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Artigo de método

Um ensaio para estudar o impacto da rigidez da matriz extracelular na infecção bacteriana

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8 de julho de 2025

Neste artigo

Resumo

Fonte: Bastounis, E. E., et al. Um ensaio baseado em poliacrilamida de formato multipoço para estudar o efeito da rigidez da matriz extracelular na infecção bacteriana de células aderentes. J. Vis. (2018).

Este vídeo demonstra um ensaio para estudar o efeito da rigidez da matriz extracelular (MEC) na infecção bacteriana de células aderentes. Hidrogéis de poliacrilamida de rigidez variável, revestidos com colágeno, são colocados em camadas em uma placa de vários poços para imitar a rigidez da ECM fisiológica. Ao sobrepor células endoteliais humanas nos hidrogéis e infectar as células com bactérias Listeria monocytogenes projetadas para expressar uma proteína fluorescente uma vez intracelular, a citometria de fluxo é usada para comparar bactérias internalizadas em células que residem em hidrogéis mais rígidos versus hidrogéis mais macios.

Protocolo

1. Fabricação de hidrogéis finos de poliacrilamida (PA) de duas camadas em placas de vários poços

  1. Fabricação de hidrogel de poliacrilamida
    nota: Veja a Figura 1.
    1. Prepare soluções aquosas que contenham 3 a 10% de solução de acrilamida estoque a 40% (consulte a Tabela de Materiais) e 0,06 a 0,6% de solução de bisacrilamida estoque a 2% (consulte a Tabela de Materiais) para fabricar hidrogéis de rigidez ajustável variando de 0,6 kPa a 70 kPa. Veja a Tabela 1.
      1. Para hidrogéis de 0,6 kPa, misture 3% de acrilamida com 0,045% de bis-acrilamida. Para hidrogéis de 3 kPa, misture 5% de acrilamida com 0,074% de bis-acrilamida. Para hidrogéis de 10 kPa, misture 10% de acrilamida com 0,075% de bis-acrilamida. Para hidrogéis de 20 kPa, misture 8% de acrilamida com 0,195% de bis-acrilamida. Para hidrogéis de 70 kPa, misture 10% de acrilamida com 0,45% de bis-acrilamida.
        NOTA: Mais detalhes sobre como alcançar a rigidez desejável do hidrogel PA podem ser encontrados em outro lugar.
    2. Prepare duas soluções aquosas para cada rigidez desejável do hidrogel. Prepare a Solução 1 para ser livre de esferas e a Solução 2 para conter 0.03% de microesferas fluorescentes de 0.1 μm de diâmetro (consulte a Tabela de Materiais).
    3. Desgaseifique as soluções 1 e 2 por vácuo por 15 min para eliminar o oxigênio que é conhecido por inibir a polimerização das soluções.
    4. Adicione 0,6% da solução APS estoque de 10 g/mL e 0,43% de tetrametiletilenodiamina (TEMED) à Solução 1 para permitir o início da polimerização. Aja rápido.
    5. Adicione 3,6 μL da Solução 1 ao centro de cada poço do prato de 24 poços.
    6. Cubra imediatamente os poços com lamínulas circulares não tratadas de 12 mm e deixe a Solução 1 descansar por 20 min para que ela polimerize completamente.
    7. Bata suavemente uma agulha de seringa em uma superfície para criar um pequeno gancho em sua ponta para facilitar a remoção das lamínulas. Levante as lamínulas usando a agulha da seringa.
    8. Adicione 0,6% da solução APS estoque de 10 g/mL e 0,43% de TEMED à Solução 2. Deposite 2,4 μL da mistura no topo da primeira camada em cada poço do prato de 24 poços.
    9. Cubra a Solução 2 com lamínulas circulares de vidro de 12 mm, pressionando suavemente para baixo usando uma pinça para garantir que a espessura da segunda camada seja mínima. Deixe a Solução 2 polimerizar por 20 min.
    10. Adicione 500 μL de HEPES 50 mM pH 7,5 a cada um dos poços e, em seguida, remova as lamínulas de vidro com a agulha da seringa e a pinça.
  2. Esterilização, revestimento de colágeno e equilíbrio de hidrogéis de poliacrilamida
    1. Exponha os hidrogéis por UV por 1 h na capa de cultura de tecidos para permitir a esterilização.
    2. Prepare uma mistura de 0,5% de sulfosuccinimidil 6-(4′-azido-2′-nitrofenilamino)hexanoato a 0,5% (Sulfo-SANPAH, consulte a Tabela de Materiais) em DMSO a 1% e HEPES 50 mM pH = 7,5.
    3. Adicionar 200 μL desta solução à superfície superior dos hidrogéis. Agindo rápido, exponha-os aos raios UV (302 nm) por 10 min para ativá-los.
    4. Lave os hidrogéis duas vezes com 1 mL de HEPES 50 mM pH = 7,5. Repita se necessário para garantir que qualquer excesso de reticulador seja removido.
    5. Revestir os hidrogéis com 200 μL de 0,25 mg / mL de colágeno I de cauda de rato (ver Tabela de Materiais) em 50 mM de HEPES. Incubar os hidrogéis, com a solução de colágeno por cima, durante a noite em temperatura ambiente.
      nota: Para evitar a desidratação/evaporação, coloque as placas de vários poços em uma contenção secundária e adicione lenços de limpeza de laboratório embebidos em água na periferia interna da contenção.
    6. Use um microscópio de epifluorescência ou confocal com uma objetiva de 40X para medir a espessura dos hidrogéis. Faça isso localizando as posições z dos planos inferior (onde está a superfície do vidro) e superior do hidrogel (onde a intensidade das esferas fluorescentes é máxima). Em seguida, subtraia as posições z para determinar a altura.
      nota: Utilizou-se um microscópio de epifluorescência invertida e uma objetiva de 40X com abertura numérica de 0,65 para medir a espessura dos hidrogéis. As medições de Microscopia de Força Atômica (AFM) também podem ser realizadas neste ponto para confirmar a rigidez exata dos hidrogéis (veja a Figura 2).
    7. Antes de semear as células de interesse nos hidrogéis, adicione 1 mL de meio nos hidrogéis e incube-os a 37 °C por 30 min a 1 h para garantir o equilíbrio.
      nota: Adicionamos mídia completa MCDB-131 porque essa é a mídia em que as células hospedeiras modelo (HMEC-1) foram cultivadas (consulte a etapa 2.1 para obter detalhes).

