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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Nós desenvolvemos uma hipocampo in vitro desdobrada que preserva CA1-CA3 matriz de neurónios. Combinada com a rede de micro-eléctrodo penetrante, actividade neuronal pode ser monitorizada em ambas as orientações longitudinais e transversais. Este método oferece vantagens em relação a preparações de fatias do hipocampo como a propagação em todo o hipocampo podem ser gravados simultaneamente.
Este protocolo descreve um método para a preparação de uma nova preparação de hipocampo in vitro fixa combinada com uma rede de micro-maquinado para mapear a actividade neuronal no hipocampo. A preparação transversal fatia do hipocampo é a preparação do tecido mais comum para estudar hipocampo eletrofisiologia. Uma fatia de hipocampo longitudinal também foi desenvolvido a fim de investigar as ligações longitudinais no hipocampo. Os hipocampo do rato também intactos podem ser mantidas in vitro, porque a sua espessura permite a difusão de oxigénio adequado. No entanto, estas três preparações não fornecem acesso direto a propagação neural já que alguns dos tecidos está ausente ou dobrado. O hipocampo intacto desdobrado fornece tanto transversais e longitudinais conexões em uma configuração plana para acesso direto ao tecido para analisar toda a extensão da propagação do sinal no hipocampo in vitro. A fim de controlar eficazmente a atividade neural de tele camada de células, um feito penetrar rede de micro-eléctrodo (PMEA) foi fabricado e aplicado ao hipocampo desdobrado. O PMEA com 64 eletrodos de 200 mm de altura poderia gravar a atividade neural profundo dentro do hipocampo do rato. A combinação única de uma preparação do hipocampo e desdobrada a PMEA fornece uma nova ferramenta in vitro para estudar a velocidade e direcção de propagação da actividade neural nas regiões bidimensionais CA1-CA3 do hipocampo, com uma alta relação sinal-ruído.
Compreendendo a condução neural ou propagação de sinais neurais é crucial para a determinação do mecanismo da comunicação neuronal, tanto no funcionamento normal e em condições patológicas do cérebro 1-3. O hipocampo é uma das estruturas mais estudadas no cérebro, uma vez que desempenha papel fundamental em diversas funções cerebrais como memória, e rastreamento espacial e está envolvido em várias alterações patológicas que afetam drasticamente o comportamento bem 1,6. Embora, o hipocampo exibe uma organização complexa, os diferentes elementos da sua estrutura pode ser facilmente identificado e consultados na preparação fatia 4-6. No sentido transversal do hipocampo, actividade neuronal é conhecida a propagar através da via de tri-sináptica que compreendem o giro dentado (DG), CA3, CA1 andsubiculum 4,5. Acredita-se que a transmissão sináptica e a condução axonal, desempenham um papel importante para comuniem neste circuito transversal 4,6. No entanto, a propagação do sinal neural ocorre em ambas direções transversal e longitudinal 4,6. Isto implica que o hipocampo não pode ser totalmente investigado usando preparações de fatias que limitam a observação de uma determinada direcção de propagação 4. A fatia longitudinal foi desenvolvido para investigar os caminhos axonal ao longo do eixo longitudinal 5. Pesquisadores observaram gama e teta oscilações específicas de comportamento predominantemente ao longo eixos transversal e longitudinal, respectivamente 6. Esses comportamentos foram estudados separadamente, mas o acesso simultâneo a ambos os sentidos é crucial para entender esses comportamentos. Mesmo com o desenvolvimento da preparação hipocampo intactos, é difícil controlar a propagação ao longo de todo o tecido devido à estrutura dobrada do hipocampo 4. O hipocampo desdobrado dá acesso aos neurônios embaladosem uma forma de uma camada de células de 7,8 bidimensional plana.
Por desdobramento do giro dentado (DG) (Figura 1), o hipocampo adopta um formato achatado com uma configuração rectangular, em que ambos transversais e longitudinais permanecem intactos ligações com a camada de células piramidais dispostos numa chapa bidimensional contendo tanto CA3 e CA1, deixando uma peça plana de tecido neural que pode ser utilizado para investigar a propagação neural (Figura 2) 8. Actividade neural pode ser monitorada com pipetas individuais de vidro, matrizes microeléctrodos, eléctrodos estimulantes, bem como corantes sensíveis à voltagem (VSD) 3,7,8. Além disso, o indicador de tensão geneticamente codificado a partir de ratinhos transgénicos que pode ser usado para controlar o padrão de propagação 9.
