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Comparando ISC Recombinação Eficiência no Ah-cre e Vil-CRE-ER T2 Sistemas
A utilização destes sistemas de cre-lox para avaliar o papel das células de Paneth, no repovoamento do intestino depois de dano, caracterização necessária da eficiência de recombinação dentro do ISC. Usando o repórter lacZ-Rosa26R condicional demonstramos que em ambos os sistemas de 3 dias após indução (dpi) há ~ 100% de recombinação no intestino delgado (Figura 1a). Quantificar a presença do alelo recombinados por qPCR foi confundido pelas diferenças nos padrões de expressão de Cre entre os sistemas. O sistema Cre-T2 Vil-ER mostraram um aumento de 3,53 vezes na presença do alelo recombinados em comparação com o sistema cre-Ah, devido à sua expressão em uma proporção maior do epithelia 16. Para superar isso, adotou uma estratégia diferente, que nos permitiu comparar diretamente os sistemas. Nós induzido os ratos com diferentes regimes de indução e analisadas em 30 dpi, em que criptas positivas ponto LacZ e vilosidades representam um evento de recombinação ISC. Utilizando esta abordagem, demonstrou que, em ambos os sistemas, 3 injecções de agente indutor (entregue IP a 80 mg / kg em 24 h), recombinados em um número equivalente de ISC apesar dos níveis de recombinação iniciais são muito maior no Vil-Cre-ER T2 16 (Figura 1b-d) do sistema. Além disso, utilizando ADN extraído das criptas recombinadas, qPCR para os alelos recombinadas demonstraram um aumento não significativo em usar o sistema de recombinação ER T2 Vil-Cre, potencialmente devido à recombinação nas células de Paneth não observados utilizando o sistema cre-Ah (Figura 1d). Além disso, a coloração para os tipos de células epiteliais não indiCate qualquer alteração ao padrão de diferenciação, imagens representativas de cada tipo de célula investigada é mostrada na Figura 2e-2h.
Caracterização de Intestinal Epithelia seguinte CatnB Exclusão
Quantificação da perda Crypt
Caracterizar a cinética de recombinação nestes sistemas Cre nos permitiu analisar o intestino do rato quando os números equivalentes de ISCs são recombinados. Usando o repórter LacZ ambos os sistemas mostrou perda completa das células recombinantes (azul) em 3 dpi (Figura 2a). Como relatado anteriormente três dias após a supressão do CatnB os ratinhos Ah-cre mostrou perda de cripta parcial, ao passo que os ratinhos T2 Vil-Cre-ER demonstrou destruição completa da cripta / vilosidade eixo 13,16,24 (Figura 2b-d).
Dinâmica de Epithelial Repovoamento Usando as técnicas acima caracterizamos vários parâmetros que nos permitam entender essa observação. Imagens representativas dos tipos de células e parâmetros analisados utilizando protocolos de 7 - 10 são apresentados na (Figura 3a e 3b). Resumidamente, a perda de criptas era consistente com os níveis elevados de apoptose indicadas em ambos os sistemas (Figura 3e). No entanto, a mitose, proliferação celular altura da cripta, cripta e de expressão (não mostrado) do sistema de dados indicaram Ah-cre pode recuperar, presumivelmente devido à repopulação por ISC recombinado-un (Figura 3C). Em comparação gritante, o vil-Cre-ER T2 não conseguiu se recuperar apesar da manutenção de células da cripta epiteliais (Figura 3d).
Caracterização de celulares fenótipos dentro Crypt
Para entender por que as criptas de camundongos Ah-CRE poderia repovoar Considerando que o vil-Cre-ER T2 não poderia foram caracterizadas as células epiteliais três dias após eliminação de CatnB. Usando hibridização in situ (secção 9) e análise de IHC (seção 7, 8 e 10) que demonstraram que as células da cripta nas vil-Cre-ER T2 CatnB flox / mice flox eram não-proliferativa e faltava expressão do marcador ISC Olfm4 , ao contrário das criptas nos ratinhos Ah-Cre (Figura 4C & F). À medida que a caracterização inicial tinha demonstrado que a recombinação em criptas era equivalente procedeu-se examinar o papel das células de Paneth. Foi realizada uma dupla fluorescente IHC contra CatnB e Lyz1 para identificar quais as células tinham perdido β-catenina e se eram células de Paneth (Figura 5a-5c). Como anteriormente descrito que demonstrated que todas as células da cripta são segmentados usando o sistema Cre-T2 Vil-ER. Em comparação o sistema Ah-cre poupou as células Paneth e os epitélios das vilosidades. Mais células Paneth foram apenas observados em apoptose após CatnB eliminação utilizando o sistema T2 vil-Cre-ER (Figura 5d & 5e).