2. Cultura de células endoteliais microvasculares humanas e semeadura em hidrogéis

  1. Cultura de células HMEC-1 (endotelial microvascular humana) em meio completo de MCDB-131 contendo meio MCDB-131 suplementado com 10% de soro fetal bovino, 10 ng/mL de fator de crescimento epidérmico, 1 μg/mL de hidrocortisona e 2 mM de L-glutamina (ver Tabela de Materiais).
  2. Divida as culturas confluentes 1:6 a cada 3 - 4 dias e mantenha as células até a passagem 40.
  3. Um dia antes do experimento, retire as células de seu vaso de cultura usando 0,25% de tripsina / EDTA. Primeiro lave as células e seu recipiente de cultura 1x com solução salina tamponada com fosfato estéril (PBS) e, em seguida, adicione a quantidade apropriada de tripsina / EDTA a 0,25% (2 mL por prato de 100 mm ou frasco de 75 cm, 1 mL por prato de 60 mm ou frasco de 25 cm), incubando o frasco a 37 ° C por 5 a 10 min para permitir o desprendimento das células de seu substrato.
  4. Neutralize a tripsina adicionando o volume desejado de meio completo MCDB-131, pipete suavemente para quebrar os aglomerados de células e, em seguida, coloque a solução em um tubo de centrífuga cônico.
  5. Agite suavemente a solução de células para garantir que as células sejam distribuídas uniformemente e, em seguida, retire 20 μL da solução e preencha muito suavemente as duas câmaras sob a lamínula de um hemocitômetro de vidro.
  6. Diluir a solução de células contidas no tubo de centrifugação cónico por centrifugação durante 10 minutos a 500 x g.
  7. Durante o período de espera de 10 minutos, conte as células usando um hemocitômetro. Use um microscópio, concentre-se nas linhas de grade do hemocitômetro com uma objetiva de 10X e, em seguida, use um contador de contagem manual para contar o número de células em um quadrado de 1 mm x 1 mm.
  8. Mova o hemocitômetro para outro quadrado de 1 mm x 1 mm, conte as células e repita o processo mais duas vezes. Calcule a média das quatro medidas e multiplique a média por 104. O valor final é o número de células viáveis/ml na suspensão celular que está a ser centrifugada.
  9. Remova o líquido do tubo cônico da centrífuga, garantindo que o pellet da célula não seja interrompido. Ressuspenda as células no meio completo MCDB-131 a uma concentração de 4 x 105 células/mL.
  10. Semeie as células em suspensão nos hidrogéis, removendo primeiro o meio com o qual os hidrogéis foram incubados e, em seguida, adicionando 1 mL de suspensão celular em cada hidrogel.

