Todos os procedimentos envolvendo amostras de animais foram revisados e aprovados pelo comitê de revisão ética animal apropriado.
1. Prepare a mistura enzimática 1 e 2 para cada amostra
NOTA: Para volumes superiores a 2 mL, use uma pipeta sorológica de 10 mL; para volumes de 200 μL-2 mL, use uma pipeta de 1000 μL; para volumes de 21-199 μL, use uma pipeta de 200 μL; para volumes de 2-20 μL, use uma pipeta de 20 μL; para volumes abaixo de 2 μL, use uma pipeta de 0-2 μL.
- Para cada amostra, descongelar uma alíquota de cada enzima P e enzima A à temperatura ambiente.
- Para a mistura enzimática 1, combine 50 μL de enzima P e 1900 μL de tampão Z em um tubo C rotulado (Tabela de Materiais).
- Para a mistura enzimática 2, adicione 20 μL de tampão Y à alíquota descongelada de 10 μL da enzima A.
2. Protocolo de dissociação cerebral para adultos
NOTA: Ao trabalhar com samples, os tubos devem ser colocados em um suporte de tubos à temperatura ambiente enquanto o BSA e o D-PBS permanecem no gelo, salvo indicação em contrário.
- Ligue o dissociador.
- Use uma pinça para transferir os pedaços de tecido do hipocampo para o tubo C.
- Transfira 30 μL de mistura enzimática 2 para o tubo C. Gire a tampa até sentir tensão e aperte até ouvir um clique.
- Coloque o tubo C de cabeça para baixo em uma posição do dissociador; a amostra receberá o status Selecionado (Figura 1). Prenda o aquecedor sobre o tubo C.
- Pressione o ícone da pasta, selecione a pasta Favoritos, role e selecione o programa 37C_ABDK_02. Clique em OK para aplicar o programa a todos os tubos C selecionados e, em seguida, toque em Iniciar (Figura 1).
- Rotule um tubo cônico de 50 mL por amostra.
- Coloque um filtro de células de 70 μm em cada tubo cônico de 50 mL e molhe com 2 mL de tampão BSA.
- Após a conclusão do programa, remova o aquecedor e o tubo C do dissociador.
- Adicione 4 mL de tampão BSA à amostra e aplique a mistura no filtro de células no tubo cônico de 50 mL.
- Adicione 10 mL de D-PBS ao tubo C, feche-o e agite a solução suavemente. Aplique-o no filtro de células no tubo cônico de 50 mL.
- Descarte o filtro da célula e o tubo C. Centrifugue a suspensão a 300 x g durante 10 min a 4°C. Em seguida, aspire e descarte o sobrenadante.
3. Remoção de detritos
- Ressuspenda o pellet com 1550 μL de D-PBS frio e transfira a suspensão para um tubo cônico de 15 mL rotulado.
- Adicione 450 μL de solução de remoção de detritos frios e pipete para cima e para baixo (não vórtice).
nota: A Solução de Remoção de Detritos é um reagente no Kit de Dissociação Brian Adulto comercial.
- Cubra suavemente 1 mL de D-PBS frio no topo da suspensão celular, mantendo a ponta contra a parede do tubo cônico. Repita até que a sobreposição total seja de 2 mL.
nota: Esta etapa é crítica; Execute com proficiência e destreza.
- Centrifugue a 3000 x g por 10 min a 4°C com aceleração total e freio total.
nota: Se as fases não estiverem claramente separadas, repita as etapas 7.2 a 7.3. Centrifugue uma última vez a 1000 x g por 10 min a 4 ° C.
- A suspensão deve agora consistir em três camadas distintas (Figura 2). Aspire a camada superior. Varra a ponta da pipeta para frente e para trás para aspirar a camada intermediária branca. Remova o máximo possível da camada intermediária sem perturbar a camada inferior.
nota: Esta etapa é crítica; Execute com proficiência e destreza.
- Adicione 2 mL de D-PBS frio e pipete para cima e para baixo para misturar.
- Centrifugue a 1000 x g por 10 min a 4°C com aceleração total e freio total. Aspire e descarte o sobrenadante. Ressuspenda o pellet em 1 mL de tampão BSA.
NOTA: As células podem ser ressuspensas no tampão apropriado e, em seguida, marcadas magneticamente e isoladas em preparação para o sequenciamento de célula única neste momento.