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Artigo de método

Ensaio de vazamento de fluorescência para estudar a interação do peptídeo que penetra nas células com a membrana

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8 de julho de 2025

Neste artigo

Resumo

Fonte: Konate, K. et al. Ensaio de vazamento fluorescente para investigar a desestabilização da membrana por peptídeo que penetra nas células. J. Vis. Exp. (2020)

Este vídeo discute o ensaio de vazamento de fluorescência para estudar as interações de peptídeos que penetram nas células com as membranas celulares usando imitadores de membrana celular - grandes vesículas unilamelares, ou LUVs, encapsuladas com um corante fluorescente e um atenuador.

Protocolo

1. Preparação de Vesículas Unilamelares Grandes (LUVs)

  1. Prepare LUVs para seu uso como imitadores de membrana celular para ensaio de vazamento de fluorescência.
  2. Misture com uma seringa de vidro Hamilton fosfatidilcolina (DOPC, 786,11 g/mol), esfingomielina (SM, 760,22 g/mol) e colesterol (Chol, 386,65 g/mol) na proporção molar 4:4:2. A solução lipídica é obtida a partir de uma solução-mãe de cada lípido solubilizado num solvente metanol/clorofórmio (3/1; volume/volume) a 25 mg/ml num balão de vidro de fundo redondo de 25 ml. Com base em 4 μmol de DOPC, 4 μmol de SM e 2 μmol de Chol, a solução lipídica é obtida a partir da solução estoque misturando 126 μL, 117 μL e 31 μL, respectivamente.
    cuidado: O metanol é um solvente tóxico e inflamável e o clorofórmio é tóxico e cancerígeno. Ambos devem ser manuseados com a proteção adequada sob um capô.
  3. Evaporar metanol/clorofórmio usando um evaporador rotativo sob vácuo durante 45-60 min a 60 °C até a formação de um filme lipídico seco.
  4. Prepare duas soluções tampão HEPES estoque. Prepare o tampão HEPES 1 misturando HEPES 20 mM (238.3 g/mol) e NaCl 75 mM (58.44 g/mol) e ajuste o pH para 7.4. Prepare o tampão HEPES 2 misturando 20 mM de HEPES e 145 mM de NaCl e ajuste o pH para 7,4. Os tampões HEPES podem ser armazenados a 4 °C por 1 mês.
    nota: Recomenda-se verificar a osmolaridade dos tampões usando um osmômetro.
  5. Prepare a solução de hidratação lipídica dissolvendo o par de têmpera de corante fluorescente impermeável à membrana, ácido 8-aminonaftaleno-1, 3, 6-trissulfônico, sal dissódico a 12,5 mM (ANTS, 427,33 g / mol) e brometo de p-xileno-bispiridínio a 45 mM (DPX, 422,16 g / mol) em solução tampão HEPES. A mistura de ANTS com DPX leva a uma solução de cor amarela. Para atingir as concentrações de 12,5 mM de ANTS e 45 mM de DPX, dissolver 21,4 mg e 76 mg, respectivamente, em 4 mL de tampão HEPES 1,
    nota: A solução de hidratação lipídica pode ser armazenada por 2 semanas a 4 ° C, envolvendo o tubo com papel alumínio.
  6. Reconstituir vesículas multilamelares (MLV) ressuspendendo o filme lipídico seco com 1 mL da solução lipídica de hidratação e por vórtice até a dissolução do filme lipídico seco. Certifique-se de que a solução esteja completamente solubilizada, pois pequenos agregados lipídicos afetarão negativamente as etapas anteriores. Além disso, verifique a parede do frasco de vidro de fundo redondo para garantir que não haja nenhum filme lipídico remanescente.
    nota: A solução ficará opalescente e amarela clara após a solubilização.
  7. Sujeite as vesículas a cinco ciclos de congelamento/descongelamento para obter vesículas unilamelares. Execute cada ciclo colocando o frasco de vidro de fundo redondo por 30 s em nitrogênio líquido para a etapa de congelamento e, em seguida, deixando-o em banho-maria por 2 min para a etapa de descongelamento.
    nota: A temperatura da água do banho deve ser 5-10°C mais alta que a temperatura de fusão dos lipídios.
  8. Prepare a extrusora de lipídios inserindo dois suportes de filtro umedecidos preliminarmente com tampão HEPES em cada peça extrusora de politetrafluoretileno (PTFE) colocada no recipiente da extrusora de metal.
  9. Coloque uma membrana de policarbonato umidificado HEPES (tamanho de poro de 0.1 μm, 25 mm de diâmetro) na parte superior de um suporte de filtro.
  10. Monte as duas caixas da extrusora de metal e aparafuse-as.
  11. Coloque a extrusora montada no suporte e introduza uma seringa de 1 mL no orifício apropriado na extremidade de cada peça extrusora de politetrafluoretileno. A extrusão corresponde à passagem do líquido testado de uma seringa para a outra através da membrana de policarbonato.
  12. Teste a extrusora com 1 mL de tampão HEPES carregado em uma das seringas de 1 mL para garantir que não haja vazamentos ou problemas.
  13. Substitua o tampão HEPES de 1 mL pela amostra MLV.
  14. Realize a extrusão passando a amostra de MLV de uma seringa para a outra através da membrana de policarbonato pelo menos 21 vezes para obter LUVs uniformes do mesmo tamanho.
    nota: A extrusão deve ser realizada a uma temperatura superior à temperatura de fusão da mistura lipídica.