3. Infecção de células endoteliais microvasculares humanas com L. monocytogenes

  1. Três dias antes da infecção, retire a cepa Lm a ser usada de um estoque de glicerol (armazenado a -80 °C) em uma placa de ágar BHI que contenha 7,5 μg/mL de cloranfenicol e 200 μg/mL de estreptomicina, se apropriado.
    nota: A cepa a ser riscada pode ser do tipo selvagem ou mutante, expressando constitutivamente fluorescência (para imunocoloração JAT1045 foi usada) ou expressando fluorescência sob o promotor ActA (para citometria de fluxo ou microscopia de força de tração JAT983 ou JAT985 foram usados).
  2. Incubar as placas a 37 °C até que se formem colónias discretas (1 - 2 dias).
  3. No dia anterior à infecção, cultive a cepa desejada durante a noite, agitando-a a 150 rpm a 30 ° C em meio BHI com 7,5 μg / mL de cloranfenicol (se apropriado).
    1. Coloque 5 mL de meio BHI em um tubo de centrífuga cônico de 15 mL, adicione 7,5 μg / mL de cloranfenicol (se apropriado) e, em seguida, inocule uma única colônia da placa de ágar usando uma ponta estéril de 10 μL.
  4. No dia seguinte, imediatamente antes da infecção, medir a densidade óptica da solução bacteriana a 600 nm (OD600) diluindo a amostra 1:5; utilizar uma cubeta contendo apenas BHI para servir de branco.
  5. Diluir a cultura durante a noite até um OD600 de 0,1 e incubá-la, agitando durante 2 h a 30 °C, em meio BHI com 7,5 μg/ml de cloranfenicol (se for caso disso) para permitir que as bactérias atinjam o crescimento logarítmico.
  6. Meça o OD600 da solução bacteriana, que deve estar em torno de 0,2 - 0,3. Se o OD600 for maior, dilua-o para 0,2 - 0,3 apenas com BHI.
  7. Leve 1 mL de solução bacteriana para um tubo de microcentrífuga. Gire para baixo por 4 min a 2.000 x g usando centrifugação em temperatura ambiente. Remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet bacteriano em 1 mL de PBS de grau de cultura de tecidos, na capa de cultura de tecidos. Lave as bactérias mais duas vezes, girando-as por 4 min a 2.000 x g em temperatura ambiente. Remova o sobrenadante e ressuspenda as bactérias em 1 mL de PBS.
  8. Prepare a mistura de infecção misturando 10 ou 50 μL da bactéria ressuspensa em PBS com 1 mL de meio completo MCDB-131 para uma multiplicidade de infecções (MOI; ou seja, o número de bactérias por célula hospedeira) de aproximadamente 50 bactérias por célula hospedeira ou 10 bactérias por célula hospedeira.
  9. Remova o meio dos poços das placas de 24 poços, com cuidado para não romper os hidrogéis ou as células. Lave as células 1x com 1 mL de meio completo MCDB-131 e, em seguida, adicione 1 mL da bactéria a cada poço.
  10. Cubra o prato com a tampa e embrulhe os pratos com filme plástico de polietileno para evitar vazamentos. Coloque as placas na centrífuga e gire as amostras por 10 min a 200 x g para sincronizar a invasão. Mover as placas para a incubadora de cultura de tecidos e incubá-las durante 30 min a 37 °C.
  11. Lave as amostras 4x com o meio completo MCDB-131 e mova-as para a incubadora de cultura de tecidos. Após mais 30 minutos, substitua o meio por meio suplementado com 20 μg / mL de gentamicina.

