O objetivo de toda a imunofenotipagem do sangue é obter quantitativa (o delineamento de subconjuntos de células imunes) e informação qualitativa (detecção de status de ativação) em células do sistema imunológico. Temos ligeiramente modificada do painel imunofenotipagem de células T proposto pelo Projeto de Imunologia Humana 1 a melhorar o desempenho geral do nosso método (Tabela 1). O nosso painel de células T tem como objetivo identificar naïve, a memória central (CM), memória efetoras (EM), e as células T efetoras. Resumidamente, que discrimina dupletos baseado em FCS-A e FCS-H. Em seguida, no portão linfócitos com base em dispersão lateral e os níveis de CD45. As células T são então identificados através da expressão de CD3. As células T CD3 + são diferenciadas em células T e células T γδ ap. células T αβ são divididos em células CD4 + e CD8 +. As células T CD4 + e CD8 + são então analisadas para os seus subgrupos com base na expression de CD45RA e CCR7: CD45RA - CCR7 + CM, CD45RA + CCR7 + Naïve, CD45RA + CCR7 - efetoras e CD45RA - CCR7 - células T EM 1. Além disso, nós também acompanhar a sua expressão de marcadores de ativação, tais como CD38, HLA-DR, ICOS, PD-1, GITR, 4-1BB, CD69, NKG2D e OX40 obter informação qualitativa.
Para demonstrar a precisão deste método, foram coradas amostras de sangue total periférico a partir de 4 dadores saudáveis, 5 vezes por dia. A Figura 11 mostra a relação entre a percentagem subpopulação de células T em linfócitos e percentagem do coeficiente de variação (% CV). Uma análise detalhada de subpopulações de células T por cento em linfócitos e% CV para cada subconjunto é apresentado na Tabela 8. Os dados de testes 2 e 3 não estão incluídos na Figura 11 e Tabela 8 para simplificar. Menos de 25% CVentre run (precisão inter-ensaio) foi sugerido por critérios de aceitação para ensaios de biomarcadores fenotípicas para utilização em investigação 10. Todas as medições encontrou este critério, exceto as células ICOS + γδ T (26,64-46,39%. Tabela 8) e células ICOS + T CD8 (14,64-58,39%. Tabela 8). Estes valores são apresentados para fins de demonstração. Não utilizar estas medições porque ICOS desempenha sobretudo um papel importante na activação de células T CD4 16. A tendência de maior CV% em populações que compõem uma porcentagem baixa para a população total foi observado por outros 7. Em investigadores de casos estão interessados em monitorar raros-eventos, o número de células examinadas precisa ser aumentado, a fim de superar a maior imprecisão 17. Juntos, os nossos dados mostram o êxito da implantação da automação na preparação de amostras de toda a imunofenotipagem sangue.
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Figura 1. Fluxo de trabalho para imunofenotipagem com sangue total periférico. Passo a passo do fluxo de trabalho de ensaio imunofenotípicas é mostrado. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2. Visão geral do método para fazer "Cocktail Base" e "Cocktail Activation". Etapas do método para fazer "Cocktail Base" e "Cocktail Activation" no software para o manipulador de líquidos automatizado são apresentados. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
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Figura 3. Disposição para o suporte de tubos com BACE_CT e ACT_CT. (A) mostra layout para o suporte de tubos "BACE_CT". (B) mostra layout para o suporte de tubos "ACT_CT". Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4. definição laboratorial para o suporte de tubos com tubos de código de barras 2D. Passo a passo processo de definição do suporte de tubos com tubos de código de barras 2D. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