2. Purificação de LUVs

  1. Prepare uma purificação de coluna para remover o excesso de ANTS e DPX não encapsulado.
  2. Introduzir gel de dextrano reticulado (G-50) ressuspenso em meio aquoso com 0,01% de NaN3 (65 g/mol) em uma coluna de cromatografia líquida (Luer Lock, não revestido, 1,0 cm x 20 cm, volume do leito 16 mL) até 1 cm abaixo do topo da parte incolor da coluna.
  3. Abra a torneira e deixe o líquido fluir para assentar o gel de dextrano reticulado.
  4. Lave a coluna eluindo com 20 mL de tampão HEPES 2 e descarte o fluxo de saída da coluna.
  5. Feche a torneira assim que o volume morto de solvente acima da coluna estiver minimizado (<100 μL), mas suficiente para evitar qualquer secagem do gel de dextrano reticulado.
  6. Coloque os LUVs recém-extrudados (amarelos) na coluna e deixe-os entrar no gel de dextrano reticulado.
  7. Adicione continuamente o buffer HEPES 2 à coluna para realizar a purificação do LUV.
  8. Eluir aproximadamente 2 mL de tampão HEPES 2 (não se esqueça de encher regularmente o topo da coluna para evitar a secagem do gel de dextrano reticulado): a solução amarela livre de ANTS e DPX migra mais lentamente do que os lipossomas.
  9. Comece a coletar LUVs purificados em tubos (1,5 mL).
  10. Observe as gotas de eluente da coluna e, quando se tornam opalescentes, contêm lipossomas. Troque o tubo para recuperar a fração contendo LUV.
  11. Eluir até que as gotas deixem de ser opalescentes (~1 ml). Em seguida, eluir mais 0,5 mL em uma fração separada e interromper a eluição.
    NOTA: Os padrões agora estão disponíveis em uma ampla gama de pesos moleculares, como kits ou pesos moleculares individuais para calibrar o volume de eluição dos LUVs.
  12. Enrole os tubos com os LUVs em papel alumínio para evitar o branqueamento do corante de fluorescência.
  13. Lave a coluna com 20 mL de tampão HEPES 2.
  14. Os LUVs podem então ser armazenados por uma semana a 4 °C.
    NOTA: Como a estabilidade do LUV pode depender da concentração e composição do LUV, bem como da força iônica, o tamanho dos LUVs deve ser controlado usando um instrumento de espalhamento dinâmico de luz (DLS) (consulte a seção 4. Caracterização do tamanho e homogeneidade do LUV) antes de cada teste.

