In vivo de imagens usando microscopia de dois fótons 1 em ratos que foram geneticamente modificados para expressar proteínas fluorescentes em células específicas 2-3 tipos ampliou significativamente o nosso conhecimento dos processos fisiológicos e patológicos em tecidos diversos in vivo 4-7. Em estudos do sistema nervoso central (CNS), tem havido uma ampla aplicação de imagem in vivo em no cérebro, que produziu uma infinidade de novas descobertas e muitas vezes inesperadas sobre o comportamento das células, como neurônios, astrócitos, microglia, sob condições fisiológicas ou patológicas 17/08. No entanto, complicações na sua maioria técnicos limitaram a implementação de imagem in vivo em estudos da medula espinhal de rato vivo. Em particular, a proximidade anatômica da medula espinhal para os pulmões eo coração gera movimento significativo artefato que faz imagens do cordão espinhal vivendo uma tarefa desafiadora. Nós desenvolvemos um novo método que supera as limitações inerentes a imagem da medula espinhal através da estabilização da coluna vertebral, reduzindo respiratória induzida por movimentos e facilitando o uso de microscopia de dois fótons para a imagem do cordão espinhal de rato in vivo. Isto é conseguido através da combinação de um dispositivo de estabilização da coluna vertebral personalizado com um método de anestesia profunda, resultando em uma redução significativa do respiratória induzida por movimentos. Este protocolo vídeo mostra como expor uma pequena área da medula espinhal que viver pode ser mantida sob condições fisiológicas estáveis durante longos períodos de tempo, mantendo a lesão tecidual e sangramento ao mínimo. Representante imagens brutas adquiridas em detalhe vivo em alta resolução a estreita relação entre microglia e da vasculatura. Uma seqüência timelapse mostra o comportamento dinâmico de processos microglia na medula espinhal de rato vivo. Além disso, uma varredura contínua do mesmo z-frame demonstrars a estabilidade excepcional que este método pode conseguir para gerar pilhas de imagens e / ou filmes timelapse que não exigem o alinhamento da imagem pós-aquisição. Por fim, mostramos como esse método pode ser usado para rever e recriar a mesma área da medula espinhal em intervalo de tempo mais tarde, permitindo estudos longitudinais de curso processos fisiológicos ou patológicos in vivo.