A configuração plana da rede do hipocampo desdobrada é bem adequado para a gravação óptica método mas também para uma matriz de microeléctrodos. Most das matrizes disponíveis no mercado são fabricados com eletrodos de perfil plano ou baixo e pode gravar a atividade neural em ambas as fatias de tecido e neurônios cultivados 10-12. No entanto, a relação sinal-para-ruído (SNR) decresce quando os sinais são obtidos a partir de um tecido intacta uma vez que a soma dos neurónios estão localizadas mais profundamente no tecido. Matrizes de eletrodos de microeletrodos com proporções elevadas são necessárias para melhorar o SNR.
Para este efeito, uma matriz de microeléctrodos penetrante (PMEA), foi desenvolvido no nosso laboratório, e proporciona a capacidade para sondar directamente no tecido através da inserção de 64 pontos com um diâmetro de 20 mm e altura de 200 mm no hipocampo desdobradas 7,13 . Esta matriz de microeléctrodos tem SNR superior em comparação com o corante de imagem sensível à voltagem e o SNR permanece estável durante uma experiência 7,13. A combinação da preparação do hipocampo e desdobrada a PMEA proporciona uma nova maneira de investirIGATE a propagação neural ao longo de um plano bidimensional. Experimentos usando esta técnica já produziu resultados significativos sobre os mecanismos de propagação do sinal neural no hipocampo em que a atividade neural pode propagar de forma independente das sinapses sinápticas ou elétricos 7.
NOTA: Animal protocolos experimentais foram revisados e aprovados pelo Comitê de Uso e Cuidado Animal Institucional na universidade. Ratos CD1 de ambos os sexos com a idade de P10 a P20 são usadas neste estudo.
1. Soluções para Cirurgia Experimental e Gravação
2. Procedimento cirúrgico para a Intacta Hippocampus Preparação
Setup 3. Sistema Experimental
4. Colocar o Unfolded Hippocampus para o PMEA para registrar a atividade Neural
5. Retirar oTecido da PMEA Após uma experiência
Os dados mostrados nas figuras aqui foram registados na preparação hipocampo desdobrado com 4-AP (100 uM) aCSF adicionado durante a incubação do tecido na câmara de gravação à TA (25 ° C). Normalmente atividade começa dentro de 5 min, mas em alguns tecidos do hipocampo dos animais mais velhos pode demorar mais tempo. O disparo neuronal induzida por AP-4 observado com o PMEA é o mesmo que anteriormente relatado 14,15. Uma vez que os eléctrodos têm uma altura de 200 mm, as pontas dos eléctrodos estão localizados logo abaixo da camada de células (Figura 3C) porque a camada de células é geralmente 250 a 300 mm acima do alveus do hipocampo (Figura 2), as gravações (57 de 64 no exemplo de experimento) de diferentes canais têm uma deflexão em sua maioria positivas. No entanto, algumas dessas gravações positivos poderia exibir pequenos desvios negativos, bem como (Figura 5B), se as pontas de eletrodos de gravação estão perto o suficiente para a camada de células.Se as dicas de eléctrodos estão localizados ao nível da camada de células, a gravação terá spiking negativo muito afiada com mudança positiva sobre ele ou apenas spiking negativo (Figura 5C) 16. Na amostra de dados mostrado aqui, 5 canais de 57 gravações têm spiking negativo. Após a aquisição dos dados de todos os 64 canais, o método de normalização individual (Figura 6B) é aplicada para mapear a propagação neural num plano 2-D ao longo do eixo do tempo da gravação 7. Com uma combinação de a PMEA e o hipocampo desdobrado, propagação neural é mapeado para iniciar e observado principalmente em um lado da CA3 e deslocar-se longitudinalmente em uma frente de onda em diagonal, atravessando toda a área do hipocampo (Figura 6).

