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1. Pré-tratamento do tecido:
Para lenços de papel frescos congelados:
- Coloque um frasco de vidro Coplin no freezer a -20°C por pelo menos uma hora antes de usar.
- Remova as lâminas do freezer a -80°C e coloque-as no frasco Coplin de vidro no freezer a -20°C por pelo menos 15 minutos.
- Sob a hotte, use um cortador de ampola para abrir a ampola de vidro de paraformaldeído (PFA) a 16%. Descarte o vidro quebrado adequadamente.
- Adicione 10 mL de PFA a 16% e 30 mL de solução salina tamponada com fosfato (PBS) a um frasco plástico Coplin. Certifique-se de que o PBS esteja pré-resfriado a 4°C.
- Transfira esta solução para o frigorífico a 4°C durante pelo menos 15 minutos.
- Após 15 minutos, transfira o frasco de vidro Coplin com as lâminas para a geladeira a 4°C por 10 minutos.
- Transfira as lâminas do frasco de vidro para o frasco plástico Coplin contendo a solução fria de PFA a 4%.
- Fixe as lâminas com 4% de PFA por 30 minutos dentro da geladeira.
- Enxágue as lâminas três vezes em temperatura ambiente PBS por 5 minutos cada, garantindo um enxágue completo entre os ciclos.
Para tecidos FFPE:
- Comece com as seções de tecido de 5 μm fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFPE) montadas nas lâminas de microscópio padrão carregadas positivamente.
- Desparafine as lâminas aquecendo-as a 60°C durante uma hora.
- Remova as lâminas e resfrie-as até a temperatura ambiente por aproximadamente 5 minutos.
- Coloque as lâminas em uma mala direta e enxágue-as em um banho de xileno por 3 minutos, duas vezes.
- Novamente, enxágue as lâminas com etanol 100% por 1 minuto, duas vezes.
- Da mesma forma, enxágue as lâminas em etanol a 95% e 70% por 1 minuto cada.
- Por fim, faça um enxágue final duas vezes em água destilada por 3 minutos.
nota: O Hyperion não pode fazer ablação a menos de 2 mm da borda deslizante, centralizar o tecido o máximo possível.
2. Recuperação de epítopos induzida por calor (HIER)
- Preparar o tampão pH9 do ácido tris-etilenodiaminotetracético (EDTA):
- O tampão Abcam ab93684 Tris-EDTA pH9 HIER é adquirido a 100x e diluído a 1x em água de cromatografia líquida de alto desempenho (HPLC).
- Ex: 2,5 mL Abcam ab93684 em 247,5 mL de água HPLC.
nota: Tampão com mais de seis meses não deve ser usado.
- Configure uma câmara de descamuflagem para aquecer as lâminas. Primeiro, encha o fundo da câmara com 500 mL de água da torneira. Em seguida, adicione 250 mL de água da torneira em ambos os recipientes laterais e 200 mL de água da torneira no recipiente central.
- Coloque até 3 slides em um envelope de 5 lugares.
- Encha o envelope de slides com o tampão HIER até que o tecido esteja completamente submerso. nota: Certifique-se de que o envelope deslizante tenha um pequeno orifício na parte superior para liberar o vapor e evitar a pressurização.
- Execute o "Programa 4" por 20 minutos a 95 °C.
- Enquanto isso, pré-aqueça as câmaras de incubação para as etapas subsequentes (consulte a etapa 3.5)
- Após a incubação, retire o envelope e coloque-o em uma banheira com água fria da torneira.
- Deixe esfriar por 5 minutos.
- Remova metade do tampão da mala direta e substitua-o por água destilada. Deixe esfriar por 5 minutos.
- Remova gradualmente o tampão e aumente o volume de água duas vezes, cada uma com um período de resfriamento de 5 minutos.
- Por fim, enxágue as lâminas em água 100% destilada.
3. Bloqueando a ligação não específica
- Prepare o tampão de bloqueio (solução salina tamponada com Tris ou TBS, Triton X-100 a 0,1%, albumina de soro bovino a 3% ou BSA) adicionando 150uL de TBS com 10% de BSA a 350uL de TBS com Triton X-10.
nota: A TBS com 10% de BSA é armazenada a -20 °C e deve ser descongelada fresca a cada vez.
