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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Neural mitose de células progenitoras é um parâmetro crítico da neurogénese. Muito do nosso entendimento da mitose progenitor neural é baseado na análise de tecido fixo. Imagens ao vivo em fatias de cérebro de embriões é uma técnica versátil para avaliar a mitose com resolução temporal e espacial de alta em um ambiente controlado.
Apesar de curta duração, a mitose é um processo multi-passo complexo e dinâmico fundamental para o desenvolvimento de órgãos, incluindo o cérebro. No córtex cerebral em desenvolvimento, a mitose anormal das células progenitoras neurais pode causar defeitos de tamanho e função do cérebro. Portanto, há uma necessidade crítica de ferramentas para compreender os mecanismos da mitose neural progenitor. Desenvolvimento cortical em roedores é um modelo excelente para estudar este processo. Neural mitose progenitor é comumente examinadas em seções cerebrais fixos. Este protocolo irá descrever em detalhe uma abordagem para geração de imagens ao vivo de mitose em ex vivo fatias cerebrais embrionárias. Vamos descrever os passos críticos para este procedimento, que incluem: extração do cérebro, a incorporação do cérebro, vibratome seccionamento de fatias do cérebro, coloração e cultura de fatias e imagem time-lapse. Nós, então, demonstrar e descrever em detalhes como realizar a análise pós-aquisição da mitose. Nós incluímos os resultados representativos from este ensaio utilizando o corante vital Syto11, ratinhos transgénicos (histona H2B-EGFP e Centrin-EGFP), no útero e electroporação (mCherry α-tubulina). Vamos discutir como este processo pode ser melhor otimizado e como ele pode ser modificado para o estudo da regulação genética da mitose. Imagens ao vivo da mitose em fatias de cérebro é uma abordagem flexível para avaliar o impacto da idade, anatomia e perturbação genética em um ambiente controlado, e para gerar uma grande quantidade de dados com alta resolução temporal e espacial. Assim, este protocolo irá complementar as ferramentas existentes para análise de neural mitose progenitor.
O objetivo geral deste protocolo é para descrever como realizar imagens ao vivo de neural mitose progenitor em fatias cerebrais embrionárias. Usando imagens ao vivo de fatias cerebrais em cultura, este protocolo fornece um método simples para analisar vários aspectos da mitose em progenitores neurais em um ambiente muito semelhante a um cenário in vivo. Ele pode ser aplicado aos cérebros de animais e / ou mutantes cérebros que foram manipuladas com eletroporação in utero) 1-5. Esta técnica também é ideal para testar o efeito de agentes farmacológicos na mitose "precursores neurais, por simples adição de um agente para o meio de cultura. Em suma, este artigo fará um protocolo tecnicamente desafiador acessível para aqueles que estudam a neurogênese.
Durante a neurogênese, as populações progenitoras neurais distintas sofrer divisões precisas para gerar neurônios que eventualmente contribuem para as seis camadas corticais do neocórtex adulto 6-8. No início do desenvolvimento cortical, a piscina precursor neural expande como células gliais (NE) divide simetricamente de auto-renovação. Células NE em seguida, converter em células gliais radiais (RGCs). Inicialmente CGR dividir simetricamente para produzir dois novos CGR, no entanto, durante a maior parte da neurogênese, o modo principal 'CGR da divisão é assimétrica. Na divisão assimétrica, um RGC dá origem a um novo e RGC ou um neurónio pós-mitótico, ou um progenitor mais especializado (ou um precursor neural curto (SNP), um glia radial exterior (ORG), ou um intermediário de progenitor (INP) 2,3,7,9. INP, SNPs e orgs pode então gerar neurónios no sub-ventricular, ventricular, e as regiões do córtex basal, respectivamente. Assim, a divisão celular das células progenitoras é um processo fundamental para a geração de neurónios do neocórtex.
