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Artigo de método

O Uso de quimiostatos em Microbial Biologia de Sistemas

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DOI:

10.3791/50168

14 de outubro de 2013

Neste artigo

Resumo

Taxa de crescimento celular é um processo regulado e um dos principais determinantes da fisiologia celular. Cultura contínua usando quimiostatos permite o controle extrínseco da taxa de crescimento celular por limitação de nutrientes facilitar o estudo de redes moleculares que controlam o crescimento celular e como essas redes de evoluir para otimizar o crescimento celular.

Resumo

Células regular sua taxa de crescimento em resposta a sinais do mundo externo. À medida que a célula cresça, diversos processos celulares deve ser coordenado, incluindo a síntese de macromoléculas, o metabolismo e, em última instância, o compromisso com o ciclo de divisão celular. O quimiostato, um método de controlar a taxa de crescimento experimental de células, proporciona um meio poderoso de estudar sistematicamente como os impactos a taxa de crescimento de processos celulares, incluindo a expressão de genes - e metabolismo - e as redes reguladoras que controlam a taxa de crescimento celular. Quando mantido por centenas de gerações quimióstatos podem ser usadas para estudar a evolução adaptativa de micróbios em condições ambientais que limitam o crescimento das células. Descreve-se o princípio de cultivos contínuos, demonstrar seu funcionamento e dar exemplos de suas diversas aplicações. Após um período de desuso após a sua introdução em meados do século XX, a convergência das metodologias genoma escala com uma renovada emteresse na regulação do crescimento celular e as bases moleculares da evolução adaptativa está estimulando um renascimento no uso de quimiostatos na pesquisa biológica.

Introdução

O crescimento das células é regulada por redes complexas de interagir factores genéticos e ambientais 1,2. O regulamento multifatorial do crescimento celular exige uma abordagem em nível de sistema para seu estudo. No entanto, o estudo rigoroso do crescimento celular regulamentada é desafiado pela dificuldade de controlar experimentalmente a velocidade com que as células crescem. Além disso, até mesmo nas experiências mais simples condições extracelulares são freqüentemente dinâmico e complexo como as células alteram continuamente o seu ambiente à medida que proliferam. Uma solução para estes problemas é fornecido pelo quimiostato: um método de cultura de ....

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Protocolo

O princípio da cultura contínua usando um quimiostato pode ser realizado em uma variedade de implementações. Em todos os quimióstatos é essencial ter um) métodos para manter a esterilidade de todos os componentes, 2) uma cultura bem misturada, 3) arejamento adequado do vaso de cultura e 4) um meio confiável de adição e remoção de meios de cultura. Aqui, descrevemos a utilização de um bioreactor de Sixfors (Infors Inc) como um quimiostato utilizando métodos que podem ser prontamente adaptados para configurações alternativas.

1. Montagem das embarcações chemostat

  1. Ligue os Sixfors usando o interruptor principal.
  2. Lave bem....

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Resultados

Uma grande vantagem do quimióstatos é a capacidade de controlar a taxa de crescimento das células experimentalmente ao variar a taxa de diluição. Na brotação levedura, Saccharomyces cerevisiae, a morfologia de uma célula é informativo da fase do ciclo de divisão celular. As populações com taxas de crescimento superiores contêm uma maior proporção de células em divisão activa tal como determinado através da medição da fracção de células não gemuladas (Figura 5A). Análises de expressão do mRNA global em c.......

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Discussão

Quimióstatos permitir o cultivo dos microrganismos em condições de estado estacionário de crescimento controlado. As células crescem continuamente a uma velocidade constante, resultando em um ambiente externo invariante. Isto está em contraste com os métodos de cultura em lotes em que o ambiente externo está em constante mudança e a taxa de crescimento das células é determinado pela interacção complexa de ambiente e genótipo. Assim, uma importante vantagem da cultura de micróbios em quimióstatos mais culturas de lote é .......

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Divulgações

Os autores declaram que não têm interesses financeiros concorrentes.

Agradecimentos

Este trabalho foi apoiado pelo arranque fundos da Universidade de Nova Iorque. Agradecemos Maitreya Dunham e Matt Brauer, que inicialmente desenvolveu o uso de biorreatores Sixfors como quimiostatos.

....