4. Citometria de fluxo para quantificar a suscetibilidade dependente da rigidez da matriz extracelular das células hospedeiras à infecção

  1. Pese 5 mg de colagenase e coloque-o em um tubo de centrífuga cônico de 15 mL. Adicione 10 mL de tripsina-EDTA a 0,25% e misture bem.
  2. 8 h após a infecção, remova o meio dos poços da placa de 24 poços e lave os poços 1x com cultura de tecidos PBS. Remova o PBS dos poços e adicione 200 μL da mistura tripsina-EDTA / colagenase a cada poço. Coloque-o na incubadora de cultura de tecidos por 10 minutos para permitir o descolamento total das células.
  3. Use uma pipeta nova para cada poço e pipete a mistura para cima e para baixo 8x. Seja gentil para não danificar as células. Adicione 200 μL de meio completo a cada poço para neutralizar a tripsina.
  4. Transfira a solução celular de 400 μL de cada poço para um tubo de poliestireno de 5 mL com uma tampa de filtro de célula de 35 μm (consulte a Tabela de Materiais).
  5. Analise de 10.000 a 20.000 células por amostra por citometria de fluxo. Realize a aquisição de dados por citometria de fluxo e determine a porcentagem de células infectadas por poço usando o software relevante disponível comercialmente. Use os gráficos de dispersão direta versus dispersão lateral para bloquear a maior parte da distribuição das contagens de células.
    NOTA:: Isso garantirá a análise de células únicas e eliminará detritos ou duplicatas ou trigêmeos de células.
    1. Meça o sinal de fluorescência das células não infectadas de controle e bloqueie a população de células infectadas, excluindo a autofluorescência.

Tabela 1. Composição de hidrogéis de poliacrilamida (PA) de rigidez variável. Nesta tabela, a porcentagem de solução de acrilamida a 40% e a porcentagem de solução de bisacrilamida a 2% para atingir uma determinada rigidez (módulo de Young, E) são indicadas em diferentes colunas.

Módulo de Young (E, kPa)Acrilamida % (de 40% do estoque)Bisacrilamida % (a partir de 2% do estoque)
0,630,045
350,075
10100,075
2080,195
70100,45

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Resultados

figure-results-1
Figura 1: Ensaio de infecção bacteriana de células hospedeiras residentes em hidrogéis finos de poliacrilamida (PA) fluorescentes de duas camadas de rigidez variável.As lamínulas de vidro são quimicamente modificadas para permitir a fixação do hidrogel. 3,6 μL de misturas de PA são depositados no fundo do vidro. A mistura é coberta com uma lamínula de vidro circular ...

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Divulgações

Não há conflitos de interesse declarados.

Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Reagentes
Pellets de hidróxido de sódiopescadorS318-500
(3-aminopropil)trietoxissilanosigmaResposta 3648
25% de gluteraldeídosigmaG6257-100ML
40% de acrilamidasigmaA4058-100ML
Solução de bis-acrilamida (2% p / v)Fisher CientíficoBP1404-250
Microesferas modificadas com carboxilato, 0,1 μm, fluorescentes verde-amareladas (505/515)InvitrogenRolamento F8803
Persulfato de amôniopescadorBP17925
TEMEDsigmaT9281-25ML
Sulfo-SANPAHProteochemaC1111-100MG
Solução de colágeno tipo I de ratosigmaC3867-1VL
Dimetilsulfóxido (DMSO)J.T. Padeiro9224-01
HEPES, ácido livreJ.T. Padeiro4018-04
Meio L-15 de Leibovitz, sem vermelho de fenolThermofischer21083027
MCDB 131 Médio, sem glutaminaTecnologias de vida10372019
Soro Fetal Bovino Foundation, Lote: A37C48AGêmeos Bio-Produto900108 500ml
Fator de Crescimento Epidérmico, EGFsigmaE9644
HidrocortisonasigmaH0888
L-Glutamina 200mMpescadorSH3003401
DPBS 1XpescadorSH30028FS
Sulfato de gentamicinaMP biomédicosRolamento 194530
CloramfenicolsigmaC0378-5G
DifcoTM Ágar, granuladoBdRolamento 214530
BBL TM Infusão cérebro-coraçãoBd211059
Hoechst 33342, tricloridrato, trihidrato - 10 mg/ul solução em águaInvitrogenH3570
Formaldeído 16% grau EMMicroscopia eletrônica15710-S
Anticorpo anti-Listeria monocytogenesAbcamAB35132
Anticorpo secundário anti-coelho IgG (H + L) de cabra, conjugado Alexa Fluor® 546ThermofischerA-11035
0,25% de tripsina-EDTA, vermelho de fenolThermofischer25200056
COLAGENASE DE CLOSTRIDIUM HISTOLÍTICOsigmaC8051
Sulfato de estreptomicinaFisher Científico3810-74-0
sacaroseCalbioquímica8510
Dodecil sulfato de sódioThermofischerRolamento 28364
Pó MESsigmaM3885
KclJ.T. Padeiro3040-05
MgCl2J.T. Padeiro2444-1
EGTAAcrosNº 40991
Equipamento de laboratório descartável
Lamínulas circulares de vidro de 12 mmMarca de pescador12-545-81N.º 1.5 lamínula | Diâmetro do vidro de 10 mm | Sem revestimento
Placas de 24 poços com fundo de vidroMattekP24G-1.5-13-F
Tubos de poliestireno de 5 ml com uma tampa de filtro de células de 35 μmfalcão352235
Balões T-25falcão353118
Tubos cônicos de 50 mlfalcãoRolamento 352070
Tubos cônicos de 15 mlfalcão352196
Pipetas sorológicas descartáveis (1 ml, 2 ml, 5 ml, 10 ml, 25 ml)falcão357551
Pipetas de vidro PasteurVWR14672-380
Ponteiras de pipeta (1-200 μl, 101-1000 μl)DenvillePág. 1122, pág. 1126
Luvas de exame sem póMicroflexXC-310
Cuvetes bactériasSarstedt67.746
LâminasVWRRolamento 55411-050
Agulha de seringaBd305167
0.2um esterilizando garrafasThermo CientíficoRolamento 566-0020
Seringas de 20 mlBdRolamento 302830
Filtros 0.2umThermo CientíficoRolamento 723-2520
varas de madeiraGrainger42181501
RolopackSanta Cruz BiotecnologiasSC-3687
Bactérias de placasfalcão351029
Equipamento de laboratório grande/não descartável
Capuz de cultura de tecidospadeiroSG504
HemacitômetrosigmaZ359629
Incubadora de bactériasThermo CientíficoIGS180
Incubadora de cultura de tecidosNuAireNU-8700
Câmara de vácuo/desgaseificadorBelarteNº 4202537 °C e 5% de CO2
Microscópio de epifluorescência Nikon Diaphot 200 invertidoNikonNIKON-DIAPHOT-200
Incubadora de gaiolaHaisoncostume
Analisador Scanford FACScanStanford e Cytek atualizaram o FACScancostume
Auxiliar de pipetaDrummond4-000-110
Pipetadores (10 μl, 200 μl, 1000ul)GilsonF144802, F123601, F123602
Medidor de pHMettler Toledo30019028
fórcepsFesta11000-12
Frasco de 1 LMarca de pescadorFB5011000
Máquina de autoclaveAmsco3021
Placa magnética de agitaçãoBellco7760-06000
Barras de agitação magnéticasBellco1975-00100
espectrofotômetroBeckmanDU 640
Analisador Scanford FACScanCytek BiociênciasFACScan atualizado personalizado de Stanford e Cytek
software
Software para microscópio (μManager)Imagem aberta
Laboratório de MatemáticaMatlab Inc
FlowjoFlowJo, LLC
Software de análise de imagem automatizada, CellChttps://sites.google.com/site/cellcsoftware/O software está disponível gratuitamente. Arquivos executáveis e códigos-fonte do MATLAB podem ser obtidos em https://sites.google.com/site/cellcsoftware/

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