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Artigo de método

Um sistema de cultura de órgãos intestinais ex vivo para estudar as interações hospedeiro-microbiota

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⸱

8 de julho de 2025

Neste artigo

Resumo

Fonte: Azriel, S., et al. Um sistema de cultura de órgãos intestinais para analisar as interações hospedeiro-microbiota. J. Vis. Exp. (2021).

Neste vídeo, descrevemos a metodologia para configurar um sistema de cultura de órgãos intestinais ex vivo para estudar as interações entre fragmentos de tecido intestinal de camundongos e bactérias intestinais específicas. O dispositivo consiste em dois pares de portas de entrada e saída, a primeira conectando o lúmen do tecido intestinal e fornecendo a suspensão bacteriana específica a ele, e a segunda fornecendo continuamente meios aos poços do dispositivo para manter a viabilidade do tecido ex vivo.

Protocolo

Todos os procedimentos envolvendo modelos animais foram revisados pelo comitê institucional local de cuidados com animais e pelo conselho de revisão veterinária JoVE.

1. Preparação do experimento

  1. Fabricação do dispositivo de cultura de órgãos intestinais (3 dias)
    1. Usando uma impressora 3D, imprima os moldes de plástico reutilizáveis para o dispositivo de cultura de órgãos (o dispositivo possui 6 poços, com 24 orifícios pequenos e grandes, e para a tampa da tampa do dispositivo).
      NOTA: Esses moldes de plástico podem ser usados para a fabricação de vários dispositivos.
    2. Insira as agulhas de ponta romba (22 G e 18 G) na posição apropriada dentro do molde do dispositivo e funda aproximadamente 20 g de mistura de polidimetilsiloxano (PDMS) (proporção de peso de 1:10, base para catalisador) para um conjunto do dispositivo e tampa.
    3. Coloque os moldes em uma câmara de vácuo por 30 min, para remover as bolhas de ar da mistura PDMS.
    4. Incube os moldes a 55 °C durante a noite, para completar a polimerização do PDMS.
    5. Quando o PDMS estiver definido, retire as agulhas do molde e solte cuidadosamente o dispositivo de cultura e a tampa dos moldes de plástico.
    6. Remova os resíduos de PDMS do contorno do poço usando uma lâmina cirúrgica. Fixe o dispositivo PDMS e a tampa do dispositivo em uma lamínula (microlâminas de 75 mm x 50 mm) usando adesivo de silicone não tóxico e deixe as peças endurecerem durante a noite (aplique a cola no lado liso do dispositivo).
    7. Insira doze agulhas de 22 G para o lúmen e doze agulhas de 18 G para o poço. Fixe todas as agulhas no lugar usando silicone e deixe descansar durante a noite. Insira duas agulhas de 18 G na tampa da tampa para um fluxo de ar adequado para dentro e para fora do dispositivo de cultura de órgãos intestinais.
    8. Verifique se há vazamentos em todas as agulhas usando uma seringa cheia de água. Verifique se não há vazamento dos poços enchendo os poços com água.
    9. Coloque dois nós cirúrgicos em cada agulha de 22 G que será conectada ao cólon. Coloque o dispositivo e a tampa em um saco de papel de autoclave e esterilize em uma autoclave.
  2. Meio de cultura (0,5 h)
    1. Em um capuz biológico, misture o seguinte (em um tubo de 50 mL): 37 mL de meio de Dulbecco modificado de Iscove (IMDM), 10 mL de reposição de soro KSR, 1 mL de suplemento de B27, 0,5 mL de suplemento de N2, 0,5 mL de tampão HEPES 1 M e 0,5 mL de aminoácidos não essenciais.
    2. Filtrar e conservar o meio completo a 4 °C.
  3. Preparação de tubos e ferramentas cirúrgicas
    1. Corte o comprimento apropriado dos tubos para o lúmen de entrada, poço de entrada, lúmen de saída e poço de saída (12 tubos curtos e 12 tubos longos). Conecte um adaptador apropriado a cada lado do tubo.
    2. Prepare as ferramentas cirúrgicas: tesoura reta, 4 pinças finas e 2 pinças afiadas.
    3. Coloque os tubos e as ferramentas cirúrgicas em um saco de papel de autoclave e esterilize-os usando uma autoclave.
  4. Prepare a entrada luminal (estimulação desejada - bactérias, fezes, medicamentos, etc.).
    1. Antes do experimento, determinar a carga bacteriana da cultura bacteriana, por diluições seriadas, e cultivar em condições aeróbias e/ou anaeróbias.
    2. Depois de calcular a carga bacteriana, diluir as culturas bacterianas em um meio de cultura de tecidos estéril para obter a concentração bacteriana necessária. Para amostras fecais, filtre usando um filtro de 100 μm.
      nota: Para estimulação não bacteriana (drogas, metabólitos, etc.), dilua a substância até a concentração necessária usando o meio de cultura intestinal.