3. Quantificar a concentração de LUVs

  1. Estimar a concentração de LUV por um kit de quantificação de fosfolipídios, que permite a avaliação da concentração de colina. Este ensaio pode ser aplicado quando os fosfolipídios com colina contendo cabeça polar são substanciais (>50% dos LUVs).
  2. Prepare o reagente de cor dissolvendo 18 mg de substrato cromógeno em 3 mL de tampão fornecido.
  3. Carregue uma cubeta de poliestireno, 10 x 10 x 45 mm, com 3 mL de reagente de cor.
  4. Use o reagente de cor pura como condição em branco (em branco). Adicione 20 μL de amostra LUV (Teste) ou 20 μL de solução padrão de concentração de colina conhecida (Padrão).
  5. Misture bem e incube por 5 min a 37 ° C em todas as condições (em branco, teste e padrão).
  6. Medir a absorvância (densidade óptica, DO) da amostra para ensaio e da solução-padrão com a solução em branco como controlo a 600 nm com um espectrofotómetro.
  7. Verificar os valores de DO que permitem estimar a concentração lipídica dos LUVs, C[LUV], em colina equivalente em comparação com o padrão de concentração conhecido.
  8. Execute o cálculo usando a seguinte equação:
    C[LUV] (mol/l) = (Amostra OD/Padrão OD) x C[Padrão] (mol/l)
    NOTA: O kit de quantificação de fosfolipídios forneceu uma solução padrão de cloreto de colina (139,6 mg / l) a 54 mg / dL correspondente à concentração molar de C [Padrão] = 3,87 mmol / L. OD Sample e OD Standard são as absorbâncias medidas a 600 nm para as soluções LUV e Colina, respectivamente.

4. Caracterização do tamanho e homogeneidade do LUV

  1. Realize uma medição usando um instrumento DLS para determinar o tamanho do LUV (em nm) e o índice de polidispersidade (PdI).
  2. Programe o "procedimento de operação padrão" (SOP) apropriado indicando a viscosidade do solvente/tampão e da cubeta usada.
  3. Colocar 500 μL da solução LUV numa cubeta semimicromicro de poliestireno.
  4. Insira a cubeta semimicro de poliestireno em um instrumento DLS.
  5. À temperatura ambiente, medir a distribuição de tamanho em termos de tamanho médio (média Z) da distribuição de partículas e de homogeneidade (índice de polidispersão, PdI).
  6. Todos os resultados são obtidos a partir de duas medições independentes realizadas cada uma em três ciclos repetitivos.
    NOTA: Os valores padrão para LUVs serão um tamanho médio de 137 ± 7 nm com um PdI de 0.149 ± 0.041.

5. Preparando soluções peptídicas

  1. Prepare uma solução de estoque do peptídeo, que deve ser analisada para o ensaio de vazamento.
  2. Dissolva o pó de peptídeo (>95% de pureza) em água pura (por exemplo, 1 mg de peptídeo em 500 μL de água pura).
    nota: Recomenda-se diluir peptídeos em água pura e evitar a solubilização de dimetilsulfóxido (DMSO), que pode induzir artefatos (por exemplo, permeabilização da membrana).
  3. Vortex a solução peptídica por 5 s.
  4. Sonicar a solução peptídica em um banho de sonicação de água por 5 min e depois centrifugar por 5 min a 12,225 x g. Recolha o sobrenadante para determinação da concentração.
  5. Meça a absorbância a 280 nm de três diluições peptídicas independentes e, em seguida, calcule a concentração de peptídeos usando seu coeficiente de extinção molar ε (dependendo do teor de triptofano e tirosina na sequência peptídica) e regra de Beer-Lambert.
    nota: Se o peptídeo contiver triptofano e tirosina, o coeficiente de extinção molar ε é calculado com base no triptofano ε = 5.690 M-1 cm-1 e tirosina ε = 1.280 M-1 cm-1. Se a sequência peptídica não contiver triptofano ou tirosina, outro ensaio colorimétrico pode ser realizado para medir a concentração (por exemplo, BCA ou Bradford).
  6. Diluir a solução peptídica em água pura até obter uma solução final de 100 μM e conservar a 4 °C.
    nota: Em água pura, não ocorre degradação de peptídeos durante o armazenamento a 4 °C. No entanto, a concentração de peptídeos deve ser medida a cada 2 semanas para garantir que não ocorra evaporação da água.