Vários estudos apontam para uma correlação entre as características específicas do CGR mitose e o destino das células-filhas. Haydar et al. E Takahashi et al.têm demonstrado que a duração mitótico RGC e aumento do comprimento do ciclo celular como neurogênese receitas, uma descoberta ecoou em acompanhar os estudos 10-13. Um número de estudos têm sugerido que a orientação relativa do fuso mitótico para o ventrículo influencia aspectos da neurogénese e corticogenesis, incluindo os tipos de neurónios gerados e localização de progenitura no cérebro, respectivamente 3,10,14-16. Quer orientação plano de clivagem influencia diretamente o destino da célula é controversa, mas a conclusão é que este mitótico impactos parâmetros neurogênese. Além disso ressaltando a importância da mitose é a observação de que muitos genes envolvidos nos mecanismos da mitose são cruciais para a neurogênese e para o desenvolvimento adequado do cérebro 17-20.
A mitose é um processo dinâmico, no entanto, até o momento a maioria dos estudos que detalham neural mitose progenitor utilizar análise de cortes de tecidos fixos ou de imagem de progenitores neurais através de cultura in vitro de células. Assim, os métodos tradicionais para avaliar a mitose só fornecer um instantâneo desse processo e não conseguem descobrir como as células se comportam em um tecido. Imagens ao vivo de neural mitose progenitor tem se tornado uma ferramenta fundamental para a compreensão da função neural progenitor. Para exemplos veja estas referências 4,8,10,21-25. Vários protocolos pendentes foram publicadas para a preparação e tratamento de imagens de fatias do cérebro 26,27. No entanto até à data, um protocolo detalhado para a imagem e análise de mitose não tem sido descrito, nem demonstrado em vídeo.
Esta técnica oferece várias vantagens significativas sobre análise fixo de seções cerebrais. Análise Time-lapse de fatias do cérebro permite a geração de um número significativamente maior de pontos de dados que podem ser analisados de uma forma flexível. Em primeiro lugar, os dados são recolhidos em pontos de tempo individuais ao longo de vários minutos ou de várias horas. Pode-se analisar pontos de tempo individuais (para criar uma montagem estática) oupode combinar diferentes momentos em filmes. Em segundo lugar, confocal de imagens de fatias permite a geração de dados em diferentes seções Z em fatias de cérebro. Como resultado, as secções individuais pode ser analisado. Em alternativa, as pilhas de secções individuais podem ser combinadas em uma projecção de intensidade máxima. Em terceiro lugar, a análise é feita no contexto de um tecido, revelando como as células se dividem em relação às células e as estruturas vizinhas. Em quarto lugar, é idealmente adequado para a análise de mutantes que mostram alguma evidência de defeitos mitóticas. Juntos, este protocolo vai ajudar a esclarecer as etapas críticas para ajudar os investigadores que pretendam realizar imagens ao vivo de neural mitose progenitor em seus próprios laboratórios.
1. Preparação de Meios (Figura 1, Passo 1)
2. Dissecção do Embriões (Figura 1, Passo 2)
3. Incorporação dos cérebros embrionários (Figura 1, Passo 3)
4. Preparação de agarose bloco (Figura 1, Passo 4)
5. Transferência dos Brains incorporados na Bandeja do Vibratome (Figura 1, Passo 5)
6. Seccionamento dos Brains incorporados (Figura 1, Passo 6)
7. Syto11 coloração das fatias (Figura 1, Passo 7)
8. Montar as fatias em um prato fundo de vidro (Figura 1, as etapas 8, 9)
9. Imaging ao vivo das fatias (Figura 1, as etapas 10, 11)
10. Pós-aquisição Análise da mitose (Figura 2)
Todos os procedimentos desta seção foram otimizados em Fiji (ImageJ), o que é vantajoso, pois é um software livre de código aberto. Outras soluções de software estão disponíveis para executar as mesmas tarefas, como Metamorph, Imaris e Amira.
