1. Processamento de organoides para histologia: o método de rotação de agarose
NOTA: Este protocolo é adaptado de uma publicação anterior de Vlachogiannis et al. Adicionamos uma etapa envolvendo a incorporação de agarose para incorporar todas as populações de organoides com sucesso.
- Remova a mídia existente do poço. Tenha cuidado para não aspirar as cúpulas da membrana basal.
- Adicionar um volume igual (igual ao volume do meio removido da etapa 1) da solução de recuperação celular e incubar durante 60 min a 4 °C.
- Desaloje a cúpula da membrana basal usando uma pipeta e esmague a cúpula da membrana basal usando uma ponta de pipeta. Colete a solução dissociada de cúpula e recuperação celular em um tubo de 1,5 mL.
- Centrifugue a 300 x g e 4 °C por 5 min.
- Remova o sobrenadante (solução de recuperação celular). Guarde todos os sobrenadantes em tubos separados até o final, quando a presença de organoides for confirmada na etapa final de peletização.
- Adicione o volume desejado (Tabela 1) de PBS frio e pipete suavemente para cima e para baixo para perturbar o pellet mecanicamente.
- Centrifugue a 300 x g e 4 °C por 5 min.
- Remova o sobrenadante (PBS).
- Fixe o pellet em um volume correspondente (por exemplo, 500 μL para um pellet da condição de cultura em placas de 24 poços, Tabela 1) de 4% de PFA por 60 min à temperatura ambiente.
- Após a fixação, centrifugue a 300 x g e 4 °C por 5 min.
- Remova o sobrenadante (PFA).
- Lave com o volume correspondente (por exemplo, 500 μL para um pellet da condição de cultura em placas de 24 poços, Tabela 1) de PBS e centrifugue a 300 x g e 4 °C por 5 min.
- Prepare agarose quente (2% de agarose em PBS).
nota: Aqui, os pellets de células para seções congeladas podem ser ressuspensos diretamente em 200 μL de composto OCT.
- Ressuspenda o pellet celular em 200 μL de agarose (2% em PBS).
- Imediatamente após a adição de agarose, retire suavemente o pellet celular da parede do tubo de 1,5 mL usando a agulha de 25 G conectada à seringa de 1 mL. Conforme mostrado na Figura 1, se o pellet celular não estiver fisicamente separado da parede do tubo de 1,5 mL, existe o risco de perder todo ou parte do pellet celular durante o processo de inclusão de agarose.
- Espere até que a agarose a 2% no PBS esteja completamente solidificada.
- Retire o bloco de agarose solidificado do tubo de 1,5 ml utilizando uma agulha de 25 G ligada à seringa de 1 ml.
- Transfira o bloco de agarose destacado contendo o pellet celular para um novo tubo de 1,5 ml.
- Encha o tubo com 70% de EtOH e prossiga usando o protocolo convencional para desidratação de tecidos e inclusão de parafina.
Tabela 1: Densidade de semeadura, volume da membrana basal e volume médio necessário para uma cúpula
| Placa de cultura | Densidade de semeadura (células) | Volume da membrana basal (μL) | Meio (μL) |
| 48 poço | 25.000-50.000 | 20 | 250 |
| 24 poços | 50.000-250.000 | 40 | 500 |
| 6 poço | 50.000-250.000 | 40 | 2.000 |