Aqui, apresentamos um método, cocem3D, para desvendar a ultraestrutura de uma célula específica em seu tecido nativo por meio da microscopia eletrônica de varredura de face de bloco confocal e serial.
Artigo de método
Aqui, apresentamos um método, cocem3D, para desvendar a ultraestrutura de uma célula específica em seu tecido nativo por meio da microscopia eletrônica de varredura de face de bloco confocal e serial.
Delineação de ultra-estrutura de uma célula é importante para compreender a sua função. Isto pode ser difícil para um projecto de tipos de células raras difundidos em tecidos feitos de diversos tipos de células, tais como células enteroendócrinas do epitélio intestinal. Estes sensores gastrointestinais de alimentos e bactérias têm sido difíceis de estudar porque a dispersão por outras células epiteliais, na proporção de 1: 1000. Recentemente, os ratinhos transgénicos repórter foram gerados para identificar células enteroendócrinas por meio de fluorescência. Uma delas é o peptídeo YY-GFP mouse. Usando este rato, foi desenvolvido um método para correlacionar e microscopia confocal de série bloco-face eletrônica de varredura. Nós chamado o método cocem3D e aplicou-o para identificar uma célula enteroend�rina específico no tecido e desvendar ultra-estrutura das células em 3D. A resolução de cocem3D é suficiente para identificar os organelos tão pequeno como vesículas secretoras e para distinguir as membranas celulares para o volume de rendering. Cocem3D pode ser facilmente adaptado para estudar a ultraestrutura 3D de outros tipos de células específicas no tecido nativo.
A vida dentro de uma célula tem lugar no tempo e no espaço. Mudanças ao longo do tempo são frequentemente estudadas usando microscopia de lapso de tempo combinado com técnicas de imagem de fluorescência, como a microscopia de super-resolução. Espacial, em particular, o arranjo de organelas no interior de uma célula ou interacções célula-para-célula, só pode ser obtido por um relato completo da estrutura fina da célula. Um relato abrangente da estrutura fina de uma célula pode também trazer clareza de função genómica nos casos em que o genoma está disponível, como o C. elegans nematóide 1 ou o tricoplax Placozoa plana adherens 2. Microscopia eletrônica de cortes seriados é agora um reprodutível, tempo eficiente, e de tarefas graças menos dispendioso para o desenvolvimento de tecnologias automatizadas de microscopia eletrônica 3D, como bloco de série-face microscopia eletrônica de varredura 3 (SBEM).
A necessidade de informações estruturais para elucidar a função é muito evidente em certos cell tipos em que a função depende de interações físicas célula-célula, como neurônios, glia, ou células epiteliais sensoriais. Estamos particularmente interessados em elucidar como sinais sensoriais de nutrientes no lúmen do intestino são traduzidas em um sinal elétrico que, em última análise modula comportamentos apetitivas. O circuito é complexa, mas começa na parede do intestino, onde os nutrientes entrar em contacto com as células epiteliais sensoriais, chamadas células enteroendócrinas. Ao contrário de outras células epiteliais sensoriais, tais como células de sabor, enteroendócrinas células estão dispersas por todo o epitélio intestinal numa razão de um a mil 4-7. Conseqüentemente, eles têm sido difíceis de identificar e estudar, e por muito tempo eles eram vistos apenas como uma fonte de hormônios intestinais. Mas, com o desenvolvimento de ratinhos fluorescência repórter específicos de células, a função sensorial complexo destas células está a emergir. Usando um desses ratos repórter, um YY-GFP (PyyGFP) do mouse peptídeo, descobrimos que enteroendocrine células têm um proeminente cauda citoplasmática que nós nomeamos neuropod. O aparecimento de neuropods sugeriu uma função conservada na comunicação célula-a-célula. Assim, nós concluímos que ao documentar a ultra-estrutura de uma célula enteroend�rina, a função de neuropods podia ser derivado.
A necessidade de compreender a estrutura de um apêndice numa célula dispersa que é difícil de identificar era a principal razão para o desenvolvimento de um método para combinar microscopia confocal e SBEM. A célula de interesse foi identificada usando PyyGFP enteroend�rina ratinhos repórter específicos de células. O método permitiu-nos para documentar toda a ultra-estrutura de uma célula enteroend�rina e sua neuropod. Dentro neuropods, encontramos características estruturais dos axónios neuronais, e fora neuropods, encontramos uma relação física com glia entérico 8. Com efeito, neuropods conter cerca de 70% de todas as vesículas secretoras que sugerem um papel fundamental na função de secreção dessas células. Com base nadados estruturais, mais recentemente, verificou-se que através destas neuropods, células enteroendócrinas e neurónios que enervam o intestino formar um circuito neuroepitelial, semelhante ao de células gustativas na língua 8,9.
