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Artigo de método

O mais rápido na Cidade Ocidental: um toque contemporâneo na Análise clássico Western Blot

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DOI:

10.3791/51149

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5 de fevereiro de 2014

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Neste artigo

Resumo

Este protocolo explora os mais recentes avanços na realização de análises de Western blot. Estas novas modificações empregar um sistema de gel de Bis-Tris com uma electroforese em tempo de execução de 35 minutos, uma seco do sistema de transferência de mancha de 7 min, e a detecção da proteína fluorescente no infravermelho e de imagem que gera uma maior resolução, qualidade, sensibilidade, e precisão melhorada de dados ocidentais.

Resumo

As técnicas de Western blot que foram originalmente estabelecidas no final de 1970 ainda estão ativamente utilizado hoje. No entanto, este método tradicional de transferência Western tem vários inconvenientes que incluem a resolução de baixa qualidade, bandas espúrias, diminuição da sensibilidade, e a integridade da proteína pobre. Os avanços recentes têm melhorado drasticamente inúmeros aspectos do protocolo padrão de Western blot para a produção de dados qualitativos e quantitativos mais elevados. O sistema de gel de Bis-Tris, uma alternativa ao sistema convencional de Laemmli, gera uma melhor separação e resolução de proteínas, mantém a integridade da proteína, e diminui a electroforese para um tempo de corrida de 35 min. Além disso, o sistema de mancha seca iBlot, melhora drasticamente a eficácia e velocidade de transferência da proteína para a membrana em 7 min, o que está em contraste com os métodos de transferência de proteína tradicionais que são muitas vezes mais ineficaz com tempos de transferência longas. Em combinação com estas modificações altamente inovadores, proteínas detection usando resultados de imagem fluorescente infravermelhos em maior qualidade, mais precisos e dados consistentes em comparação com a técnica de Western blot padrão de quimiluminescência. Esta tecnologia pode detectar simultaneamente dois antigénios diferentes sobre a mesma membrana, pela utilização de duas cores de corantes de infravermelho próximo, que são visualizadas em diferentes canais fluorescentes. Além disso, a linearidade e ampla gama dinâmica de imagiologia fluorescente permite a quantificação precisa de bandas de proteínas, tanto fortes e fracos. Assim, este protocolo descreve as principais melhorias para o método de Western blot clássico, em que esses avanços aumentar significativamente a qualidade dos dados, reduzindo consideravelmente o tempo do experimento de desempenho.

Introdução

A técnica de Western blot foi desenvolvido pela primeira vez entre 1977 e 1979, a fim de criar um método melhorado para a detecção de proteínas utilizando anticorpos 1-3. Este procedimento utilizado transferência electroforética de proteínas para membranas de géis de SDS-PAGE com proteínas alvo visualizadas utilizando anticorpos secundários e detectados por auto-radiografia, a luz UV, ou um produto de reacção de peroxidase 3. Assim, estes mesmos princípios básicos são ainda largamente utilizados em protocolos actuais de Western blot. No entanto, essa técnica clássica de Western Blot não apresenta muitas desvantagens, tais como tempos lento....

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Protocolo

1. Preparação de lisados ​​de células inteiras a partir de Cultura de Células

  1. Colocar placas de cultura de células em gelo e adiciona-PBS frio, com 5 mM de EDTA (por exemplo, 5 ml de PBS com 5 EDTA/10 mM cm 2 placas). Remover células aderentes do prato usando um raspador de células e, em seguida, transferir a suspensão celular para um tubo de 15 ml frio.
  2. Agregar as suspensões de células por centrifugação a baixa velocidade a 1000 rpm (230 xg) durante 5 min a 4 ° C. Colocar os tubos cónicos em gelo e o sobrenadante cuidadosamente aspirado sem perturbar o sedimento.
  3. Lava-se a pelete com 1 ml de PBS com EDTA 5 mM e tran....