Figura 1: Comparação da Especificidade e Eficiência de Cre / Lox recombinação dentro da Intestinal Epithelia usando o Ah-cre e Vil-CRE-ER T2 Sistemas (a):. Visualização do Ah-cre expressão LacZ repórter em wholemount pequeno (SI; * extremidade distal) e grande (LI; * extremidade distai) a partir de um ratinho de tipo selvagem. (b): Resultados de qPCR mudança vezes mostrando para o alelo CatnB flox recombinados em uma dpi para comparar diferentes regimes de indução em Ah-cre CatnB Flox / Flox (BNF induzido) e vil-Cre-ER T2 CatnB Flox / Flox (TAM induzido ); * P <0,05 (Mann-Whitney [2-cauda] comparado com o controlo). (c) - (e):.. intestino delgado Wholemount mostrando LacZ cripta positiva 30 dpi Panel (b) - (e) modificado a partir Parry et al 16 Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Comparação de AH-CRE e T2 Vil-Cre-ER CatnB no Intestino Delgado Epithelia (a):. intestino delgado Wholemount que mostra a perda de células recombinadas em camundongos AH-cre CatnB Flox / Flox LacZ + ao longo de 3 dias. (b): Quantificação da perda cripta 3 dias após eliminação de CatnB; * P <0,05 (Mann-Whitney [2-cauda] comparado com o controlo). (c & d): transversais secções H & E de formalina intestino fixo demonstrando perda de criptas após CatnB eliminação. (e) - (h) Exemplo de tipos de células a partir de ratinhos de controlo: (e) células entero-endocriine, (f) as células caliciformes, (g) CatnB IHC indicando uma ISC (→) com nuclear B-catenina e (h) Paneth células. O painel (b) modificado a partir Parry et al. 16. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
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Figura 3: Caracterização do início da Fenótipo ao usar o Ah-cre e Vil-CRE-ER T2 Sistemas para Condicionalmente Excluindo CatnB em Números semelhantes de ISC dentro do Intestino Delgado Epithelia (a & b) H & E seções fixas em formalina manchado indicando a localização da cripta. altura ([), um apoptótica (←) e células mitóticas (↓). Quantificação do número médio de células por cripta entre o tipo selvagem (azul) e CatnB Flox (laranja) ratos em três pontos de tempo (ppp) (c) Altura cripta, (d) mitose e (E) de apoptose (barras de erro indicam o desvio padrão ). O painel (c) - (e) modificado a partir Parry et al 16."Target =" _ blank 3429fig3large.jpg "> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4:. Comparação das características do ISC usando Ah-cre e Vil-CRE-ER Sistemas T2 para Condicionalmente Excluindo CatnB nas células epiteliais das criptas Epithelia Intestino Delgado 3 dias após a eliminação de CatnB usando o Ah-cre (ac) ou vil- Cre-ER T2 sistema (df). (a & d) secção H & E mostrando áreas de perda cripta; (b & d) Ki-67 IHC perda demonstração de células de proliferação utilizando vil-Cre-ER T2; (c & f) Olfm4 in situ demonstrando presença de ISC funcionais usando Ah-cre. Painel (a.) - (f) modificado a partir Parry et al 16 Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: Caracterização das células de Paneth após CatnB Exclusão usando os Vil-Cre-ER T2 e Ah-cre Sistemas (ac):. Imagens de imunofluorescência de criptas mostrando Paneth células (vermelho), B-catenina (verde) e núcleo (azul ), seta indicam ligada à membrana β-catenina; (DE) IHC para a caspase-3 de células de Paneth indicando apoptóticos estão ausentes na ah-CRE (d), mas presente no sistema Vil-Cre-ER T2 (E). O painel (a) - (e) a partir modificadoParry et al 16. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
| O tampão de acetato | * | * | Para perfazer 100 ml: 4,8 ml de ácido acético 0,2 M, 45,2 ml de 0,2 M de acetato de sódio e 50 ml de água destilada |
| Ácido acético | Fisher Scientific | C / 0400 / PB17 | |