- Usando uma mala direta de slides ou frascos Coplin, lave as lâminas por 5 minutos em TBS, 0,1% Triton X-100 duas vezes.
- Remova o slide da mala direta e use um lenço Kim para remover qualquer buffer fora do círculo PAP. Deixe ~ 1 minuto secar ligeiramente.
- Usando um P200, adicione algumas gotas do tampão de bloqueio sobre o tecido, apenas o suficiente para cobri-lo. A linha PAP deve manter o líquido sobre o tecido.
nota: Se o tampão não estiver confinado no círculo PAP, redesenhe o círculo PAP ao redor do tecido para evitar a perda de anticorpos posteriormente.
- Incubar a lâmina à temperatura ambiente numa câmara de humidade durante 1 hora.
nota: Uma caixa de ponteira de pipeta vazia funciona bem para uma câmara de umidade. Certifique-se de que uma pequena quantidade de água da torneira esteja presente no fundo.
4. Coloração com anticorpos conjugados com metal
- Remova os anticorpos conjugados com metal de 4 ° C e centrifugue a 10.000 x G por 1 minuto.
- Preparação da diluição ideal da mistura mestre de anticorpos em TBS, Triton X-100 a 0,1% e mistura BSA a 1%
NOTA: a) A diluição ideal de cada anticorpo deve ser determinada experimentalmente e é uma das etapas mais críticas para experimentos bem-sucedidos de citometria de massa por imagem. Use uma planilha do Excel para calcular volumes. Faça apenas um pouco mais do que o necessário devido ao custo do anticorpo. por exemplo, se foram necessários 200 uL de buffer de bloqueio, faça um master mix de 250uL. b) A mistura principal deve ser preparada fresca para cada experimento durante a etapa de bloqueio.
- Após a incubação (consulte a etapa 3.5), remova a lâmina da incubadora.
- Remova o excesso de buffer de bloqueio tocando no slide vertical e horizontalmente nos lenços umedecidos. Isso deve deixar algum tampão de bloqueio no tecido, mas removerá a maior parte dele.
- Deixe ~ 1 minuto secar ligeiramente.
- Coloque o slide na câmara de umidade a 4°C e deixe-o equilibrar.
- Em seguida, pipete cuidadosamente a mistura principal de anticorpos no tecido, extremamente cuidadosa para que a solução esteja contida dentro do círculo PAP.
- Feche a câmara de umidade e incube durante a noite a 4°C.
- Após a incubação durante a noite, remova a lâmina de 4 ° C e remova o excesso de mistura principal batendo na lâmina vertical e horizontalmente nos lenços Kim.
- Coloque a lâmina no envelope ou no frasco de Coplin; lave por 5 minutos com solução salina tamponada com fosfato ou PBS, suplementado com 0,2% de Triton X-100, duas vezes.
- Em seguida, lave a lâmina em PBS por 5 minutos, duas vezes. Remova a lâmina e deixe-a secar por aproximadamente 1 minuto.
5. Intercalação de DNA
- Para intercalação de DNA, diluir o intercalator-Ir 1:1000 em PBS.
- Pipete cuidadosamente o intercalador diluído no tecido, tomando muito cuidado para que a solução fique contida no círculo PAP.
- Incubar durante 30 minutos à temperatura ambiente na câmara de humidade utilizada para o bloqueio.
- Depois disso, toque nos slides vertical e horizontalmente nos lenços umedecidos Kim para remover o excesso de corante Intercalator-Ir.
- Coloque a lâmina na mala direta ou no frasco Coplin e lave duas vezes com água HPLC por 5 minutos cada.
- Seque as lâminas em um dessecador por 5 minutos antes de digitalizar.
6. Digitalização de imagens
- Para digitalização de slides, use um gravador de vidro com ponta de carboneto para riscar quatro Xs fracos no slide. Pontos de ensino precisos permitirão o melhor registro de imagem.
nota: Não chegue muito perto da borda.
- Digitalize usando um scanner de documentos de mesa a pelo menos 1200 pontos por polegada
- Corte esta imagem o mais próximo possível das bordas do slide e salve-a em uma unidade flash.
- Para o co-registro de imagem, digitalize o slide em um Hamamatsu NanoZoomer com "Pre_IMC" no nome do arquivo.