Descobrindo tais características dos mecanismos de quimio gastrointestinais provindos de dados estruturais reunidos usando este método de microscopia correlativo. Acreditamos que este método pode ser útil em outras áreas da biologia das células, em particular em que as células estão dispersas dentro dos tecidos a uma razão muito baixa. Nós que se refere ao método confocal como correlativo e microscopia de série rosto bloco eletrônico de varredura em 3D (Cocem3D). O método é composto das seguintes etapas principais: dissecção dos tecidos, microscopia confocal, imagens SBEM, SBEM e correlação imagem confocal, e segmentação manual. Em comparação com outros métodos de correlação, o conceito é simples, porque a correlação é física em vez de química.
Todos os cuidados com os animais e experimentos foram feitos em conformidade com um protocolo aprovado pelo Comitê Animal Care Institucional e Uso da Universidade Duke.
Cocem3D resultou de uma combinação dos protocolos previamente publicados 10,11 e foi aplicado aqui a estudar numa célula enteroend�rina específica utilizando um repórter rato PyyGFP 12. Este método pode ser facilmente aplicada a outras células de interesse utilizando ratinhos transgénicos repórter disponíveis comercialmente. O método é descrito em três seções: microscopia confocal Correlative, bloco-face de microscopia eletrônica de varredura de série (SBEM), e dados de renderização em 3D.
Correlativo microscopia confocal
O objetivo desta seção é para colher um segmento de tecido do cólon distal de dimensões que permitem confocal correlativa e SBEM imagem. O protocolo é como se segue:
1. Colheita de Tecidos
2. Fixação de dissecação e segmentos de tecido
3. Blocos dissecando-tissue micro
4. Imagem Confocal
5. Incorporação de Blocks em Agarose
Serial Block-cara Microscopia Eletrônica de Varredura (SBEM)
Nesta seção, o bloco de tecido é preparado e fotografada com SBEM em baixa ampliação. A imagem levantamento da face do bloco é então correlacionado com os dados confocal para identificar a região contendo a célula de interesse. Uma vez que a regiãoé identificado, o tecido é fotografada em uma resolução de 7 nm / pixel e fatias de 70 nm. Isso foi suficiente para resolver e distinguir vesículas secretoras centrais grandes densa de outras organelas. Em células enteroendócrinas, este tipo de vesículas varia entre 100 e 150 nm de diâmetro 13. O protocolo é como se segue:
6. As secções de tecido de coloração
7. infiltrando e incorporação de cortes de tecido em Resina
8. Montagem e aparar o bloco de tecido for Imaging
9. SBEM
10. Otimização SBEM Imagens para a superfície Segmentação
Renderização de dados em 3D
11. Microscopia Confocal
12. Serial SEM Bloco-face
Nota: segmentação de dados manual é um processo muito demorado e, dependendo dos recursos a serem prestados, o procedimento pode levar várias semanas. Segmentação para os vídeos e números apresentados em Bohórquez et al 2014 8. Era feito manualmente e levou cerca de 500 horas de trabalho. Recomenda-se a priorizar as características essenciais que necessitam de renderização antes de iniciar o processo de segmentação. O procedimento é o seguinte:
O método aqui descrito foi usado para estudar a ultraestrutura de uma célula específica dentro de uma camada de epitélio. A célula de interesse, neste caso, é a célula enteroend�rina elusiva. A sua identificação in situ foi possível apenas nos últimos anos com o desenvolvimento de ratinhos fluorescência repórter específicos de células. Em 2011, foi desenvolvido um rato em que o promotor do hormônio PYY dirige a expressão da proteína verde fluorescente 17. Neste PyyGFP rato, células enteroendócrinas da parte distal do intestino delgado e cólon são facilmente distinguidos sob luz UV. Este modelo do rato foi uma base para identificar um bloco de tecido contendo uma célula enteroend�rina e processá-lo para SBEM. O método de correlação é referido aqui como cocem3D e foi construído em protocolos previamente publicados 10,11.
Optimizar as dimensões do bloco de tecido é crítica para a correlação. Em experiências preliminares,determinou-se que num bloco de tecido 300 um de comprimento x 50 mm de espessura o número de imagens SBEM é reduzida a um mínimo, enquanto que cobre todo o corpo da célula de interesse. A Figura 1A mostra uma vista do dissecção usando uma lâmina vibrante para microtrome obter o bloco de tecido com as dimensões corretas. Pelo menos 100 blocos são obtidos antes de classificar através deles para escolher aqueles com células intactas de interesse. Blocos selecionados são visualizados por microscopia confocal e de imagem z-stacks são espaçados opticamente cada 1 mm (Figura 1B e C). A Figura 1D mostra um volume vista renderizada de uma célula enteroend�rina no íleo do rato. A sua neuropod proeminente se estende por baixo de células epiteliais para ~ 60 mm.