Figura 1. O procedimento cirúrgico para um hipocampo desdobrado . (A) Um dos dois hipocampos é dissecado a partir do lobo temporal de cérebro de rato. (B) do septo e terminações temporais ao longo do eixo longitudinal. (C) O hipocampo é virada ao contrário, com uma pipeta de vidro polido ao fogo expor o sulco. Ambas as extremidades do hipocampo são aparados e uma agulha de vidro é usada para cortar as conexões entre a DG e CA1 ou subiculum ao longo do eixo longitudinal. (D) O hipocampo é desdobrada por uma alça de fio de metal feito por encomenda. (E) hipocampo Unfolded com subiculum e DG aparada. (F) A preparação final do tecido de um hipocampo desdobrado. Esta posição mostra a orientação do hipocampo quando ela é colocada sobre a matriz em uma experiência. Para detalhes adicionais sobre a anatomia hipocampo desdobrado consulte métodos experimentais em manuscritos publicados anteriormente 7."target =" _ g1large.jpg blank "> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2. Corte histológico do hipocampo desdobrado. Mancha de cristal-violeta mostra a posição da camada de células piramidais de CA1-CA3 do hipocampo desdobradas dentro de um nível de 250 a 300 mm acima do alveus localizando assim os microeléctrodos logo abaixo da camada de células (consulte a Figura 3C). Para obter as secções coradas com violeta de cristal a, o tecido foi pós-fixada após o hipocampo foi desdobrado. O hipocampo foi colocado desdobrado em PFA a 4% O / N. Em seguida, o tecido foi transferido e mantidas em solução de sacarose (30%) durante 48 horas, e seguido por snap-congelação de motociclista contendo isopentano (2-metilbutano) para arrefecer a -35 ° C em gelo seco. Congelação foram então cortados em criostato com20 mm de espessura no plano transversal (como mostrado na Figura 2) para revelar a localização da camada de células piramidais. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3. unfolded no hipocampo a PMEA. (A) Vista de cima de um novo PMEA com os microeletrodos localizados no final de cada traço de metal ouro. A inserção no lado direito mostra uma única microeléctrodo sob microscopia de electrões com uma altura de 200 mm e um diâmetro de 20 mm 7,13. (B) A matriz de microeléctrodos está colado sobre um pacote de PGA, com uma câmara de registo de plástico em torno dos microeléctrodos sobre um substrato de vidro. A inserção da direita mostra um hipocampo desdobrado colocado no arr microeletrodosay no meio. (C) À esquerda, Tomografia de Coerência Óptica (OCT) imagem mostra o tecido desdobrado posicionado no topo da matriz em uma experiência diferente. À direita, duas imagens de corte longitudinais obtidos a partir da imagem de outubro à esquerda mostra as dicas de microeletrodos (pontos brancos apontado pelas setas) chegar para a área logo abaixo da camada de corpo celular. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura .

Figura 4. configuração Experimental. (A) A tampa de cobertura de plástico com parafusos é colocada sobre os circuitos para protegê-lo contra possíveis danos causados pela água. A câmara de gravação tem tanto de entrada e saída de tubos para transportar o fluxo de solução. Uma âncora de tecido feito à medida coladas com uma malha de fibra de nylon é usado para proteger o TISSue durante os experimentos. (B) Imagem tirada da parte inferior do substrato de vidro da PMEA que mostra a âncora segurando uma fatia de tecido da amostra durante uma experiência. Os arames curvos são as fibras de nylon da malha pressionando na parte superior do tecido. Os pontos redondos são as bases de microeletrodos. As setas indicam a eletrodos que foram danificados após várias experiências. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5. Os dados brutos registrados pela PMEA de um hipocampo se desenrolava. Painel esquerdo: 4-AP-induzida actividade epileptiforme gravado a partir de um único painel de microeléctrodos direita:.-Zunidas na versão do sinal marcado na janela de tempo do lado esquerdo. 10 seg secção de um exemplo da actividade espontânea em (A)produzida por 100 | iM de AP-4 ACSF obtido para um dos microeléctrodos localizados na região basal dendrítica com base na polaridade dos sinais com um SNR de 34,9 dB. (B) Os dados em bruto a partir de um outro microeléctrodo localizada mais próxima do somata com um SNR de 27,2 dB. (C) Exemplo de gravação obtido a partir de um eléctrodo posicionado no interior da camada somática. Neste exemplo, o SNR é 18,53 dB (D) de gravação. Obtidas a partir de um eléctrodo de realização ainda curvado mas não penetra no tecido. O eléctrodo dobrado tem uma significativa SNR mais baixo em comparação com os eléctrodos de 1,5 dB intactos (neste exemplo). (E) o ruído de linha de base gravada a partir de um microeléctrodo. A linha de base geralmente tem um valor pico a pico 150-200 mV e a impedância de um único eletrodo é de cerca de 1 a 2 mohms. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6. A conversão de dados de gravação neurais no mapas propagação 2-D. (A) A janela de tempo ms 170 trunca um único spiking neural em cada canal plotados na fotografia do PMEA. Os dados brutos é filtrado por um filtro passa-baixa a 100 Hz. Os sinais provenientes dos eléctrodos quebradas são interpolados com as gravações em torno dele. Neste exemplo, todos os pontos são positivos. (B) Um único ponto neural a partir do pixel vermelho (A) é normalizado para a barra de cores com um método desenvolvido sob medida para a normalização individual (Por favor, consulte a publicação anterior para obter mais detalhes sobre a normalização 7). (C) Os mapas de cor criados pela normalização indivíduo mostram que se move de propagação ao longo de toda a área do hipocampo desdobrada em diferentes pontos de tempo."target =" _ www.jove.com/files/ftp_upload/52601/52601fig6large.jpg blank "> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada a divulgar.