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Resultados

Duas cores de fluorescência no infravermelho detecta bandas tanto fortes e fracos sobre a mesma membrana, com o aumento da sensibilidade e a maior relação sinal-para-ruído para produzir imagens nítidas de Western blot. Os resultados típicos gerados por duas cores detecção de Western blot visualizado em ambos os 700 nm e 800 nm canais fluorescentes são exemplificados nas Figuras 1 e 2. O Western blot superior na Figura 1 mostra o concomitante (overlay) detecção do total .......

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Discussão

Os passos críticos na geração de alta qualidade, transferências de Western quantitativas de acordo com este protocolo, são os seguintes: 1) a medição das concentrações de proteína e 2) a preparação da amostra, 3) o bloqueio da membrana e 4) qualidade e calibre do anticorpo primário.

A precisão da medição das concentrações de proteína total podem ter um impacto importante na quantificação bandas de proteínas uma vez que a sensibilidade excepcional de detecção fluorescente no infravermelho vai.......

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Divulgações

Os autores não têm nada a revelar.

Agradecimentos

Gostaríamos de agradecer a todos os membros do laboratório McMahon por sua assistência e apoio. Esta pesquisa foi apoiada por doações de um R01 CA176839-01 NIH / NCI (a MM) e um Prêmio de Pesquisa Institucional e Acadêmico de Desenvolvimento de Carreira (IRACDA para JS).

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Kit de Ensaio de Proteína BCAThermo Scientific/Pierce23225
4x NuPAGE LDS Sample Buffer Invitrogen/Life TechnologiesNP0007
10x Agente Redutor de Amostras NuPAGE Invitrogen/Life TechnologiesNP0004
20x NuPAGE® MES SDS Running BufferInvitrogen/Life TechnologiesNP0002
20x NuPAGE MOPS SDS Running BufferInvitrogen/Life TechnologiesNP0001
NuPAGE AntioxidantInvitrogen/Life TechnologiesNP0005
NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris Gel 1.5 mm, 10-well Invitrogen/Life TechnologiesNP0335BOX
NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris Gel 1.5 mm, 15 poçosInvitrogen/Life TechnologiesNP0336BOX
SeeBlue Plus2 Prestained Standard Invitrogen/Life TechnologiesLC5925
XCell SureLock Mini-Cell Invitrogen/Life TechnologiesEI0001
, Pilha de transferência de iBlot regular de PVDFInvitrogen/Life TechnologiesIB4010-01
, Mini pilha de transferência de iBlot de PVDFInvitrogen/Life TechnologiesIB4010-02
, Pilha de transferência regular de nitroceluloseInvitrogen/Life TechnologiesIB3010-01
Mini de nitroceluloseIB3010-02da Invitrogen/Life
Technologies Invitrogen/Life TechnologiesIB1001
β-ActinSigmaA2228
Phospho-BIM (S69)BD BiosciencesN/A
Total BIMEpitomics1036-1
Phospho-ERK1/2 (T202/Y204)Tecnologia de Sinalização Celular4370
Total ERK1/2Tecnologia de Sinalização Celular9107
Odyssey Blocking Buffer LI-COR Biosciences927-40000
IRDye 800CW IgG anti-coelho para cabrasLI-COR Biosciences926-32211
IRDye 680LT IgG anti-rato para cabras LI-COR Biosciences926-68020
Caixa de Incubação Ocidental, Média LI-COR Biosciences929-97205
Odyssey Classic Imaging SystemLI-COR BiosciencesN/A
Odyssey Application Software V3.0.30LI-COR BiosciencesN/A
Pilha de transferência de iBlot , Dispositivo de Transferência de Gel iBlot

Referências

  1. Burnette, W. N. Western blotting: electrophoretic transfer of proteins from sodium dodecyl sulfate--polyacrylamide gels to unmodified nitrocellulose and radiographic detection with antibody and radioiodinated protein A. Anal. Biochem. 112, 195-203 (1981).
  2. Renart, J., Reiser, J., Stark, G. R.

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Reimpressões e permissões

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