O sucesso deste ensaio e da observação de várias células mitóticas durante uma sessão de imagens ao vivo depende em grande parte tanto a integridade eo nível anatômico da fatia onde as aquisições são feitas. Como se verá adiante, o nível anatômico de uma fatia é um fator importante. Figura 3A mostra rostro-caudal e locais onde temos sido mais bem sucedido medial-lateral. Para discussão adicional sobre este assunto consulte Noctor 26. A integridade da fatia pode variar em diferentes regiões da fatia. Esta pode ser determinada antes do início do lapso de tempo (usando imagens de toda a fatia como no Passo 7.6). Em uma boa região de um cérebro E13.5 as seguintes observações podem ser feitas: muitas células mitóticas serão encontrados na fronteira ventrículo, os núcleos interfásicos será em forma elíptica em vez de redondo, e núcleos interfásicos aparecerá em relação à fronteira colunar ventrículo . Em uma região menos desejável do cérebro, onúcleos vai olhar arredondado e um pouco desorganizado (Compare Figuras 3B e 3C, e veja a Figura 3D para uma imagem de uma fatia bem montado).
Quando são alcançadas as condições ideais, este ensaio irá permitir a identificação qualitativa dos diferentes fases da mitose. Estes podem ser detectados por meio de análise do padrão de DNA (ver Figura 3E para exemplos de apicalmente a divisão das células em cada fase de mitose). Durante profase, a condensação de DNA terá a aparência de ADN de baixa densidade marcada (regiões de ADN-pobre-rico de ADN e no núcleo). Durante a metáfase, os cromossomos formam um plano no equador do corpo celular. Dependendo da orientação do plano, o padrão de ADN é (i) uma linha de espessura (Figura 3E, ver 1) ou (ii) um "roseta", com uma região de ADN-pobre no meio (Figura 3E, ver 2) . Durante a anáfase, quando os cromossomos se separam, eles se parecem com "mãos"; que migram em sentidos opostos. Esta fase pode ser difícil de identificar quando o plano de clivagem está no X - Y plano de aquisição. Durante a telófase, DNA relaxa e adquire uma forma elipsóide como as reformas envelope nuclear. Pontos de tempo individuais podem ser coletadas para visualizar mitose ao longo do tempo (veja a Figura 3F).
Além de obter imagens de mitose de células progenitoras dividem apicalmente, este ensaio pode ser utilizado para a imagem, tais como células de orgs ou INP basalmente divisão, o último dos quais é mais provável representado na Figura 3G. Tais células são identificáveis pela sua localização para a divisão no SVZ camada. No entanto, para realmente marcar essas células é melhor par a análise com a expressão de um marcador fluorescente que rotula o processo de célula ou o destino (ver Figuras 4B-D). INP terá nem um processo de apicais nem basal, orgs terá um processo basal com o seu corpo celular localizado nas camadas exteriores, e CGRs terá uma baprocesso de sal com o seu corpo celular localizado na camada VZ.
A mitose das células progenitoras pode ser visualizado através de métodos alternativos. Figura 4A demonstra o uso da histona H2B-EGFP ratinho transgénico para rotular cromossomas de todas as células em divisão. Isto marca as células em um padrão semelhante ao Syto11. Figura 4B mostra imagens realizada com cérebro no útero eletroporados com EGFP-α-tubulina e histona H2B-mCherry. Como demonstrado, o que permite uma visualizar ambos os microtúbulos e cromossoma, e, adicionalmente, o corpo da célula e processos basal. Figura 4C mostra imagiologia realizada com cérebro de um rato Centrin-EGFP, no útero electroporadas com mCherry-a-tubulina e a histona H2B-EGFP . Como demonstrado, este permite que se cromossomos e centríolos imagem no canal verde eo corpo do fuso mitótico e celular / processo no canal vermelho. Figura 4D mostra imagens realizadas com o cérebros no útero eletroporados com CMV-Cre esparsamente e CALNL-EGFP 28. Esta técnica permite que se escassamente rótulo progenitores divisão, tornando a análise de células em divisão individuais mais fáceis. Ao utilizar eletroporação no entanto, tenha em mente que este método tem como alvo um grupo bastante sincronizada de células de ciclismo 2,12. Isto significa que o tempo de imagens ao vivo em relação à electroporação necessita de ser ajustada, de modo que o grupo de células electroporadas aproxima mitose no início da sessão de imagem. Se não, o sucesso da experiência na identificação de células mitóticas pode ser comprometida em uma sessão de imagens de curto prazo.