| Anidrido acético | Sigma | A6404 | |
| Solução de anidrido acético | * | * | 2 M de anidrido acético em cloridrato de trietanolamina 0,1 M |
| Alcian Blue | Sigma | A5268 | |
| Alcian PH azul 2,5 | * | * |
| fosfatase alcalina anti-digoxigenina conjugado anticorpo | Abcam | ab119345 | |
| B (beta) -naftoflavona | Sigma | N3633 | BNF, injetar, sem permitir que a solução para esfriar muito como composto vai cair fora da solução. A solução pode ser re-utilizado - armazenar a -20 ° C entre as utilizações, não mais do que duas vezes reaquecer. |
| Bloxall | Vector Labs | SP-6000 | |
| BM roxo | Roche | 11442074001 | |
| BSA | Sigma | A4503 | Albumina de soro bovino |
| Clorofórmio | Fisher Scientific | C / 4920/17 de | |
| Tampão citrato / Antigen Solução desmascaramento | Vector Labs | H-3300 | |
| Óleo de milho | Sigma | C8627 | |
| Solução Demucifiying | * | * | Por 500 ml: 50 ml de glicerol, 50 ml de Tris 0,1 M pH 8,8, 100 mL de EtOH, 300 mL de solução salina (NaCl a 0,9% em água), 1,7 g de DTT. Demucifying solução pode ser feita antecipadamente e armazenado, mas DTT sholud ser adicionado imediatamente antes da incubação (340 mg / 100 ml). |
| DEPC água tratada | Life Technologies | 750.023 | |
| TDT | Sigma | 101509944 | |
| EDTA | Sigma | O3690 | 0,5 M |
| Etanol | Fisher Scientific | E / 0650DF / 17 | |
| Filtro de papel | Que homem | 3000917 | |
| Formaldeído | Sigma | F8775 | |
| Formalina | Sigma | SLBL11382V | Formalina tamponada neutra |
| Formamida | Sigma | F5786 | |
| Glutaraldehye | Sigma | G6257 | |
| H 2 O 2 | Sigma | 216763 | |
| Haematoxylin | Raymond A Lamb | 12698616 | |
| HBSS | Gibco | 14175-053 | HBSS (-MgCl2 +; -CaCl2) |
| Tampão de hibridação | * | * | 5 x SSC, 50% formamida, 5% de SDS, 1 mg / ml de heparina, 1 mg / ml de tRNA de fígado de bezerro |
| Hidroquinona | Sigma | H9003 | |
| IMMPACT DAB peroxidase | Vector Labs | SK-4105 | |
| Vector Labs | MP-7402 | |
| Kit Immpress HRP anti-coelho IgG | Vector Labs | MP-7401 | |
| Pó de tecido intestinal | * | * | Os intestinos delgados de 5 ratinhos adultos foram combinadas e homogeneizadas num volume mínimo de PBS gelado. 4 volumes de acetona gelada foram adicionados ao intestino homogeneizado, o qual foi cuidadosamente misturada e incubada em gelo durante 30 min. Esta foi centrifugada e o sedimento foi lavado com acetona gelada. Este foi ainda centrifugado e o sedimento resultante espalhada sobre papel de filtro e deixada a secar. Depois de secar completamente o material foi moído até um pó fino usando um almofariz e pilão. |
| K-ferricianeto | Sigma | P-3667 | |
| K-ferrocianeto | Sigma | P3289 | |
| Levamisol | Sigma | L0380000 | |
| Methacarn | * | * | 60% de metanol: 30% clorofórmio: 10% de ácido acético |
| Metanol | Fisher Scientific | M / 4000/17 de | |
| MgCl2 | Sigma | M8266 | |
| Soro normal de cabra | Vector Labs | S-1012 | NGS |
| Soro normal de coelho | Dako | X0902 | NRS |
| NTMT | * | * | 100 mM de NaCl, 100 mM Tris-HCl, MgCl2 50 mM, 0,1% de Tween 20, 2 mM de Levamisol |
| PAP caneta | Vetor | H-400 | |
| Paraformaldeído | Sigma | P6148 | |
| PBT | * | * | 0,5 M de NaCl, 10 mM de trisHCL pH 7,5, 0,1% de Tween 20 |
| Penicilina / Estreptomicina | Gibco | 15140-122 | 100x solutiuon. |
| Salina tamponada com fosfato (10x) | Fisher Scientific | BP3994 | Diluído 1:10 com água destilada para fazer 1x |
| Lâminas PLL | Sigma | P0425-72EA | Lâminas de microscópio poli-L-lisina |
| Proteinase K | Sigma | P2308 | |
| Solução de proteinase K | * | * | Dilui-se proteinase K a 200 jig / mL em Tris 50 mM, EDTA 5 mM. |
| Ralwax | BDH | 36154 7N | |
