. A reconstrução 3D da fonte de bioluminescência (s) de um rato pulmonar infectado. O rato foi infectado com bactérias expressando CBRluc por injeção intratraqueal. A seqüência de imagens foi adquirido usando filtros diferentes comprimentos de onda de emissão de série de 540 nm e 700 nm. Uma seqüência de imagens foi utilizada para a reconstituição em 3D para fonte de luminescência em indivíduos animais que continha uma imag estruturado. A) A tomografia para mouse é mostrado em diferentes posições: frente, trás, esquerda e direita. Fontes de luz são mostrados como voxels (caixas vermelhas dentro de mouse 3D) que estão localizados dentro do pulmão, conforme determinado pela reconstrução. B) Photon mapa densiy de dados medidos e simulados. Comparando as curvas de densidade medidos e simulados fóton fornecer as informações de qualidade de reconstrução. Boa qualidade no resultado reconstruções semelhante medidos e simulados densidades de fótons.
Métodos de imagem de bioluminescência de infecções bacterianas em animais vivos são descritos. Patógenos são modificados para expressar luciferase permitindo que imagens de corpo inteiro óptico de infecções em animais vivos. Modelos animais podem ser infectados com patógenos luciferase expressar eo curso resultante de doença visualizadas em tempo real pela imagem de bioluminescência.
Os autores agradecem os membros Cirillo laboratório pelas valiosas discussões e assistência ao longo deste estudo. Agradecemos ao Dr. Joshua Hill e do laboratório do Dr. James Samuel para a assistência durante as filmagens com o do presente protocolo. Este trabalho foi financiado por bolsa 48523 da Fundação Bill & Melinda Gates Foundation e AI47866 concessão do National Institutes of Health.
| Isoflurano | VETONE | 501027 | |
| Ketamine | Butler Animal Health Supply | ||
| Xylazine | MP Biomedicals | 158307 | |
| Luciferina | GMT | LUCK-100 | |
| Solução fetal mais | Vortech Pharmaceutical Ls, Ltd | ||
| Cathether (22G x 1”) | Corporação Médica Terumo | OX2225CA | |
| Fio guia | Hallowell EMC | 210A3491 | |
| Octocope com espéculo | Hallowell EMC | 000A3748 | |
| Xenogen Sistema IVIS | Paquímetro Life Sciences | ||
| XGI-8-gas Sistema de Anestsia | Paquímetro Life Sciences | ||
| Software de Imagem Viva | Paquímetro Ciências da Vida | ||
| Cones de nariz transparentes | Caliper Life Sciences | ||
| Divisor de defletor leve | Caliper Life Sciences |