2. Preparação da configuração do experimento

  1. Dentro da incubadora de cultura de órgãos, ligue a unidade de aquecimento e ajuste-a para 37 °C.
  2. Configure as bombas, bem como as seringas de entrada e saída.
  3. Entrada do meio de cultura de tecidos
    1. Em uma capela de fluxo biológico ou laminar, encha as seringas do poço de entrada com um meio de cultura completo. O volume final depende da duração do experimento e da vazão; geralmente 1 mL / h mais um meio adicional para purga.
    2. Conecte os tubos às seringas usando o adaptador Luer-lock. Coloque as seringas cheias nas bombas de seringa.
    3. Purgue as seringas de entrada. Certifique-se de que o meio do poço flua de todos os tubos para um vidro residual.
  4. Entrada luminal
    1. Encha as seringas de entrada luminal com tratamento de estimulação (bactérias, medicamentos, etc.). O volume depende da duração do experimento e da taxa de fluxo (geralmente 30 μL / h mais um meio adicional para purga).
    2. Conecte os tubos às seringas usando o adaptador Luer-lock. Coloque as seringas cheias nas bombas de seringa.
    3. Purgue as seringas de entrada. Certifique-se de que a estimulação flui de todos os tubos para um copo usado. Tenha cuidado para não contaminar os diferentes estímulos.
  5. Saídas
    1. Coloque as seringas vazias nas bombas de seringa de saída (defina o modo de bomba para 'retirada').
  6. Configuração do dispositivo
    1. Defina o regulador que controla a vazão da mistura de gases (95% O2 + 5% CO2) para um fluxo suave e mínimo.
    2. Examine o dispositivo em uma coifa laminar.
    3. Lave as agulhas do dispositivo com IMDM estéril para lavar as agulhas.
    4. Adicione 500 μL de meio de cultura estéril em cada poço do dispositivo.
  7. Preparação para dissecção de tecidos
    1. Coloque as ferramentas cirúrgicas estéreis dentro da capa laminar.
    2. Encha uma seringa de 10 mL com IMDM estéril e conecte uma agulha estéril (autoclavada) de 22 G para lavagem do cólon.

3. Culturas de órgãos

  1. Sacrifício de camundongos e dissecção de tecidos
    1. Em um capuz laminar, sacrifique camundongos de 12 a 14 dias por decapitação. Pulverize os ratos com etanol 70% e coloque-os em um prato de plástico.
    2. Usando uma tesoura afiada e uma pinça, disseque o camundongo e retire o trato digestivo do estômago ao ânus, cortando toda a gordura e tecidos conjuntivos. Corte os dois pontos e coloque-o em um novo prato.
      nota: Minimize o contato com o tecido do cólon. Não toque na parte média do tecido do cólon. Segure o tecido suavemente e apenas nas bordas do tecido.
  2. Lavagem e lavagem do cólon
    1. Sob um microscópio de dissecção, lave suavemente o conteúdo do cólon com IMDM estéril (no lado proximal) com a seringa preparada de 10 mL (etapa 2.7.2). Depois de remover as fezes do tecido intestinal, coloque o cólon em uma nova placa de 6 poços preenchida com 0,5 mL de IMDM estéril.
  3. Conectando os dois pontos ao dispositivo
    1. Pegue o lenço, conecte-o cuidadosamente à agulha 22 G e faça um laço apertado com os dois fios. Neste ponto, é imperativo manter a orientação correta do cólon para o fluxo do lúmen (proximal = entrada, distal = saída). Repita as etapas 3.2-3.3 para todos os 6 tecidos.
    2. Verifique se as travas Luer da agulha de entrada estão vazias do meio. Caso contrário, esvazie-os. Adicione estímulos à trava Luer da agulha de entrada (para evitar a entrada de bolhas de ar no lúmen). Repita esta etapa para cada cólon com a estimulação apropriada.
    3. Verifique se todos os lenços estão conectados e coloque a tampa da tampa em cima do dispositivo.
  4. Conectando o dispositivo de cultura de órgãos às bombas
    1. Coloque o dispositivo na câmara pré-aquecida com temperatura controlada (37 °C).
  5. Conecte o fluxo de gás
    1. Conecte o adaptador de gás à tampa da tampa usando a agulha de entrada apropriada.
    2. Conecte os tubos de entrada e saída ao dispositivo.
      nota: Conecte o lado proximal do cólon às cubas de entrada.
  6. Purgue o lúmen com as entradas de estimulação.
    1. Flua suavemente a estimulação luminal através do intestino e verifique o fluxo do meio nos tubos de saída.
    2. Lave o meio externo.
    3. Lave o meio externo 3 vezes (ajuste as bombas a uma taxa de 600 μL/min para entrada e saída). Cada lavagem leva 1 minuto (começando por esvaziar o poço).
  7. Inicie o experimento.
    1. Inicie as bombas nas seguintes taxas:
      Taxa de fluxo: lúmen: entrada - 30 μL / h, saída - 35 μL / h < br / > Meio externo: entrada - 1000 μL / h, saída - 950 μL / h < / > nota: O tempo de experimento pode variar entre 30 min a 24 h.
  8. Fim do experimento (até 24 h para culturas de órgãos do cólon)
    1. Desconecte todos os tubos do dispositivo.
    2. Desconecte os lenços das agulhas e continue com as leituras desejadas.

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Divulgações

Não há conflitos de interesse declarados.

Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
dispositivo
Agulha romba de calibre 18McmasterRolamento 75165a754
Agulha romba de calibre 22McmasterRolamento 75165a758
Selante adesivo multiuso 100% siliconeDapEpisódio 688
Dessecador a vácuo cúbico VDC-21+ 2 prateleirasAAAD4021
Lâmina de vidro com 1 mm de espessuraCorning2947-75X50
Mini Incubadora im-10AAH24315K
BOMBA DE VÁCUO MPC 301EVI-412711
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tubulaçãoMcmasterNº 6516T11
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Média
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Tampão HEPES (1M)Thermo Fisher Científico15630056
Soro Knock-Out Thermo Fisher Científico 10828028
Suplemento N2 (100x) Thermo Fisher Científico A1370701
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