Quando são alcançadas as condições ideais, as características fundamentais da mitose pode ser medido quantitativamente incluindo a duração da mitose em geral, a duração das fases individuais, a rotação do plano da metafase e clivagem orientação do plano. Nas condições descritas, temos observado uma duração mitótico global média de 1h30 min nos dias embrionários (E) 13,5 e 14,5. Como descrito anteriormente, a rotação do plano de ADN metafase pode ser medido num ponto de tempo individual ou cumulativamente ao longo da duração de uma metafase inteiro 2,6,9,10. Isto pode ser conseguido utilizando a reconstrução em 3D do plano da metafase de uma célula em cada ponto de tempo e a medição de ângulos de DNA em relação ao ventrículo. Nós temos aplicado com sucesso o método neste artigo a seguir células por pelo menos 3 horas.

Figura 1. Representação esquemática dos passos no protocolo. Tempo necessário para cada etapa é indicado em cada uma das etapas. Detalhes para cada uma dessas etapas são descritos na seção "protocolo". Por favor, note que o Passo 7 pode ser contornado quando imagiologia fatias de oiembriões pedra H2B-EGFP, ou fatias de cérebros que foram electroporadas com os plasmídeos que expressam os marcadores para a mitose.

Análise pós-aquisição Figura 2. De time-lapse conjuntos de dados de microscopia de vídeo em Fiji (ImageJ). A) Localização das diferentes ferramentas utilizadas para a análise em Fiji. B) diferentes etapas envolvidas na reconstrução 3D de uma célula em metáfase. Detalhes para cada uma dessas etapas são descritos na seção "protocolo". C) Medição de clivagem orientação do plano de reconstrução 3D de células em anáfase. Por favor, note que os números em B Passo 6 e C mostram a seqüência seguida para medir o ângulo. D) Os dados representativos, mostrando a repartiçãon de duração da metafase em um grupo de células mitóticas observada na fronteira ventricular em fatias de cérebro de E13.5 (n = 35). E) Os dados representativos mostram a rotação cumulativa de placas na metafase em células mitóticas E13.5 na fronteira do ventrículo . Clique aqui para ver imagem ampliada.

Figura 3. Exemplos de dados representativos da análise de imagens ao vivo. A) ao longo do eixo dorso-ventral, mitose é mais facilmente trabalhada na região dorsal de fatias do cérebro, porque o processo basal das CGR é mais curta e, assim, menos susceptíveis de ser cortados por vibratome. Ao longo do eixo rostro-caudal, fatias nas regiões caudais do córtex dorsal darresultados mais consistentes em nossas mãos Exemplos. B e C) são mostrados de uma boa região (B) e uma região ruim (C) para a imagem latente. Em uma boa região, os núcleos são de forma elíptica (regiões circulados) e muitas células mitóticas são observados na fronteira do ventrículo antes de lapso de tempo de imagem (setas). Em uma região ruim, muito poucas células mitóticas são observados na fronteira do ventrículo (seta simples) e os núcleos são redondos (regiões circulado) D) Exemplo de uma boa fatia observados com um microscópio de baixa ampliação antes de viver de imagem.. E) Exemplos de Syto11 rotulado células em diferentes fases da mitose, como observado F) Montagem de uma região na fronteira do ventrículo onde dois progenitores neurais percorrer as diferentes fases da mitose, marcada em cores diferentes (tempo, hh:. mm). G) Montagem de uma região em destaque na (B) em que um progenitor neural divide em distância da fronteira ventricular. Em montagens (D) e (E), cells foram pseudo colorido usando o Photoshop para destacar as diferentes fases de mitose. (As barras de escala: B, C, F: 10 mM, D: 1 milímetro, E, G: 5 mm).