A célula de interesse é encontrada ao correlacionar os confocal z-stacks uma imagem SBEM de toda a face do bloco com. Um exemplo é apresentado aqui de um bloco a partir do cólon distal de um PyyGFPrato. Após a obtenção confocal z pilhas (Figura 2A), o bloco é incorporado em uma fina camada de agarose de baixo ponto de fusão (Figura 2B). Isto é necessário para subsequente manipulação do bloco. É importante para manter a orientação do bloco tão plano quanto possível combinar as fatias ópticos com as fatias SBEM. Na Figura 2C, uma imagem representativa é mostrada de toda a face do bloco de tecido. Partes desta figura foram anteriormente publicados em Bohorquez et al., 2014 8. Este foi posteriormente correlacionado com a imagem confocal, tendo em conta os pontos de referência do tecido e às dimensões. A Figura 2D mostra uma sobreposição da imagem SBEM confocal e do bloco, revelando o localização precisa da nossa célula de interesse.
Uma vez que a célula tenha sido identificado, a imagem latente SBEM é feito com uma resolução suficientemente alta para identificar vesículas secretoras e outros organelos celulares. O conjunto de dados apresentados,re foi fotografada em 7 nm por pixel como imagens do bloco foram tomadas todas as 70 nm. O conjunto de dados contidos imagens 643 que se estendem por 45 um de profundidade do tecido. A poucos microns são raspadas durante o exame inicial de toda a face do bloco a baixa ampliação. O conjunto de dados SBEM-prima foi adquirido em formato .dm3 e transformado para .tiff para o tratamento subsequente. A pilha SBEM foi cortada usando o software Fiji plugin "safra (3D)" bloco de forma a conter apenas a região de interesse. Isto reduz a quantidade de memória RAM necessária para renderização de volume. A célula foi identificado pela sua posição e vesículas secretoras, e segmentado utilizando software Imaris. A Figura 3 contém uma representação em 3D da célula enteroend�rina.

Figura 1:. Microscopia confocal Correlative (A) Fluxo de trabalho de dissecar um pedaço detecido intestinal para bloquear um tecido de 300 x 50 mm de espessura. (B) Um bloco de as dimensões corretas tecido representativo. Note-se que um bloco de tecido destas dimensões do intestino delgado do rato mede cerca de 3 vilosidades ou, no caso do cólon cerca de 8 criptas. (C) Uma das vilosidades do intestino delgado, contendo uma célula de interesse. (D) A confocal z-stack rendido em 3D usando software Imaris mostra uma célula enteroend�rina com um neuropod proeminente corrida sob o epitélio intestinal. Azul = DAPI mancha nuclear. Barras = 10 mm. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: microscopia Serial bloco-face eletrônica de varredura (A) imagem confocal de uma sele.bloco de tecido CTED a partir do cólon contendo células PyyGFP enteroend�rina (verde) de interesse. (B) Uma vez que o bloco é fotografada por microscopia confocal, é então incorporado apartamento em baixo ponto de fusão agarose usando lâminas de vidro. Incorporando o bloco de tecido em agarose facilita a manipulação subseqüente, eo entalhe no canto esquerdo ajuda a montar o bloco dentro da SBEM na orientação correta. (C) SBEM imagem da face do bloco. (D) A correlação de dados confocal com SBEM para identificar células de interesse (seta branca). São modificados Imagens em c e d desta figura de Bohorquez et al., 2014 8. Azul = DAPI mancha nuclear. Barras = 10 mm. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3:. Renderização de dados em 3D (A) a prestação Volume de célula enteroend�rina usando software Imaris. A célula contém um neuropod embalado com vesículas secretoras. Para uma descrição completa da ultra-estrutura de uma célula enteroend�rina, consulte Bohórquez et al., 2014 8. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Chemosensation gastrointestinal está a emergir como um novo campo emocionante na pesquisa biomédica. Isto é, em grande parte devido à descoberta de receptores gustativos funcionais em células enteroendócrinas 18. Estudos subsequentes têm mostrado que as células enteroendócrinas expressam receptores específicos para nutrientes, incluindo hidratos de carbono, lípidos, aminoácidos e 5,6,19,20. O factor catalítica para estas descobertas tem sido o desenvolvimento de ratinhos repórter, em que as células são enteroendócrinas marcado por fluorescência 20. Desenvolvemos um destes ratinhos, o rato PyyGFP, para estudar enteroendócrinas células do intestino delgado e cólon distai 17,21. Estas células são de interesse porque eles segregam PYY e glucagon-like peptide 1, ambos os quais são indutores da saciedade 22,23. Na época, uma conta de ultra-estrutural completa destas células era ausente, que acreditava que era essencial para compreender os seus mecanismos de sinalização.