6. Ensaio de fuga de fluorescência

  1. O ensaio de vazamento de fluorescência é medido em um espectrofluorômetro à temperatura ambiente. O comprimento de onda de excitação e emissão é fixado em Ex = 360 nm ± 3 nm e Em = 530 nm ± 5 nm, respectivamente.
  2. Diluir LUVs em 1 mL de tampão HEPES 2 até uma concentração final de 100 μM em uma cubeta de fluorescência de quartzo. Adicione um agitador magnético para homogeneizar a solução durante o experimento.
  3. Meça as LUVs sozinhas durante os primeiros 100 s, entre t = 0 s e t = 99 s, a fim de acessar a fluorescência de fundo.
    nota: Os LUVs sozinhos também podem ser medidos durante todo o experimento (15 min) para acessar a fluorescência de fundo e possíveis vazamentos.
  4. Depois disso, meça o vazamento como um aumento na intensidade de fluorescência após a adição de alíquotas de solução peptídica pelos próximos 900 s (15 min). Este protocolo é realizado para cada concentração de peptídeo testada de 0,1 μM a 2,5 μM.
  5. Finalmente, 100% de fluorescência foi alcançada solubilizando os LUVs pela adição de 1 μL de Triton X-100 (0,1%, v / v), resultando na sonda completamente não extinta entre t = 1.000 s e t = 1.100 s.

7. Quantificação da fuga

  1. Suprimir os valores obtidos após t = 1.090 s para manter o mesmo número de pontos para cada condição testada.
  2. Calcule a fluorescência mínima, Fmin, fazendo a média de 50 pontos entre t = 0 s e t = 49 s (LUVs sozinhos).
  3. Calcule a fluorescência máxima, Fmax, fazendo a média de 50 pontos entre t = 1.041 s e t = 1.090 s (LUVs com Triton X-100).
  4. Calcule a porcentagem de vazamento (%Vazamento) em cada ponto de tempo (t = x), de acordo com a seguinte equação:
    %Vazamento(t=x) = (F(t=x) - Fmin) / (Fmax - Fmin) x 100
  5. Calcule a média e o desvio-padrão para valores obtidos com diferentes preparações LUV (n ≥ 2) para a mesma condição.
  6. Plote a porcentagem de vazamento, %Leak(t=x), em função do tempo (s).

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Divulgações

Não há conflitos de interesse declarados.

Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Balão de vidro de 25 ml com fundo redondoPyrex
8-aminonaftaleno-1, 3, ácido 6-trissulfónico, sal dissódico (ANTS)InvitrogenA350Proteger da luz
clorofórmioSigma-Aldrich288306
colesterolSigma-AldrichC8667
DOPC (dioleoilfosfatidilcolina)Avanti Polar850375PProteger do ar
ExtrusoraAvanti PolarNº 610000
FluorímetroPTI Serlabo
Seringa de vidro de 50 μLHamilton705N
HEPESSigma-AldrichH3375
Fosfolipídio LabAssayWAKO296-63801
coluna para cromatografia líquidaSigma-Aldrich
metanolCarlo Erba414902
Membrana de policarbonato nuclepore (tamanho de poro de 0,1 μm, diâmetro de 25 mm)O que homem800309
Cubeta de poliestireno, 10 x 10 x 45 mmGrener Bio-One614101
cubeta semi-micro de poliestireno, DLSFisher CientíficoFB55924
brometo de p-xileno-bispiridínio (DPX)InvitrogenX1525Proteger da luz
cubeta de fluorescência de quartzoHellma109.004F-QS
Sistema de rotavaporHeidolphZ334898
Resina Sephadex G-50Amersham17-0042-01
Azida sódica (NaN3)Sigma-AldrichS2002
Cloreto de sódio (NaCl)Sigma-AldrichS5886
USC300T de banho do soniadorVWR142-6001
EsfingomielinaAvanti Polar860062PProteger do ar
Tritão X-100Eromedex2000-B
Zetaziser NanoZSMalvernZEN3500

Etiquetas

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