Figura 4. Exemplos de instrumentos alternativos para visualizar a mitose de células progenitoras neurais. A) Montagem de uma região na fronteira do ventrículo em uma fatia do cérebro de um embrião transgênico histona H2B-EGFP em E13.5. Um progenitor é observada como ela prossegue através das diferentes fases da mitose. B) Montagem de um VZ em E14.5 na fatia de um cérebro que foi electroporado em E13.5 com vectores que expressam EGFP-a-tubulina e H2B-mCherry. EGFP-a-tubulina permite a visualização da dinâmica dos microtúbulos durante a mitose (B 1-B 2) C) Montagem de uma região ventricular numan E15.5 cérebro de um embrião transgénico Centrin-EGFP que foi electroporado em E14.5 com plasmídeos que expressam mCherry-a-tubulina e H2B-EGFP. Centrin-EGFP permite a visualização de centríolos dinâmica durante a mitose (C 1 e C 2). D) Montagem de uma região mostrando o IZ de uma fatia E14.5 cérebro onde as células foram escassamente rotulada pela eletroporação em E13.5 com um baixo concentração de um plasmídeo de expressão de Cre e uma concentração normal de um plasmídeo expressando EGFP após recombinação Cre 28. A célula dividindo nesta montagem tem a morfologia de um RGosvz com um processo longo basal (setas rosa) e nenhum processo apical 9. O objectivo usado para imagens em tempo real de (A) e (B) é um objectivo exemplos 60X óleo de silicone, óleo de 100X objectivo, por exemplo, (C), e objectiva 10X ar, por exemplo, D. A resolução temporal utilizada para a imagem (A) , (B), (C) e (D) foram exemplos de 4 min, 4 min, 30 seg e 5 min, respectivamente. VZ: Ventricular Zum, IZ: Zona intermediária, RGosvz: zona subventricular exterior radial de células glia-like. (Barras de escala: A: 15 mm, B, C, D: 5 mm, C 1, C 2: 2,5 mm) Clique aqui para ver a imagem ampliada.
Os autores declaram que não têm interesses financeiros concorrentes.
Neural mitose de células progenitoras é um parâmetro crítico da neurogénese. Muito do nosso entendimento da mitose progenitor neural é baseado na análise de tecido fixo. Imagens ao vivo em fatias de cérebro de embriões é uma técnica versátil para avaliar a mitose com resolução temporal e espacial de alta em um ambiente controlado.
Os autores reconhecem o financiamento do NINDS / NIH, R00-NS064197 e NINDS / NIH, R01NS083897 (tanto para DLS).
| 100X N2 | Life technologies | 17502048 | para meio de cultura |
| 50X B27 sem vitamina A | Life technologies | 12587010 | para meio de cultura |
| DMEM/F12 | Life technologies | 11320033 | para meio |
| de cultura Soro de cavalo inativado por calor | Sigma Aldrich | H1138-500ml | para meio |
| de cultura Soro de bezerro inativado por calor | Sigma Aldrich | F4135-500ML | para meio de cultura |
| FGF | R& D Sytems | 3139-FB-025 | para meio de cultura |
| EGF | para meio de cultura | ||
| 10X HBSS | Life technologies | 14065-056 | para a dissecção dos embriões |
| Hepes Free Acid | Sigma Aldrich | H4034 | diluir a 1 M (pH 7,4) |
| 2,5 M D-Glucose | Sigma Aldrich | G8769 | para a dissecção dos embriões |
| 0,9 M NaHCO3 | Life technologies | 25080-094 | para a dissecação dos embriões |
| Agarose de baixo ponto de fusão | Fisher | BP165-25 | para geração de fatias |
| Syto11 | Life technologies | S7573 | Make 5µ l alíquotas |
| 3 mg/ml de colagénio tipo I | Life technologies | A1048301 | para cultura de fatias |
| Prato com fundo de vidro | MatTek | P35G-1.5-14-C | para cultura de fatias |
| Placas | de Petri | para dissecação dos embriões | |
| Termómetro | digital | para medir a temperatura da agarose | |
| Espátula | para transferir cérebros | ||
| Pincel | alternativa para transferir cérebros | ||
| Vibratome | Leica | VT1000s | para gerar fatias |
| de dissecação | de embriões | ||
| Microscópio | de imagem | É necessário um microscópio confocal, que precisa ser equipado com uma câmara de incubação |