ontent "> Aqui, descrevemos um visualmente um método para colmatar microscopia confocal com SBEM. O método é conhecido como Cocem3D, o que nos permitiu documentar a ultra-estrutura completa das células enteroendócrinas. Temos informou que estas células têm uma neuropod que contém três quartos de todas as vesículas secretoras 8. Dentro do neuropod, há neurofilaments e muito parecido com axônios neuronais, neuropods são alimentados por células gliais entéricas 8. Mais importante, é que estes neuropods que enteroendócrinas células conectar fisicamente aos neurônios que inervam o intestino e 9 cólon.Um dos pontos fortes do cocem3D é a sua simplicidade. A redução da amostra de tecido em um bloco que pode ser trabalhada por SBEM confocal e facilita a identificação de uma célula específica dentro de um tecido. Vesículas secretoras e outras organelas pode ser identificado com facilidade em uma resolução de 7 nm / pixel. Porque as seções em SBEM são descartados, outros procescantar de tecidos para identificar proteínas específicas não é uma opção neste momento. No entanto, o desenvolvimento de métodos, tais como ATUM 24, em que secções de tecido do bloco são preservados, são susceptíveis de permitir a identificação de proteínas específicas na célula. Determinação do local específico de receptores quimiossensoriais em células enteroendócrinas é informação essencial para o desenvolvimento de terapias com drogas para obesidade, porque as células enteroendócrinas são uma interface entre sensorial alimentos no intestino e saciedade no cérebro.
Dr. Satish Medicetty é um empregado de e recebe 100% do salário Renovo Neural Inc; no entanto, isso não altera a adesão do autor de políticas JoVE sobre a partilha de dados e materiais. Não há conflito de interesse é declarada para autores restantes.
Nosso sincero agradecimento é expresso às seguintes pessoas: Drs. Sam Johnson e Benjamin Carlson do Duke Light Microscopy Core Facility por sua assistência com software de visualização de dados, e Sra. Valerie Lapham e Dr. John M. Mackenzie, Jr. do Centro de Microscopia Eletrônica da Universidade Estadual da Carolina do Norte por seus conselhos sobre microscopia eletrônica. Agradecemos à Dra. Elaine B. Bohórquez por sua assistência editorial. Os autores contribuíram da seguinte maneira: DVB, SM e RAL projetaram experimentos e analisaram os dados. O DVB realizou experimentos e a FH realizou a renderização manual dos dados. SM é diretor da Renovo Neural, onde os dados do SBEM foram adquiridos. DVB escreveu o manuscrito e todos os autores revisaram e editaram o manuscrito final. Este trabalho foi apoiado por R01DK091946 de subsídios do NIH e I01BX002230 de subsídios de Assuntos de Veteranos para RAL e, F32DK094704, para DVB.
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Solução salina tamponada com fosfato | Life technologies | 10010023 | |
| Heparina sal de sódio | Sigma | H4784 | |
| Paraformaldeído | Sigma | 158127 | 4%, recém-feito em PBS, pH final 7.4 |
| Glutaraldeído | Sigma | G5882 | |
| Cera dental | Microscopia eletrônica Sciences | 72660 | |
| Agarose de baixo ponto de fusão | Life technologies | 16520-100 | 5%, recém-feito em PBS |
| Standard Tissue-Tek Cryomold | Electron Microscopy Sciences | 62534-25 | |
| DAPI mancha nuclear | Life technologies | D1306 | |
| Lâminas e lamínulas | |||
| Pincel de pintura de arte #1 | |||
| Tampão de cacodilato | Microscopia Eletrônica Sciences | 11650 | |
| Ácido tânico | Microscopia Eletrônica Sciences | 21700 | |
| EMbed 812 kit | Ciências de Microscopia Eletrônica | 14120 | |
| Agente de liberação líquida | Ciências de Microscopia Eletrônica | 70880 | |
| Prata líquida coloidal | Ciências de Microscopia Eletrônica | 12630 | |
| CircuitWorks epóxi condutor | ITW Chemtronics | CW2400 | |
| VWR | 70730-064 | ||
| VT1200S Micrótomo de lâmina vibratória Microscópio | Leica | ||
| Zeiss 780i | Carl Zeiss | ||
| Microscópio Eletrônico de Varredura Sigma VP | Carl Zeiss | ||
| Sistema 3view | Gatan | ||
| Renovo Neural Inc (Cleveland, OH) | http://www.renovoneural.com | Renovo fornece serviços de EM 3d | |
| Software Fiji Software | de acesso aberto | ||
| Estação de computador com 16 GB de RAM ou mais | |||
| Software de visualização de dados Imaris 7.5 | Plano de |
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