| Solução Redutor | * | * | Para perfazer 100 ml de 1: g de hidroquinona, 5 g de sulfito de sódio e 100 ml de água destilada |
| ARNase | Sigma | R6148 | |
| Salina | * | * | NaCl a 0,9% em água destilada |
| SDS | Sigma | I3771 | |
| Soro de ovelha | Sigma | S3772 | |
| Nitrato de prata | Sigma | S / 1240/46 | |
| Solução de prata | * | * | Para fazer 100 ml: 10 ml de tampão de acetato, 87 ml de água destilada, de nitrato de prata 3 ml de 1% |
| Acetato de sódio | Fisher Scientific | S / 2120/53 | |
| Cloreto de sódio | Sigma | S6753 | NaCl |
| O sulfito de sódio | Sigma | 239321 | |
| SSC | Sigma | 93.017 | Citrato de sódio salino 20x |
| Fita cirúrgica | Fisher Scientific | 12960495 | |
| Tamoxifen | Sigma | T5648 | TAM, injetar, sem permitir que a solução para esfriar muito como composto vai cair fora da solução. A solução pode ser re-utilizado - armazenar a -20 ° C entre as utilizações, não mais do que duas vezes reaquecer. |
| TBS / T | Cell Signalling | # 9997 | |
| Cloridrato de trietanolamina | Sigma | T1502 | |
| Tris-HCL | Invitrogen | 15567-027 | |
| Tween20 | Sigma | TP9416 | |
| VectaMount | Vector Labs | H-5000 | |
| Vectashield Hardset meio de montagem com DAPI | Vector Labs | H-1500 | |
| Vectastain Kit ABC | Vectou Labs | PK-4001 | |
| X-gal | Promega | V3941 | |
| X-gal fixador | * | * | 2% de formaldeído, 0,1% de glutaraldeído em 1xPBS |
| X-gal mancha | * | * | X-gal mancha; 200 uL de X-gal (A) em 50 ml de solução B (0,214 g de MgCl2, 0,48 g de K-ferricianeto, 0,734 g de K-ferrocianeto em 500 ml de PBS). Solução B pode ser constituído por oin antecedência e guardadas a 4 ° C |
| Xileno | Fisher Scientific | X / 0200/21 | |
Para fazer 500 ml: 15 ml de ácido acético, água 5 g Alcian Blue & 485 ml destilada Kit Immpress HRP IgG anti-murganho
Tabela 1: Materiais e Métodos
d> 1/200, 30 min à TA
| Alvo | beta-catenin | A lisozima | Ki67 | A caspase-3 | Vilina |
| Fonte comercial de Ab primário | Transduction Labs | Neomarkers | Vector Labs | Sistemas de I & D | Santa Cruz |
| Número de catálogo | 610154 | RB-372 | VP-K452 | AF835 | SC-7672 |
| Ab primária cresceu em | Mouse (mAb) | Coelho (PAB) | Mouse (mAb) | Coelho (PAB) | Goat (PAB) |
| Recuperação antigênica | Banho maria / tampão citrato | Tampão banho maria / Citrato | Tampão banho maria / Citrato | Tampão banho maria / Citrato | Tampão banho maria / Citrato |
| Bloqueio da peroxidase | Bloxall ou 2% de H 2 O 2, 45 seg | Bloxall ou 1.5% de H 2 O 2, 30 min | Bloxall ou 0,5% de H 2 O 2, 20 min | Bloxall ou 2%H 2 O 2, 45 seg | Bloxall ou 3% de H 2 O 2, 20 min |
| Bloco de soro | BSA a 1%, 30 min | 10% NGS, 30min | 20% NRS, 20 min | NGS 10%, 45 min | 10% NRS, 30 min |
| Tampão de lavagem | PBS | TBS / T | TBS / T | PBS | TBS / T |
| Condições para Ab primário | 1/300, 2 h à TA | 1/100, 1 h à TA | 1/50, 1 h à TA | 1/750, o / n a 4 ° C | 1/500, 1 h à TA |
| Ab secundário | Kit Immpress HRP IgG anti-murganho | Kit Immpress HRP anti-coelho IgG | Coelho anti-ratinho biotinilada | Biotinilado de cabra anti-coelho | Coelho biotinilado anti-cabra |
| Condições para Ab secundário | 1 h à TA | 30 min à TA | 1/200, 30 min à TA | 1/200, 30 min à TA |
| Amplificação do sinal | N / D | N / D | Kit ABC | Kit ABC | Kit ABC |
| Detecção de sinal | IMMPACT DAB peroxidase | IMMPACT DAB peroxidase | IMMPACT DAB peroxidase | IMMPACT DAB peroxidase | IMMPACT DAB peroxidase |
| Imunofluorescência | AlexaFluor 488 | AlexaFluor 594 | N / D | N / D | N / D |
| Propriedades de imunofluorescência | Max Excitação 488 / Emissão Max 525 | Excitação Max 595 / Emissão Max 617 | | | |
| Conjunto de Filtros comum | FITC | Vermelho do Texas | | | |
conteúdo
"> Quadro
2: IHC anticorpos e Condições