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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Nós desenvolvemos uma técnica para testar interações proteína-proteína na planta. A proteína fluorescente amarela (YFP) é dividido em dois fragmentos não-sobrepostas. Cada fragmento é clonado em-frame de um gene de interesse através do sistema Gateway, permitindo a expressão de proteínas de fusão. Reconstituição do sinal YFP só ocorre quando as proteínas interagem inquérito.
Nós desenvolvemos uma técnica BiFC para testar a interação entre duas proteínas in vivo. Isto é conseguido através da divisão de uma proteína fluorescente amarela (YFP) em dois fragmentos não-sobrepostas. Cada fragmento é clonado em-frame de um gene de interesse. Estas construções podem ser co-Nicotiana benthamiana transformada em via Agrobacterium transformação mediada, permitindo a expressão de trânsito de proteínas de fusão. A reconstituição do sinal YFP só ocorre quando as proteínas interagem inquérito 1-7. Para testar e validar as interações proteína-proteína, BiFC pode ser usado junto com o fermento dois híbridos do ensaio (Y2H). Isto pode detectar interações indiretas que podem ser negligenciados no Y2H. Tecnologia de gateway é uma plataforma universal que permite aos pesquisadores shuttle o gene de interesse (GOI) em como expressão e muitos sistemas de análise funcional como 8,9 possível. Tanto a orientação do quadro de leitura e pode ser mantido sem o uso de enzimas de restrição ou ligadura de fazer-expressão pronto clones. Como resultado, pode-se eliminar todas as etapas de re-seqüenciamento para garantir resultados consistentes ao longo dos experimentos. Nós criamos uma série de vetores gateway compatível BiFC e Y2H que fornecer aos pesquisadores, com um fácil de usar ferramentas para executar ensaios tanto BiFC e Y2H 10. Aqui, demonstramos a facilidade de usar o nosso sistema BiFC para testar interações proteína-proteína em N. plantas benthamiana.
1. Preparação da cultura de Agrobacterium
2. Infiltração
3. Observação do sinal YFP reconstituído
4. Resultados representativos:
Um exemplo de interação proteína-proteína testada por ensaio BiFC é mostrado na Figura 1. AtTHP1 e AtSAC3A Acredita-se que os componentes da Arabidopsis homólogo de levedura TREX-2 complexos. Eles podem interagir com um AtNUP1 nuclearporin e facilitar a exportação de mRNA 10. AtTHP1 e AtSAC3A foram clonados em pEarlyGate201-YC enquanto AtNUP1 foi clonado em pEarlyGate202-SN. Os construtos foram posteriormente transformadas em GV3101. As três construções foram pareados com 3 combinações possíveis (AtTHP1 + AtNUP1; AtTHP1 + AtSAC3A; AtNUP1 + AtSAC3A) para infiltração. O sinal YFP reconstituído foi observado sob uma LCSM 48 horas após a infiltração. Os sinais foram observados nas células epidérmicas e localizadas na periferia nuclear ou plasma nuclear, o que é consistente com a localização sub-celular destas proteínas. Os controles negativos não mostraram qualquer sinal YFP.

Figura 1. Arabidopsis TREX-2 componentes mRNA exportação complexo interagem uns com os outros. N. benthamiana folhas, co-transformada com construções de GOI fundido a pEarleyGate201-YC e pEarleyGate202-SN (como indicado), foram fotografadas 48-72 h após a infiltração, usando um microscópio Leica TCS SP2 confocol. Imagens são mostradas como YFP confocal fundidas e brilhantes de campo imagens da epiderme N. células benthamiana folha
Não há conflitos de interesse declarados.
Nós desenvolvemos uma técnica para testar interações proteína-proteína na planta. A proteína fluorescente amarela (YFP) é dividido em dois fragmentos não-sobrepostas. Cada fragmento é clonado em-frame de um gene de interesse através do sistema Gateway, permitindo a expressão de proteínas de fusão. Reconstituição do sinal YFP só ocorre quando as proteínas interagem inquérito.
Agradecemos Vi Nguyen para a leitura do manuscrito e assistência de laboratório em geral.
| Acetosiringona | Sigma-Aldrich | D134406 | |
| MES hidrato | Sigma-Aldrich | M2933 | |
| 1 mL seringa de tuberculina de ponta deslizante | BD Biosciences | 309602 |