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Figura 5. A configuração do instrumento para o método para fazer "Cocktail Base" e "Cocktail Activation". Ele mostra o layout da plataforma para o método para fazer "Cocktail Base" e "Cocktail Activation". Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6. Instalação para "Criar conjunto de dados". Ele mostra a definição detalhada para "Criar conjunto de dados". Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figu re 7. Visão geral do método para fazer "Mestre Antibody Cocktail". Etapas do método para fazer "Mestre Antibody Cocktail" no software para o manipulador de líquidos automatizado é mostrado. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 8. layout para o suporte de tubos com 5 ml tubos de poliestireno de fundo redondo. Ele mostra layout para o suporte de tubos "SPL_TUBES_1". FM3 significa fluorescência menos 3 (brilhante violeta 421, ficoeritrina e aloficocianina). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
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Figura 9. A configuração do instrumento para o método para fazer "Mestre Antibody Cocktail". Ele mostra o layout da plataforma para o método para fazer "Mestre Antibody Cocktail". Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 10. Configuração de "Transferência de Arquivo". Ele mostra a definição detalhada de "Transferência de Arquivo". Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 11. Baixa vari capacidade total imunofenotipagem sangue semi-automatizado. valores de CV individuais de todas as populações celulares analisados a partir de quatro dadores saudáveis são mostrados como círculo aberto azul. curva de regressão é mostrado na linha azul. Red linhas pontilhadas indicam 95% bandas confiantes e ganância linhas pontilhadas mostram 95% bandas de previsão. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 12. Um exemplo de coloração subóptima. A coloração foi realizada com agitação em vórtex adequada ou inadequada dos tubos de microcentrífuga de "BACE_CT" e "ACT_CT". Existem duas populações fechado em B. A população menor com coloração CD45 fraca representa células que não recebem coloração ideal.g12large.jpg "target =" _ blank "> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
| GRUPO | MARCADOR | fluoróforo | Clone | Titulação (mL / coloração) |
| COCKTAIL BASE | TCELL | CD45 | FITC | 2D1 | 0,4 |
| CD3 | Alexa700 | UCHT1 | 1 |
| CD8 | APC-H7 | SK1 | 0,4 |
| CD4 | PerCP-Cy5.5 | SK3 | 2 |
| CCR7 | PE-CF594 | 150503 | 1 |
| CD45RA | PE-Cy7 | L48 | 1 |
| TCRab | BV786 | T10B9.1A-31 | 1 |
| TCRgd | BV650 | B1 | 5 |
| ATIVAÇÃO COCKTAIL-1 | TEST1 | HLA-DR | BV421 | G46-6 | 5 |
| CD278 (ICOS) | PE | DX29 | 5 |
| CD38 | APC | HB7 | 1 |
| ATIVAÇÃO COCKTAIL-2 | TEST2 | CD279 (PD1) | BV421 | EH12.1 | 2.5 |
| CD357 (GITR) | PE | eBioAITR | 5 |
| CD137 (41BB) | APC | 4B4-1 | 10 |
| ATIVAÇÃO COCKTAIL-3 | TEST3 | CD69 | BV421 | FN50 | 1 |
| CD314 (NKG2D) | PE | 1D11 | 2 |
| CD134 (OX40) | APC | ACT35 | 5 |
Tabela 1. Uma lista de anticorpos para o painel de células T modificadas.
| AB | BC |
| CD45_FITC | 0163562388 |
| CD3_Alexa700 | 0163562110 |
| CD4_PerCP_CY5.5 | 0163562364 |
| CD8_APC-H7 | 0163562363 |
| CCR7_PE-CF594 | 0163562387 |
| CD45RA_PE-Cy7 | 0163562091 |
| TCRab_BV786 | 0163562069 |
| TCRgd_BV650 | 0163562108 |
| A_HLA-DR_BV421 | 0163562339 |
| A_CD278 (ICOS) _PE | 0163562082 |
| A_CD38_APC | 0163562317 |
| A_CD279 (PD1) _BV421 | 0163562340 |
| A_CD357 (GITR) _PE | 0163562093 |
| A_CD137 (41BB) _APC | 0163562315 |
| A_CD69_BV421 | 0163562341 |
| A_CD314 (NKG2D) _PE | 0163562314 |
| A_CD134 (OX40) _APC | 0163562316 |
Tabela 2. nomes de anticorpos com números de código de barras 2D.
| GRUPO | WELL_BASE | AB_NAME | VOL |
| TCELL | 1 | CD8_APC-H7 | 7.2 |
| TCELL | 1 | CD45_FITC | 7.2 |
| TCELL | 1 | CD3_Alexa700 | 18 |
| TCELL | 1 | CCR7_PE-CF594 | 18 |
| TCELL | 1 | CD45RA_PE-Cy7 | 18 |
| TCELL | 1 | TCRab_BV786 | 18 |
Tabela 3. Um arquivo "BASE_CT_P50": nomes de anticorpos e informações de volume.
| GRUPO | WELL_BASE | AB_NAME | VOL |
| TCELL | 1 | CD4_PerCP_CY5.5 | 36 |
| TCELL | 1 | TCRgd_BV650 | 90 |
Tabela 4. Um arquivo "BASE_CT_P200": nomes de anticorpos e informações de volume.