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Infors-HT Sixfors ChemostatRecursos Técnicos Apropriados, Inc. 
Garrafa de Vidro 9.5 LFisher Scientific02-887-1Para Recipiente de Mídia e Mangueira
PinchcockFisher Scientific05-867Para Recipiente de Mídia e Rolha de Mangueira
, Tamanho 12, Neoprene VerdeCole-PalmerEW-62991-42Para Recipiente de Mídia e
Mangueira Conector RetoCole-PalmerEW-30703-02Para Recipiente de Mídia e Mangueira
Geral Laços de propósito 4 inFisher ScientificNC9557052Para Recipiente de Mídia e Tubo de Mangueira
, Borracha de SiliconePeças PequenasB000FMWTDEPara Vaso de Mídia e Tubo de Mangueira
, Silicone, 3/8 in ODFisher Scientific02-587-1QPara Recipiente de Mídia e Tubo de Mangueira
, Silicone, 7/32 in ODFisher Scientific02-587-1EPara Vaso de Mídia e Mangueira
Tubulação, Aço Inoxidável, 3/16 in ODMcMaster-Carr6100K164Para Vaso de Mídia e Tubulação de Mangueira
, Aço Inoxidável, 3/8 in ODMcMaster-Carr6100K161Para Recipiente de Mídia e
Conectores de GanchoFisher Scientific14-66-18QPara Vaso de Mídia e
Braçadeira de CatracaCole-PalmerEW-06403-11Para Vaso de Mídia e Luer de Mangueira
, FêmeaCole-PalmerEW-45512-34Para Vaso de Mídia e Mangueira
Luer, MachoCole-PalmerEW-45513-04Para Vaso de Mídia e Mangueira
Filtro Millipore Aervent MTGR05010 62 mm, 0.2 μ mFisher ScientificMTGR05010Para Vasos de Mídia e Mangueiras
Filtros PTFE Acrodisc CR 13 mm, 0.2 μ mFisher ScientificNC9131037para vaso de mídia e mangueira
Tubo de fluxo de leitura direta para arCole-PalmerEW-32047-77Para configuração de gás nitrogênio
Tubo de fluxo de leitura direta para nitrogênioCole-PalmerEW-32048-63Para configuração de gás nitrogênio
Proporcionador de gás Multitube QuadrosCole-PalmerEW-03218-50Para configuração
de gás nitrogênioRegulador, Airgas analítico de dois estágiosY12-N145D580para configuração de gás nitrogênio
Adaptador de mangueira,AirgasY99-26450configuração de gás nitrogênio
Adaptador machoAirgasWES544para configuração de gás nitrogênio
Norprene TubingUS Plastics57280para instalação de gás nitrogênio
Base de tripéCole-PalmerEW-03218-58Para
Cartuchos de VálvulaCole-PalmerEW-03217-92Para Configuração de Gás Nitrogênio
Carboy 10 LFisher Scientific02-963-2APara Preparação de Mídia
Filtros de Topo de Garrafa de Vácuo Estéril Steritop, 1.000 ml, membrana PES; para tamanho de gargalo de 45 mmFisher ScientificSCGP-T10-REPara Preparação de
Mídia Garrafa de 100 ml, tamanhodo gargalo de 45 mmFisher ScientificFB-800-100Para Preparação de Mídia
cloreto de cálcio· 2H2OFisher ScientificC79-500Reagentes de Mídia
cloreto de sódioFisher ScientificBP358-1Reagentes de Mídia
sulfato de magnésio· 7H2OSigma Aldrich230391Reagentes de
mídia fosfato de potássio monobásicoFisher ScientificAC424205000Media Reagentes
sulfato de amônioFisher ScientificAC423400010Media Reagentes
cloreto de potássioSigma AldrichP9541Reagentes de mídia
ácido bóricoSigma AldrichB6768Reagentes de Mídia
sulfato de cobre· 5H2OSigma Aldrich209198Reagentes de Mídia
iodeto de potássioSigma Aldrich60400Reagentes de Mídia
cloreto férrico· 6H2OReagentes de MídiaFisher ScientificI88-100
sulfato de manganês· H2OSigma Aldrich230391Reagentes de
Mídia molibdato de sódio· 2H2OSigma AldrichM7634Reagentes de Mídia
sulfato de zinco· 7H2OFisher ScientificZ68-500Reagentes de
Mídia biotinaFisher ScientificBP232-1Reagentes de
Mídia pantotenato de cálcioFisher ScientificAC24330-1000Reagentes de Mídia
fólicoSigma AldrichF7876Reagentes de Mídia
inositol (também conhecido como mio-inositol)Fisher ScientificAC12226-1000Reagentes de Mídia
niacina (também conhecido como ácido nicotínico)Sigma AldrichN4126Reagentes de Mídia
ácido p-aminobenzóicoFisher ScientificAC14621-2500Reagentes de Mídia
piridoxina HClSigma AldrichP9755Reagentes de Mídia
riboflavinaSigma AldrichR4500-25GReagentes de Mídia
tiamina HClReagentesMídiaFisher Scientific BP892-100
LeucinaSigma AldrichL8000-100GReagentes de Mídia
UracilSigmaAldrich U0750Reagentes
Mídia DextroseFisher ScientificDF0155-08-5Reagentes de Mídia
de Mangueira de Mangueira de aço inoxidável para mangueira de de Configuração de Gás Nitrogênio ácido de de

Referências

  1. Ingraham, J. L., Maaloe, O., Neidhardt, F. C. Growth of the Bacterial Cell. , Sinauer Associates, Inc. (1983).
  2. Cell Growth: Control of Cell Size. Hall, M. N., Raff, M. C., Thomas, G. , CSHL Press. (2004).
  3. Monod, J. La technique de culture continue, theorie et applications. Ann. Inst. Pasteur. 79, 390-410 (1950).
  4. <....

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Reimpressões e permissões

Etiquetas

Cultivo em QuimiostatoControle da Taxa de CrescimentoAnálise de Expressão GênicaEvolução AdaptativaCitometria de FluxoLimitação de NutrientesCultivo em Estado EstacionárioCálculo da Taxa de DiluiçãoEnsaio de Aptidão Competitiva