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Artigo de método

Ensaio Híbrido Levedura-Um Modificado para Detectar Interações Complexo de Proteína Heteromérica e DNA

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8 de julho de 2025

Neste artigo

Resumo

Fonte: Tripathi, P. et al., Um Sistema Híbrido de Levedura-um Modificado para Estudos de Interação DNA-Complexo de Proteína Heteromérica. J. Vis. Exp. (2017)

Neste vídeo, demonstramos o ensaio de um híbrido de levedura modificado, que detecta várias proteínas interagindo com o DNA alvo. As células de levedura transformadas contêm a sequência de DNA alvo a montante do gene repórter. Além disso, eles expressam proteínas do fator de transcrição. Quando as proteínas formam complexos e se ligam ao DNA alvo, o gene repórter é expresso e pode ser detectado enzimaticamente.

Protocolo

1. Dia 9 (manhã): Iniciar a cultura para medição enzimática.

  1. Ressuspenda a cultura e transfira 125 μL usando uma pipeta multicanal em uma placa espectrofotômetro (medida OD600).
    nota: Cuidado: Não dispense a última gota para evitar bolhas, se o OD600 estiver abaixo de 0,3 - 0,6, incube as células restantes por mais 1 - 2 h com base na leitura. A cultura de 125 μL usada nesta etapa pode ser descartada ou transferida de volta para o bloco de poço profundo original a critério do usuário.
  2. Centrifugar as células restantes no bloco de poços profundos durante 10 minutos a 3000 x g e 21 °C. Remover o sobrenadante invertendo.
  3. Adicione 200 μL de tampão Z e vórtice.
    nota: Consulte a receita do Z-buffer na Tabela 1.
  4. Centrifugue durante 5 min a 3000 x g e 21 °C. Retirar o sobrenadante invertendo.
  5. Adicione 20 μL de tampão Z e vórtice.
  6. Cubra a placa com papel alumínio que resista aos ciclos de congelamento e descongelamento. Realizar 4 ciclos de congelamento/descongelamento com azoto líquido em capela e depois 42 ºC em banho-maria (2 min cada).
  7. Adicione 200 μL de tampão Z / beta-mercaptoetanol (β-ME) / orto-nitrofenil-β-galactosídeo (ONPG) (12 mL, 21 μL, 8,4 mg, respectivamente, produzirá 20 mL de solução; sempre prepare fresco).
    nota: O ONPG levará algum tempo para se dissolver adequadamente, portanto, prepare a solução uma hora antes de chegar a esta etapa. O ONPG serve como substrato para a medição da atividade da β-galactosidase.
  8. Incubar até 17 - 24 h a 30 °C (verificar no meio, se a cor se desenvolver mais cedo, prossiga para o passo seguinte).

2. Dia 10 (manhã): Pare a reação e meça.

  1. Adicione 110 μL 1M Na2CO3 para interromper a reação e registrar o tempo.
  2. Vórtice e centrifugação por 10 min a 3000 x g e 21 °C.
  3. Pegue 125 μL de sobrenadante usando multicanal e meça OD420.
    nota: Cuidado, não dispense a última gota para evitar bolhas.

Tabela 1: A receita para as soluções usadas no protocolo. A tabela fornece a receita para as soluções de estoque e de trabalho dos principais tampões usados no ensaio.

Tampão TE 10X (10ml)
desejávelDo estoque
1000mM Tris-Cl (pH 8,0)1mL de Tris 1M
10mM EDTA (pH 8,0)200uL de EDTA 0,5M
Completar o volume com água
TE/LiAc (10ml)
desejávelDo estoque
1X 1mL TE 10X
0,1 milhão de LiAc1mL LiAc 1M
Completar o volume com água
TE/LiAc/PEG (50 mL) 50%
desejávelDo estoque
1X5 mL TE 10X
0,1 milhão de LiAc5 mL LiAc 1M
40 mL PEG3350
Tampão Z (1L) pH 7,0
Na2HPO4 16,1g de heptahidratado ou 8,52g de anidro
NaH2PO4 5,5g de hidratado ou 4g de anidro
KCl 0,75g
MgSO4 0,246g de hidratado ou 0,12g de anidro
Manter o pH com HCl
Todas as soluções são esterilizadas antes do uso.
Placas de meio e ágar utilizadas no protocolo (YPDA, SD-Ura; SD-Trp-Ura e SD-Trp-Ura) seguem a mesma receita do Y1H

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Divulgações

Não há conflitos de interesse declarados.

Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Placa inferior redonda de 96 poçosGreiner bio-one650101Artigos de plástico
Bloco de poço de 96 profundidadesEUA Científico1896-2000Artigos de plástico
Folha selávelEUA CientíficoRolamento 2923-0110Artigos de plástico
ArasealExcel CientíficoB-100Artigos de plástico
2-mercaptoetanolFisher CientíficoRolamento 034461-100Análise
ONPGSigma-AldrichRolamento 73660Análise
Na2CO3Sigma-Aldrich223484Análise
Na2HPO4Sigma-AldrichS3264Análise
NaH2PO4Sigma-AldrichS3139Análise
KclFisher CientíficoBP366-500Análise
MgSO4Sigma-AldrichRolamento 83266Análise
HclFisher CientíficoSA54-4Análise
Banho secoThermo Fischerdispositivo
vórticeThermo Fischerdispositivo
centrifugaEppendorfCentrífuga 5810Rdispositivo
Leitor de placasDispositivo molecularEspectrofotômetro de microplacas SPECTRAMAX PLUSdispositivo
incubadoraThermo FisherInformação básica Modelo: 5250-37 graus, 6250-30 grausdispositivo
Incubadora ShakerNew brunswickdispositivo
Banho-mariaThermo FisherIsoTemp 205dispositivo
Base TrisFisher CientíficoBP152-1Análise

Etiquetas

Interação de Complexo Proteico com DNAEnsaio de Beta GalactosidaseDomínio de Ativação GAL4Ligação de Fator de TranscriçãoExpressão de Gene RepórterLise por Congelamento e DescongelamentoSubstrato Z BufferMedição de Densidade ÓpticaDetecção de Proteína Heteromérica