Nós desenvolvemos uma hipocampo in vitro desdobrada que preserva CA1-CA3 matriz de neurónios. Combinada com a rede de micro-eléctrodo penetrante, actividade neuronal pode ser monitorizada em ambas as orientações longitudinais e transversais. Este método oferece vantagens em relação a preparações de fatias do hipocampo como a propagação em todo o hipocampo podem ser gravados simultaneamente.
Este trabalho foi apoiado pelo National Institutes of Health (National Institute of Neurological Disorders and Stroke) Grant 1R01NS060757-01 e pela cadeira dotada de E.L. Lindseth para Dominique M. Durand. Agradecemos ao laboratório do Dr. Andrew M. Rollins pela ajuda na imagem da OCT.
| frasco dessecador | LABRECYCLERS Inc. | 5410 | Coloque toalhas de papel comuns no fundo do frasco para uso em anestesia animal. |
| Uma lâmina e um estágio cirúrgico feito pela Custome para desdobrar o hipocampo | N/ | A N/A | Uma placa de Petri é colocada de cabeça para baixo (no centro) no gelo com um papel de filtro úmido colocado em cima dela. |
| Câmara de recuperação de tecidos feita sob medida | N/A | N/A | Os tubos de plástico foram colados com malha plástica na parte inferior e borbulharam com 95% de O2/5% de CO2 no aCSF. |
| Operação Reta Tesoura | Fisher Scientific | S17336B Medco Instruments No.:81995 | Esta tesoura é usada para decapitar os ratos. |
| Integra Miltex Goldman-Fox Tesoura | Fisher Scientific | 12-460-517 MILTEX INC No.:5-SC-320 | Esta tesoura é usada para cortar o crânio dos ratos. |
| Fórceps de Histerectomia Miltex | Claflin Equipamento médico | CESS-722033-00001 | Este fórceps é usado para descascar o crânio cortado para expor o cérebro |
| Micro Espátula | Cardinal Health | Esta micro espátula é usada para transferir todo o cérebro de uma semiesfera para a câmara de reperfuração. | |
| Espátula Semi-Micro de Aço Inoxidável Frey Scientific | Cardinal Health | Esta espátula semi micro é usada para transferir o hipocampo desdobrado para a glicose aCSF na câmara de recuperação. | |
| pincel pequeno | Lowe's | tem #: 105657 Modelo #: 90219 | Aquele com o menor tamanho em um pacote de pincel normal |
| Ferramenta de ajuda de vidro polido a fogo | N / A | N / A | Esta ferramenta foi polida a fogo e feita a partir das pipetas de vidro Pasteur regulares. |
| Agulha de vidro feita sob medida | N/A | N/A | Esta ferramenta foi polida a fogo e feita a partir das pipetas de vidro Pasteur regulares. |
| Ferramenta de vidro feita sob medida com um laço de fio de metal | N/A | N/A | Esta ferramenta foi polida a fogo e feita a partir das pipetas de vidro Pasteur regulares com um laço de fio de metal remodelado. |
| Conta-gotas de solução de vidro feito sob medida | N/A | N/A | Esta ferramenta foi feita a partir das pipetas de vidro Pasteur regulares com suas pontas cortadas e uma cabeça de borracha anexada com a extremidade cortada. |
| Âncora de tecido personalizada | N / A | N / A | A Malha de fibra de nylon foi colada em um anel de fio de cobre isolado. A âncora de tecido foi segurada por um micromanipulador. |
| Matriz de microeletrodos fabricada sob medida | N/A | N/A | Mais detalhes sobre a matriz, consulte Kibler, et al, 2011. |
| Circuitos de filtro e amplificadores feitos sob medida para a matriz | N/A | N/A | Mais detalhes sobre a matriz, consulte Kibler, et al, 2011. |
| Processador de aquisição de dados 3400a | Microstar Laboratories | N/A | Este é um sistema completo de aquisição de dados com conversor A/D. |