| GRUPO | WELL_ACT | AB_NAME | VOL |
| TEST1 | 7 | A_HLA-DR_BV421 | 30 |
| TEST1 | 7 | A_CD278 (ICOS) _PE | 30 |
| TEST1 | 7 | A_CD38_APC | 6 |
| TEST2 | 13 | A_CD279 (PD1) _BV421 | 15 |
| TEST2 | 13 | A_CD357 (GITR) _PE | 30 |
| TEST3 | 19 | A_CD314 (NKG2D) _PE | 12 |
| TEST3 | 19 | A_CD69_BV421 | 6 |
| TEST3 | 19 | A_CD134 (OX40) _APC | 30 |
Tabela 5. Um arquivo "ACT_ CT_P50": nomes de anticorpos e informações de volume.
| GRUPO | WELL_ACT | AB_NAME | VOL |
| TEST2 | 13 | A_CD137 (41BB) _APC | 60 |
Tabela 6. Um arquivo "ACT_CT _P200": nomes de anticorpos e informações de volume.
| DOADOR# | SRC_ BASE | COCKTAIL BASE | BEM_ BASE | VOL_ BASE | SRC_ACT | dades vação COCKTAIL | BEM_ AJA | VOL_ACT | DEST_MACT | BEM_ MACT |
| HD001 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | FM3 | 1 | 25 | SPL_TUBES_1 | 1 |
| HD001 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST1 | 7 | 36 | SPL_TUBES_1 | 7 |
| HD001 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST2 | 13 | 42,5 | SPL_TUBES_1 | 13 |
| HD001 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST3 | 19 | 33 | SPL_TUBES_1 | 19 |
| HD002 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | FM3 | 1 | 25 | SPL_TUBES_1 | 2 |
| HD002 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST1 | 7 | 36 | SPL_TUBES_1 | 8 |
| HD002 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST2 | 13 | 42,5 | SPL_TUBES_1 | 14 |
| HD002 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST3 | 19 | 33 | SPL_TUBES_1 | 20 |
| HD003 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | FM3 | 1 | 25 | SPL_TUBES_1 | 3 |
| HD003 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST1 | 7 | 36 | SPL_TUBES_1 | 9 |
| HD003 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST2 | 13 | 42,5 | SPL_TUBES_1 | 15 |
| HD003 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST3 | 19 | 33 | SPL_TUBES_1 | 21 |
| HD004 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | FM3 | 1 | 25 | SPL_TUBES_1 | 4 |
| HD004 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST1 | 7 | 36 | SPL_TUBES_1 | 10 |
| HD004 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST2 | 13 | 42,5 | SPL_TUBES_1 | 16 |
| HD004 | BASE_CT | TCELL | 1 | 36,8 | ACT_CT | TEST3 | 19 | 33 | SPL_TUBES_1 | 22 |
Tabela 7. Um arquivo "AB_MACT": Fonte e informações de destino para "Mestre Antibody Cocktail".
| População # na Fig. 1 | Eu | ii | iii | iv | v |
| nome população | CD3 + | células T ab | células T gd | CD3 + CD4 + | CD3 + CD8 + |
| % De linfócitos | Heathly Dador # 1 | 79.80 | 75,20 | 2.70 | 49.60 | 22.30 |
| Heathly Dador # 2 | 69,40 | 61.90 | 5.85 | 44.40 | 16.20 |
| Heathly Dador # 3 | 75.80 | 69.60 | 4.75 | 42.00 | 23.50 |
| Heathly Dador # 4 | 77,20 | 73.50 | 1,98 | 52.70 | 18.90 |
| %CV | Heathly Dador # 1 | 1,42 | 1.58 | 3.70 | 2.50 | 1,56 |
| Heathly Dador # 2 | 2.48 | 2.39 | 5,74 | 2,82 | 2.41 |
| Heathly Dador # 3 | 1.15 | 1,40 | 6,32 | 1,42 | 2,72 |
| Heathly Dador # 4 | 0,81 | 0,94 | 5.45 | 1.20 | 1,44 |
| Média | 1,47 | 1.58 | 5.30 | 1.99 | 2.03 |
| Desvio padrão | 0,72 | 0,61 | 1.13 | 0,79 | 0,63 |
Tabela 8. Os dados em bruto para% de linfócitos e% CV para cada subconjunto representados graficamente na Figura 4. Note-se que os dados para os testes 2 e 3 não são mostrados na Figura 5 e na Tabela 8, para simplificar a apresentação dos dados.